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去除细胞效应和基因效应

其实质量控制三部曲,还有一个很关键的点没有讲解,就是多个样本整合,并且区分批次效应和生物学差异。...所以我这里把归一化和标准化替换成为去除样本/细胞效应或者去除基因效应: 首先去除样本/细胞效应:因为不同样本或者细胞的测序数据量不一样,所以同样的一个基因在不同细胞,哪怕你看到的表达量是一样的,但是背后细胞整体测序数据量的差异其实反而说明了这个基因在不同细胞表达量其实是有差异的...然后去除基因效应,这个主要是在绘制热图的时候会需要使用,因为个别基因表达量超级高,在热图里面一枝独秀,实际上我们并不会关心不同基因的表达量高低,我们仅仅是想看指定基因在不同细胞的高低而已,这样的话,就把该基因的表达量在不同细胞的数值...0.2761133 -0.2761133 -0.2337521 HES2 -0.4569104 -0.4569104 -0.4569104 -0.4569104 -0.4569104 其实样本/细胞效应不仅仅是文库大小...每个细胞测序数据量的不一致是很容易理解的,但其实细胞之间还有很多其它效应,比如线粒体基因含量,ERCC含量等等,那些处理起来,其实就是深入了解我们讲解seurat里面的NormalizeData和ScaleData

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啁啾效应

前面一篇笔记高速直调激光器里提到啁啾效应,COO对此比较感兴趣。我解释了下,说是的频率随时间变化,就像小鸟叽叽喳喳的叫声。COO不是特别满意,所以这篇详细地讲一讲啁啾效应。...场的相位随着时间发生变化,其瞬时频率定义为相位对时间的导数, ? 如果相位随时间线性变化,频率保持不变。如果相位是二次型相位或者更高阶,的频率就会随时间变化,也就是所谓的啁啾。...在直调激光器中,由于注入电流的变化,引起载流子浓度的变化,导致激光器折射率的变化,使得场的相位随时间变化,产生啁啾效应。...(图片来自 http://slideplayer.com/slide/5740423/) 在超快光学中,超短脉冲中含有多个频率的,当该脉冲经过某一介质时,由于材料的色散,不同频率的群速度不一样,使得脉冲波包中不同位置处的频率随时间变化...由于啁啾效应脉冲中不同频率的群速度大小不一,例如红光速度快,蓝光速度慢,导致最终叠加起来的脉冲宽度变大。如何消除啁啾效应

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门面效应

”门面效应“又叫“留面子效应”与”登门槛效应“正好相反,是指在请求别人帮忙的时候,可以先提一个大忙,等对方拒绝后,再提一个小忙。对方这时候大概率会倾向于接受。...“门面效应”利用的是人们的补偿心理,正如”登门槛效应”所说的那样,人们往往都希望扮演慷慨大方的角色,所以拒绝别人也是一件难事。拒绝一般会让人无法扮演慷慨大方的角色,会让人产生愧疚的心理。...这一效应在美国心理学家西阿弟尼等人 1975 年做的实验中也得到了印证。实验对三组人员做对照组测试。...可见,运用这种让步术的效应是十分明显的。那这个实验是不是说明了“门面效应”比”登门槛效应“更有用?...总结,”门面效应“与”登门槛效应“都是生活中请求别人帮助的一种策略、每个人在具体使用中会有不同的效果。实际才是检验真理的唯一标准。

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计量模型 | 固定效应与交互固定效应

这期推送简单谈一下我本人对固定效应与交互固定效应一些或许不太成熟的理解。...设想一种极端情况,被解释变量$y$只对核心解释变量$x$做回归,其他影响$y$的因素都放到残差项中,这种情况下$x$的估计系数就不再代表$x$影响$y$的净效应了,而是参杂了其他因素对$y$的影响,因为...一般而言,在回归方程中引入FE有两种方法(见上期推送『计量模型 | 时间固定效应与时间趋势项』),下面基于tabulate的方法具体分析。...况且,就算不存在企业跨行转移的情况,也可以通过附上时变因素来规避共线性的问题,即行业 - 年份FE(具体引入方法见上期推送『计量模型 | 时间固定效应与时间趋势项』)。 这里就引入了交互FE的话题。

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Nature neuroscience:遗传调控需要谨慎解释光热效应对神经元放电的影响

,研究中常用的遗传调控光照强度会引起局部脑组织0.2-2摄氏度的升温,这种光热效应会抑制神经元的放电。...因此,在遗传调控研究中,需要谨慎选择刺激参数,并且在解释实验结果时需要考虑光热效应对神经元放电影响这个因素。...图1h表示,刺激过程中神经元的放电频率比刺激前、后都要显著降低,这说明,光热效应会显著抑制神经元的放电。而图1i、j、k和i表明,这种光热抑制效应会在脑内多种神经元上表现出来。...,研究中常用的遗传调控光照强度会引起局部脑组织0.2-2摄氏度的升温,这种光热效应会抑制神经元的放电。...本研究的实际意义在于,我们在进行遗传研究时,特别是在对光遗传研究结果进行解释时,必须要考虑光热效应对神经元放电影响这个因素。

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一篇文章了解保偏光纤原理、快慢轴、保偏拍长、消

保偏光纤是如何影响光纤内的双折射效应?...保偏光纤在拉制过程中,当线偏振沿光纤的一个特征轴传输时,部分光信号会耦合进入另一个与之垂直的特征轴,最终造成出射偏振信号偏振消比的下降,从而影响了双折射效应。 如何制造保偏光纤?...常用的引入高双折射的方法可在预制的光纤芯中引入几何对称的不均匀应力来实现,通过在纤芯两侧加入两种改进玻璃组分的应力。...应力型保偏光纤主要是依靠嵌入的应力和光纤纤芯的热膨胀系数的不同来产生热应力,在热应力作用下导致材料折射率的变化,从而产生双折射效应。...应力与光纤纤芯平行,施加的应力在光纤纤芯内产生双折射,有利于仅延一个方向偏振传播,从而维持保偏工作。熊猫型应力是圆柱形的,而领结型采用梯形棱镜应力

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登门槛效应

“登门槛效应“又称”得寸进尺效应“是指一旦接受了他人一个微不足道的请求,为了避免认知上的不协调(比如我友好助人),或者想给他前后一致的印象,就有更大概率接受他更大的一个请求。...这个效应对我们日常生活很有用,如果我们请求他人帮忙,可以先请求帮一个小忙,微不足道的忙。...这就是登门槛效应的作用。在日常生活中,人都希望别人对自己能有一个正面评价。 更重要的一点是,别人请求我们帮忙时候,我们要警惕登门槛效应。遵循自己的原则。...延伸一下,在工作中,我们在制定目标时,也要符合登门槛效应,从小到大,一步一步来。目标的难度一定要"跳一跳就能够得着的”,跳一跳是指具体的执行方式,作为管理者要教下属拆解关键指标和关键结果。...总结,这个效应在日常生活中真的好用,比如追女/男孩子、与客户建立关系、孩子的教育。可谓是只要细想、处处都能用。

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浅谈市值效应

市值是股票市场上一个非常重要的属性,本文梳理对于市值效应的一些观点,欢迎指正。...小市值效应 市值效应,或者说小盘股溢价效应,最早由Banz(1981)提出,他发现美国市场中,小盘股票相比于大盘股票有更为突出的表现,因此市值效应往往也被称为小市值效应。...因此壳价值是导致市值效应的重要原因。 但壳价值也并不是唯一原因,一方面,国外市场并没有壳资源,但也同样具有小市值效应。...逆转的市值效应 从图1图2的收益净值可以看出,2017年之前,小市值效应是明显存在的,效果非常好,但2017年之后,就不太行了。...总结 综上,这是一篇并不量化的文章,简要梳理了对于市值效应的一些观点。

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频梳与传输?

在这种情况下,频梳发生器(FCG)作为一种紧凑、固定的多波长光源,可以提供大量定义明确的载波,从而发挥关键作用。...另外,频梳的一个特别重要的优势是,梳状线在频率上本质上是等距的,因此可以放宽对信道间保护带的要求,并避免了在使用DFB激光器阵列的传统方案中需要对单条线进行的频率控制。...此外,使用带有锁相功能的LO梳状信号进行并行相干接收,甚至可以重建整个波分复用信号的时域波形,从而补偿传输光纤的非线性造成的损伤。...这种波分复用链路的性能显然在很大程度上取决于基本的梳状信号发生器,特别是光线宽和每条梳状线的功率。 当然,频梳技术还处于发展阶段,其应用场景和市场规模相对较小。...如果它能够克服技术瓶颈、降低成本并提高可靠性,那么在传输中将可能实现规模级的应用。

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令牌网络效应

令牌的数量必须适应越来越多的交易,因此会增加GNT的需求和价格,并加速网络效应。 随着人工智能等技术的各项进步,网络效应已经发展到与这些创新相匹配的地步。...网络效应 网络效应的概念非常简单:随着更多人使用网络,网络变得更有价值。...数据网络效应 随着时间的推移,网络效应随着技术的进步而发展。例如,今天我们拥有数据网络效应 —— 构建数据生态系统的平台,并利用机器学习来创造更好的产品体验。...——Chris Dixon 341852200769254116.jpg 令牌网络效应 当网络的增长与令牌的升值一致时,会出现令牌网络效应。...从这些示例中可以看出,令牌网络效应允许飞轮随着网络变大而加速并变得更加强大。它推动项目达到临界质量,由于令牌网络效应,簇生出赢家通吃时代。

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机械开关& MEMS开关

光纤通信系统中,开关(Optical Switch,OS)主要用于路中实现信号的物理切换或其他逻辑操作,多用于交叉连接OXC(Optical Cross-connect)技术中作为切换路的关键器件...开关在光纤通信系统中有着广泛的应用,其实现技术多种多样,包括:机械开关、热开关、声光开关、电光开关、磁开关、液晶开关和MEMS开关,等等。...其中机械开关和MEMS开关是目前应用较为广泛的两种开关。 机械开关的工作原理是借助机械装置物理地移动光纤来重定向光信号。通过移动棱镜或定向耦合器,将输入端的导向所需要输出的端口。...机械式开关分主要有3种类型:一是采用棱镜切换路技术,二是采用反射镜切换技术,三是通过移动光纤切换路。...MEMS开关原理十分简单,当进行交换时,通过静电力或磁电力的驱动,移动或改变MEMS微镜的角度,把输入切换到开关的不同输出端以实现路的切换及通断。

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