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JMC | 通过基于深度学习的设计、合成和生物学评价发现吡唑并[3,4-d]哒嗪酮衍生物作为选择性DDR1抑制物

本文介绍的是来自中国科学院上海药物研究所药物研究国家重点实验室的Sulin Zhang, Hong Liu和Mingyue Zheng共同通讯发表在Journal of Medicinal Chemistry上的研究成果。由于盘状结构域受体1(DDR1)的改变可能导致炎症细胞因子的增加,使DDR1成为治疗炎症性肠病(IBD)的一个靶点。作者通过整合深度生成模型、激酶选择性筛选和分子对接,建立了基于骨架的分子设计流程,产生了一种新型的DDR1抑制剂化合物2,该化合物显示出有效的 DDR1 抑制特性(IC50 = 10.6±1.9 nM) 和对一组 430 种激酶的出色选择性(S(10) = 0.002,0.1μM)。化合物2能有效地抑制细胞中促炎症细胞因子的表达和DDR1的自磷酸化,而且在葡聚糖硫酸钠(DSS)诱导的小鼠结肠炎模型中也显示出较好的口服治疗效果。

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鞘脂代谢调控星形胶质细胞 | MedChemExpress

研究团队发现,星形胶质细胞中的 cPLA2 的 C2 结构域与 MAVS 中的 CARD 结构域相互作用,在实验性自身免疫性脑脊髓炎 (EAE) 以及潜在的多发性硬化症 (MS) 中上调 NF-κB 驱使的转录,促进中枢神经系统 (CNS) 的炎症发生;cPLA2 被招募到 MAVS,破坏了 MAVS- 己糖激酶 2 (HK2) 间的相互作用,降低了 HK 的酶活以及参与神经元代谢的乳酸水平;Miglustat (一种于治疗 Gaucher 病和 Niemann-Pick 病的药物),能抑制星形胶质细胞的致病活性,改善 EAE。总而言之,这些发现定义了一种能驱动促炎性星形细胞的活动的新的免疫代谢机制,概述了 MAVS 在中枢神经系统炎症中的新作用,为治疗性干预提供了候选靶点。

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肿瘤前基质细胞驱动BRCA1介导的乳腺肿瘤形成

可分为四个小部分:**①背景:**具有BRCA1突变的女性发生遗传性乳腺癌的风险增加。BRCA1突变时肿瘤的发生与乳腺上皮细胞在癌前所出现的变化(分化改变、增殖性应激及基因组的不稳定)有关。然而,在BRCA1驱动的肿瘤发生过程中上皮细胞相关的基质环境所起的作用目前尚不清楚。**②研究方法及结果:**本研究使用单细胞转录组测序技术分析伴BRCA1突变但尚未发生肿瘤的乳腺组织及正常的乳腺组织,发现基质细胞产生大量的促增殖分泌信号来诱导上皮细胞的增殖。同时,该研究发现一群与癌前期相关的成纤维细胞,其可产生大量的促肿瘤因子包括MMP3,且在体内可促进BRCA1驱动的肿瘤形成。基因特征分析及上皮细胞分化的数据模型表明基质细胞诱导的增殖导致了伴分化改变的luminal前体细胞的积累,从而导致BRCA1突变者乳腺癌的风险增加。本研究进一步阐明了细胞间通讯的改变是如何导致上皮细胞稳态失衡进而导致癌症发生的。**③本研究的意义:**研究结果可能将为新的疾病监测和治疗策略奠定基础,以改善遗传性乳腺癌患者的管理。例如,CAF前特异性蛋白可作为癌前疾病发生的生物标志物,以权衡是否需要进行根治性双侧乳房切除术。此外,MMP抑制剂可以重新用于高危BRCA1突变女性的原发性癌症预防治疗。

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单细胞RNA-seq分析小鼠肺动脉高压内皮细胞

结果:小鼠特殊造模进行单细胞数据分析,并对不同内皮细胞进行细分得到相应的七个主要肺内皮亚型(动脉,静脉,毛细血管A,毛细血管B,淋巴管,增殖和“Sftp”) 。基于SCrna-seq和BulkRNA-seq两种分析得出抗原加工和呈递该通路中在肺高压造模小鼠的血管相关亚群细胞的特异性。后续确定毛细内皮B亚群对于细胞凋亡、迁移和血管生成基因有关也侧面证明了该亚群在肺高压疾病中的特殊性确定了一些特异性基因(Aqp1,Cav1,Bmpr2, Eng)并推断在人与大鼠中是否也具有特异性。进一步分析血管相关亚群探究确定了一个动静脉轴的差异变化确定了某些基因(Sgk1, Cd34, Sparc, Sparcl1)在疾病中对于动静脉轴的一个影响作用。

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Nucleic Acids Res. | 一个全面的药物耐受性信息数据库

今天为大家介绍的是来自Feng Zhu团队的一篇数据库论文。药物耐受性已经成为全球医疗保健中的一个关键问题。研究人员为揭示与药物耐受性相关的各种疾病,以及耐受性背后的不同分子机制,做出了很多努力。目前迫切需要一个数据库,不仅列出了所有具有药物耐受性的疾病(不仅限于癌症或感染),还包括所有类型的耐受性机制。因此作者研究开发了一个名为“DRESIS”的全面药物耐受性信息数据库。DRESIS的目的是:(i) 系统地首次提供所有现有类型的药物耐受性分子机制;(ii) 广泛覆盖所有现有数据库中最广泛的疾病范围;(iii) 明确描述最大数量药物的临床/实验验证的耐受性数据。由于药物耐受性问题日益严重,DRESIS预计对未来新药发现和临床治疗优化将具有重大意义。

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618数据洪峰来了 一键下单背后都有哪些技术支撑?

618大促来临,在零点的时候,你打开购物车、点点点、清空,整个过程一气呵成。但背后,成千上万的数据在马不停蹄、加速流转,以保障消费体验流畅有序。 腾讯云和数据库服务是背后默默守护的“无名英雄”。电商订单、支付、物流等核心链路,都是以数据库为基础。一旦数据库成为瓶颈、或任何细微的疏忽,整个618大促将会变成一个大型“灾难现场”。 一场电商大促,涉及到的数据量有多大? 以一个消费者的购买过程为例,一次下单行为,对于后端数据库就有多次读写调用;如果是秒杀场景就会产生“热点更新”的问题,更是对数据库内核优化能力

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Nat Biotechnol 恭喜胡鹏、邱琪丨吴昊团队开发同时检测DNA 5hmC/5mC修饰的单细胞测序技术

DNA胞嘧啶甲基化(5mC)是一种重要的表观遗传修饰,参与了细胞特异的基因表达调控、基因组稳定性维持等重要的过程。哺乳动物细胞中,DNA胞嘧啶甲基化可以被TET家族蛋白氧化,进而去甲基化,从而动态调控基因组中的胞嘧啶修饰( 图1a, b)【1】。胞嘧啶羟甲基化修饰(5hmC)是基因组中丰度最高的去甲基化中间产物(尤其在神经细胞中),可能发挥着重要的功能【2】。但是由于传统的亚硫酸盐测序技术(Bisulfite sequencing)无法区分5mC 和5hmC修饰(图1c),研究团队在2018年研发了ACE-seq技术能在单碱基分辨率上鉴定5hmC修饰【3】,然而如何在单细胞水平对这两种DNA修饰进行定量检测还是一个挑战。

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积分和“我的待办”新升级、轻享支持发表话题……来看4月新特性

‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍ 3月,积分功能有了一大波新特性,比如支持连续签到多加激励、新增了签到消息提醒激励,“我的待办”功能也全面上线。 这些更新让乐乐收到了许多客户的点赞:“提高了社区粘性”、“帮助管理员做好运营”…… 4月,乐乐又优化了更多新特性:积分界面全部优化、新增每周积分任务、签到弹窗提醒、我的待办可以放置到菜单栏……K吧、轻享、直播也有了新动态,一起来看看~ 每周积分任务,促活社区 在个人积分界面,新增了每周任务板块,提升成员赚积分的成就感,促进

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