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【精品思路在手，高分Paper不愁】转录组数据-免疫微环境精品分析思路（三）

思路导图： 数据来源：作者利用TCGA中结直肠癌的转录组数据来预测肿瘤浸润的淋巴细胞。利用突变联合转录组数据来预测新抗原，并标记了每位患者的微卫星不稳定状态、甲基化状态等作为其分子表型。 一....结直肠癌肿瘤浸润的淋巴细胞亚群（TILs）可以反映分子表型 1....结直肠癌瘤内浸润的适应性免疫细胞有：效应记忆CD4+,CD8+,未成熟的B细胞，Th1细胞；固有免疫细胞包括：活性DCs, MDSCs,巨噬细胞。 2. 肿瘤免疫细胞浸润细胞关联不同的分子表型。...2.为了验证这些候选结果与预后的关系，在GEO数据库中下载了11个芯片研究，1945个样本数据进行验证。 六....其特点为：在转移肿瘤中下调；具有CCR8胚系突变的患者有较差的生存。TCGA数据中CCR8的表达与好的预后相关。

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吉大超分子结构与材料国重实验室刘轶课题组Nanoscale:Z型异质结构在葡萄糖氧化酶致敏放射催化和肿瘤饥饿治疗中的应用

这种放射催化治疗（radiocatalysis therapy, RCT）的治疗效果与ROS产量密切相关。...使用GOx消耗肿瘤细胞内的葡萄糖可以有效切断肿瘤细胞的能量供给，抑制其增值。这种治疗策略被称之为饥饿治疗（starvation therapy, ST）。...因此，如果将GOx负载到具有Z-scheme能级结构的半导体放射增敏剂上，饥饿治疗和放射催化治疗之间的级联、协同作用就可以在较低的辐射剂量下实现高效的肿瘤治疗效果。...随后，我们对纳米片的•OH生成能力进行了表征，证明了BiOI/Bi2S3具有比BiOI更高的•OH产量，这来自于其特殊的Z-scheme能级结构。...(c)和(e)不同处理后Hela细胞内DCF染色的荧光强度与共聚焦显微镜照片。(d)和(f)不同处理后Hela细胞内g-H2AX染色的荧光强度与共聚焦显微镜照片。

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模电基础部分总结（自用）

大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。 模电基础部分总结（自用） 第一章 1.1半导体基础知识 1.什么是模拟信号，数字信号？ 答：模拟信号在时间和数值上均具有连续性，例如正弦波信号。...模拟信号在时间和数值上均具有连散性，它们的数值是最小量值的整倍数，并以此倍数作为数字信号的数值。 2模/数转换，数/模转换？...数模：计算机输出的数字信号常需转换为能够驱动负载的模拟信号。 3什么是半导体，本征半导体？ 答：导电性介于导体和绝缘体之间的物质，其以原子的最外层电子受原子核的束缚力介于导体与绝缘体之间。...答：半导体在热激发下产生自由电子和空穴对的现象称为本征激发。 自由电子在运动过程中如果与空穴相遇就会填补空穴，使两者同时消失，这种现象称为复合。...7 PN结是怎么形成的？ 答：将P型半导体和N型半导体制作在同一块硅片上，在它们的交界面附近就形成PN结。由于扩散运动使P区N区的交界面缺少多数载流子，形成内电场，从而阻止扩散运动的进行。

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Intel的硅光子技术

其基本原理是等离子体色散效应（plasma dispersion effect）, pn结施加反偏电压后导致载流子浓度减小，引起波导折射率的变化，进而引起MZI两臂的相位差，导致输出强度的变化。 ?...实验中，相移器的长度为3mm, 调制器的插损是7dB, Vpi*L为4V.cm，3dB带宽为20GHz。和最新的结果相比，Intel当年的调制器性能不是特别好。...Mux/DeMux 关于片上滤波器，Intel采用的是阶梯光栅(echelle grating)方案。利用光栅的衍射效应，使得不同波长的光从不同的角度出射，达到分光的目的，如下图所示。...uri=ao-51-18-4073） 基于阶梯光栅的Mux/DeMux, 其CWDM4芯片的结构示意图如下， ? (图片来自文献6) DeMux的测试结果如下图所示，插损大于5dB，串扰约-20dB。...在OFC2018上，Intel展示了其CWDM8的光模块。 ? （图片来自文献1） 从以上的Intel进展报道的时间节点来看，在2010年前关键器件的功能都已经实现。2010年之后的文献报道比较少。

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模电知识点汇总

###2.PN结 将p型半导体与n型半导体制作在同一片硅片上，它们的交界处形成PN结。多子由于浓度差进行扩散运动，产生内建电场；少子由于受到电场力进行漂移运动。...###4.Bjt的工作原理及特性 在同一硅片上，利用制造工艺形成三个掺杂区域，构成两个PN结，就构成了双极型晶体管（bjt）。它是放大电路的核心组成部分，将输入的微小变化不失真的放大。...其工作原理简述如下：发射结杂志浓度高，正向偏置，扩散运动形成了ie，扩散到基区（很薄且杂质浓度低，）的自由电子与空穴复合，形成了ib，漂移运动（极电结面积较大）形成ic。...截止区，发射结未达到截止电压，集电结反向偏置；放大区，发射结正向编制，集电结反向偏置；饱和区，均正向偏置。其基本参数有共射直流电流系数、交流电流放大系数、极间反向击穿电压等。...###5.场效应晶体管 Field effect transistor.简称fet，用输入回路的电场控制输出回路的电流。 和晶体管不同的是，场效应管在控制输出时，基本不索取电流。

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高性能mysql之前缀索引

下面的示例是mysql官方提供的示例数据库 下载地址如下： http://downloads.mysql.com/docs/sakila-db.zip 在示例数据库sakila中并没有合适的例子，所以从表...city中生成一个示例表，这样就有足够数据进行演示： 1.解压下载的sakila-db.zip文件 2.使用source命令以及sakila-schema.sql和sakila-data.sql文件来初始化...| | 11 | Shi | | 10 | La | | 10 | El | +-----+------+ 10 rows in set (0.00 sec) 可以看到3字节检索到的结果与全文检索相差很大...，下面给出如何在同一个查询中计算不同前缀长度的选择性： mysql> select count(distinct left(city,3))/count(*) as sel3,count(distinct...优点：前缀索引是一种能使索引更小，更快的有效办法 缺点：mysql无法使用其前缀索引做ORDER BY和GROUP BY，也无法使用前缀索引做覆盖扫描。

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Python 基础知识点归纳

"] = "苍老师" >>> >>> info {'stu1': '加藤鹰', 'stu2': '波多野结衣', 'stu3': '小泽玛利亚', 'stu4': '苍老师'} 修改字典: 在info字典的基础上...删除字典: 在info字典的基础上,删除几个字典,以下提供多种删除方法. >>> info {'stu1': '金手指', 'stu2': '波多野结衣', 'stu3': '小泽玛利亚', 'stu4...>>> >>> info.get("stu1") #使用get函数查询 '加藤鹰' >>> >>> info["stu2"] '波多野结衣' 更新字典: 在info字典的基础上,更新字典内容...stu4': '苍老师'} 遍历字典: 这里提供两种字典遍历方法,建议使用第二种,因为其遍历速度最快. >>> info = {'stu1': '加藤鹰', 'stu2': '波多野结衣', 'stu3...print(table[i].get("name")) ... admin guest lyshark 元组的类型 元组是Python中常用的一种数据结构,元组由不同的元素组成,每个元素可以存储不同类型的数据

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全响应式web前端开发

为什么写这篇文章 结一老师之前有写过一篇从css角度去实现响应式的文章（下手响应式及断点设置分析），不过真正设计并实现一个全响应式网页(RWD)，还需要从一开始的布局设计开始，并从页面结构、页面表现和用户交互三个方面来实现一个全响应式网页...，这就要求我们的页面元素模块化，能够在不同的设备尺寸和应用环境下进行自适应。...例如，在一款新闻类网站中，先将不同类型的元素进行分开设计，对于不同的实体做好封装，可以将一条新闻推送设计为卡片形式，其html结构大致如下： 166 由于其结构层次清晰，在不同的应用场景下，我们可以很方便地修改其样式（长、宽、字体、字号、颜色、显示如否等...，padding和小范围内定位使用像素； 使用媒体查询(media query)，这一CSS特性弥补了一套css样式的不足，允许页面在不同的尺寸或设备上有不同的显示样式，我们可以非常简单地定义覆盖规则

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全响应式web前端开发

为什么写这篇文章 结一老师之前有写过一篇从css角度去实现响应式的文章（下手响应式及断点设置分析），不过真正设计并实现一个全响应式网页(RWD)，还需要从一开始的布局设计开始，并从页面结构、页面表现和用户交互三个方面来实现一个全响应式网页...，这就要求我们的页面元素模块化，能够在不同的设备尺寸和应用环境下进行自适应。...例如，在一款新闻类网站中，先将不同类型的元素进行分开设计，对于不同的实体做好封装，可以将一条新闻推送设计为卡片形式，其html结构大致如下： 166 由于其结构层次清晰，在不同的应用场景下，我们可以很方便地修改其样式（长、宽、字体、字号、颜色、显示如否等...，padding和小范围内定位使用像素； 使用媒体查询(media query)，这一CSS特性弥补了一套css样式的不足，允许页面在不同的尺寸或设备上有不同的显示样式，我们可以非常简单地定义覆盖规则

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全响应式web前端开发

为什么写这篇文章 结一老师之前有写过一篇从css角度去实现响应式的文章（下手响应式及断点设置分析），不过真正设计并实现一个全响应式网页(RWD)，还需要从一开始的布局设计开始，并从页面结构、页面表现和用户交互三个方面来实现一个全响应式网页...，这就要求我们的页面元素模块化，能够在不同的设备尺寸和应用环境下进行自适应。...例如，在一款新闻类网站中，先将不同类型的元素进行分开设计，对于不同的实体做好封装，可以将一条新闻推送设计为卡片形式，其html结构大致如下： 166 由于其结构层次清晰，在不同的应用场景下，我们可以很方便地修改其样式（长、宽、字体、字号、颜色、显示如否等...，padding和小范围内定位使用像素； 使用媒体查询(media query)，这一CSS特性弥补了一套css样式的不足，允许页面在不同的尺寸或设备上有不同的显示样式，我们可以非常简单地定义覆盖规则

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Nature｜单细胞多组学绘制小鼠新皮质发育图谱

结果显示，每种细胞类型的空间分布结果与其预期位置一致(图2a)。...接着，URD轨迹树还绘制了神经元和神经胶质类的分化轨迹上不同的转录变化。...因此，研究者通过非负矩阵分解(NMF)确定每个时间点的基因模块，使用排名靠前的基因对其进行注释，并从连续时间点链接模块以定义皮质发生不同方面的“遗传程序”(图3c)。...最后，对E13.5对照和敲除组皮层的单细胞分析没有发现细胞类型组成的重大差异，只有有丝分裂后神经元表现出转录差异，其表型与后期时间点的表型相似。...，重建了皮质细胞类别多样性的发育轨迹，推断了它们的空间组织和伴随其谱系分叉决策和分化轨迹的基因调控程序。

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硅基电光调制器基础

这篇笔记整理一下硅光芯片中的电光调制器。最近在做相关的设计，理解还不是很深刻。 调制器的作用是基于一定的物理效应，将信号加载到光信号上。...但是受限于电子-空穴对的复合时间，其调制速率不是很高，只能达到几个GHz。该类型调制器的插损较小。...2) 载流子耗尽型 （carrier depletion modulator） 该类型的波导结构与注入型类似，在脊形波导不同区域进行掺杂，形成PN结。不同的是，此时PN结工作在反偏模式。...但是它的调制速率非常高，可以达到几十个GHz，满足高速高模块的需求。目前基于硅光的光模块产品，都是采用该类型的调制器。另外，由于波导中心区域也进行了掺杂，因而该类型的调制器插损较大，约为4-5dB。...以上两种调制器，只需对脊形波导不同区域进行不同程度的掺杂，foundry一般都会提供相应的PDK。由于掺杂浓度不能随意改变，在做器件设计时，能够调整的参数只有掺杂区域的宽度。

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OFC2022: Intel的硅光版图

今年的OFC会议上，Intel有多个报告，报道了其在硅光领域的核心器件进展以及未来的布局，小豆芽这里简单整理下，供大家参考。...激光器可以满足可靠性与使用寿命的要求，激光器在80度时仍然可以输出30mW的光功率，并且可稳定工作10000小时。激光器的RIN值小于-150dB/Hz, 边模抑制比SMSR大于45dB。...具体的测试结果如下图所示， （图片来自文献1） Intel对其TWMZM(travelling-wave MZM)调制器进行了进一步的优化，采用差分信号驱动的方式，EO转换的3dB带宽可以达到30GHz...Intel采用L型的PN结设计，其调制效率优于传统的横向PN结设计，如下图所示。采用金属热电极进行温度调节，控制微环的共振波长。微环的半径为4um，对应16.3nm的FSR。...以上是对今年OFC上Intel相关报告的整理，Intel展示了其可靠的InP激光器、240Gbps的微环调制器及其控制电路。

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ceRNA研究思路！

在GBM的治疗上，以手术、放疗、化疗或其他综合治疗为主的患者术后易复发，预后差，平均存活期约为15个月，而个性化治疗往往存在成功率低且副作用大的问题。...研究内容： 脂肪分泌的circRNA能调节HCC的去泛素化，从而促进细胞生长。外泌体环去泛素化(circ-DB)在体脂率较高的HCC患者中上调。...体内外的研究显示，exocirc-DB通过抑制miR-34a和激活与去泛素化相关的USP7，来促进HCC生长并减少DNA损伤。最后结果表明，脂肪外泌体对肝癌细胞的作用可通过敲降circ-DB来逆转。...然而，目前circRNA在结直肠癌(CRC)中的分子机制尚清楚。本文研究的目的是试图从circRNA-microRNA(MiRNA)-mRNA相互作用的角度为结直肠癌的靶向治疗提供新的依据。...研究人员重点研究了位于1号染色体上，起源于FMN2的circRNA has_circ_0005100，并将其命名为circFMN2。

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可能是作者把部分样品标记错误了分组吗

病理特征上，原发癌症和转移瘤可能在细胞形态、分化程度等方面存在不同。 分子生物学特征： 肝癌和结直肠癌在分子水平上可能有不同的遗传变异、突变谱、基因表达模式等。...转移瘤与原发瘤可能存在分子亚型的差异，包括在肿瘤抑制基因和促癌基因的表达上。...免疫组织化学标记： 肝癌和结直肠癌的肝转移样品可能在免疫组织化学标记上表现出不同的特征，例如免疫组织化学标记物（如肿瘤标记物）的表达水平。...病程特征： 肝癌和结直肠癌的肝转移可能在发病时机、生长速率、蔓延模式等方面存在差异。 肝转移可能对治疗的反应不同，包括对放疗、化疗、免疫治疗等的敏感性。...临床表现： 临床上，肝癌和结直肠癌的肝转移可能表现出不同的症状和体征，例如肝功能损害、腹痛、体重减轻等。 预后： 肝癌和结直肠癌的肝转移样品的预后可能存在差异，包括生存期、复发率等。

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Go开源ORM——GORM

} 更新表 AutoMigrate方法与CreateTable用法类似，不同的是，如果表已经存在，AutoMigrate也不会抛出异常，而是使用当前传入的最新结构体更新表结构，如果表不存在，则与CreateTable...= '2013-11-17 21:34:10' WHERE id = 111; // 对于下面的更新，什么都不会更新为""，0，false是其类型的空白值 db.Model(&user).Updates..., "jinzhu").Count(&count) //// SELECT count(*) FROM users WHERE name = 'jinzhu'; (count) db.Table("deleted_users...接收的参数不再只是为了确定表，其必须是一个设定了主键的对象，否则会报错 关联查询查询该主键关联的其他表的数据 Relative Relative提供关联关系的查询功能 // User 包含多个 emails...(Language{Name: "DE"}, languageEN) // Count - 返回当前关联的计数 db.Model(&user).Association("Languages").Count

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