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使用Apriori进行关联分析(如何挖掘关联规则)

书接上文(使用Apriori进行关联分析(一)),介绍如何挖掘关联规则。 发现关联规则   我们的目标是通过频繁项集挖掘到隐藏的关联规则。   所谓关联规则,指通过某个元素集推导出另一个元素集。...一个具有N个元素的频繁项集,共有M个可能的关联规则: ?   下图是一个频繁4项集的所有关联规则网格示意图, ? ?   ...对于寻找关联规则来说,频繁1项集L1没有用处,因为L1中的每个集合仅有一个数据项,至少有两个数据项才能生成A→B这样的关联规则。   当最小置信度取0.5时,L2最终能够挖掘出9条关联规则: ?   ...因为书中的代码假设购买商品是有顺序的,所以在生成3后件时,{P2,P4}和{P3,P4}并不能生成{P2,P23,P4},如果想去掉假设,需要使用上篇中改进后的代码。   ...- conseq, conseq, conf)) prunedH.append(conseq) #返回后件列表 return prunedH # 对规则进行评估

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使用plink进行casecontrol关联分析

本篇文章按照plink官方提供的教程,进行一个实际操作。可以看做是官方教程的一个翻译版本。...主要包括以下几个参数 --mind : 对样本进行过滤,去除缺失基因型频率大于给定阈值的样本 --maf: 对SNP位点进行过滤,去除MAF小于给定阈值的SNP位点 --geno : 对SNP位点进行过滤..., 去除缺失基因型频率大于给定阈值的SNP位点 --hwe : 对SNP位点进行过滤, 去除不符合哈温伯格平衡的SNP位点。...替换成二进制之后,原始的ped和map中的信息,用bed, bim, fam三个文件进行存储。 4....关联分析 进行疾病和突变位点基因型之间的关联分析,命令如下 plink --bfile hapmap1 --assoc --out as1 --noweb 输出结果如下 CHR SNP BP A1 F_A

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Scipy使用简介

optimize模块提供了许多数值优化算法,这里主要对其中的非线性方程组求解、数值拟合和函数最小值进行介绍 非线性方程组求解 fsolve()可以对非线性方程组进行求解,它的基本调用形式为fsolve(...如果方程组中的未知数很多,而与每个方程有关联的未知数较少,即雅各比矩阵比较稀疏的时候,将计算雅各比矩阵的函数最为参数传递给fsolve(),这能大幅度提高运算速度 def j(x): x0,x1...result)) [ 0.70622057 -0.6 -2.5 ] [0.0, -8.881784197001252e-16, 0.0] 最小二乘拟合 在optimize模块中,可以使用...leastsq()对数据进行最小二乘拟合。...下面将使用来实现各个算法 import numpy as np from scipy import optimize def target_func(x,y): return (1-x)**2+

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面试官让你使用 scipy.fft 进行Fourier Transform,你会吗

有关该库的更一般介绍,请查看Scientific Python:使用 SciPy 进行优化。 安装 SciPy 和 Matplotlib 在开始之前,您需要安装 SciPy 和Matplotlib。...除非您有充分的理由使用scipy.fftpack,否则您应该坚持使用scipy.fft. scipy.fft 对比 numpy.fft SciPy 的快速傅立叶变换 (FFT)实现包含更多功能,并且比...通常,如果您需要查看信号中的频率,则需要进行傅立叶变换。如果在时域中处理信号很困难,那么使用傅立叶变换将其移动到频域中是值得尝试的。在下一节中,您将了解时域和频域之间的差异。...如果你知道你只会使用实数,那么这是一个值得了解的速度技巧。 现在您有了信号的频谱,您可以继续对其进行滤波。...再一次,您需要在将信号写入文件之前对其进行标准化。

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【机器学习实战】第11章 使用 Apriori 算法进行关联分析

第 11 章 使用 Apriori 算法进行关联分析 关联分析 关联分析是一种在大规模数据集中寻找有趣关系的任务。...使用该原理就可以避免项集数目的指数增长,从而在合理的时间内计算出频繁项集。...Apriori 算法流程步骤: * 收集数据:使用任意方法。 * 准备数据:任何数据类型都可以,因为我们只保存集合。 * 分析数据:使用任意方法。 * 训练数据:使用Apiori算法来找到频繁项集。...* 使用算法:用语发现频繁项集以及物品之间的关联规则。 Apriori 算法的使用 前面提到,关联分析的目标包括两项: 发现 频繁项集 和发现 关联规则。...分级法: 频繁项集->关联规则 1.首先从一个频繁项集开始,接着创建一个规则列表,其中规则右部分只包含一个元素,然后对这个规则进行测试。

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使用 NumPy 和 SciPy 创建 PyTorch 扩展

官方教程链接: CREATING EXTENSIONS USING NUMPY AND SCIPY 该教程主要有两个任务: 使用 NumPy 实现无参数的网络 使用 SciPy 实现有参数的网络 使用...NumPy 实现无参数的网络 下面使用的这层网络没有做任何有用的或者数学上正确的计算,所以被称为 BadFFTFunction。...SciPy 实现有参数的网络 在深度学习文献中,这一层被混淆地称为卷积,而实际操作是 cross-correlation (唯一的区别是卷积时会翻转滤波器,而 cross-correlation 不翻转...from numpy import flip import numpy as np from scipy.signal import convolve2d, correlate2d from torch.nn.modules.module...1.1731e+00, 5.9753e-01, -1.8710e-01, 1.7740e-01, -5.7756e-01, 3.6896e-01, -6.6725e-02]]) 最后进行一下梯度校验

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机器学习实战 - 读书笔记(11) - 使用Apriori算法进行关联分析

前言 最近在看Peter Harrington写的“机器学习实战”,这是我的学习心得,这次是第11章 - 使用Apriori算法进行关联分析。...基本概念 关联分析(association analysis)或者关联规则学习(association rule learning) 这是非监督学习的一个特定的目标:发现数据的关联(association...关联分析的目标包括两项:发现频繁项集和发现关联规则。首先需要找到频繁项集,然后才能获得关联规则。 频繁项集告诉我们哪些项集会经常出现,以及出现的支持概率。...关联规则告诉我们频繁项集中出现的关联规则,哪些原因项的出现决定另外一些结果项的出现,以及规则的可信概率。 关联(association) 一个关联是一个满足最小支持度的项集。...关联规则(association rule) 关联规则 前提集(antecedent) 也称为前件、左手边。是关联规则 的 部分。

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【收藏】万字解析Scipy使用技巧!

optimize模块提供了许多数值优化算法,这里主要对其中的非线性方程组求解、数值拟合和函数最小值进行介绍 非线性方程组求解 fsolve()可以对非线性方程组进行求解,它的基本调用形式为fsolve...如果方程组中的未知数很多,而与每个方程有关联的未知数较少,即雅各比矩阵比较稀疏的时候,将计算雅各比矩阵的函数最为参数传递给fsolve(),这能大幅度提高运算速度 def j(x): x0,x1...)) [ 0.70622057 -0.6 -2.5 ] [0.0, -8.881784197001252e-16, 0.0] 最小二乘拟合 在optimize模块中,可以使用...leastsq()对数据进行最小二乘拟合。...下面将使用 来实现各个算法 import numpy as np from scipy import optimize def target_func(x,y): return (1-x)**

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Apriori 算法-如何进行关联规则挖掘

关联分析除了可以用于零售行业外,还可以用于网站流量分析和医药行业等。 Apriori 算法是一种发掘事物内在关联关系的算法,它可以加快关联分析的速度,从而让我们更有效的进行关联分析。...2,三个重要概念 关联分析中有三个重要的概念,分别是: 支持度 可信度 / 置信度 提升度 支持度 要进行关联分析,首先要寻找频繁项,也就是频繁出现的物品集。那么怎样才叫频繁呢?...image.png 5,Apriori 算法的实现 这里,我们使用Apriori 算法来寻找上文表格中的购物清单的频繁项集(为了方便查看,我把表格放在这里)。...使用 apriori 函数 首先,将表格中的购物清单转化成 Python 列表,如下: data = [ ('牛奶', '面包'), ('牛奶', '面包', '火腿'), (...另外,还有CBA 算法,GSP 算法等,都对Apriori算法进行了改进,这里不再详细介绍。 (本节完。)

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为什么使用进行关联运算比表Join更具吸引力?

但在实际使用中,特别是在流式更新的数据中,这种方式存在诸多痛点。痛点一:关系运算成本高表模型的重点在于多条记录统一描述为表,但本身缺乏关系描述能力,只能通过Join运算来完成关系的计算。...由于表与表之间一对多的关联关系,导致一张表的数据通过关联会放大多份,造成数据量指数级膨胀和冗余。而且宽表一经生成就难以更改,否则需要重新生成新宽表,费时费力,不够灵活。...痛点三:复杂关系查询难以描述使用表建模的分析系统只支持SQL join一种方式进行关系分析,这在复杂场景中能力十分局限。...GeaFlow提供融合GQL和SQL样式的查询语言,这是一种图表一体的数据分析语言,继承自标准SQL+ISO/GQL,可以方便进行图表分析。...图片图4图4展示了GeaFlow使用Match算子在图上进行多跳关联查询,相比Flink的Join算子带来的实时吞吐提升。

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