在使用sbatch file.slurm提交slurm作业后，您将获得一个作业ID。您可以使用squeue和sacct来检查作业的状态。但都不会返回作业的原始提交命令(sbatch file.slurm)。是否有一个命令可以显示提交命令，即sbatch file.slurm？我需要将作
浏览 8提问于2020-03-05得票数 0
我一直在使用一个由200个节点组成的集群，每个节点有32个核心，用于模拟随机过程。在我的sbatch脚本中，我有以下内容： # Specify the number of nodes(nodes=) and the number of cores per nodes(tasks-pernode=) to be used#SBATCH --ntasks-per-node=32 ..。/main，直到使用了list.dat的所有行(10000行)。 有没有办法将这些未<e
浏览 20提问于2020-10-23得票数 1
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我使用--array运行slurm作业数组，我想运行大约2000个任务/数组项。但是，这超出了集群一次提交约500个作业的限制。
有没有什么小贴士/最佳实践来拆分这一切呢？我想一次提交所有的数组，如果可能的话，仍然可以将数组id参数1-2000传递给我的程序。我认为像等待提交数组片段这样的事情可能会有帮助，但目前我不确定如何做到这一点。
浏览 0提问于2020-11-10得票数 0
plotConvergence.py i 然后，我使用另一个bash文件slurm_run_all.sh提交所有这些任务 #!/bin/bash sbatch slurm_run_$i.sh
done 这是可行的(集群上正在运行50个作业)，但是我发现输入文件超过50个是很麻烦的。在寻找解决方案时，我想出了&命令，获得了如下内容： #!但是，我不能单独管理这些作业：squeue的输出
浏览 38提问于2020-04-16得票数 1
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我是一名癌症研究人员，我们想知道你们中是否有人知道如何编写一个调用其他SLURM的SLURM脚本。如果上一个脚本成功完成，则继续执行下一个调用。也就是说，类似于：#SBATCH --nodes=1 #SBATCH --time=24:00:00#call first
浏览 7提问于2018-12-07得票数 2
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我是slurm的新手，我正在尝试对shell脚本进行批处理，以便写入文本文件。我的shell脚本(标题为"troublesome.sh")如下所示：#SBATCH -N 1
echo "It worked!"当我运行sh troublesome.sh > doeswork.txt时，它会写“它成功了！”如预期的那样传送到doeswork.txt。但是，当我运行sbatch trouble
浏览 4提问于2020-06-24得票数 0
我使用的计算机集群有20个节点，每个节点有16个CPU。我尝试使用"sbatch XX.sbatch“命令向所有节点提交1,000个作业。我想要的是320个作业同时运行，即每个节点16个作业，或每个CPU 1个作业。#!/example.sh
我注意到每个节点上只有一个作业在运
浏览 6提问于2021-03-11得票数 0
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在SLURM中，我可以很容易地指定用于在作业脚本中登录的文件：#SBATCH --error=logs/error-%j我怎么能做到这一点？(主要的困难似乎是获取%j)。
浏览 3提问于2017-07-30得票数 0
我有一个shell脚本，它向SLURM提交多个作业。这些作业是在以下循环中提交的：slurmids=() # storage of slurm job ids
for k in $(seq 1 $nb_partitions除了提交作业外，此循环还创建数组slurmids，该数组包含所有SLURM作业的作业ids列表。现在，我有另一个SLURM<e
浏览 2提问于2021-07-01得票数 1
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有没有办法使用sbatch将作业id记录到一个变量中，将作业提交给slurm？job_id = sbatch --account my_account some_script.sh
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浏览 21提问于2020-09-24得票数 2
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我使用的集群刚刚切换到SLURM，我试图做一些我认为非常简单的事情。我认为我需要使用#SBATCH --array=0-29来调用文件的数量，而$SLURM_ARRAY_TASK_ID也涉及到这个问题。#SBATCH --ntasks=1#SBATCH --mem=4G
#SBATCH --array=0-29
浏览 0提问于2018-09-17得票数 0
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我正在尝试使用slurm提交一组作业，但它并不像我预期的那样工作。我的bash脚本是test.shecho $SLURM_ARRAY_TASK_IDpython test.pyprint('TEST MESSAGE 2')sbatch --wrap="bash test.sh"
我甚至不确定我是否该这么做因为bash
浏览 1提问于2022-07-12得票数 0
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这个问题与普林斯顿研究计算引入SLURM一文有关。例如,SBATCH在第一个#之后将被执行，而在第二个#之后的create
浏览 0提问于2019-11-05得票数 2
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我有一个问题，我需要启动相同的脚本，但使用不同的输入参数。因此在实践中，我需要运行独立于NxM的作业。因为每个批处理作业都有相同的节点/cpu配置，并调用相同的python脚本，除了更改输入参数之外，原则上，在伪语言中，我应该有一个sbatch脚本，它应该执行以下操作：#SBATCH --partition=gpu2#SBATCH --cpus-per-task=4
for p1 in 0.05 0
浏览 5提问于2017-01-28得票数 9
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我正在尝试向Slurm服务器提交大量作业(数百个)，并希望避免为我想要运行的每个作业提交新的shell脚本。提交的代码是一个Python脚本，它接受shell脚本中的两个输入变量，并且这些变量是在不同作业之间唯一变化的变量。以下是适用于单个作业的简短shell脚本的示例： #!/bin/bash
#SBATCH -t 01:00:00
srun python retr
浏览 1898提问于2021-04-02得票数 0
我正在运行一个bash脚本，使用SLURM在Linux集群上运行作业。脚本的相关部分如下所示(slurm.sh)：#SBATCH -p parallel#SBATCH --exclusive#SBATCH -e err.log#SBATCH --open-mode=append
#S
浏览 2提问于2014-05-30得票数 0
在bash/slurm中是否有一种方法可以让脚本知道它运行在哪个节点上？
因此，我编写了一个名为wrapCode.sh的bash脚本，并且监视脚本时间以及它在哪个节点上运行。sstat是这样做的，但是我需要知道我的工作id是什么，脚本似乎也不知道这个id(或者至少我还没有找到它)。
浏览 7提问于2017-05-12得票数 4
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将参数传递到slurm脚本
、、、、
我使用slurm脚本在集群上运行用于Matlab计算的数组。每个脚本都使用一个数组来循环matlab参数。#SBATCH --array=1-128matlab -nodesktop r "frame=[${SLURM_ARRAY_TASK_ID}]; filename=['Person24这意味着我将提交作业(S批处理exam
浏览 0提问于2019-06-18得票数 2
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我在linux集群中提交了我的作业(使用SLURM调度作业)，但每个分区的时间限制只有24小时(实际上这个限制是由管理员设置的)，而且我的代码似乎需要运行一周以上(根据我的猜测)。我是SLURM脚本的新手，对以下内容之间的相互作用略知一二：#SBATCH --ntasks-per-node=#SBATCH--ntasks-pe
浏览 1提问于2021-04-23得票数 2
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