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使用作者代码重复结果

第三单元第十二+十三讲:使用作者代码重复结果 课程链接在:http://jm.grazy.cn/index/mulitcourse/detail.html?...(结果有点高): # 计算dropout的比例 sum(expr_raw==0)/(dim(expr_raw)[1]*dim(expr_raw)[2]) # 0.8305757 读入ERCC数据 #...个细胞 根据一些指标去掉了52个细胞 作者也把这52个细胞的质控结果读入了R: cell_QC<-read.delim(paste(Path_Main,"/qc/qc_2plates.filtered_cells.txt...最后就是拿这5000多个基因做下游分析 看第三个R脚本 Dimensionality_reduction.R 这个脚本需要RPKM结果,因此需要先跑完上面第二个完整的脚本 降维主要使用tSNE,聚类使用...作为50次中效果最优的tSNE,然后主要关注tsne结果的itercosts opt_tsne <- tsne_out[[as.numeric(names(KL)[KL==min(KL)])]]$Y opt_tsne_full

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    使用PHATE复现Science Immunology上文章的结果

    在上篇文章中,我们初步探索了PHATE的使用方法,发现它在揭示一些连续分化过程中不同细胞状态之间的微小局部差异具有很好的效果,同时也能保留细胞全局的整体结构。...在本节教程中,我们将复现演示近期发表在Science Immunology期刊上的一篇文章的结果,进一步学习PHATE的相关使用方法。...,我已将其转换为TSV文件存放在我的百度云盘中,有需要的可以下载使用。...详细用法见上期 [使用PHATE进行单细胞高维数据的可视化] 使用PHATE进行低维嵌入降维可视化 ### analysis for chronic sample ### #Embedding Data...,我们将不同的cluster进行细胞类型的注释,得到以下的细胞注释结果。

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    使用aPEAR来增强clusterProfiler的GSEA分析结果

    而前面我们演示了:使用topGO增强你的GO数据库注释结果的可视化,是超几何分布检验的结果的可视化,主要是展示GO数据库的有向无环图结构。...接下来我们聊聊使用clusterProfiler的GSEA方法针对GO数据库进行注释后的结果的可视化,所以是需要大家自己提前弄清楚GSEA方法和超几何分布检验方法的区别哦!...:使用topGO增强你的GO数据库注释结果的可视化 然后使用clusterProfiler的GSEA方法针对GO数据库进行注释 前面的DESeq2进行转录组差异分析后的表格里面有两万多个基因,需要对它们根据里面的...log2FoldChange对基因排序后的全部的基因的列表,而前面我们演示了:使用topGO增强你的GO数据库注释结果的可视化,是超几何分布检验的结果的可视化只需要统计学显著的上下调的几百个基因即可。...clusterProfiler的GSEA方法针对GO数据库进行注释,和前面的 :使用topGO增强你的GO数据库注释结果的可视化,是超几何分布检验的结果,差异很多哦!

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    Elasticsearch使用:自定义搜索结果的得分

    在使用 Elasticsearch 进行全文搜索的时候,默认是使用 BM25 计算的 _score 字段进行降序排序的。...比如,虽然所有的结果都很匹配,但是我们也许不只单单是匹配 Final Fantasy,而且我们想把 user_score 和 critic_score 加进来(虽然你可以使用其中的一个)。...,但是它可以让我们每次进入一个网页看到不同的文档,而不是严格按照固定的匹配而得到的固定的结果。...我们的分数和之前的那个 soft_score 结果是不一样的,但是我们搜索的结果的排序是一样的。 在上面的 script 的写法中,我们使用了硬编码,也就是把10硬写入到 script 中了。...与使用 script_score 函数类似,但是它避免了脚本编写的开销。 如果用于多值字段,则在计算中仅使用该字段的第一个值。

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    解析Amazon搜索结果页面:使用BeautifulSoup

    在互联网技术领域,数据的获取和处理是至关重要的一环。尤其是对于电子商务网站,如Amazon,其搜索结果页面包含了大量的商品信息,对于市场分析、价格比较等应用场景具有重要价值。...本文将详细介绍如何使用Python语言中的BeautifulSoup库来解析Amazon搜索结果页面,并在代码中加入代理信息以应对可能的IP限制。...发送HTTP请求接下来,我们使用requests库发送HTTP请求,获取Amazon搜索结果页面的HTML内容。3. 解析HTML内容4....数据使用:获取的数据应遵守相关法律法规,不得用于非法用途。结语通过本文的介绍,我们了解了如何使用BeautifulSoup库来解析Amazon搜索结果页面,并在代码中加入代理信息以应对可能的IP限制。...网络爬虫技术是一个强大的工具,但使用时必须遵守法律法规和道德标准。希望本文能够帮助读者更好地理解和应用网络爬虫技术。

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    ElasticSearch 中使用衰减函数来完美你的搜索结果

    最近的项目在原有的搜索需求增加功能 ElasticSearch 7.6 (请注意,大版本不同可能参数不同) 原有搜索:简单的标题+正文 全文索引 新加功能:在原有的基础上,更加完善排序结果。...,在 0 分外的值都是 0 分 exp 衰减速度先快后慢 gauss 衰减速度先慢后快再慢 我的参数配置如下: { "query":{ // 使用得分函数 "function_score...(现在是所有得分累加) "score_mode":"sum", "functions":[ // 使用高斯函数, 原始日期是...天的使用高斯函数得分 // 距离原始日期超过 90 天(30+60) 的都得最低分,也就是 0.5 {...www.elastic.co/guide/en/elasticsearch/reference/7.6/query-dsl-function-score-query.html 知乎Live全文搜索之使用

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    测试结果存储并使用图表展示

    流程 每次执行完测试之后将测试结果插入数据库 使用Spring Boot+MyBatis读取数据 前端通过接口获取处理后的数据并在图表上展示 最终展示 数据表创建 数据源来自于pytest执行之后的结果...,由于使用allure进行结果的保存,所以直接读取对应的测试结果文件 解析报告存储路径,拿到包含'-result.json'名称的文件 遍历json文件,读取到测试结果信息 处理重复执行数据 json文件...:param path: 存放allure运行json结果的文件夹 :return: """ result_list = [i for i in os.listdir(...,所以我们需要使用SQL进行一轮处理 SQL处理 根据 Job名称、执行编号进行分组 拿到执行状态是failed或 broken的数据 select ui.project_name,...$nextTick(() => { this.showCharts() }) } }, 查询某个项目 查询某个项目的某个时间 然后使用vue进行展示

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    多协程如何使用channel优雅的收集结果

    但是随之而来的问题就是,有些时候我们需要同时执行多个协程,然后再根据其结果再进行处理,这时候收集多个协程的值就非常关键。 这篇文章我们一起来实现从一个小白到优雅的处理这个问题的方式。...} func main() { fmt.Println(job(1)) } 我们用 job 方法来模拟耗时的方法,现在需要执行多次,在不使用协程的情况变成了这样: //模拟耗时操作 func job...: 0 1 2 3 4 总共耗时:2.512076777s 现在我们加入协程,我们这里直接使用 sync.WaitGroup 来管理协程。...500) return number } func main() { start := time.Now() num := 5 resCha := make(chan int) //用于收集结果的...{ resCha <- job(input) }(i) } cnt := 0 for item := range resCha { cnt++ fmt.Println("收到的结果

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