我们选择了宫颈癌的表达芯片“GSE89657”来分析。
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点击芯片的标题,就能看到芯片的全部信息了!包括实验设计,类型样本信息,作者,文献以及数据等等!直接看都能看懂!
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?...用权重图查看数据在整体中的重要程度,可以看出,本芯片数据较好,芯片质量较高。
image(Pset,type = "weights",which=1,main="weights")
?...残差图看数据的分布情况,主要是在回归分析中。
image(Pset,type = "resids",which=1,main="Residuals")
?...image(Pset,type = "sign.resids",which=1,main="Residuals.sign")
?...boxplot(Pset,col=colors,main="NUSE",LAS=3)
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质量控制:RNA降解图,它的原理是RNA降解从5’端开始,因为芯片结果5端荧光强度要远低于3’端。