修正的SIR模型

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python、numpy、graph、networkx、eon

我正在制作一个修改的SIR模型，添加了疫苗接种参数V。InitIALLY图中的所有节点都是易感的，并且有一些最初感染的人。首先接种prob (即不会被感染)，然后再感染prob，接种的总人数由V1控制，V1是总人口的一小部分。random import sample def discrete_SIRinitial_in

浏览 6提问于2019-07-08得票数 0

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修正SIR模型以包含随机性

r、parameters、poisson、stochastic

我试图建立一种传染病参数的估计方法，通过将实际流行病曲线与随机SIR模型的模拟结果进行比较。为了构造随机SIR模型，我使用deSolve包，而不是使用固定的参数值，而是从以原始参数值为中心的泊松分布中提取方程在每个时间点使用的参数值。[2])) gamma_p <- 1/infectious_period_p times <- seq(from = 0, to = 50,by

浏览 8提问于2021-05-31得票数 3

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我已经创建了上述模型的一些非常基本的实现。然而，虽然图表看起来是正确的，但这些数字加起来并不等于一个常数。也就是说，每个隔间中易受感染/感染/恢复的人的总和应该等于N(这是总人数)，但由于某种原因，它不会加成一些奇怪的十进制数，而且我现在看了3天之后，真的不知道如何修正它。plt.ticklabel_format(style='sci', axis='y', scilimits=(0,0)) plt.xlab

浏览 1提问于2017-11-18得票数 4

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Rstudio中的SIR模型

r、shiny

我正试图在Rstudio中构建基本的SIR模型。模型采用2个参数(β=感染率/天，γ=恢复日/天)，3个初始值(S =敏感数，I=传染性，R=恢复)，最后变量为时间(以天为单位)。下面是R标记中的代码： with(as.list_1 <- ode( time

浏览 3提问于2020-01-23得票数 0

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识别拥抱面板管道填充掩码所选的单词

python、neural-network、nlp、huggingface-transformers

我想使用拥抱脸的填充面具管道猜测一个蒙面令牌，然后提取只是猜测的令牌作为一个词。这个代码应该这样做： !

浏览 8提问于2020-04-09得票数 2

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如何将变量从javascript (coffeescript)传递到rails控制器？

javascript、ruby-on-rails、coffeescript

我想这应该很简单，但我想不出来link_to( "#{sir.sir_id}" , '#', :data => {'sir-id' => sir.id}, remote: true ),$ -> $("a[data-sir</

浏览 0提问于2013-10-27得票数 1

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不带ode函数的SIR模型

r、ode

我已经得到了基本的SIR模型以下代码。我需要在没有ode()函数或任何其他函数的情况下求解微分方程。你能帮我在不使用ode()函数的情况下计算这个微分方程吗？y = initial_values, func = sir_equations, plot(sir_values_1$val$time, sir_val

浏览 2提问于2020-02-18得票数 0

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Rstudio中的Rshiny SIR模型

我正在尝试使用Rshiny和SIR()模型创建交互式绘图。基本上，我想要5个滑块输入，这是贝塔，伽马，S，I和R，并输出一个S，I，R在一个特定的时间绘图。下面是我在Rstudio中的代码。忽略S+I+R应等于1的事实。有什么建议是错误的吗？value = 1e-06 + 1e-06), ) val <- SIR</

浏览 7提问于2020-06-22得票数 0

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改变SIR模型的恢复率

python、numpy、networkx、eon

collections import Counter S, V, I, R = discrete_SIR(G,w,initial_infecteds=initial_infections,beta=0.5,Vl=1,du

浏览 0提问于2019-07-29得票数 0

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基于NumPy和Plotlib的SIR模型

python、numpy

对于我的一个作业，我正在用phyton上的Runge Kutta-4写一个简单的SIR模型，然而，我似乎遇到了某种障碍，因为我的模型总是解析成垂直线或水平线，而不是它应该的逻辑曲线，我找不到问题所在，import numpy as np

浏览 5提问于2021-10-10得票数 0

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用于SIR模型的耦合ODE的集成与拟合

python、scipy、model、curve-fitting

在这种情况下，有3个ODE描述了SIR模型。问题来了，我想要计算哪些beta值和gamma值最适合于来自x_axis和y_axis值的数据点。我目前使用的方法是从odeint库和来自同一个库的curve_fit方法集成使用scipy的ODE。在这种情况下，您如何计算β和gamma的值来拟合数据点？当前的错误是：ValueError: operands could not be broadcast together with shapes (3,) (1

浏览 13提问于2022-09-24得票数 0

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SIR流行病模型的MATLAB优化

matlab、curve-fitting

我正在尝试使用SIR模型对流感流行进行建模：。我的任务是将图表与一组数据进行拟合，我只是想知道我应该如何进行这项工作。我已经成功地建立了一个系统来解决如下的ODE：B = p(1);S = y(1);R = y(3);以及调用它的m文件：y0 =

浏览 4提问于2013-05-23得票数 1

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基于SIR模型的疾病暴发模拟

c++

我有一个作业，我必须写一个C++程序来模拟疾病爆发使用SIR模型(易感，传染性，恢复期)。要求是使用7x7大小的2D数组，其中用户将选择X和Y坐标来初始化感染者。s s s s s s s s s s s s s s s s 到目前为止，我只能检查位置(1,1)，(1,7)，(7,1)，(7,7)中的状态如果接下来的三个位置旁边有一个被感染的人，它会将状态更新为nextDayState。下面是到目前为止我为两个函数SpreadingDiseas

浏览 0提问于2018-10-18得票数 0

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R中的SIR模型:错误的y边界

我使用了SIR model并设置了initial conditions at S= 600, I = 1 and R=0。inits <- c(S=600, I=1, R=0) }) # end of

浏览 2提问于2014-07-17得票数 0

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输出保持不变，实际上应该不断变化

c++

我正在开发一个叫做SIR模型的流行病模型，其中t表示执行时间应该保持从0到10的时间，但我的输出在10保持不变。我在下面的代码中做错了什么？#include<iostream> using namespace std; { SIR(double bCurr, double kCurr, do

浏览 1提问于2016-11-15得票数 0

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MATLAB中离散SIR模型的分叉图

matlab、modeling

我的MATLAB代码在显示离散SIR模型的分叉图时遇到了问题。我的模型是： S(n+1) = S(n) - h*(0.01+beta*S(n)*I(n)+d*S(n)-gamma*R(n)) I(n+1) = I(n) + h*beta*S(n)*I(n)-h*

浏览 18提问于2021-01-02得票数 1

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SIR python模型中的变化参数

python、variables、parameters、jupyter

我正在使用python中的SIR模型的改编来模拟流感大流行。我的模型包括疫苗接种计划，因此我有一个参数(epsilon)，它代表疫苗接种推出率。我需要epsilon在不同的时间间隔之间变化。epsilon_result = epsilon(t)# A grid of time points (in days) # Initi

浏览 9提问于2021-04-29得票数 1

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防止Gillespie随机模型运行负值

r、modeling、stochastic、stochastic-process

我已经建立了一个随机的感染模型(寄生虫)，使用Gillespie。模型使用了“GillespieSSA”包()。简单地说，代码模拟了一个离散空间的总体。舱室之间的移动取决于用户定义的速率方程。SSA算法计算给定时间步长(τ)的每个速率方程产生的事件数，并相应地更新总体，处理重复到给定的时间点。,sir.a,sir.nu,sir.parms, method="ETL&quo

浏览 3提问于2016-06-10得票数 3

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在coffeescript中，如何使变量在控制器中可用，并通过ajax返回结果以填充datatable？

ajax、json、datatable、coffeescript

，我有一个想要在单击时触发ajax事件的链接，它有一个data属性，我以这种方式在coffeescript中获取数据属性的值： data_s

浏览 5提问于2013-10-26得票数 2

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如何用R绘制一个参数的不同值的同一变量的几条曲线？

r、plot、system、ode

我正在使用一个使用R的SIR模型，对于不同的β值，例如0.001、0.002、0.003、0.004和0.005，我需要在相同的图形上绘制多条I曲线。下面给出了我迄今为止一直在使用的代码。我知道这可能是一个非常简单的问题，但我对R还不熟悉，也找不到任何有用的东西。library(deSolve) with(as.list

浏览 13提问于2022-11-20得票数 3

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