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全长转录组 | 三代全长转录之circRNA(ONT )-- CIRI-long

目前研究表明,在生物体内,circRNA主要通过其序列特征,发挥miRNA海绵、RNA-binding proteins (RBPs)海绵以及翻译短肽等生物学功能(1-2)。因此,确定其的全长序列,是进行circRNA功能研究的重要基础。由于目前对于circRNA的研究多采用二代测序的方法,而circRNA的内部序列与线性mRNA分子高度相似,单纯通过算法(识别反向剪切位点)很难区分来自环形RNA和线性RNA分子的读段,以及确定全长circRNA内部组成。近期的研究中利用了长读长测序技术,对circRNA的全长重构进行了尝试(3-4)。因此,目前研究方法对于circRNA结构的识别能力主要被二代测序的读长所限制,对于长度较长(>500bp)的circRNA分子,仍然缺少有效的全长重构手段。

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Dubbo 源码分析 - 集群容错之 LoadBalance

LoadBalance 中文意思为负载均衡,它的职责是将网络请求,或者其他形式的负载“均摊”到不同的机器上。避免集群中部分服务器压力过大,而另一些服务器比较空闲的情况。通过负载均衡,可以让每台服务器获取到适合自己处理能力的负载。在为高负载的服务器分流的同时,还可以避免资源浪费,一举两得。负载均衡可分为软件负载均衡和硬件负载均衡。在我们日常开发中,一般很难接触到硬件负载均衡。但软件负载均衡还是能够接触到一些的,比如 Nginx。在 Dubbo 中,也有负载均衡的概念和相应的实现。Dubbo 需要对服务消费者的调用请求进行分配,避免少数服务提供者负载过大。服务提供者负载过大,会导致部分服务调用超时。因此将负载均衡到每个服务提供者上,是非常必要的。Dubbo 提供了4种负载均衡实现,分别是基于权重随机算法的 RandomLoadBalance、基于最少活跃调用数算法的 LeastActiveLoadBalance、基于 hash 一致性的 ConsistentHashLoadBalance,以及基于加权轮询算法的 RoundRobinLoadBalance。这几个负载均衡算法代码不是很长,但是想看懂也不是很容易,需要大家对这几个算法的原理有一定了解才行。如果不是很了解,也没不用太担心。我会在分析每个算法的源码之前,对算法原理进行简单的讲解,帮助大家建立初步的印象。

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偷偷看了同事的代码找到了优雅代码的秘密

对于一个软件平台来说,软件平台代码的好坏直接影响平台整体的质量与稳定性。同时也会影响着写代码同学的创作激情。想象一下如果你从git上面clone下来的的工程代码乱七八糟,代码晦涩难懂,难以快速入手,有种想推到重写的冲动,那么程序猿在这个工程中写好代码的初始热情都没了。相反,如果clone下的代码结构清晰,代码优雅易懂,那么你在写代码的时候都不好意思写烂代码。这其中的差别相信工作过的同学都深有体会,那么我们看了那么多代码之后,到底什么样的代码才是好代码呢?它们有没有一些共同的特征或者原则?本文通过阐述优雅代码的设计原则来和大家聊聊怎么写好代码。

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Dubbo 源码分析 - 集群容错之 LoadBalance

LoadBalance 中文意思为负载均衡,它的职责是将网络请求,或者其他形式的负载“均摊”到不同的机器上。避免集群中部分服务器压力过大,而另一些服务器比较空闲的情况。通过负载均衡,可以让每台服务器获取到适合自己处理能力的负载。在为高负载的服务器分流的同时,还可以避免资源浪费,一举两得。负载均衡可分为软件负载均衡和硬件负载均衡。在我们日常开发中,一般很难接触到硬件负载均衡。但软件负载均衡还是能够接触到一些的,比如 Nginx。在 Dubbo 中,也有负载均衡的概念和相应的实现。Dubbo 需要对服务消费者的调用请求进行分配,避免少数服务提供者负载过大。服务提供者负载过大,会导致部分服务调用超时。因此将负载均衡到每个服务提供者上,是非常必要的。Dubbo 提供了4种负载均衡实现,分别是基于权重随机算法的 RandomLoadBalance、基于最少活跃调用数算法的 LeastActiveLoadBalance、基于 hash 一致性的 ConsistentHashLoadBalance,以及基于加权轮询算法的 RoundRobinLoadBalance。这几个负载均衡算法代码不是很长,但是想看懂也不是很容易,需要大家对这几个算法的原理有一定了解才行。如果不是很了解,也没不用太担心。我会在分析每个算法的源码之前,对算法原理进行简单的讲解,帮助大家建立初步的印象。

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