我有以下基本的snakemake设置: rule step1:
"""
The output will contain a list of GENEs in a txt file.
"""
input: "input1.txt"
output: "output1.txt"
shell:
"""
analysis1.R {input} {output}
"""
ru
我正在从r中的一个表格中得到一个平衡的平均值。在下表中,我想返回每个位置的平均值,但是如果每个位置的“名称”有一个以上的总数,我想取平均值而不是平均值。
Name Loc Total
Jeff IA 17
Jill IA 67
Jeff IL 12
Jeff IL 13
Jill IL 45
Jeff MN 32
Jill MN 65
Jeff WI 23
Jill WI 67
name <- c("Jeff", "Jeff", "Jeff",
我在R中有一个数据集,其中包括I和no。发生次数:
ID Occurrences
1001 A
1001 A
1001 B
1002 C
1002 A
1002 C
我希望获得ID (唯一)和事件(模式)的输出,如下所示:
ID Occurrences
1001 A
1002 C
我如何在R中做到这一点?我试过"table“之类的东西,但我得不到正确的答案。
当我调用聚合函数时,我得到了错误Error in match.fun(FUN) : object 'count' not found
我尝试过更新R以及使用plyr包,但后者并没有给我我想要的结果。
aggregate(soybean.table, by=list(soybean$seed.tmt, soybean$germination), FUN=count)
我在Server 2008中创建了以下视图,以便为土地所有者创建邮件列表:
SELECT
dbo.parcel.featid,
CAST(mms_db.dbo.TR_Roll_Master.FMT_ROLL_NO AS decimal(11, 3)) AS Roll,
dbo.parcel.survey, mms_db.dbo.Central_Name_Database.NAME AS Owner,
mms_db.dbo.Central_Name_Database.NAME_2 AS Owner2,
mms_db.dbo.Central_Name_D