groupadd命令用于创建一个新的工作组，新工作组的信息将被添加到系统文件中。...语法 groupadd(选项)(参数) 选项 -g：指定新建工作组的id； -r：创建系统工作组，系统工作组的组ID小于500； -K：覆盖配置文件“/ect/login.defs”； -o：允许添加组...ID号不唯一的工作组。...参数 组名：指定新建工作组的组名。...实例 建立一个新组，并设置组ID加入系统： groupadd -g 344 linuxde 此时在/etc/passwd文件中产生一个组ID（GID）是344的项目。
空间分辨组学技术正在改变我们对生物组织的理解。然而，由于数据量大、数据类型异构以及缺乏灵活的空间感知数据结构，单模式和多模式空间组学数据集的处理仍然是一个挑战。...2024年3月，《Nature Methods》发表了一个建立统一、可扩展的多平台文件格式的框架——SpatialData，为空间注释和跨模态聚合与分析提供便利。 SpatialData是什么？...SpatialData是一个灵活的、基于领域标准的框架，用于存储、处理和注释来自迄今为止几乎任何可用的空间组学技术的数据，实现了多模态空间组学数据的可查找、可访问、可互操作、可重用(FAIR)集成。...癌症三个空间数据集的比对和综合分析 开发团队使用napari-spatialdata定义所有数据集中存在的地标点，然后使用变换对齐所有三个数据集来定义通用坐标系（CCS）。...对齐的结果显示：SpatialData 能够识别公共空间区域，可以使用跨数据集的SpatialData 查询来访问该空间区域。接下来，利用来自所有三个数据集的集体信息创建了一套共享的空间注释。
同理，男性样本里面混入了女性样本，会给男性带来大量的X染色体的杂合SNV，也很容易检测出来。...我的测序结果 我对前面步骤call到的vcf格式的变异位点文件进行了X,Y染色体的简单统计，代码如下： cat jmzeng.freebayes.vcf |grep -w 'chrY'|grep -v...但是为什么我call出来的snp位点， 居然~~~这么多杂合的？？？？ 尽管测序会有错误，不那么精准，但是误差不应该那么大吧！ 我测试了另外一个软件call出来的snp位点，也用同样的脚本进行统计！...起初我怀疑是我的snv结果没有进行过滤，所以造成了这么大的误差，那么就用测序深度来进行过滤吧！ ?...很明显，纯合杂合的问题，并没有测序深度的偏差，我暂时还不能确定问题出在哪里，接下来4篇帖子都会围绕着这个问题展开！ 关于NGS数据探索性别相关问题，更多阅读，请自行前往我的博客搜索！
转录组测序后的表达量矩阵的差异分析大家应该是都比较熟悉了，一般来说大家都会在DESeq2和edgeR或者limma的voom算法里面三选一，但是最近看到同一个文章使用两个不同转录组测序差异分析方法，还是蛮奇怪的操作...urothelial carcinoma》 第一个方法是 NOISeq 这个NOISeq方法的文章在：https://genome.cshlp.org/content/21/12/2213 ，但是引用率到现在也很低...出图如下所示： ANLN的差异 图仍然是很丑，我也不想评价什么了，毕竟这个文章发表的杂志就有点质量差，也算是“臭味相投”。...转录组测序后的表达量矩阵的差异分析方法确实很多 简单的搜索了一下，有一个2019的转录组测序后的表达量矩阵的差异分析方法综述：《Interpretation of differential gene expression...results of RNA-seq data: review and integration》，当时里面汇总的这些软件的引用率都没有破万，如下所示： 引用率都没有破万 感兴趣的可以看这个综述文章
前言 最近上线了一个 React Native 外访项目，用户为公司外访员，外访员根据公司业务去实地考察，收集记录一些资料，考察记录资料的过程全部用公司配的专用手机，里面安装了当前外访项目APP。...当前离线同步机制，前端离线操作，本地存储数据，监测有网后定时器轮询发送每次操作记录，操作记录同步是调用对应的后端接口，前端传参包含用户操作调用的接口，以及接口对应的参数，根据整个操作记录，存储在一个数组里...通过添加 loading, 数据锁，流程走完后5分钟后再更新数据等方式，损耗了一些用户体验，前端组断断续续改了一个多月，可算是把这个功能彻底修复完了。...关于代码阻塞，通定时请求计算请求响应时间，设置阈值，如果响应时间长，则停止定时器等请求任务，几分钟后再次触发定时器，调整代码实现方式，操作等待，按钮禁用，添加友好提示等解决 弱网，实际场景中很难定义，网速达到多少算弱网...，虽然有相关技术负责人和架构组，项目从架构搭建进入开发阶段后就不参与了 (作为前端开发开发人员，没有话语权，日常工作最心塞的事情之一) 测试，UI是单独的部门不按业务线划分，属于公共资源，有需要调配形式
大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。 /** 描述： 删除链表中等于给定值val的所有节点。...不使用java api LinkedList、ArrayList实现 样例： 给出链表 1->2->3->3->4->5->3, 和 val = 3, 你需要返回删除3之后的链表：1->2->4->5。...分析： 1.首先判断head是不是空，为空就直接返回null 2.然后从head.next开始循环遍历，删除相等于val的元素 3.最后判断head是否和val相等，若相等，head = head.next...（这里最后判断head是有原因的，因为head只是一个节点，只要判断一次，如果最先判断head就比较麻烦，因为如果等于val，head就要发生变化） 这里也体现出为什么设计链表的时候要空出一个头结点
在本文中，我将讲解如何通过自定义ExceptionHandlerMiddleware，以便在中间件管道中发生错误时创建自定义响应，而不是提供一个“重新执行”管道的路径。...例如，如果您创建一个使用Razor Pages（dotnet new webapp）的新Web应用程序，您将在Startup.Configure中看到如下的中间件配置： public void Configure...如果您正在使用该[ApiController]属性（你可能应该这样使用），并且该错误来自您的Web API控制器，那么ProblemDetails默认情况下会得到一个结果，或者您可以进一步对其进行自定义...官方文档中描述了一种解决方案，建议您创建ErrorController并具有两个终结点的： [ApiController] public class ErrorController : ControllerBase...创建自定义异常处理函数 对于此示例，我将假设我们在中间件管道中遇到异常时需要生成一个ProblemDetails的对象。我还要假设我们的API仅支持JSON。
RunLoop 的适用场景 回顾一下上一篇文章的介绍，只有当你为你的应用创建子线程时，才可能需要显式的运行一个 RunLoop 。而主线程的 RunLoop 是自动启动循环。...下面的代码向你展示如何创建 RunLoop 观察者，因此代码简单的设置了一个 RunLoop 来监视所有 RunLoop 活动。...也没办法在自定义模式下运行 RunLoop 。 设置时间限制： 相比无条件的运行一个 RunLoop ，运行一个有超时值的 RunLoop 是更好的。...当开始网络传输时，我们可以看到 NSURLConnection 创建了两个新线程：com.apple.NSURLConnectionLoader 和 com.apple.CFSocket.private...一个Demo 根据上面对NSURLConnection的介绍，我们模拟一个类似的设计来实现通过RunLoop来等待和处理事件。 第一步：创建任务线程 创建子线程，用于初始化一个接收自定义事件源。
转录组的时代（2010-2015年间）早就过去了，哪怕是单细胞转录组其实也已经在慢慢退火。...技术是新旧确实是科研课题价值的一个关键因素，但总有一些人能化腐朽为神奇，哪怕是一个超级简单的传统bulk转录组项目，比如2021发表在NC杂志的文章，《Postpartum breast cancer...确实是两个分组的标准 差异分析 目前简单的差异分析流程，基本上转录组测序技术和芯片技术拿到的表达量矩阵后续分析大同小异： 解读GEO数据存放规律及下载，一文就够 解读SRA数据库规律一文就够 从GEO数据库下载得到表达矩阵...，两个分组还是说比较好的区分，在364个差异基因里面就更好的区分了两个分组。...另外一个亮点是转录因子分析： 文章里面介绍的是 Master regulator analysis，这个分析在同年(2021) 有一个发表在CELL的TCGA数据挖掘文章就是基于此。
今天介绍一个同门师兄开发的 Python 模块：pyfastx，用于快速随机访问基因组序列文件。作品发表在生信顶刊上，必须强行安利一波。...一个接口同时满足 FASTA/Q 文件读写需求 轻量级、内存节约 随机访问压缩的 FASTA/Q 文件 逐条迭代读取 FASTA 文件 计算 FASTA 文件的 N50 和 L50 计算序列的 GC 含量和核酸组成...这里要说明一下顺序迭代和随机读取的区别。顺序迭代顾名思义就是从一个文件的开始逐条记录往后读，直至最后一条记录。 随机读取就是能够直接访问指定的序列，不需要从头读到尾。怎么实现呢？...，这两个信息可以方便地通过迭代返回。...in pyfastx 0.4.1 >>> fq.encoding_type ['Sanger Phred+33', 'Illumina 1.8+ Phred+33'] Read 类 FASTQ 文件的每一条记录是一个
大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。 “java中全局变量应该放哪儿? ”引发的争论 1、单独写一个final的类，在里面定义final static的全局变量，在其它程序里包含进来就可以了。...但是在JAVA中，确实没有所谓的全局变量的概念，通过设置一个abstract class or interface，并将许多final or final static field置于其中，并在使用时调用...ClassName.xxx or InterfaceName.xxx来模拟全局变量的使用(可以肯定的是，在许多的著作中大师们都已经反复强调了将许多常数放入一个abstract class or interface...全局变量的概念显然过于宽泛，以至于我们说一个程序甚至是一个系统拥有一个唯一的变量变成可能，但final or static显然不是为其而设计的(当然可以模拟)。...至于如何实际应用全局变量，我看，还是有则去之，无则加冕吧，实在要用偶也么的办法(不过自从使用C++/JAVA开始，全局变量的使用确实降到了一个极低的程度，也许是因为在下的代码写的还是太少的缘故吧，呵呵…
四年前我做了一个单细胞课程，就是对scRNAseq包里面的数据示例的一些处理。...不过那个时候的R包的很多函数代码现在都过时了，现在没有学习的价值了哈，但是思路是可取的， 比如我把单细胞转录组数据分析流程分成如下10个步骤： step1: 创建对象 step2: 质量控制 step3...: 表达量的标准化和归一化 step4: 去除干扰因素(多个样本整合) step5: 判断重要的基因 step6: 多种降维算法 step7: 可视化降维结果 step8: 多种聚类算法 step9:...让我想起来了，单细胞转录组数据分析的每个步骤理论上都应该是有一个综述的，欢迎大家留言分享自己珍藏已久的单细胞数据处理方面的综述。我们会详细整理成为列表再奉献给所有的粉丝哈！...参考前面的例子：人人都能学会的单细胞聚类分群注释 ，自己梳理单细胞数据分析的方方面面哦！
前言在探索Vue3的前端世界时，上一篇简单介绍Vue3的目录结构，为了深入了解其核心组件的创建与应用。本文将通过实战的方式，带领大家一步步构建起第一个Vue3组件，并深入解析其背后的原理。...首先先介绍重点三步骤：引入createApp用于创建应用-》引入App根组件-》使用createApp创建组件。一、创建Vue应用在Vue3中，创建一个新的应用实例非常简单。...部分定义了组件的HTML结构，这里我们简单地包含了一个标题和一个引入的Person_Vue3子组件。<!...在这里，我们导入了Person_Vue3组件，并将其注册为局部组件。同时，我们还设置了组件的name属性，这是Vue组件的一个重要属性，用于标识组件。...，运行程序效果如下：四、总结通过以上步骤，成功地创建了第一个Vue3组件。
*arrs = [[NSMutableArray alloc] initWithCapacity:1]; // NSMutableArray *smallArr = nil;//变量的定义...arr count]; i ++) { // if (i % 3 == 0) { // //仅仅要读到0,3,6,9,12就开辟空间存储接下来的元素...= nil; big 指向无效的空间(堆区空间) // NSLog(@”%@”,arrs); 版权声明：本文博主原创文章，博客，未经同意不得转载。
作者期望通过研究化疗前后卵巢癌样本的单细胞转录组层面的变化，然而由于卵巢癌肿瘤特有的异质性，不同肿瘤之间细胞成分差异很大，多样本之间整合存在困难。...PRIMUS 采用双线性泊松回归模型，将表达数据同时分解为明确的干扰因素（defined nuisance factors）、未定义的细胞表型及其相应的转录组学特征。...创建SingleCellExperiment 对象 PRIMUS 全程使用的是 SingleCellExperiment 对象，这里也使用该对象。...从出发点来说，该包解决了多样本异质性的问题，某些细胞群只在单个样本中有，而在另一个样本中无，这种情况下的样本整合。...BIC=k*ln(n)-2 ln(L) 注：L是在该模型下的最大似然，n是数据数量，k是模型的变量个数。 那么如何实现PRIMUS BIC分析？
2022-05-02：给定一个数组arr，一个正数num，一个正数k， 可以把arr中的某些数字拿出来组成一组，要求该组中的最大值减去最小值<=num， 且该组数字的个数一定要正好等于k， 每个数字只能选择进某一组...，不能进多个组。...返回arr中最多有多少组。 来自微软。 答案2022-05-02： 排序+动态规划。滑动窗口有陷阱，不一定行，可能可以。 第一种情况，包含i,dpi跟dpi-k相关。
2022-05-02：给定一个数组arr，一个正数num，一个正数k， 可以把arr中的某些数字拿出来组成一组，要求该组中的最大值减去最小值<=num， 且该组数字的个数一定要正好等于k， 每个数字只能选择进某一组...，不能进多个组。...返回arr中最多有多少组。 来自微软。 答案2022-05-02： 排序+动态规划。滑动窗口有陷阱，不一定行，可能可以。 第一种情况，包含i,dp[i]跟dp[i-k]相关。
基因原位表达技术的最新进展构成了转录组学的一个新的迅速发展领域。随着10x Genomics Visium平台的推出，这种方法开始被广泛采用。实验方案是在从较大的组织样本中采集单个组织的切片上进行。...来自瑞典的科研团队开发了STUtility，一个为空间转录组学数据提供完整工作流程的工具，从测序和图像数据处理到组织的最终三维模型的创建。 STUtility是什么？...小鼠大脑矢状面和人类乳腺癌样本的空间分析 在小鼠大脑样本中，可以用明确定义的空间模式提取多个不同的因子，空间自相关测试中排名靠前的基因在其表达中显示出明显的空间依赖性。...最后，类风湿关节炎样本被用来演示三维应用于由多个连续ST切片组成的样品集。用户可以收缩或扩大切片之间的空间，创建一个密集的点云反映实际距离或引入间距，以便更容易识别切片之间的特征转换。...总的来说，使用STUtility分析的空间解析数据，能够呈现出关于组织的持续细胞状态的景观视图。 STUtility是一个R软件包，目的是为空间转录组学数据提供一个易于使用的可视化和分析工具包。
前面的教程里面 能从源头解决数据分析的瑕疵吗 ，我们重现了普通单细胞转录组数据分析的从fastq文件开始的走cellranger的定量流程。...接下来，继续，应粉丝要求，跑一个肝癌的单细胞转录组10x数据定量流程！...参考： 10X单细胞转录组原始测序数据的Cell Ranger流程（仅需800元） 10X的单细胞转录组原始数据也可以在EBI下载 一个10x单细胞转录组项目从fastq到细胞亚群 一文打通单细胞上游：...fastq文件的对应关系 10X单细胞转录组测序数据的 SRA转fastq踩坑那些事 10x的单细胞转录组fastq文件的R1和R2不能弄混哦 差不多几个小时就可以完成全部的样品的cellranger的定量流程...区别在于有一些样品它的R1文件是远小于R2文件的，但是有一些样品的1文件和R2文件是大小一致的，是因为这些样品的fastq文件并没有在r1文件被trim，我们可以看2022的一个文章的示意图（The cellBC
简单介绍一下指针：由于通过地址能找到所需的变量单元，可以说，地址指向该变量单元。因此，将地址形象化地称为“指针。”意思是通过它能找到以它为地址的内存单元。...一般形式 类型名 *指针变量名； 大部分人初学C语言的时候遇到：int p，则理解为定义了一个int类型的变量p。...因此到指针的时候，很容易也理解：int *p，是一个int类型的*p变量，这种说法实际上是错误的。...int *p，其中p只是变量的名字，int *表示p变量存放的是int类型变量的地址，而不是一个int类型的*p变量。 指针就是一个地址，地址就是一个指针。...还有一点需要注意，指针和指针变量是两个不同的概念，我们平时习惯性说的指针，实际上是指针变量，指针只是一个地址，没有其他含义。 建议初学者学习的时候，直接说清楚学的是指针变量还是指针，避免说多混淆概念。
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