作者：中科院微生物所 陈亮博士 本教程旨在告诉大家如何使用cytoscape根据Node信息表格制作带有barplot信息节点的网络图。以安装文件夹下的样例数据为例。...打开Cytoscape 本文以Cytoscape_v3.4.0为例，不同版本操作类似，略有不同请自行按思路进行修改进行。 1. 打开cytoscape并载入一个网络。...若想制作pie图，此处选择pie chart选项。 ? 7. 现在你可以根据自己需要来选择Node table中要展示的数据了。Available Columns窗口展示了所有可以用于作图的数据。...修改结点颜色和形状 从图上可以看出圆形的节点并不适合展示bar plot图，因此我们可以将节点的形状改为正方形，填充颜色改为白色。...并选择上面工具栏中Zoom selected region放大查看细节（点击旁边的Zoom out挖扭退回查看完整网络），也可以根据节点名字从右上方的搜索框搜索感兴趣的节点。 ? 11.
常见的图神经网络应用 GNN可以用来解决各种与图相关的机器学习问题: 节点的分类：预测节点的类别或标签。例如，在网络安全中检测网络中的欺诈实体可能是一个节点分类问题。...链接预测：预测节点之间是否存在潜在的链接(边)。例如，社交网络服务根据网络数据建议可能的朋友联系。 图分类：将图形本身划分为不同的类别。比如通过观察一个化合物的图结构来确定它是有毒的还是无毒的。...这些掩码用于训练损失计算和模型评估，而图卷积使用整个图数据。 节点分类基线模型(MLP) 在构建GCN之前，只使用节点特征来训练MLP(多层感知器，即前馈神经网络)来创建一个基线性能。...从MLP中获得了大约15%的精度提高。 链接预测 链接预测比节点分类更复杂，因为我们需要使用节点嵌入对边缘进行预测。预测步骤大致如下: 编码器通过处理具有两个卷积层的图来创建节点嵌入。...它是一个具有图卷积层的自编码器网络，其重构误差将是节点异常评分。该模型遵循以下步骤进行预测。 属性网络编码器使用三个图卷积层来处理输入图，从而创建节点嵌入。
当你需要写论文、做演讲、可视化的时候，就可以拿来用。 这套模板可以说非常的用心了，常用到的图形元素都有，甚至还提供了黑白两套配色。并且鼓励大家随意使用，不需要任何授权。 不过这只是一个ppt模板。...当然，相比PPT来说，我还是更喜欢用流程图软件或者Sketch来进行可视化，毕竟ppt的学习成本太高了。 直到我发现了manim！...你可能会说，ppt就拖拖拽拽就够了，这个还得写代码，当然，你的网络结构简单，也没有什么动态需求的话，ppt是可以满足。但如果你想做出令人惊艳的效果，manim就是你的最佳选择了。...3Blue1Brown火了之后，大家都很好奇，课程我听懂了，但我想知道你的动画怎么做的。好吧，我开源自己的制作工具，manim！ 整个项目不到17M，却收获了2万多星！...如何使用manim制作自己想要的数学动画呢？ 你可以参考这个开源项目，作者精心制作了一系列教程。
该频道从独特的视觉角度解说高等数学，内容包括线性代数、微积分、神经网络、黎曼猜想、傅里叶变换以及四元数等等。 ? 本人通过该视频频道获得了很多启发，同时也对其精良的视频制作技术产生了浓厚的兴趣。...偶然的机会，得知其在Github上有专门开设了一个视频制作引擎：manim。 ?...，即可使用（此为manim引擎所包含的全部文件）； miktex：https://miktex.org/download，直接安装即可，（路径中不要包含中文！）...如果都有类似于上面的版本提示，则说明依赖的软件安装成功，否则，回去检查安装或用户路径的添加是否正确。...此过程中会提示安装一些程序包，为了加快编译进度，可以点击去掉那个复选框的勾选，默认安装所有需要的程序包。得到的是具有3b1b经典风格的文字动画： ?
Manim是一个Python库，可让您创建数学和科学中难以用普通视频制作工具制作的图形和动画。Manim 是一个用于精确编程动画的引擎，专为创建解释性数学视频而设计。...技术概念的动画制作在传统上是相当乏味的，因为要使动画足够精确，以准确地表达它们是很困难的。Manim 使用 Python 以编程方式生成动画，使其有可能准确地指定每一个动画应该如何运行。...系统要求是FFmpeg、OpenGL和LaTeX（可选，如果你想使用 LaTeX）。对于 Linux，需要Pango及其开发头文件。...pip直接安装 > pip install manimgl MacOS安装 > brew install ffmpeg mactex 制作一个简单的视频 from manim import * class...0-9,神经网络动画,是不是很强。
作者提出了DENVIS（DEep Neural VIrtual Screening），一种使用具有原子和表面蛋白袋特征的图神经网络进行可扩展和高通量虚拟筛选的新型算法。...本文引入了深度神经虚拟筛选（DENVIS），这是一种使用图形神经网络（GNN）进行虚拟筛选的端到端管道。...原子级模型由图同构网络（GIN）[2]组成，这是一种通用但功能强大的GNN实现，已用于生物和化学应用。表面级方法使用混合模型网络（MoNet）[3]，一种特殊的GNN，具有考虑输入流形几何的卷积运算。...DENVIS模型图 在原子域中，DENVIS为每个分子（蛋白质口袋或配体）提取九个节点和三个边缘特征。...不同特征DENVIS的对比 总结 本文研究了融合原子级别和表面级别表示的蛋白质-药物亲和力预测模型，并通过使用图神经网络，显著改进了对蛋白质-药物互相作用关联的预测。
传统的分子对接算法使用基于物理的模拟，通过估计查询蛋白配体对的结合方向和相应的结合亲和度评分来解决这一挑战。近年来，经典和现代机器学习架构显示出超越传统对接算法的潜力。...在氨基酸序列级别处理目标信息的算法家族以在更高表示级别处理蛋白质数据为代价，避免了这一情况。本文介绍了深度神经虚拟筛选(DENVIS)，一种使用图神经网络(GNNs)进行虚拟筛选的端到端管道。...通过在两个基准数据库上进行实验，本文证明了本文的方法与几种基于分子对接的、基于机器学习的以及基于分子对接的与机器学习结合的算法相比具有竞争力。...由于避免了中间的分子对接步骤，DENVIS的筛选时间比基于分子对接的和混合模型都要快几个数量级(即更高的吞吐量)。与筛选时间相当的基于氨基酸序列的机器学习模型相比，DENVIS的性能显著提高。...我们方法的一些关键元素包括使用原子和表面特征组合的蛋白质口袋建模，模型集成的使用，以及在模型训练期间通过人工负采样的数据增强。
本周特推 1.1 移动检验工具包：mtv 本周 star 增长数：3,900+ New MTV 是一组实用程序，用于简化和自动化收集取证痕迹的过程，有助于识别 Android 和 iOS 设备的潜在危害...你可以在 learn-python 的 playground 中可以更改或添加代码来查看代码是如何工作的，并使用 assertion 进行测试。...GitHub 地址→https://github.com/doocs/source-code-hunter 2.3 制作数学动画：manim 本周 star 增长数：500+ Manim 是一个用于解释数学视频的动画引擎...Golang，客户端使用了 Swift（iOS）和 Java（Android）网页端使用了 webapp，如果你想学习如何制作一个聊天软件，不妨试试这个移动端、网页端、桌面端皆有的开源项目。...和之前的送书活动类似，留言点赞 Top5 的小伙伴(棒），小鱼干会努力去找 Repo 的^^ 以上为 2021 年第 30 个工作周的 GitHub Trending ?
相反，选择使用捕获的背景作为真实背景的估计。这使得更容易求解前景和alpha值。称其为“随意捕获”的背景，因为它可能包含轻微的移动，色差，阴影或与前景类似的颜色。 捕获过程。...下图显示了它的外观： 捕获的输入，捕获的背景以及在新背景上合成的示例。 请注意，此图像具有挑战性，因为它具有非常相似的背景和前景色（尤其是在头发周围）。它也用手持电话录制，并且包含轻微的背景移动。...“称其为随意捕获的背景，因为它可能包含轻微的移动，色差，阴影或与前景相似的颜色。” 拍摄技巧 尽管方法适用于某些背景干扰，但是当背景恒定且在室内环境下效果最佳时，效果会更好。...监督学习 为了首先训练网络，使用Adobe Composition-1k数据集，其中包含450个经过认真注释的地面真相alpha遮罩。以完全监督的方式训练网络，在输出上每像素损失一次。...也在寻找使该方法实时运行且具有较少计算资源能力的方法。这可以在视频流或移动应用程序等领域中实现各种用例。 参考文献 [1] S. Sengupta，V。Jayaram，B。Curless，S。
最近做了一个功能，里面涉及到了渐变圆形的需求。就是一个颜色可以渐变的圆环，最后实现的效果如下图： ? ? 左图是带渐变效果，右图是不带渐变效果。...这些操作就像是虽然你的笔还是原来的地方画，但是画纸旋转或者移动了，所以你画的东西的方位就产生变化。...为了方便一些转换操作，Canvas 还提供了保存和回滚属性的方法(save和restore)，比如你可以先保存目前画纸的位置(save)，然后旋转90度，向下移动100像素后画一些图形，画完后调用restore...(time); // setAnimationTime(time); this.startAnimation(mAnim); } /** * @param stepNum */ public void...R.id.color_progress_view); color_progress_view.setMaxStepNum(500); color_progress_view.update(470,1000); 由于和调用其他控件方法类似
最近做了一个功能，里面涉及到了渐变圆形的需求。就是一个颜色可以渐变的圆环，最后实现的效果如下图： 左图是带渐变效果，右图是不带渐变效果。...这些操作就像是虽然你的笔还是原来的地方画，但是画纸旋转或者移动了，所以你画的东西的方位就产生变化。...为了方便一些转换操作，Canvas 还提供了保存和回滚属性的方法(save和restore)，比如你可以先保存目前画纸的位置(save)， 然后旋转90度，向下移动100像素后画一些图形，画完后调用restore...(time); // setAnimationTime(time); this.startAnimation(mAnim); } /** *...color_progress_view.setMaxStepNum(500); color_progress_view.update(470,1000); 由于和调用其他控件方法类似
nat 特性包括： 显示文件权限 显示文件大小 显示文件最后被修改的日期 显示文件所属的用户 显示文件所属的组 一个容易使用的文件搜索 用醒目的颜色区分文件和文件夹 GitHub 地址→https://...OCR 工具包，支持多语言识别：英语、中文、韩语、日语、德语、法语等，3.5M 实用超轻量化 OCR 系统，支持服务器、移动、嵌入式和物联网设备之间的培训和部署。...100 毫秒内即可返回答案 可以直接在代码编辑器中使用，无需打开浏览器 GitHub 地址→https://github.com/chubin/cheat.sh 2.5 开心学数学：manim 本周...star 增长数：1200+ manim 是一个动画制作库，主要用于制作跟数学物理相关的动态视频。...使用它可快速构建有关数学的动画，非常精确且形象。
如果你无法理解高等数学、比特币、深度学习这些概念，可能有人会向你推荐 3blue1brown 的视频——这是一个专门制作可视化讲解视频的频道，其内容覆盖数学、人工智能等领域，每门课都配有直观生动的动画演示...对于一个硬核教学 UP 主来说，这样的成绩几乎是无人可及了。 ? 不过 3b1b 的创立者 Grant Sanderson 认为仅仅把数学概念做成动图还不够。...你可以亲眼看到你所给出的输入是如何被神经网络处理成输出的。 例如，想知道神经网络做 MNIST 数据集手写识别要经历怎样的流程，你可以用自己的涂鸦来考验 AI： ?...他开发的动画引擎名叫 Manim，在 Python 上运行。 ?...Manim 引擎 Github：https://github.com/3b1b/manim 如果你对自己的学习能力信心不足，或许看看 3b1b 的内容会是一个好主意。
结果： 与以往关于结构良好幻觉的帕金森患者脑结构改变类似，伴轻微幻觉帕金森患者在视空间处理区域及默认模式网络核心区域表现出明显的脑萎缩。...该区域是默认模式网络的核心节点，同时表现出与注意过程相关的其他静息态网络之间很强的负相关。尤其来说，作者使用小球后扣带种子点（中心点MNI坐标x=0，y=-56, z=28，小球半径10mm）。...当使用替代的默认网络脑区作为种子点时（内侧前额叶、左右海马旁回），在轻度幻觉患者中发现的连接模式仍然保持一致，尤其是使用内侧前额叶时（参见补充图2、3、4和5）。...在作者的研究中，伴有轻微幻觉的帕金森患者表现出后扣带回和属于TPN（任务正网络）网络的脑区之间功能连接增强。DAN（背侧注意网络）中心节点展现出更高的连接，比如双侧顶上叶和右侧中央前回。...当解释外部刺激时，外生和内生网络之间功能对抗的失败可能导致属于两个操作系统的节点同时激活，这将导致注意力网络的激活不足，以及在视觉感知任务中过度使用DMN的某些区域。
Grant 经营着一个名为3Brown1Blue（国内俗称：3黄1绿）的YouTube频道，在那里他使用Manim库来创建和控制这些动画，向观众教授更高的数学。...使用 manim，你还可以创建动画视频，并精确控制用于图表和插图的动画。...开发者声称，互联网上超过95%的深度假视频都是用这个工具制作的。...开发人员声称，他的工具不是简单地测试随机有效负载，而是分析网站并生成具有工作效果的专门工程有效负载。...Python 和 NumPy 中使用多模式递归神经网络的图像字幕项目。
推荐的制作工具有：D3、Protovis、RAWGraphs、The R Graph Gallery、Vega。 网络图 也称为「网络地图」或「节点链路图」，用来显示事物之间的关系类型。...这些节点通常是圆点或小圆圈，但也可以使用图标。 网络图主要有分别为「不定向」和「定向」两种。不定向网络图仅显示实体之间的连接，而定向网络图则可显示连接是单向还是双向（通过小箭头）。...网络图数据容量有限，并且当节点太多时会形成类似「毛球」的图案，使人难以阅读。...平行集合图 平行集合图与桑基图类似，都显示流程和比例，但平行集合图不使用箭头，它们在每个所显示的线集 (line-set) 划分流程路径。...单一流向线所代表的移动规模或数量由其粗幼度表示，有助显示迁移活动的地理分布。 推荐的制作工具有：AnyChart。
推荐的制作工具有：D3、Protovis、RAWGraphs、The R Graph Gallery、Vega。 网络图 ? 也称为「网络地图」或「节点链路图」，用来显示事物之间的关系类型。...这些节点通常是圆点或小圆圈，但也可以使用图标。 网络图主要有分别为「不定向」和「定向」两种。不定向网络图仅显示实体之间的连接，而定向网络图则可显示连接是单向还是双向（通过小箭头）。...网络图数据容量有限，并且当节点太多时会形成类似「毛球」的图案，使人难以阅读。...平行集合图 ? 平行集合图与桑基图类似，都显示流程和比例，但平行集合图不使用箭头，它们在每个所显示的线集 (line-set) 划分流程路径。...单一流向线所代表的移动规模或数量由其粗幼度表示，有助显示迁移活动的地理分布。 推荐的制作工具有：AnyChart。 甘特图 ?
time_continue=122&v=G4lT9CLyCNw 【摘要】 利用人工智能的方式控制或者制作可信的角色动画，一直以来是个不小的挑战，本文试图使用hierarchy（层级）控制网络来控制角色的下肢移动...【解决方法】 高层的控制网络（HLC），输入周围环境的高度图、角色当前的状态和高级的目标（比如到达某处或者将球踢向目标），运行频率为２Hz，输出为两脚下一步的位置和身体的朝向(Gh)；底层的控制网络（LLC...本文试图发明一种用常见网络摄像头就可以在室内外使用的动捕方案，其关键思想是借助于骨骼节点的热点图和深度图估计，以及实时的骨骼长度和时序变化校正。...【解决方法】 视频经过track定位到人的bounding box区域后，经过resnet-50的处理，然后通过cnn网络同时获得骨骼节点的2D热点图和三维x/y/z轴向的位置信息（相对于人的胯部基准点...），然后使用euro filter进行时间上的过滤平滑，得到实时的人体三维骨骼节点信息，然后利用ceres库做了一次skeleton骨骼节点的匹配优化处理，获得最终骨骼位置。
3b1b/manim[2] Stars: 53.4k License: MIT Manim 是一个用于创建数学解释视频的精确编程动画引擎。...SmartKnob是一款开源输入设备，具有软件可配置的止动器和虚拟止动器。...) 8 个侧发光 RGB LED 灯珠围绕旋钮发光 核心优势： 具有软件可配置的止动器和虚拟止动器。...该项目列举了许多重要的论文，并提供了这些论文的描述和日期。以下是该项目的核心优势和主要特点： 提供对语言模型、视觉模型、卷积神经网络等领域内重要论文进行解释。...该项目具有以下优点和特性： 可以像使用OpenAI ChatGPT API一样调用Claude API 支持流式响应 支持claude-v1.3、claude-v1.3-100k模型 可通过Cloudflare
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