一起复习一下吧~ 函数有3个好处： 更容易看清代码意图 更容易对需求变化做出反应（改变） 更容易减少程序bug 除了函数，减少重复代码的另一种工具是迭代，它的作用在于可以对多个输入执行同一种处理，比如对多个列或多个数据集进行同样的操作...使用purrr，我们可以解决子问题，然后用管道将其组合起来。 映射函数 先对向量进行循环，然后对其每一个元素进行一番处理，最后保存结果。...0.0269 0.6161 0.0573 map_dbl(df, sd) #> a b c d #> 0.608 1.086 0.797 0.873 **与for循环相比，映射函数的重点在于需要执行的操作...当检查多个模型时，有时候我们需要提取像R方这样的摘要统计量，要想完成这个任务，我们需要先运行summary()函数，然后提取结果中的r.squared： models %>% map(summary...前面我们提到的映射函数都是对单个输入进行映射，但有时候我们需要多个相关输入同步迭代，这就是map2()和pmap()函数的用武之地。
3 个子集是没有可以连接的列的，第 4 个子集起到桥梁作用。...所以使用 dplyr 提供的连接函数报错是正常的，但有意思的是，基础包提供的 merge() 函数可以完成连接操作，真是优秀（感兴趣的朋友可以看下测试下 merge 函数源代码）！...be_join[[1]])[col_exist]) be_join[[1]] <- NULL } else { be_join <- shifter(be_join) } } 上述代码中执行下面的操作...如果 be_join 不为空，进行如下的循环： 如果存在，则将这个子集和 to_join 按共同列合并 如果不存在，使用循环位移一位，将当前 be_join 的第 2 个子集移动为 第 1 个。...2 S1 S2 S2 S1 S2 更新 在后面的一些使用过程中发现基础包的 merge() 函数在进行连接操作时会输出有问题的结果，所以建议使用的小伙伴仔细检查结果。
purrr的walk函数针对这种情形。...purrr包的pmap类函数支持对多个列表、数据框、向量等进行向量化处理。pmap不是将多个列表等作为多个自变量， 而是将它们打包为一个列表。...（之于map 对列执行，有点类似于apply 选择行or列）。...将数据分散存储在不同计算节点中， 将需要的操作先映射到每台计算节点， 进行信息提取压缩， 最后用reduce的思想将不同节点的信息整合在一起。 6....；discard(.x, .p)返回不满足条件的元素子集。
R-Purrr的使用，加速数据处理 Tidyverse中包含一个purrr程序包，之前在看数据处理分析时候，一直看到别人的code中，涵盖purrr，map函数，但是一直不知道这个是干什么的，现在发现purrr...Purrr 主要是替换for循环的使用。 Purrr引入了map函数以及一些用于操纵list的新函数。cheatsheet可以速查一些关于Tidyverse使用方法。...这篇文章是快速教你使用purrr。 因为Purrr的操作对象基本上都是关于list，所以对R的基本Number，Vector，dataframe及list又个了解。...apply（）函数是一组超级有用的base-R函数，可用于vector或list的条目迭代执行操作，而无需编写for循环。...匿名函数是一个临时函数（您定义为映射的function参数）。 在这里，我使用了参数名称.x，但我可以使用任何参数。
readr是利用C++和RCpp编写的，所以执行的速度是相当快的，不过相对于直接用C语言写的data.table::fread()就稍微慢大概1.2-2倍左右。...如果使用purrr包就可以很好的解决这一问题。...参考 Wisdom's Quintessence: Purrr package for R is good for performance 的例子： 具体使用可以参考Rstudio Blog:purrr...DDF用一个统一的跨引擎API简化了多数据源的分析操作，进一步将data frame底层的分布式傻瓜化。...6.知乎的高分问答：如何使用 ggplot2？
function(i){ if(all(dat_t[,i]==dat_t[,i][1] )){ print(colnames(dat_t)[i]) } } my_genes <- purrr...# 取子集再挑选基因 sub_cells <- subset(pbmc_small, cells = sample(Cells(pbmc_small), 20)) object_seurat <- sub_cells...4 tryCatch容错函数 try就像一个网，把try{}里面的代码所跑出的异常都网住，然后把异常就给catch{}里面的代码去执行，最后执行finally之中的代码。...无论try中代码有没有异常，也无论catch是否被异常捕获到，finally中的代码都一定会被执行。...plotlist=list(VlnPlot_plot_cluster, featureplot1_cluster), nrow=2) ---- References [1] R语言tryCatch使用方法
； AUCell 基于单个样本中的基因表达排名,使用曲线下面积来评估输入基因集是否在单个样本的前5%表达基因内富集； UCell 基于单个样本的基因表达排名，使用Mann-Whitney U统计量计算单个样本的基因集富集分数...Viper 通过根据细胞间基因表达的排名执行three-tailed计算来估计基因集的富集分数。...我们期待从多个角度解释复杂的生物学问题，并找到生物学问题中的共性部分。...), "M") 69.33521 M > cat(object.size(pbmc3k.final3) / (1024^2), "M") 69.27851 M 2.irGSEA支持的基因集打分方法 测试了不同数据大小下各种评分方法使用...msigdbr包支持多个物种的基因集获取，以及多种基因格式的表达矩阵的输入。
因为向量化，我选择R image.png 我们的所有操作，都可以对向量的每一个元素执行。...同样的操作也可以用来取子集： 一些使用的注意事项 一般来说，c() 是创建向量的语法，但R 也提供了一些例外：可不要因为它们养成坏习惯了哦。 2...."hot", "cold")) 用户 系统 流逝 0.070 0.005 0.086 这里有人还做了一张图：https://thatdatatho.com/vectorization-r-purrr...28%29%20converts%20a%20scalar%20function%20to%20a,vectorize%20functions%20would%20be%20with%20the%20purrr
1-别用循环的方言教R做事 lsum <- sum(log(x)) 我们的所有操作，都可以对向量的每一个元素执行。 同样的操作也可以用来取子集。...同样在[[50-R茶话会10-编程效率提升指北]] 我们举过如下例子：在计算总和、元素乘积或者每个向量元素的函数变换时， 应使用相应的函数，如sum, prod, sqrt, log等。...比如利用取子集对数据框批量操作，如果你是一个较大的数据框，可能就需要考虑其他专门处理大数据框的R包，亦或是改用循环的方法了。...Vectorization in R – Speeding up For Loops (thatdatatho.com): https://thatdatatho.com/vectorization-r-purrr...28%29%20converts%20a%20scalar%20function%20to%20a,vectorize%20functions%20would%20be%20with%20the%20purrr
按行汇总统计 dplyr::summarise() 让一列多行的统计汇总变得非常简单，当它与 rowwise() 结合时，它也可以简便地操作汇总一行多列。...它们允许你避免显式的循环和/或使用 apply() 或 purrr::map 家族函数。...模拟 我认为这是执行模拟的一种特别优雅的方式，因为它允许您存储模拟值以及生成它们的参数。...list()意味着我们将得到一个列表列，其中每一行都是一个包含多个值的列表。...作为替代方案，我们建议使用 purrr 的 map() 函数执行逐行操作。但是，这很有挑战性，因为您需要根据变化的参数数量和结果类型来选择映射函数，这需要相当多的 purrr 函数知识。
排除一些团队(表3b)后，65个团队的阈值映射和64个团队的无阈值映射(z-或t-统计)被纳入分析。...4.阈值统计图的变异性 通过分析研究小组提交的统计图，进一步探讨分析变异性的性质。阈值映射是高度稀疏的。...对于假设1和假设3，有7个团队的一个子集，其无阈值映射与主大多数团队的映射不相关。...为了测试这一点，研究者在每个假设的所有团队的无阈值映射上应用了一致的阈值方法和ROI的解剖定义。...首先，研究者们建议使用多个pipeline分析复杂的数据集，最好由多个研究团队进行分析。
) 当查询优化器决定执行特定SQL查询的最有效方式时，它会考虑以下三种情况： 查询中使用的每个表的ExtentSize行计数。...BlockCount 当编译一个持久化类时，类编译器会根据区段大小和属性定义计算每个SQL映射使用的映射块的大致数量。...这些类型的子表的BlockCount值与父表数据映射的BlockCount值相同。 如果全局映射是远程全局(不同名称空间中的全局)。取而代之的是使用在类编译期间使用的估计的BlockCount。...它还为每个SQL映射生成块计数。 可以指定该调优表，使用此信息更新与表及其每个字段相关联的元数据。 查询优化器随后可以使用这些统计信息来确定最有效的查询执行计划。...虽然TuneTable可以在实时数据上运行，但建议在具有实际数据的测试系统上运行TuneTable，而不是在生产系统上运行。可以使用可选的系统模式配置参数来指示当前系统是测试系统还是活动系统。
系统具有非常强的灵活性，可以通过修改调度路由策略和存储数据映射表，轻松的做到跨机房的作业迁移和数据迁移。...同机房内不同集群之间可以实现作业跨子集群运行充分利用各集群资源，功能可随时根据子集群负载动态开关，无需用户参与，对用户完全透明。 为了使新的大数据平台系统更友好更易于管理使用，团队开启了界面化项目。...我们利用WEB技术实现了面向管理员的大数据平台管理系统，使用这套管理系统之后可以灵活方便的上下线子集群，实时管理和修改调度策略，不再需要像以前一样登陆到对应的物理服务器上执行相关命令。...（所有的调度策略和控制信息我们保存在DBMS中） 增加了作业的动态跨子集群借用资源功能，可以随时控制某个队列中的相关作业是否需要跨子群执行。方便单个子集群在资源紧张时动态去借用另一个空闲集群的资源。...另一方面丰富了调度器分配资源的算法逻辑，增加多个维度的排序筛选规则，多个规则之间可以组合使用，如：基于内存、基于负载 、基于使用率等等。
1.设置数据框以进行可视化 在本课中需要制作与每个样本中的平均表达量相关的多个图，还需要使用所有可用的metadata来适当地注释图表。 观察rpkm数据。...编程语言通常有办法允许多次执行代码，或者在“循环”中执行。虽然R语言也有“循环”，但有些函数更直接，例如apply()函数map()族和函数族。...这是因为每种类型的geom通常都具有一组必需的映射。映射使用aes（）函数设置，并且可以在geom_point()内部设置以专门应用于该层。...ggscatter1 有了必须的映射，再为图片添加一些可选的映射，比如颜色。通过指定列标题来，按照基因型给点上色。自动使用一组默认颜色，不必指定。此外，ggplot2还自动绘制了图例！...dev.off() 注意1： 在执行dev.off()函数之前，将无法使用标准方法（Adobe Acrobat或Preview等）打开和查看文件。
这些决定将由一个或多个AI模型提供支持。概率决策将被证明是企业的巨大福音。然而，概率决策的引入将为企业带来质量和测试挑战的新水平。这将迫使行业如何进行质量保证以及如何设计和生成测试指标。...新的质量标准 相同的数据，多个模型，相同的AI场景 在这种情况下，使用相同的数据来生成多个AI模型，使用不同的AI技术为相同的AI场景/业务问题提供动力。...转换后的数据，多个AI场景 在这种情况下，数据集通过几种ETL机制转换为不同的AI场景/及业务问题。数据的转换可以在下列之间变化： 采样：数据集的一个子集在子集可以被使用，但不必随机生成。...预测：训练数据集旨在包含数据集中可用属性的子集。 聚合：训练数据集是通过聚合建立的，跨特定的一组属性或随着时间的推移。...测试最佳实践 企业范围内的数据转换映射 企业需要确保他们建立和维护全面的企业级数据转换图。这个企业范围内的数据转换映射应该描述如何从原始数据源获取数据，并将其转换并提供给AI模型。
img 公式保存了创建它的环境 使用到 R 的朋友几乎都用过公式，它在统计建模方面给了我们极大的方便。不过，公式相比于数值、逻辑值这些数据类型，有什么特点吗？...如果进行拓展，2 个参数时使用 .x 与 .y，3 个参数时使用 ..1, ..2, ..3 等。 通过下面的例子，我们来学习如何基本掌握它的用法。...purrr 可以写出更简洁的代码： df3 <- purrr::map_df(df, ~ (.x - mean(.x)) / sd(.x)) 我们检查下两种操作是否结果相同： identical(df2...identical( purrr::map_df(df, ~ (.x - mean(.x)) / sd(.x)), purrr::map_df(df, ~ (. - mean(.)) / sd(....)) ) #> [1] TRUE 在理解了上述操作后多个参数的使用也就不难理解了，接下来我们看一个更加实际的例子。
这种方法称为“单变量”，因为相应的统计检验每个条件仅考虑一个值（例如区域或体素的平均信号）。近年来，越来越多的研究人员正在考虑使用跨多个体素（称为MVPA）而不是基于单个体素或区域值的反应模式分析。...因此，更常见的是使用k折叠交叉验证，其中将数据多次（k）次划分为训练和测试集，并在数据的每个子集中执行训练和测试过程（表2 ，图5）。...（F）可以在回归中将多个RDM作为预测变量，并且可以将生成的β映射回ROI，作为该变量在其他预测变量之上和之外预测神经数据的指标。 统计测试。完成上述步骤后，就可以进行显著性测试了。...然后在每次迭代中执行相关的统计测试（例如，置换后的神经RDM与模型RDM的相关性，分类分析）以创建一个空分布，可以将真实的测试统计数据（从非混洗数据生成）与该空分布进行比较。...跨被试测试。测试跨被试的MVPA结果的显著性可以通过测试来自相应ROI或统计参数图的数据对单变量研究中的各个被试的显著性来完成。
为此，当前的最佳做法是使用pseudobulk方法，该方法涉及以下步骤： 将子集替换为感兴趣的细胞类型以执行DE分析。...注意：要从我们在单细胞分析工作流程结束时创建的Seurat对象中提取子集并提取细胞，我们可以使用类似于以下代码： # Bring in Seurat object seurat <- readRDS("...我们将使用此信息来执行感兴趣的任何特定细胞类型的条件之间的差异表达分析。 获取样本中细胞间聚合的必要指标 首先，我们需要确定数据集中存在的群集数量和群集名称。...然后，我们将使用归一化计数在基因和样本水平上为QC绘制一些曲线图。最后一步是使用DESeq2包中的适当函数来执行差异表达式分析。...对感兴趣的群集取子集 现在我们有了样本级别的元数据，我们可以使用DESeq2运行差异表达式分析。通常，我们希望对多个不同的群集执行分析，这样我们就可以将工作流设置为在任何群集上轻松运行。
根据情况，技术人员可以在STB的特定子集（例如，通过一系列序列号、特定软件/硬件版本、所处地理区域来标识）或在单个设备上执行操作，例如强制执行纠错操作以尝试和改进网络性能。...可以执行以下监测活动： 定期在所有STB设备上检查网络和设备是否正常工作， 在STB设备的子集上，例如在通过定期测试识别问题之后。...每个音频输出都映射到一个或多个物理输出连接器。如果音频输出直接映射到SCART连接器，则在数据模型中通过从音频输出到相应SCART实例的引用来表示（其他类型的物理连接器未建模）。...每个视频输出都映射到一个或多个物理输出连接器。当视频输出直接映射到SCART连接器时，这在数据模型中通过从视频输出到相应SCART对象实例的引用来表示（其他类型的物理连接器未建模）。...定义服务类型的主要原因是它们对应于不同的协议栈和配置，跨多个服务类型收集的统计信息将毫无意义。
在R和python上都可使用 readr：实现表格数据的快速导入。...purrr：函数式编程工具，在做数据整理时非常有用。...R包，其中的一些R包适用于多个主题。...drat：一个用于创建和使用备选R包库的工具 testthat：单元测试，让R包稳定、健壮，减少升级的痛苦。 roxygen2：通过注释的方式，生成文档，远离Latex的烦恼。...purrr：一个用于 提供函数式编程方法的工具 profvis：用于可视化R代码的性能分析数据 Rcpp：用于实现R与C++的无缝整合。
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