我正在尝试将多个p值添加到我的堆叠条形图。我可以使用以下代码将单个p值添加到我的数据中: library(tidyverse)
library(ggprism)
library(rstatix)
RDT_Pos_genus_pval <- table(RDT_genus_ratio$Ag_RDT, RDT_genus_ratio$Genus_Cytb) %>% ##filtered to one group for example purposes
fisher.test() %>%
.
因此,我正在尝试创建类似这样的东西:
使用我自己的数据,特别是使用我在这里找到的p值:
现在,我能够用不正确的方法生成类似的东西。具体地说,我能够使用T测试产生类似的结果:
我通过编写以下代码生成了以下代码:
l<- ggplot(VioPos, aes(x=Regulation, y=Score,fill=Regulation)) +
geom_violin(trim=FALSE)+
labs(title="Plot of ARE Scores by Regulation",x="Gene Regulation", y = "ARE
我使用wilcox_test在分组条形图上执行统计。
在p.adj.signif中确定星号的截止点是什么?
尝试在这里进行检查(),但没有真正地发现执行此操作的代码。
类似的函数compare_means具有以下符号:
ns: p > 0.05
*: p <= 0.05
**: p <= 0.01
***: p <= 0.001
****: p <= 0.0001
这同样适用于wilcox_test吗?请你提供消息来源好吗?
我正试图构建一个数据可视化软件包,它严重依赖于ggplot2,但对于我每天面临的一些问题,我有一些定制的快捷方式。
我可以使用ggplot_add函数从脚本中扩展自定义类的+功能,但是当我将这些脚本添加到包中时,ggplot_add就不再工作了。
下面我粘贴一个minrep,要复制第一个需要创建一个包(我使用的是RStudio),这个包我已经调用了SOExa。该项目包含以下文件:
.Rbuildignore
^.*\.Rproj$
^\.Rproj\.user$
描述
Package: SOExa
Type: Package
Title: An minrep for a problem I
假设您想要创建一个如下所示的图形。
我想使用基于的ggplot2函数。如何添加空图以获得具有多重图的三角形输出?
MWE如下:
library(ggplot2)
# Multiplot function from http://www.cookbook-r.com/Graphs/Multiple_graphs_on_one_page_(ggplot2)/
multiplot <- function(..., plotlist=NULL, file, cols=1, layout=NULL) {
library(grid)
# Make a list from the
想要在一页上画两幅图片。以为例,它不起作用。错误是could not find function "multiplot"。
但是ggplot2是可绘制的,我也重新安装了R、ggplot2、重新启动等等。我做错了什么吗?
library(ggplot2)
# This example uses the ChickWeight dataset, which comes with ggplot2
# First plot
p1 <-
ggplot(ChickWeight, aes(x=Time, y=weight, colour=Diet, group=Chick))