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gis地理加权回归步骤_地理加权回归权重

上一节我们讲了GLR广义线性回归,它是一种全局模型,可以构造出最佳描述研究区域中整体数据关系的方程。如果这些关系在研究区域中是一致的,则 GLR 回归方程可以对这些关系进行很好的建模。不过,当这些关系在研究区域的不同位置具有不同的表现形式时,回归方程在很大程度上为现有关系混合的平均值;如果这些关系表示两个极值,那么全局平均值将不能为任何一个极值构建出很好的模型。当解释变量表现出不稳定的关系(例如人口变量可能是研究中某些地区911呼叫量的重要影响因子,但在其他地区可能是较弱的影响因子,这就是不平稳的表现)时,全局模型通常会失效。

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arXiv|使用深度生成模型在3D空间上生成类药分子

今天给大家介绍的是北京大学来鲁华课题组在arXiv上挂出的预印论文《Learning to design drug-like molecules in three-dimensional space using deep generative models》。近年来,分子图的深度生成模型在药物设计领域受到了越来越多的关注。目前已经开发了多种模型来生成拓扑结构,但在产生三维结构方面的探索仍然有限。现有的方法要么关注于低分子量化合物而不考虑药物相似性,要么利用原子密度图来间接生成三维结构。在这项工作中,作者介绍了配体神经网络(L-Net),一种新的图生成模型,用于设计具有高质量三维结构的类药分子。L-Net直接输出分子(包括氢原子)的拓扑和三维结构,而不需要额外的原子放置或键序推理算法。实验结果表明,L-Net能够产生化学正确、构象有效的类药分子。最后,为了证明其在基于结构的分子设计中的潜力,作者将L-Net与MCTS结合,并测试其产生靶向ABL1激酶的潜在抑制剂的能力。

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Bioinformatics丨GraphDTA用图神经网络预测药物靶点的结合亲和力

今天给大家介绍迪肯大学Thin Nguyen教授等人发表在Bioinformatics上的一篇文章 “GraphDTA: predicting drug–target binding affinity with graph neural networks” 。药物再利用可以避免昂贵和漫长的药物开发过程,估计新药物-靶标对相互作用强度的计算模型可加快药物的再利用,然而,以往的模型均是将药物表示为字符串,但这不是分子表示的合理方式,所以作者提出了一种新的GraphDTA模型,将药物表示为图,并使用图神经网络预测药物与靶点的亲和力。结果表明,图神经网络不仅比非深度学习模型更能预测药物靶点的亲和性,而且比其他深度学习方法更有效。

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狼羊菜过河问题深入学习分析——Java语言描述版

前言 这个问题的抛出,是几个星期之前的算法课程。老师分析了半天,最后的结论是:其实就是图的遍历。那时候挺懵逼的,不管是对于图,还是遍历,或者是数据结构,心里面都没有一个十足的概念,所以搁置了这么久的问题,现在就来好好研究清楚。 问题描述: 一个农夫在河边要过河,但是他带着一匹狼、一只羊和一颗白菜。他需要用船将这三样东西运至对岸,然而,这艘船的空间有限,只容得下他自己和另一样东西(或狼或羊或白菜)。若他不在场看管的话,狼就会吃羊,羊就会去吃白菜。此人如何才能过河。 问题分析: 抛开算法,把这个题当成是一

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