使用python、Ubuntu OS从脚本调用命令行

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python、bioinformatics

我遇到了从脚本中调用命令行的困难。我运行了脚本，但没有得到任何结果。通过我的脚本中的这个命令行，我想运行一个工具，该工具生成一个文件夹，其中包含已经定义的每个line.The输入路径的输出文件。for line in inputFile: cmd = 'python3 CRISPRcasIdentifier.py -f %s/%s.fasta -o %s/%s.csv -st dna -co%s/'%(

浏览 13提问于2020-05-06得票数 0

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如何通过Python脚本使用./执行命令行程序？

python、ubuntu、subprocess、executable、pythonpath

使用Ubuntu，如果我cd到这个目录，那么我可以用$./program执行这个程序但是，我希望能够从Python脚本中执行此程序，但是当我尝试使用 import subprocess.run subprocess.run(".我正在通过Pycharm的终端运行python脚本。我想到我可以通过Ubuntu的终端运行python脚本，但我在Ubuntu找到正确

浏览 61提问于2020-06-11得票数 0

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使用os.system从python提示符执行命令

python、shell

我正在尝试使用python shell执行一些命令来导入模块ABC。为此，我创建了一个python文件test.py，其中包含以下行：os.system('python')现在，我尝试执行该文件，如下所示- python test.py。在这里，它正常运行到第二行，即os.system('python</e

浏览 2提问于2020-12-15得票数 0

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Shell命令仅在手动执行时才起作用，而不是从Python文件执行

python、shell、command-line、subprocess

我有一个运行Ubuntu 16.04的VPS，我正在使用Python自动执行一些任务。我编写了一个简单的脚本，使用newusers命令一次创建多个用户。我在脚本中首先做的是创建一个名为users.txt的文件，我将所有用户数据放在其中。之后，我在后面的脚本中对该文件调用newusers，以便实际创建用户。我尝试使用os和子进程模块来调用命令sudo newusers users.txt，但是，两者都

浏览 12提问于2019-04-22得票数 1

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从Python中执行命令行或R脚本文件时出现问题

python、r、shell、ubuntu

我目前正在使用optparse包，将一个R脚本文件作为接受C样式长和短标志的命令行可执行文件。这个程序正在Ubuntu上运行。整个应用程序的执行由Python脚本控制，该脚本(1)首先使用os.system对script.R文件调用chmod，如下所示：os.system("chmod +x script.R; export PATH=$PATH:

浏览 1提问于2015-09-15得票数 1

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如何使用python调用cshell脚本

command-line、python

如何使用python调用外部c- shell脚本？在Ubuntu中，命令行如下所示：如果我正在使用堆栈，并且所需的输入(date_ID和.zip文件)被保存为变量，我如何修改它。就像are文件在文本文件中一样，我将其保存到变量f中： date_ID

浏览 0提问于2018-10-09得票数 0

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调用python* cgi-bin中的外部函数*

python、apache、cgi、torch

我试图从脚本中调用一个Torch 7程序.如果我从命令行运行以下Python脚本：from subprocess import call call (['th', 'sample.lua', 'אמר הגאון הגרפקא המן איש טוב היה שנאמר"', '-temperature', '1.0',

浏览 0提问于2016-03-05得票数 0

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使用Nodejs执行python代码时获取错误路径

python、node.js

我正在使用从我的nodejs服务器调用python脚本。python脚本将打开一个名为myfile.txt的文件，并读取其内容：path = os.path.abspath("myfile.txt") f = open(path, 'r') 当我从python命令行执行Python代码时，它将正常运行，但当我试图从Nodej

浏览 1提问于2017-05-04得票数 0

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Windows 7 32位系统中的Python脚本执行错误

python、python-2.7

我已经在我的windows732位系统上安装了python 2.7.10。我已经创建了一个小脚本test.py并将其保存在文件夹D:\python27中。现在，当我从windows cmd执行test.py时，它运行得很好。但是，当我从命令行运行python，然后执行相同的命令test.py时，我得到了错误： File "<stdin>",line 1, in<module>NameError:name 'test' is

浏览 2提问于2015-09-09得票数 1

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如何使用Python从系统服务dbus插件启动gnome终端

python、systemd、dbus、gnome-terminal

我使用Python开发了一个简单的基于dbus的插件(dbus.service.Object)，它从命令行脚本中获取IPC调用。dbus服务被配置为在systemd中托管。它正在按预期运行。python脚本，并让脚本启动gnome终端，但仍然失败。我也尝试过使用os.system。如果直接从控制台运行，它就能工作。Os.system(‘gnome- -c - /bin&#

浏览 1提问于2018-12-20得票数 1

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使用Python查找平均颜色

python、colors、simplecv

有人能给我解释一下下面代码的main函数是如何工作的吗？在main函数中，average_image_color()函数接受sys.argv[1]的参数是什么意思？ h = i.histogram() r = h[0:256] b = h[256*2: 256*3] # per

浏览 2提问于2015-04-19得票数 0

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如何从从tcl脚本<- (modulefile脚本)运行的bashscript中检索输出

bash、shell、tcl、environment、modulefile

每个操作系统都有自己的程序副本，其中一个是Python：当I ssh I COMP2时，"python2“应该指向$HOME/Ubuntu/

浏览 2提问于2016-08-20得票数 0

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在python中使用$作为os.system参数的一部分*

python、os.system

命令：从命令行调用它与从python脚本调用它时具有不同的功能，如下所示：os.system(make foo -f $*)我意识到我可以编写一个.bat脚本，然后用python调用它，但我希望有更有

浏览 0提问于2016-07-28得票数 0

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从蟒蛇

python、linux

你好，我正试图从我的另一个脚本调用的外部python脚本中获得一个结果(我知道这个结果是1)。什么时候回波$？从命令行得到1，但当我尝试调用echo $时？为了从python脚本中获得结果，我在脚本中得到0。这是我的代码： os.system(pythonPath+"serialWait.py "+dev+" "+brate+"

浏览 3提问于2016-01-11得票数 0

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Bash脚本可以从命令行调用，但不能从Python脚本调用。

python、linux

我有以下脚本utils/pdf2image.shpdftoppm -png $1 $2script_path = os.path.join(os.getcwd(), 'utils', 'pdf2image.sh') + ' ' + invoice_path + ' ' + invoice_path[:-4] subprocess.call(script

浏览 3提问于2021-05-18得票数 0

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导入和设置python版本时遇到问题

php、python、python-3.x、command-line、anaconda

我在从不同的起点运行相同版本的Python时遇到了麻烦，这导致了导入到我的Python脚本的问题。3.7.4 (default, Aug 13 2019, 20:35:49) [GCC 7.3.0] 当我使用shell_exec('Python39:04) [GCC 7.4.0]

浏览 2提问于2019-10-21得票数 0

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如何从命令行运行不包含在if name=="main“中的单独函数？

python、shell

我有一个python文件，其中包含以下代码def sum(a, b): print("Hello") final()python test.pyHello现在，我想添加一个函数say，它将与命令line.How分开调用，我做了吗?def final():

浏览 0提问于2018-05-23得票数 2

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将命令发送到vim的python脚本(mvim)

python、vim、macvim

我写了一个非常简单的vim插件和python脚本，试图测试两者之间的一些通信。我的vim脚本如下所示： silent :!python helloworld.py然后我的python脚本如下所示： os.system(\'<CR>\"&#x

浏览 1提问于2011-05-08得票数 0

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Python，Pycharm - os.environ中缺少环境变量

python、pycharm

使用Python3.6、PyCharm 2019.3.1 CE、64位Ubuntu18.04 我有一个环境变量，它在从命令行运行python脚本时可以很好地访问，但在使用PyCharm运行时不会显示出来脚本是这样的： import os print(os.environ.get("GENICAM_GENTL64_PATH")) 在终端上，这是我的输出： :/usr/lib&#x

浏览 40提问于2021-02-02得票数 0

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Python，使用os.system -有没有办法让Python脚本在不等待调用完成的情况下跳过这一步？

python、django、command-line、os.system

我正在尝试使用Python (通过Django框架)来进行Linux命令行调用，并尝试了os.system和os.open，但对于这两种调用，Python脚本似乎在进行命令行调用后挂起，因为调用是为了实例化服务器我知道对于其他Python代码，你可以使用像芹菜这样的东西来做类似的事情，但我认为有一种简单的方法可以让它只进行命令行

浏览 1提问于2010-09-30得票数 6

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