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空间转录组简介

一.首先来看下,空间转录组是什么 空间转录组技术旨在分析基因在组织特定空间位置的表达量。也就是说,当我们拿到一份组织切片样品,两个圈圈,在这个两个区域里的基因表达情况,高高低低的,都能弄明白了呗。...doi.org/10.1523/JNEUROSCI.2376-15.2015) 没错,免疫组化(immunohistochemistry, IHC)和ISH早就用来研究切片组织的DNA、RNA丰度和蛋白表达的空间特征了...空间转录组的技术路线主要有两种: 基于二代测序或者成像。 (doi:10.1038/nmeth.2563) 1....基于二代测序的技术(在测序之前加上空间位置信息) 将切片组织与载有空间条形码的微阵列共同孵育,用poly-T将组织里的mRNA捕获,然后再去建库、测序。...空间条形码的结构以及编号 可通过算法分析将不同位置、但具有类似基因表达情况的取样点进行分类 (doi: 10.1126/science.aaf2403) 2. 基于成像的方法 2.1.

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2002-2007年最新免费空间

免费空间的『演示』 虎翼网 2007/08/14 老牌免费空间,停停开开N次了,最近发现又开始提供免费空间了,50M空间,ftp上传管理文件。...此免费空间的『演示』(感谢News Up提供此信息) 爱迪 2006/12/20 免费个人主页空间,可以使用他们的模版,也可以自己上传页面,总共仅有10M空间,还提供免费论坛、日记本、相册等免费服务...此免费空间的『演示』 MyJavaServer 2006/07/30 为您提供5M免费主页空间,ftp方式上传管理文件,支持JSP应用,主要是面向JSP编程爱好者提供空间,申请的时候要完成一道题目才行...本人也不懂编程,所以就没申请演示空间。...此免费空间的『演示』 7Host 2006/05/10 为您提供50M免费主页空间,ftp、web上传管理文件,支持asp,有广告。老牌免费空间了,过了N年还可以用,就是不稳定。

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空间转录组(Spatial Transcriptomics)

单细胞转录组测序技术和空间转录组技术【2】 单细胞转录组测序技术可以说是融合了高通量组技术和传统的单细胞研究手段,即解决了通量和分辨率的问题。...空间转录组技术(spatial transcriptomics)则需要利用常规的原位技术和组技术两方面的优势。 ? 图3....图10. 10X Genomics Visium空间转录组技术的流程 3、应用方向 空间转录组的应用方向包含了肿瘤,免疫,发育生物,神经科学及病理学等各个方向。 ? 图11....空间转录组技术的应用方向 4、数据分析 空间转录组数据分析的核心是根据每个芯片上每个spot的基因表达信息进行聚类,然后将spot根据地址序列放回到组织的图像上,同时可以对每个gene在组织上表达的空间位置进行定位...基因表达的空间热图【8】 5、空间转录组和单细胞转录组数据的整合 10X Genomics Visium空间转录组技术目前还达不到单细胞分辨率,而单细胞转录组数据则能够起到一定的补充作用,将两者的数据进行锚定和整合

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Github开源免费编程书籍

HgInit (中文版) Mercurial 使用教程 Pro Git Pro Git 中文版 (整理在gitbook上) svn 手册 学习 Git 分支 (点击右下角按钮可切换至简体及正体中文) 沉浸式...取悦的工序:如何理解游戏 (豆瓣阅读,免费书籍) 每个程序员都应该了解的内存知识(译)【第一部分】 程序员编程艺术 编程入门指南 编译原理 《计算机程序的结构和解释》公开课 翻译项目 编辑器...JavaScript patterns”中译本 javascript 的 12 个怪癖 JavaScript 秘密花园 JavaScript核心概念及实践 (PDF) (此书已由人民邮电出版社出版发行,但作者依然免费提供...(深入JavaScript语言核心机制的系列图书) Zepto.js Zepto.js 中文文档 命名函数表达式探秘 (注:原文由为之漫笔 翻译,原始地址无法打开,所以此处地址为我博客上的备份) 用...(中文版) 大家來學 VIM Visual Prolog Visual Prolog 7初学指南 Visual Prolog 7边练边

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精选国外免费PHP空间推荐「建议收藏」

精选国外免费PHP空间推荐 方法/步骤 000webhost – 1500M支持PHP可绑米免费虚拟主机   免费提供1500M空间,100G流量,FTP、Web方式上传管理文件,支持...Zymic – 6G容量可绑米免费PHP空间   Zymic免费空间,6G容量,每月50G流量限制,FTP、Web方式上传管理文件,支持PHP5,限制较多,有3个MySQL数据库,提供免费二级域名...SiteMix – 日本1.5G可绑米免费PHP空间   SiteMix是一家日本免费空间服务网站, 1.5G存储空间,支持PHP,提供免费二级域名1个或绑定1个你自己的域名(仅支持顶级域名,二级域名不可以...Six6 – 6G容量cPanel面板免费PHP空间   Six6免费空间,6G容量,无限月流量,简体中文版cPanel主机管理面板,支持FTP、Web方式上传管理文件,支持PHP5,不提供MySQL...6 FreeWebHostingArea – 1.5G容量可绑米免费PHP空间   FreeWebHostingArea免费PHP空间,500M存储空间,单个文件限10M以内,不限上传文件类型

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科研“出圈”必备——空间技术

空间技术正在提供一个新的视角。通过量化数十到数百个基因、转录物或蛋白质,空间能够在自然组织或细胞结构的背景下收集有价值的分子、细胞和微环境信息。...2020年5月,来自美国的研究人员在《Matrix Biology》发表综述论文,概述了目前可用的空间转录组空间蛋白质组方法,并进一步描述了应用这些方法来提高对细胞外基质(ECM)和成纤维细胞生物的理解的最新研究...空间靶向光学显微蛋白质组(STOMP)将质谱(MS)和亲和光标记技术结合起来,以充分利用全局空间蛋白质组的方法。 ...多组空间技术在基质研究中的应用 ECM蛋白的生化特性与细胞内不同。...然而,空间技术还需要继续提升和发展,例如在基于空间图像的蛋白质组中,每个图像周期的构建库受到条形码、荧光染料或稀有金属等数量的限制;目前的空间方法都不能在活体外或活体内对活细胞进行多重空间研究等

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科研“出圈”必备——空间技术

空间技术正在提供一个新的视角。通过量化数十到数百个基因、转录物或蛋白质,空间能够在自然组织或细胞结构的背景下收集有价值的分子、细胞和微环境信息。...2020年5月,来自美国的研究人员在《Matrix Biology》发表综述论文,概述了目前可用的空间转录组空间蛋白质组方法,并进一步描述了应用这些方法来提高对细胞外基质(ECM)和成纤维细胞生物的理解的最新研究...空间靶向光学显微蛋白质组(STOMP)将质谱(MS)和亲和光标记技术结合起来,以充分利用全局空间蛋白质组的方法。...多组空间技术在基质研究中的应用 ECM蛋白的生化特性与细胞内不同。...然而,空间技术还需要继续提升和发展,例如在基于空间图像的蛋白质组中,每个图像周期的构建库受到条形码、荧光染料或稀有金属等数量的限制;目前的空间方法都不能在活体外或活体内对活细胞进行多重空间研究等

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编程到底是什么?

只有程序员需要编程吗? 今天,学习编程的大部分还是程序员和期望成为程序员的朋友。编程在大众眼中还是一种专门的职业技能,学了,是用来找工作的。 ?...即使一时无法达到社会全员编程的地步,至少正在朝着这个方向发展—— 越来越多的互联网行业非技术岗从业人员,比较典型的像产品经理(PM),都在自学编程。 ?...如果大家留意一下儿童教育的话,不难发现:儿童编程已经成K12教育领域的一匹绝尘黑马,在短短几年中异军突起,大有进入主流教育体系的势头。 编程的核心是什么?...从语言特征(词汇、语法等)的角度来讲,最复杂的编程语言远比最简单的自然语言简单得多。 我们学习各种自然语言是为了日常生活与人交流、收发信息,学习编程语言又是为什么呢?...简单而言,"编程"就是学习用编程语言编写算法! 研习算法,修炼内功 计算机技术从诞生起就处在飞速发展之中。

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空间研究肿瘤微环境

空间正在系统层面改变我们对癌症生态系统的理解。空间和单细胞组的整合可以从根本上提高我们对肿瘤发生和癌症微环境的理解。...空间多组技术联合解析空间的多组图谱使我们能够重建肿瘤发生的关键过程,相关技术包括DBiT-seq(支持同时记录空间条形码mRNA和感兴趣的蛋白质)、STvEA(可以利用scRNA-seq丰富的多重免疫组化数据...有趣的是,该细胞群具有共享 HDAC1 和 ETS1 激活的致癌转录程序,表明潜在的表观遗传编程位于前缘区域。...结合scRNA-seq和ST揭示了胰腺癌亚型特异性的区室重编程对新辅助化疗的反应。总的来说,这些数据解释了TME隔间的解剖学分子特征如何决定肿瘤发生的命运,以及癌细胞如何在空间上对治疗作出反应。...如何将生物数据和数学模型整合到同一个框架中,建立生态和肿瘤之间的跨学科联系,利用蓬勃发展的空间数据,开发复杂的分析算法仍然是一个挑战。

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好用的php空间,推荐国内三个优质的免费PHP空间

1.亿家免费国内PHP空间 这是我见过最好的免费国内PHP空间了,这个BLOG就是由他的空间支撑的,所以你看到我这个空间的稳定,快速就代表着他们空间的优质了,推荐 注册地址:www.e9china.net...这个先要在他们论坛上发帖子,当你在论坛里的号升级后,就可以到相应版块去提交申请免费国内PHP空间了,具体多少级我记不得了,现在论坛改版本了,我都成新手上路了··· 这个免费国内PHP空间你得到后,不需要你再做任何动作了...,不过还是去论坛逛逛吧,感恩一下哦··· 2.5i8我爱吧免费国内PHP空间 这个免费国内PHP空间是150MB,1.5GB的月流量,是新加坡的服务器,速度和稳定性很不错 注册地址:bbs.5i8.us...这个要求更低了,只要你发5个主题贴,就是5个威望,到免费PHP空间申请区去发帖申请就行了,一般很快就可以给你开通了 纯正CPANEL控制面板,函数几乎都支持,不过他要求在他的免费空间里需要加上一些GG...这个免费国内PHP空间注册要求更低了,只要有邀请地址就可以注册了,点击下面的链接会出现一个页面,上面会有链接,点击 进去后就可以申请该免费PHP空间了 http://liuyan.net.ru/yqm.htm

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腾讯课堂向全国发放学习卡,小语种、设计、编程免费

3月25日,腾讯课堂宣布向全国发放免费学习卡——“15天畅卡”,助力全国网友通过学习提升职业技能,丰富“宅”家生活。...即日起至4月30日,用户扫描下方二维码,或者打开腾讯课堂官方公众号点击“站内福利”栏的“领畅卡”菜单,即可获得领取学习卡的入口。...扫码领取腾讯课堂免费学习卡 领卡后15天内,畅卡内课程均可免费学习。...卡内精选了腾讯课堂平台上优质的热门学习课程,包含英语、日语、韩语、电商运营、平面设计、绘画创作、工业设计、前端开发及编程语言等,充分满足不同人群的个性化、多元化的学习需求。...腾讯课堂“畅卡”免费课程示意 终身学习的时代正在加速到来。艾瑞咨询发布的《2022中国综合性终身教育平台大数据报告》指出,越来越多学习者希望通过体系化课程针对性提升职业、生活相关技能的学习效率。

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零基础编程026:什么编程语言最有前途?

(封面图来自于网络) 想学习编程的朋友可能一直纠结于到底哪一种编程语言最有前途,我google了一下,在维基百科的下面这个页面里大概有500多种编程语言,这些相对来说还是比较知名的编程语言,不包括一些语言的方言以及一些标记性的语言...停止纠结 与其在多种编程语言中纠结和争吵,不如从排名前10的语言中挑一种快速入手,所有的主流编程语言基本上都是相通的。编程的基本原理是相同的,背后的算法没有变,数据结构也类似,只是语法稍有不同而已。...明白了编程的基本原理,换成另外一种语言相对来说比较容易,只是换一种语法结构去重写而已(当然背后还有庞大的类库要熟悉,这些都需要时间去熟悉)。...我学过N种编程语言,现在看来语法是最容易学的部分,最麻烦的部分在于要去熟悉大量的模块或类的使用方法,还要学会正确的使用方法。...公众号后台发消息:python,跳转到“零基础编程”的所有文章目录。 --- END ---

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