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NeurIPS22 | 具有自适应读出神经网络

在许多涉及神经网络学习任务中,通过读出函数将节点特征有效地聚合为级表示是必不可少一步。通常,读出是简单且非自适应函数,其设计使得得到假设空间是排列不变。...先前对深度集研究表明,这样读出可能需要复杂节点嵌入,通过标准邻域聚合方案很难学习。基于此,我们研究了神经网络给出自适应读出潜力,这些神经网络不一定会产生排列不变假设空间。...我们认为,在一些问题中,如分子通常以规范形式呈现结合亲和性预测,可能会放松对假设空间排列不变性约束,并通过使用自适应读取函数学习更有效亲和性模型。...我们经验结果证明了神经读出在跨越不同领域和特征40多个数据集上有效性。此外,我们观察到相对于邻域聚合迭代次数和不同卷积运算符,相对于标准读数(即和、最大值和平均值)有一致改进。

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Prometheus核心概念:一了解瞬时向量Instant vector和区间向量Range vector区别

5 PromQL处理瞬时向量和区间向量区别 5.1 PromQL聚合操作 例如:sum,min,max,count等聚合函数,只能作用于瞬时向量上。...// 这是错误,因为count只能作用于瞬时向量,而这个查询本身返回是区间向量 count(http_requests_total{job="prometheus"}[5m]) 5.2 PromQL...内置函数 5.2.1 ceil()向上取整,瞬时向量 ceil(v instant-vector) 将 v 中所有元素样本值向上四舍五入到最接近整数。...,区间向量 changes(v range-vector) 输入一个区间向量, 返回这个区间向量内每个样本数据值变化次数(瞬时向量)。...# 如果样本数据值没有发生变化,则返回结果为 1 changes(node_load5{instance="192.168.1.75:9100"}[1m]) # 结果为 1 6 结语 深刻理解瞬时向量和区间向量含义

3.7K82

Writer.com基于RAG向量检索替代方案

在许多情况下,应用程序将使用 RAG 来执行向量检索和其他 LLM 优化,而这些优化最适合使用向量数据库来实现。 然而,有一家公司正在推销 RAG 另一种用法——一种不涉及向量数据库用法。...Writer.com 是“基于”RAG 支持者,这意味着构建知识图谱并使用数据库而不是向量数据库。...“知识图谱,我们基于检索增强生成 (RAG),比使用向量检索传统 RAG 方法实现了更高准确性,”Writer 在其主页上宣称。...Writer 方法是在开始时使用其自己模型收集更多元数据,然后使用数据库而不是向量数据库来管理数据。 “数据库旨在存储实际信息——那些是节点——[以及] 实体之间关系——那些是边。...总之,Writer 知识图谱方法是否能够获得与具有向量数据库“传统”RAG 相同发展势头还有待观察。但这肯定是一个让 Writer 与众不同机会,也许也是一个让数据库公司探索机会。

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R语言 主成分分析PCA(绘图+原理)

其中,第一个新坐标轴选择是原始数据中方差最大方向,第二个新坐标轴选取是与第一个坐标轴正交且具有最大方差方向,依次类推,我们可以取到这样k个坐标轴。...(3)特征向量(eigen vector) 特征向量为对应主成分线性转换向量(线性回归系数),特征向量与原始矩阵矩阵积为主成分得分。特征向量是单位向量,其平方和为1。...值以及相对方差 wine.pca$loading #特征向量,回归系数 wine.pca$score screenplot(wine.pca) #方差分布 biplot(wine.pca,scale=...选择主成分足以解释总方差大于80% (方差比例碎石) 2. 从前面的协方差矩阵可以看到,自动定标(scale)变量方差为1 (协方差矩阵对角线值)。...待选择主成分应该是那些方差大于1主成分,即其解释方差大于原始变量(特征值碎石,方差大于1,特征值也会大于1,反之亦然)。

13.5K31

具有构象灵活性等变匹配网络预训练用于药物结合

,静止“锁和钥匙”理论并不普遍适用,原子位点和结合姿势变化可以为理解药物结合提供重要信息。...然而,计算开销限制了蛋白质轨迹相关研究发展,从而阻碍了监督学习可能性。...本文提出了一种基于改进等变匹配网络时空预训练模型,称为 ProtMD,它包含两个自监督学习任务:原子级基于提示去噪生成任务和构象级快照排序任务,以捕捉分子动力学(MD)轨迹中信息。...ProtMD 中编码器能够捕获MD内短期和长期依赖性,生成大于或等于一步构象。...该模型性能超越以往基于蛋白质3D静态结构信息AI模型,达到目前最优,证明了蛋白质动态空间信息在蛋白质-小分子亲和力预测问题上重要性。

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具有分子结构多重图分子动力学驱动神经网络

1.摘要 从分子结构预测理化性质是人工智能辅助分子设计关键任务,目前已经提出了越来越多神经网络 (GNN) 来应对这一挑战。...然后对于每一层,提出相应消息传递模块来平衡表达能力和计算复杂度。基于这两个模块,作者构建了多重分子神经网络 (MXMNet)。...由此,对于一个分子,可以构建出一个两层多重图——一层 (Local GI) 代表着局部几何信息,另一层 (Global GI) 代表着全局几何信息。...为了更好地结合两个层次信息,作者引入了交叉层 (Cross Layer),如下: 交叉层以上一层节点表示为输入,将其转换成下一层输入,形成(a)中交叉学习方式。...可以发现,作者提出方法表现强劲,在不同目标上均有不错表现。

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ggplot2画密度分布按取值范围填充不同颜色

之前发过一篇推文 ggplot2画散点图拼接密度 模仿下面这幅图片。但是遇到一个问题是如何给密度某一个部分填充不同颜色,就像下面的图片被红色方框圈住部分。 ?...area plot : Quick start guide - R software and data visualization - Easy Guides - Wiki - STHDA 首先是最基本密度分布...第一步是构造数据 x<-rnorm(500,0,1) df<-data.frame(x) df 基本密度分布 ggplot(df,aes(x))+ geom_density() ?...image.png 这里需要注意一个问题是默认Y轴是小数,应该是某个值占所有的数据比例,如果要把它改成频数可以加stat="bin"参数 ggplot(df,aes(x))+ geom_density...image.png 上面的如果想要给x小于-2和大于2填充另外一种颜色改如何实现呢?

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技术解析|如何绘制密度分布

前言 在前几天对数据分析师与算法工程师进行岗位对比分析文章中,我们使用了密度分布和箱线图对薪资水平与学历对薪资影响进行了分析,那么早起就对这两种图形绘制方法进行解析,也借着这个机会讲一下我最喜欢绘图包...:ggplot2 密度分布 在频率分布直方图中,当样本容量充分放大时,图中组距就会充分缩短,这时图中阶梯折线就会演变成一条光滑曲线,这条曲线就称为总体密度分布曲线。...这条曲线排除了由于取样不同和测量不准所带来误差,能够精确地反映总体分布规律,密度分布其实就是密度分布曲线填充。 原文密度分布绘制软件为R,为啥不用Python?...接下来我们使用下面代码添加密度曲线 p + geom_density() ?...xlim(0,80000)来调整,这样我们就做出了漂亮密度分布 ?

2.5K10

R语言可视化——图表嵌套(母子

之前在学习ggplot时候,一直存在着一个困惑。 就是这个函数是否允许两个做出来两个相关图表重叠嵌套(也就是在一个大(主边缘位置,放置另一个缩小版)。...不过他处理方式不是通过ggplot内置函数,而是通过grid包中viewport函数来实现: 以下是具体实现步骤: 加载包: library(ggplot2) #用于画图,主和附图都使用ggplot...内置数据集 library(grid) #用于设定附图长宽及叠放在主精确位置 加载并预览数据集: 这里我们还是使用关于钻石那个数据集(之前图表案例很多都是使用该数据集) data(diamonds...因为附图要放置在主边缘并且缩放很大比例,为了防止其背景和网格线系统遮挡主重要信息,对其主题元素进行了大量简化。 将主与附图合成一并显示: print(chart2,vp=vie) ?...其实仔细看这种做法,里面也不外乎图层叠加,先做出主,然后通过viewport函数将附图缩小并叠加到主图上,不过这种方式用来展示一些需要多角度透视数据分布问题还是很合适,而且因为是依赖于不同包,所有主与附图之间没有严格类型限制

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无需向量监督矢量生成算法,入选CVPR 2021 | 代码开源

不过,大多数算法都针对栅格图像,也就是位图,而不支持矢量。 虽然也有一些生成矢量图形算法,但是在监督训练中,又受限于矢量数据集有限质量和规模。...△Im2Vec插值效果 原理架构 为建立无需向量监督矢量图形生成模型,研究人员使用了可微栅格化管线,该管线可以渲染生成矢量形状,并将其合成到栅格画布上。...,ImageVAE则受到低分辨率栅格图像限制(a),而Im2Vec能够生成矢量输出,因此具有相关可编辑性和紧凑性优势;二者在生成插值上也都实现了较好效果(b)。...,具有显著拓扑变化。...此外,由于缺乏向量监督,在特殊情况下,Im2Vec可能会采用包含退化特征近似最优值,或者考虑语义上无意义部分来生成形状。

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无需向量监督矢量生成算法,入选CVPR 2021 | 代码开源

不过,大多数算法都针对栅格图像,也就是位图,而不支持矢量。 虽然也有一些生成矢量图形算法,但是在监督训练中,又受限于矢量数据集有限质量和规模。...△Im2Vec插值效果 原理架构 为建立无需向量监督矢量图形生成模型,研究人员使用了可微栅格化管线,该管线可以渲染生成矢量形状,并将其合成到栅格画布上。 ?...重构性能评估 首先,计算各种方法和数据集重建损失: ? 值得注意是,在没有向量监督情况下,SVG-VAE和DeepSVG均无法在数据集上运行。...,ImageVAE则受到低分辨率栅格图像限制(a),而Im2Vec能够生成矢量输出,因此具有相关可编辑性和紧凑性优势;二者在生成插值上也都实现了较好效果(b)。...此外,由于缺乏向量监督,在特殊情况下,Im2Vec可能会采用包含退化特征近似最优值,或者考虑语义上无意义部分来生成形状。

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首个可公开访问 3D 全脑具有前所未有的细节

现在,由阿姆斯特丹大学(UvA)科学家领导一个团队将 MRI 和显微镜相结合,生成了两个完整大脑 3D 图像,具有前所未有的细节水平。...研究人员使用了超高场 7-T MRI 系统,该系统具有比医院常规使用 MRI 系统更强大磁铁。研究人员专门为这些研究编写了 MRI 软件,以适应活组织和保存组织之间差异。...将单独脑切片放置在特别订购载玻片上,并使用定制实验室设备进行处理。 图示:从重建的人脑中获得解剖细节。...(来源:论文) 在对单个显微镜载玻片进行数字化后,研究人员创建了新算法,以纠正由切割和显微镜处理引起组织变形。经过数周不间断计算,研究人员终于能够对两个单独大脑进行完整重建。...研究人员表示:「我们展示了第一个可公开访问 3D 全脑,其中包含多个显微镜对比和 7-T 定量多参数 MRI 在 200 μm 处重建。」

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