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    R语言系列第三期:②R语言多组汇总及图形展示

    ①当处理分组数据的时候,你会希望得到一些按组别分类计算的不同统计量,比如均值和标准差等形成的一张表格。这里可以使用tapply()函数。...因此,计算数值向量组成的数据框中每个变量的均值可以如下操作: > lapply(thuesen,mean,na.rm=T) $blood.glucose [1] 10.3 $short.velocity...同样的方法,标准差和每组中变量的数目都可以计算得到: > tapply(folate,ventilation,sd) N2O+O2,24h  N2O+O2,op     O2,24h 58.71709  ...by()函数也是类似的,不同之处在于函数by()只能把整个数据框作为它的变量,不能使用mean,sd等函数,但是可以通过不同分组汇总。...01 直方图 之前我们已经使用过hist()函数来得到一个简单的直方图,R可以根据数据选择合适的分割。同时也可以通过breaks来设定区间数量。

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    tidyverse|数据分析常规操作-分组汇总(sumamrise+group_by)

    使用tidyverse进行简单的数据处理: 盘一盘Tidyverse| 筛行选列之select,玩转列操作 盘一盘Tidyverse| 只要你要只要我有-filter 筛选行 Tidyverse|数据列的分分合合...,一分多,多合一 Tidyverse| XX_join :多个数据表(文件)之间的各种连接 本次介绍变量汇总以及分组汇总。...一 summarize汇总 汇总函数 summarise(),可以将数据框折叠成一行 ,多与group_by()结合使用 1.1 summarise完成指定变量的汇总 统计均值,标准差,最小值,个数和逻辑值...group_by() 和 summarise() 的组合构成了使用 dplyr 包时最常用的操作之一:分组摘要 2.1 按照Species分组,变量汇总 iris %>% group_by...is.na(x)) :返回非缺失值的梳理; n_distinct(x):返回 唯一值的数量。

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    R语言︱数据集分组、筛选(plit – apply – combine模式、dplyr、data.table)

    ##用lapply也可以,返回值是列表 > lapply(g,mean) $USA [1] 18.57292 $`non-USA` [1] 20.50889 ##分组结果 summary(g)...lapply函数可以对每组数据都执行同样的算法。Split和lapply两者结合可以实现本案例。 2.由于分组后的数据可以复用,因此本算法比aggregate性能更高。...##对于数据框 x是对象,subset是保留元素或者行列的逻辑表达式,对于缺失值用NA代替。 Select 是选取的范围,应小于x。...data.table包提供了一个非常简洁的通用格式:DT[i,j,by],可以理解为:对于数据集DT,选取子集行i,通过by分组计算j。...data.table比较简洁一步搞定,dplyr花了两步,不过也dplyr也可以通过%>%来实现一步搞定。%>%的功能是用于实现将一个函数的输出传递给下一个函数的第一个参数。

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    R in action读书笔记(5)-第七章:基本统计分析

    通过sapply()计算描述性统计量 >mystatsna.omit=FALSE){ + if(na.omit) +x和观测的数量、缺失值和唯一值的数目、平均值、 分位数,以及五个最大的值和五个最小的值 通过Hmisc包中的describe()函数计算描述性统计量: >describe(mtcars[...通过psych包中的describe()计算描述性统计量: > describe(mtcars[vars]) vars n mean sd median trimmed mad...使用by()分组计算描述性统计量: doBy包和psych包也提供了分组计算描述性统计量的函数,doBy包中summaryBy()函数的使用格式为: summaryBy(formula,data=dataframe...()函数可计算和describe相同的描述性统计量,只是按照一个 或多个分组变量分层,使用psych包中的describe.by()分组计算概述统计量.

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    (数据科学学习手札19)R中基本统计分析技巧总结

    : 1.描述性统计量部分 1.1 计算描述性统计量的常规方法 summary() summary()函数提供了最小值、最大值、四分位数和数值型变量的均值,以及因子向量和逻辑型向量的频数统计: > #挂载鸢尾花数据...is.na(x)] + m mean(x) + n <- length(x) + skew mean(x))^3/sd(x)^3)/n + kurt 计算描述性统计量: 在psych包中,可以通过describe()来计算非缺失值的数量、平均数、标准差、中位数、截尾均值、绝对中位数、最小值、最大值、值域、偏度、峰度和平均值的标准误差...同样地,在R中完成这个任务有若干种方法: 利用aggregate()来对数据数组求描述性统计量: aggregate(data,by,fun),其中data为待考察的数据所在的数据框,至少有两列,其中一列为分组依据的类别型数据...()函数来创建SPSS风格的二维列联表: CrossTable()函数有很多选项,可以做许多事情:计算(行、列、单元格)的百分比;指定小数位数;进行卡方、Fisher和McNemar独立性检验;计算期望和的残差

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    R数据科学|3.6内容介绍

    上节我们对选择现有的列和使用mutate添加新列做了介绍。现在对数据框使用summarize()进行分组摘要进行介绍。...group_by() 和 summarize()的组合构成了使用 dplyr 包时最常用的操作之一:分组摘要。...3.6.2 缺失值 聚合函数遵循缺失值的一般规则:如果输入中有缺失值,那么输出也会是缺失值。好在所有聚合函数都有一个 na.rm参数,只需设置na.rm =TRUE,即可在计算前除去缺失值。...is_na()):对非缺失值的计数 n_distinct():计算出唯一值的数量 count():一个简单的辅助函数,用于只需要计数的情况 3.6.4 常用的摘要函数 位置度量:median(x),mean...x[2] 和 x[length(x)] 相同,只是当定位不存在时(比如尝试从只有两个元素的分组中得到第三个元素),前者允许你设置一个默认值。

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    手把手教你R语言方差分析ANOVA

    在R语言中,实现方差分析主要涉及到以下步骤:数据导入数据清洗ANOVA计算结果解析ANOVA评估首先,你需要一个数据集,其中包含至少一个分类变量(通常是因子类型)和一个或多个数值型变量。...在进行方差分析之前,你可能需要对数据进行一些预处理,例如处理缺失值(使用na.omit(), na.exclude(), na.fill()等函数)、转换数据类型(使用as.factor(), as.numeric...(N=n(), Means=mean(RR), SS=sum((RR - Means)^2), SD=sd(RR),...;Mean Sq列是平方和的平均值,通过将平方和除以每个参数的自由度来计算;F value列是F检验的检验统计量。这是每个自变量的均方除以残差的均方。...F值越大,自变量引起的变化越有可能是真实的,而不是偶然的; Pr(>F)列是F统计量的p值。这表明,如果组均值之间没有差异的原假设成立,那么从检验中计算出的F值发生的概率大小。

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    R语言数据分析利器data.table包 —— 数据框结构处理精讲

    n列,.N(总列数,直接在j输入.N取最后一列),:=(直接在data.table上添加列,没有copy过程,所以快,有需要的话注意备份),.SD输出子集,.SD[n]输出子集的第n列,DT[,....y求和 DT[, .N, by=x] #用by对DT 用x分组后,取每个分组的总行数 DT[, .SD, .SDcols=x:y] #用.SDcols 定义SubDadaColums(子列数据),这里取出...函数画图,对于每个x的分组画一张图 DT[, m:=mean(v), by=x] #对DT按x列分组,直接在DT上再添加一列m,m的内容是mean(v),直接修改并且不输出到屏幕上 DT[, m:=mean...(v), by=x] [] #加[]将结果输出到屏幕上 DT[,c("m","n"):=list(mean(v),min(v)), by=x][] # 按x分组后同时添加m,n 两列,内容是分别是mean...(y=max(y)), lapply(.SD, min)), by=x, .SDcols=y:v] #对DT取y:v之间的列,按x分组,输出max(y),对y到v之间的列每列求最小值输出。

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    「R」dplyr 列式计算

    ❝在近期使用 「dplyr」 进行多列选择性操作,如 mutate_at() 时,发现文档提示一系列的 「dplyr」 函数变体已经过期,看来后续要退休了,使用 across() 是它们的统一替代品,所以最近抽时间针对性的学习和翻译下...), sd)) #> n x y #> 1 NA 1 4.041452 这里 n 变成 NA 是因为 n 是数值的,所以 across() 会计算它的标准差,3(常量) 的标准差是...n, sd)) #> n x y #> 1 3 1 4.041452 其他动词 到目前为止,我们聚焦于 across() 和 summarise() 的组合使用,但它也可以和其他 「..._if, _at, _all 「dplyr」 以前的版本允许以不同的方式将函数应用到多个列:使用带有_if、_at和_all后缀的函数。这些功能解决了迫切的需求而被许多人使用,但现在被取代了。...」 的开发者们通过 across() 简化了 「dplyr」 对于一些数据复杂操作的处理逻辑,提高了整体的学习和使用效率,让我们使用者更关注于逻辑而非实现上。

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    Day-6 香波🐟

    summarise():汇总对数据进行汇总操作,结合group_by使用实用性强summary(test)#区分base包里的summary和dplyr包里的summarise函数summarise(test..., mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))# 计算Sepal.Length的平均值和标准差# 先按照Species分组,计算每组Sepal.Length的平均值和标准差...(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))# 计算Sepal.Length的平均值和标准差## mean(Sepal.Length) sd(Sepal.Length)##1...5.916667 0.8084965# 先按照Species分组,计算每组Sepal.Length的平均值和标准差 group_by(test, Species)## # A tibble...unique值dplyr处理关系数据即将2个表进行连接,演示数据来自生信星球1.內连inner_join,取交集2.左连left_join3.全连full_join4.半连接:返回能够与y表匹配的x表所有记录

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    day6-白雪

    引用于微信公众号生信星球须知R包是多个函数的集合,具有详细的说明和示例。...#含有多个函数使用的代码以及方法R包的安装和加载镜像设置# options函数就是设置R运行过程中的一些选项设置> options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn...) #dplyr下载的是一个安装包,解压在输,要不报错示例数据直接使用内置数据集iris的简化版:test dplyr 的五个基础函数mutate...(Sepal.Length), sd(Sepal.Length)) #计算每组的 mean(Sepal.Length)和 sd(Sepal.Length))# A tibble: 3 × 3 Species...引用自微信公众号生信星球图片count统计某列的unique值计算数据对象(vector、dataframe)的unique独特值: unique函数 从vector向量、dataframe 中 删除重复项

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    数据处理|R-dplyr

    %in% c("setosa","virginica")) 3)变量筛选(列) select函数:可以通过指定列名选择指定的变量进行分析,得到的为选择的列。...Width) #计算一个或多个新列并删除原列 6)数据汇总 summarize()函数实现数据集聚合操作,将多个值汇总成一个值 summarise(iris,avg = mean(Sepal.Length...Min ;Max Mean ;Median ;Var ;Sd等 summarise(iris, max(Petal.Width), first(Sepal.Width)) #返回数据框中变量的最大值及第一四分位值...Q:按品种分组,分别计算花萼宽度的均方差 summarise(group_by(iris,Species),sd=sd(Petal.Width)) 8)连接操作符 dplyr包里还新引进了一个操作符,%...iris %>%group_by(Species) %>% summarise(sd=sd(Petal.Width)) #iris数据集,按Species分组,汇总Petal.Width的sd值, 9)

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