下面您可以找到沿给定DNA序列进行内含子检测的简单脚本
from re import match
f= open('data.txt', 'r').readlines()[1::2]
u = [element[:-1] for element in f]
chain=u[0]
exons=[]
#detect introns in chains
for i in u:
for j in range(len(chain)):
if i==chain: #pass sequence itself
pass
在quines的上下文中,内含子(或有效负载)是quine的一部分,它在产生输出时没有任何用途,但仍然包含在数据部分中。例如:
function quine() {
const data = "function quine() {\n const data=\"@\";\n // Arr! This be an intron!\n return data.replace(\"@\", JSON.stringify(data));\n}";
// Arr! This be an intron!
return
有两个数据帧:内含子和gene_count。在内含子中有一列- V3 -它显示了样本的类型(外显子、内含子等)。有一列V9,它包含了什么基因拥有这个RNA样本的信息。在gene_count中有一个空栏ExonN,需要由每个基因的外显子数量来填充。gene_count具有列gene_id,该列与V9相同,但它只在此工作表中出现一次。所以我试了一下: 对于(内含子$V3中的i){ if (i ==‘外显子’){ gene_count_pv$ExonN }} 但是,这当然是愚蠢和幼稚的
我想添加一个带有子菜单的新自定义菜单,并研究了WHMCS官方文档,但只发现了以下内容:
<?php
#adding Menu Item to primaryNavbar
use WHMCS\View\Menu\Item as MenuItem;
add_hook('ClientAreaPrimaryNavbar', 1, function (MenuItem $primaryNavbar)
{
$primaryNavbar->addChild('Menu Name')
->setUri('https://www.example.
我有一个包含逗号分隔的变异等位基因列("alt")的vcf文件,以及另一列,它具有预测的效果("info")。(有关数据below示例,请参阅下面的dput()结构。)然而,由于任何原因,变量效应预测软件以随机顺序输出效果,而不是相同的顺序,变量列在"alt“列中。
我只想从每个变量效果字段中提取某些信息(真正的文件在这个字段中有很多我不需要的信息),并将这些信息连接到一个逗号分隔的字符串中。但是,首先,必须根据其在"alt“列中的顺序重新排序各种影响。
例如,下面的dataframe中的第2行当前如下所示:
alt info
我在这个网站上看到过以不同的方式被问到这个问题,但他们都没有确切地解决我的问题。
我有一个内含单引号的sql语句,在使用它进行数据库查询之前,我正在尝试使用推荐的做法。所以语句是这样的
val2="abc 'dostuff'"
sql="INSERT INTO TABLE_A(COL_A,COL_B) VALUES(%s,'%s')" %(val1, val2)
a_cursor.execute(sql)
然而,当我运行这段代码时,我得到了..
ProgrammingError: (1064,"You have an e
我编写了一个非常简单的Perl脚本,其中包含以下代码行。
my $q_it = $dbh->prepare('SELECT customdata.Field_ID,
customdata.Record_ID,
customdata.StringValue
FROM customdata
WHERE customdata.Field_ID='\'10012'\' && (StringValue LIKE '\'1%'\' OR StringValue LIKE '\'
这是我为原来的smith waterman算法编写的伪代码。
Input: U[1, n], V[1, m]
Set W[0, j] = 0 for j = 0 .. m
Set W[i, 0] = 0 for i = 0 .. n
For i = 1 to n
For j = 1 to m
W[i, j] = max {
0,
W[i, j-1] - d,
W[i-1, j-1] + s(U[i], V[j]),
我正在尝试操纵一个内含单引号的JSON,我遇到了一些麻烦:
1.-当我有一个函数时,我不能传递一个内部有单引号的JSON字符串作为参数:这是函数:
CREATE OR REPLACE FUNCTION public.give_me_text
(
IN text json
)
RETURNS JSON AS
$$
DECLARE
v_text varchar;
begin
RAISE NOTICE 'text: %', text;
v_text:=text || '- hello';
return v_text;
end
$$
LANGUAGE