我正在尝试绘制一个有100行的热图和树状图，但我发现该图看起来非常拥挤，并且树状图和名称重叠。datasets.flowingdata.com/ppg2008.csv", sep=",")
nba_heatmap<- heatmap</e
浏览 20提问于2016-07-26得票数 0
在调用NMF包aheatmap或heatmap.2时，如何使R绘制树状图标度(以便解释每个树状图的高度)和热图？这些树状图显示了规模：，这是执行plot(hclust(...))的默认行为，我想仿真一下，但不确定如何通过heatmap函数来实现。
浏览 0提问于2014-03-17得票数 1
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我在R中生成了以下热图使用以下代码。heatmap(data.matrix(data), col=colorRampPalette(c("yellow", "blue"))(64), labRow=NA, Rowv=NA)
我想用不同的列顺序来绘制热图这种列排序维护了树状图的拓扑，因此我还想继续绘制树状图。heatmap函数的R帮助提到了行
浏览 3提问于2013-12-11得票数 0
我正在尝试使用heatmap3来可视化我的细菌社区数据。我已经对我的样本进行了聚类，并且有一个来自hclust的树状图，我想用它在热图中排序我的样本，同时也显示树状图。但是，我要放入heatmap3中的数据文件已经崩溃到了属级，所以我以前的结构在heatmap3中并不是立即显现出来的，因此我不希望heatmap3尝试自己进行集群
浏览 5提问于2017-11-29得票数 0
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默认情况下，R的heatmap将对行和列进行集群：heatmap(mtscaled, scale='none')我可以禁用群集：然后树状图就消失了：
但是现在数据不再是聚集的了。我不希望显示树状图
浏览 1提问于2015-04-27得票数 10
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是否有可能删除树状图，保持行名和冒号的顺序，就像它与dendrogram = 'both'一样
这两个输出看起来都不一样，但我希望得到与第一个示例相同的没有树状图
浏览 4提问于2016-07-29得票数 0
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用树状图和样品标签绘制热图
、、、、
使用heatmap函数made4，我从示例文件中创建了这个热图树状图：heatplot(khan$train[1:30,], lowcol="blue", highcol="red本例中的标签是与热图第一次和顶部行相邻的正方形，用于表示每个样本的标签，以便人们可以看到标签是否与热图/树状图所显示的聚类
浏览 1提问于2013-07-25得票数 4
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我正在尝试使用heatmap.2来绘制具有热图的双树形图。我有两个预制的树状图，我将它们放到了Rowv = dend_row和Colv = dend_col中。问题是树状图也被重新排序了。我从软件包中了解到，在heatmap.2中，如果一个树状图是以Rowv / Colv格式输入的，那么它将被“按原样”使用，即不需要任何重新排序。因此，
浏览 1提问于2018-09-25得票数 1
为了制作一个热图，我需要把它从long改造成wide。d3heatmap(df2, scale = "column", colors = "Blues")1)命令行名："Domingo"，"Lunes“.到"Sábado把它们放在图形的左边。*我也想删除“记录”？(我不知道如何命名这些广场，上下)我已经尝试
浏览 2提问于2015-07-29得票数 1
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我正在尝试使用heatmap.2 (下面的代码)生成一些日志转换的折叠数据。seq(1,4,length=100)) # for green
heatmapdendrogram='none&
浏览 1提问于2015-01-15得票数 8
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以下是由gplots::heatmap.2创建的我的热图示例cor<-cor(df)
heatmap.2(cor,trace="none",col=bluered)#fig1
heatmap.2(
浏览 8提问于2014-02-19得票数 0
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我使用heatmap函数( heatmap(heatmap_16m, col=redgreen(75))在R中生成热图，以获得以下结果：正如你所看到的，它有一个正态分布的红色，黑色和绿色。由于heatmap函数不能提供任何图例，所以我切换到heatmap.2函数(heatmap.2(heatmap_16m, col= redgreen(75), trace="none"
浏览 0提问于2018-09-05得票数 0
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我想在网页上显示我在R中生成的热图(矩阵)。我的矩阵看起来像这样，但在我的例子中，大小是300x300。
我到处看了看，找不到很多东西。任何意见和建议，我们将在此非常感谢。
谢谢。
浏览 0提问于2011-12-13得票数 1
4回答
我正在尝试在同一个png或pdf中并排显示两个或更多热图。布局或mfcol在这种情况下不起作用。有没有人能帮帮我。
浏览 0提问于2013-02-27得票数 5
3回答
这里是新的R用户。我正在尝试将树状图添加到我使用ggplot2创建的热图中。我该怎么做呢？我已经将我的代码添加到下面的热图中。p <- p + scale_fill_gradient2(low=RtoBrange(100), mid="black", high=BtoGrange(100))谢谢你的帮忙
浏览 2提问于2016-08-03得票数 2
3回答
下面的代码用树状图创建1.Dendgram和2.heatmaphclustfunc <- function(x) hclust(x, method="completecutree(fit, k=5)
rect.hclust(fit, k=5, border="red")现在我想用树状图创建一个热图# plot
浏览 6提问于2013-12-03得票数 5
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我有一个基因表达数据集，并想显示一个热图的，一些的基因。首先，我想对所有的基因进行分层聚类，然后创建一个树状图，然后在这些基因的子集上创建一个热图。显式地说，heatmap将具有与已经创建的树状图相同的列，但显示的行较少。我试着使用下面的代码，但是它似乎是基于缩减矩阵对集群进行重新排序。scale = "none",
clus
浏览 2提问于2019-02-20得票数 0
6回答
我有一个1000*1000的矩阵(它只包括整数0和1)，但当我试图制作一个热图时，因为它太大而出错。
如何使用如此大的矩阵创建热图？
浏览 1提问于2011-04-15得票数 16
2回答
首先，有谁知道如何缩小树状图与颜色行之间的距离？然后，如何缩小颜色行与实际热图之间的距离。第二，树状图的底部确实是压扁的，很难读懂。有谁知道如何改变树状图中的线条长度吗？下面是我用来创建heatmap的代码 '&#
浏览 4提问于2021-04-10得票数 0
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