剪切树状图

文章/答案/技术大牛

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如何标记切割树状图的末端节点？

r、hierarchical-clustering、dendrogram、dendextend

我使用下面的代码来剪切树状图，我遇到的一个特殊问题是，当我剪切树状图时，我不知道如何向nodes.How添加标签，我可以使用R程序来剪切带有标签的树状图吗？

浏览 1提问于2011-08-26得票数 4

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基于距离的聚类

cluster-analysis、hierarchical-clustering

这是我的问题:我有一个村庄列表。对于每个村庄，我计算了它们之间的路径距离，并准备了一个距离矩阵。现在，我想确定彼此靠近的村庄集群。

浏览 1提问于2013-08-05得票数 2

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r、list、dendrogram、ape

我有一台dendrogrammat <- matrix(rnorm(20*10),nrow=20,ncol=10)并给出了一个深度截止点：depth.cutoff <- 4.75plot(dend,horiz = TRUE) 并最终得到这个dendrogram我得到的最接近的方法是使用

浏览 32提问于2017-02-02得票数 2

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仅将clusters绘制到被切割的集群，而不是每一片叶子

r、plot、hclust

我已经将其切割成适当数量的集群，并希望绘制树状图，但在我切割集群的高度结束，而不是一直到每个单独的叶子。我的完整树状图如下所示：我想把它画出来，就好像它停在我在这里画的那条线一样(例如)：

浏览 12提问于2017-08-03得票数 2

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树状图使用什么数据结构？

machine-learning、artificial-intelligence、data-mining、cluster-analysis、hierarchical-clustering

我一直在寻找如何高效地实现树状图，用于描述层次聚类。目前，我使用一个正则表达式来解析和显示它，就像树结构一样，如下所示。因为我们在特定级别上剪切树状图后得到了簇。剪切所示的正则表达式是困难的，并且并不总是给出适当的聚类。我们应该使用什么数据结构和表示，以便从树状图中获得聚类相对容易。

浏览 1提问于2014-03-05得票数 1

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用Matlab实现树状图的截取

matlab、cluster-analysis、hierarchical-clustering、dendrogram

有没有办法在Matlab中剪切树状图？我希望将距离限制为100，但我不知道如何将其添加到函数中。 ?

浏览 19提问于2019-02-13得票数 0

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使用identify.hclust()获取切割高度

r、dendrogram、hclust

我正在使用identify.hclust在R中手动剪切从hclust创建的树状图。该函数的默认返回是每个组中观察值的in。我需要这些信息，但我也需要知道这个团队的高度。有什么办法可以做到这一点吗？hang=-1, sub="", xlab="", labels=F)例如，我使用identify在以下高度剪切树状图

浏览 6提问于2016-12-23得票数 1

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从R中的邻接矩阵/边列表生成簇

r、cluster-analysis、adjacency-list

我目前正在使用这些信息来构建一个边缘列表(如果它们已经组合在一起，则存在一个边缘)，然后使用walktrap社区来生成树状图。在给定边缘列表的情况下，是否有其他方法可以梳理出组或集群？

浏览 2提问于2012-01-11得票数 3

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如何调整树状图的y轴的大小

python、scipy、hierarchical-clustering、dendrogram

在进行层次聚类之后，我使用scipy.cluster.hierarchy as sch绘制了一个树形图。问题是聚类发生在树状图的顶部，在0.8到1.0之间，这是y轴上的相似度。我如何才能“剪切”从0到0.6的所有图形，在这些图形中没有任何“有趣的”图形发生？

浏览 1提问于2013-09-30得票数 2

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Python中的iGraph : VertexDendrogram对象和VertexClustering对象之间的关系

python、igraph、hierarchical-clustering

然后使用V.as_clustering()，我从树状图中获得了一个VertexClustering对象。我知道社区是集群的，所以模块化是最大化的，但我认为树状图对象一直在合并，所以很难在树状图上看到社区。我的问题是: V.as_clustering()的输出如何与树状图中社区之间的距离相对应？换句话说，每个社区都有一个代表性的数字(例如，社区，社区2)，那么这个数字如何与树状图上的位置相对应呢？当树状图合并到最大模块化级别时，社区0和社区1是否相邻，

浏览 2提问于2013-07-02得票数 1

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在r中的cutree之后查找层次聚类树形图中的聚类数

r、hierarchical-clustering

在树状图上使用cutree后，我在查找簇的数量时遇到了一些问题。below the maximum height通过打印树变量，我可以看到我的树状图被分成了两个簇

浏览 2提问于2016-04-04得票数 1

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如何裁剪树状图并在地理地图上表示

matlab

我想知道在MATLAB或任何其他软件中是否有任何工具/命令可以帮助将树状图(其中点表示状态)剪切到某个高度，并将其表示在如下图所示的地理地图中。你能告诉我有没有更好的方法吗？谢谢。

浏览 3提问于2013-04-01得票数 2

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选择合适的聚类方法进行潜在语义分析

cluster-analysis、latent-semantic-indexing、latent-semantic-analysis

我想对一些文本文档进行聚类，以找到具有相同概念的文档。我已经使用潜在语义分析(LSA)进行了语义相似性分析，但我搞不清应该选择哪种聚类方法来实现我的目的。谢谢

浏览 1提问于2015-06-19得票数 0

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如何在树状图中选择低于某一分界点的所有集群

r、cut、dendrogram

然后，我使用以下命令制作了一个树状图：Y轴的范围从0到9。我想要一个在高度为1的高度剪切树状图的命令，并且只显示1和2。

浏览 15提问于2017-07-21得票数 1

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如何绘制大数据集的树状图？

r、plot、zooming、dendrogram

我正在使用R中的ape (系统遗传学和进化分析)包，它具有树状图绘制功能。我使用以下命令读取Newick格式的数据，并使用plot函数绘制树状图：gcPhylo <-read.tree(file = "gc.tree") plot(gcPhylo

浏览 5提问于2011-09-13得票数 25

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如何在图中持久化社区信息

algorithm、graph、partitioning、neo4j、hierarchical-clustering

这些算法通常返回一个，表示从整个网络到单个节点的图的划分。我想知道如何持久化这些结果。我认为它可以存储为一个单独的图，但是有没有一种方法可以将它存储在图本身中？

浏览 4提问于2011-12-05得票数 4

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在最高纯度水平上切割树状图

data-mining、cluster-analysis、hierarchical-clustering、unsupervised-learning

我正在尝试创建使用分层凝聚聚类对文档进行聚类的程序，程序的输出依赖于在这样一个级别上削减树状图，以便获得最大纯度。下面是我现在正在研究的算法。问题是，当我在最低层剪切树状图时，每个集群只包含一个文档，这意味着它是100%纯的，因此集群的平均纯度是1.0。但这不是期望的输出。我想要的是对文档进行适当的分组。我做错了什么吗？

浏览 4提问于2014-03-11得票数 0

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