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D3库实践笔记之几类特定图表与布局 |可视化系列37

饼图布局 在v3.x版本中，d3的布局在d3.layout接口下，通过d3.layout.pie()创建一个饼状图布局，而到v5x及最新的v6之后，是d3.pie()，不再使用d3.layout系列，在控制台输入...d3-hist 力导向图 力导向(force-directed)图布局效果通过d3.forceSimulation(nodes).force()实现，将输入的节点表和关系表转换为带坐标点方便SVG里绘制...在d3中通过d3.chordDirected()(matrix)得到需要的数据，具体代码如下，因为还需要绘制节点的排布效果，因此会调用d3.arc()。...d3-chord 分层树图 要绘制思维导图等分层的树图，在d3中使用的是d3.hierarchy(data)转换为层级数据，再通过d3.tree()(data)建立树的节点，用svg里的...绘制节点，用绘制边，从而有流线的效果。

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Gephi实战，从零开始

Force Atlas及Force Atlas2 Force Atlas及Force Atlas2为力引导布局，力引导布局方法能够产生相当优美的网络布局，并充分展现网络的整体结构及其自同构特征，所以在网络节点布局技术相关文献中该方法占据了主导地位...通过这个可以看出哪些节点的度高，反应出连接他的点就多，就越关键 weightedDegree(平均加权度)： 加权入度 加权出度 加权度 有向图：取得每个点的边，如果该边的源为该节点，那么该边的权重为加权出度...计算出每个点的加权出度，入度和度 其实平均度是平均加权度的一个特例，平均度的每条边的权重为1 加权度为加权出度和入度的总和 计算同样入度出度的节点个数 无向图：取得每个点的边，将边的权重求和，即为该点的加权度...graphdensity(图密度)：无向图： 边数2 / （节点数节点数-节点数） 有向图： 边数 / （节点数节点数-节点数） 大概理解： （节点数节点数-节点数） 这个计算出最多的连接边数(不包含连自己...预览 选择 "节点标签" -> "显示标签" -> "选中打钩"，在"字体"中调整字体的大小等。选择 "边标签" -> "显示标签" -> "选中打钩"，点击"刷新"。 效果如下： ?

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    图布局算法的发展

    在力导向布局算法出现后的近十年中，研究者们主要的研究内容集中在模型的改进和减少绘制时的边交叉等问题，主要偏重于理论研究，在数据集的选取上均为规模较小（几十至几百顶点数）的、具有特定结构的图数据。...由于数据规模的增大，不可避免的出现了表示混乱的问题，在2009年，Holten等人首次提出边捆绑的概念（Edge bundling）并将其应用到图布局的展现上 [25] ，其提出在边绑定时要遵循一种“位置关联...”的规则，即像长短差异很大或是距离间隔很远的边不应该捆绑在一起，这种方法的使用大大提高了图布局结果的展现能力，直到最近边捆绑技术仍然是图可视化研究的热点 [26] 。...在这之后的布局算法中，美学设计被提到了和算法本身同等的位置，边捆绑等技术得到了快速的发展。...其中，D x i 会向画布中靠近点 x i的点 x 1,…, x n 贡献密度值，上式的求和包括斥力和引力两部分，在计算引力时通过公式中的 w ij （边的权值）来作用使之将关联性强的节点放置在相近的位置

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    cytoscape中文手册推荐（配视频）

    网络中的节点代表生物分子（如基因、蛋白质等），边代表它们之间的关系（如相互作用、调控等）。用户可以自定义节点和边的样式、颜色、标签等，以便更好地展示网络结构和功能。...") 上述代码创建了一个包含3个节点和3条边的简单网络图，然后使用“force-directed”布局算法对网络进行布局，并将结果传递给Cytoscape进行可视化。...，最后使用“force-directed”布局算法对网络进行布局，并将结果传递给Cytoscape进行可视化。...将WGCNA的模块信息导出为CSV文件，其中包括每个节点的名称和所属的模块。 在Cytoscape中导入你的基因网络数据，创建节点和边。...在Cytoscape中导入WGCNA的模块信息CSV文件，将每个节点与对应的模块进行关联。 根据模块信息，设置节点的样式，比如根据模块给节点上色。 使用Cytoscape的布局算法对网络进行可视化。

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    D3.js 力导向图的显示优化

    d3-force 是 D3.js 实现以模拟粒子物理运动的 velocity Verlet 数值积分器的模块，可用来控制粒子和边秩序。...在力导向图中，d3-force 中的每个节点都可以看成是一个放电粒子，粒子间存在某种斥力（库仑斥力）。同时，这些粒子间被它们之间的“边”所牵连，从而产生牵引力。...而 d3-force 中的粒子在斥力和牵引力的作用下，从随机无序的初态不断发生位移，逐渐趋于平衡有序。整个图只有点 / 边，图形实现样例较少且自定义样式居多。...首先我们创建一个力导向图：this.force = d3 .forceSimulation() // 为节点分配坐标 .nodes(data.vertexes)...基于上述的方法，笔者有了另一种解决思路——保证新增节点是在该选中拓展的节点周围，也就是说直接把新增节点的坐标设置为对应选择拓展节点一样的 x,y 坐标而不用 D3 .forceSimulation().

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    【D3.js - v5.x】（5）绘制力导向图 | 附完整代码

    这些数据是不能作图的，因为不知道节点和连线的坐标。 于是，我们想到布局。...center", d3.forceCenter()); d3.forceSimulation().force(name)，也就是当force中只有一个参数，这个参数是某个力的名称，那么这段代码返回的是某个具体的力...每个 node 必须是一个对象类型，下面的几个属性将会被仿真系统添加: index - 节点在 nodes 数组中的索引 x - 节点当前的 x-坐标 y - 节点当前的 y-坐标 vx - 节点当前的...如果想要某个节点固定在一个位置，可以指定以下两个额外的属性: fx - 节点的固定 x-位置 fy - 节点的固定 y-位置 d3.forceLink.links()，这里输入的也是一个数组（边集），...因为在d3中，各元素是有层级关系的， 边上的文字 var linksText = g.append("g") .selectAll("text") .data(edges) .enter() .

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    Gephi网络图极简教

    2.图相关的概念和术语 节点与边 无向图和有向图 Co-occurrence网络图与 相关性网络图 （两个矩阵的相关性） 权：图中的边或弧上有附加的数量信息，这种可反映边或弧的某种特征的数据成为权。...网：图上的边或弧带权则称为网。可分为有向网和无向网。 度：在无向图中，与顶点v关联的边的条数成为顶点v的度。...平均度（Average degree）：表示每个节点连接边的平均数，如果络图是无向图，平均度的计算为 2*edges/nodes。...节点设置 7.边设定 在【外观】中选择【边】Partition 渲染方式选择pn即我们数据中相关性标签；Ranking选择【度】。...生成gexf需要用到布局算法, 常见的有 Force-directed_graph_drawing 力导向算法, 算法的核心思想是节点之间产生斥力,边给两个节点提供拉力,通过多次迭代最后维持一个稳定状态

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    知识图谱可视化技术在美团的实践与探索

    图分析应用：对业务场景中的关系类数据进行可视化展示，帮助业务同学快速了解链路故障、组件依赖等问题。 技术品牌建设：通过知识图谱向大家普及人工智能技术是什么，以及它能做什么，让AI也具备可解释性。...视觉降噪-文字-四叉树 边处理 多边散列排布 知识图谱中存在包含大量出（入）边的中心节点，在对这些中心节点的边进行可视化展示时，往往会出现边与中心节点联结处（Nexus）重叠交错在一起的情况，进而影响视觉体验...知识图谱可视化：成簇布局、环路布局、节点寻路算法、画布的缩放与拖拽、节点锁定操作、聚焦呈现。 辅助信息：推荐菜、菜品标签、店铺标签词云、情感曲线、细粒度情感分析、相似餐厅。...节点样式优化 3d-force-graph中默认节点就是基础的SphereGeometry 3D对象，视觉观感一般，需要更有光泽的节点，可以通过下面的方案实现。...3D-节点纹理 3D动效 为了在3D场景下有更好的效果，还需要添加一些动效。 镜头游走 我们利用了内置的相机进行四元数的旋转计算。

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    62个有用的图形可视化库

    AfterGlow 1.6.5的最新版本于13/08/17发行。 02 Alchemy.js 内置在d3中的JavaScript图形绘图应用程序，用于启动和运行图形可视化应用程序。...05 Circos Perl中的软件包，用于可视化数据和信息。它以圆形布局可视化数据。...D3结合了可视化组件和数据驱动的DOM操作方法。 09 Dagre-d3 根据MIT许可证发布的JavaScript库，用于在客户端布置有向图。...16 GGraph 图形可视化库，用于根据Apache 2.0许可发布的大数据。它建立在顶级D3之上，扩展了节点的概念以及与节点组的链接。...24 Graphvy 使用Kivy进行的基本图形(数据)浏览和可视化，并根据MIT许可发布。 25 H3Viewer 一个JavaScript库，提供3D双曲空间中节点链接图的布局和导航。

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    05-Nebula Graph 图数据 可视化

    图数据库的可视化 Nebula本身自带的Studio 虽然很好用, 但是并不能直接嵌入到业务系统中, 也不能直接给客户用, 所以我找了好多也没有说直接能展示图关系的, 但是我看网上好多都说是基于D3....js就可以做, 但是我是一个后端呀, D3相对复杂, 但是需求刚在眼前还是要做的.....nodes') .selectAll('g') .data(data.nodes) .enter() .append('g') // 这个是悬浮节点展示线路的标签...最重只能在语法上进行处理, 通过两个函数和管道符循环,来完成, 但是会吧节点和关系拆开, 拆成两个列.., 不过也算是能返回结果了 然后在程序里面处理, 转为D3需要的数据结构 导入需要的模型类 package...indexs.add(se); } } } // 解决图数据库存在自环边的问题

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    Graphviz 使用教程

    它的输入是一个用dot语言 编写的绘图脚本，通过对输入脚本的解析，分析出其中的点，边以及子图，然后根据属性进行绘制。...-V 返回 graphviz 的版本信息则表示安装、路径配置完成 dot - graphviz version 4.0.0 (20220529.0937) 使用 布局引擎 graphviz中包含了众多的布局器...： 布局方式 描述 dot 默认布局方式，主要用于有向图 neato 基于spring-model(又称force-based)算法 twopi 径向布局 circo 圆环布局 fdp 主要用于无向图...-o test.png image.png 图文件配置 也可以在图的生成文件中配置属性 以上文示例为例，如需要通过配置 graph 属性为图形添加红色的标题，并配置node 属性，可以修改配置文件：...dot.graph_attr['splines'] = 'true' # 禁止节点重叠 dot.graph_attr['overlap'] = 'false' # 添加节点 dot.node('A',

    2.8K20

    【数学建模】——【python】实现【最短路径】【最小生成树】【复杂网络分析】

    构建图并添加边： 使用 networkx.Graph() 创建图对象。 使用嵌套的 for 循环，将矩阵中的距离作为边的权重添加到图中。...（2）绘制结果应清晰地展示MST中的所有边和顶点，并且可以通过边的颜色或粗细来区分MST中的边与其他边。 （3）标注MST的总权重。...要点： 定义边列表： 创建一个包含边的列表，每个元素是一个三元组 (起点, 终点, 权重)。 构建图并添加边： 使用 networkx.Graph() 创建图对象。...总结三个问题 这三个问题分别涉及图论中的最短路径问题、最小生成树问题以及结合这两种方法的复杂网络分析。...第一个问题使用Dijkstra算法计算并可视化了从一个指定城市到其他所有城市的最短路径，第二个问题使用Kruskal算法找到并绘制了一个无向带权图的最小生成树，第三个问题在最小生成树的基础上，使用Dijkstra

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    可视化布局算法的框架设计

    FRLayoutConifg 私有：K值、阈值、是否有向、冷却值、温度值 gvbd.graph 定义布局数据结构的包,包含图+边+节点等类的定义...gvbd.evaluate 节点价值的计算 布局结束之后获得全部节点的坐标数据，开始可视显示 使用d3/Gephi等等 整个后台代码可大致分为四个部分：基础数据结构、配置类...、绑定类、布局类 基础数据结构 这里要注意Graph类的成员变量只含一个Node类对象数组，对于Node类，要特别关注，其既包含节点本身的信息，也包含节点涉及的边的信息，对于边Edge类，其包含起始点和目标点...//节点名称 private String nodeLabel; //节点标签 private String nodeValue; //节点权重值...该方法主要是传入输入数据的文件流参数，在GraphData类中默认实例化一个Graph类对象，并通过上述load方法对Graph对象的节点和边进行初始化。

    1.5K30

    Python 图_系列之基于邻接炬阵实现广度、深度优先路径搜索算法

    边可以有方向也可以没有方向，有方向的边又可分为单向边和双向边。 如下图（项点1）到（顶点2）之间的边只有一方向（箭头所示为方向），称为单向边。类似现实世界中的单向道。...图的类型： 综上所述，图可以分为如下几类： 有向图： 边有方向的图称为有向图。 无向图： 边没有方向的图称为无向图。 加权图： 边上面有权重信息的图称为加权图。 无环图： 没有环的图被称为无环图。...当然，权重是可以省略的，但一般研究图时，都是指的加权图。 如果用 G 表示图，则 G = (V, E)。每一条边可以用二元组 (fv, ev) 也可以使用 三元组 （fv,ev,w） 描述。...add_vertex( vert )：向图中添加一个新节点，参数应该是一个节点类型的对象。 add_edge(fv，tv )：在 2 个项点之间建立起边关系。...，to_v 节点的编号为列号 self.matrix[from_v.v_id][to_v.v_id] = weight 添加边信息的方法有 2 个，一个用来添加无权重边，一个用来添加有权重的边

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    纵览全局垂直打击的组织模式（下）

    可视化页面 这里采用的是 D3.js 进行的可视化呈现，基本上是复用的 d3 的官方模板，但将文本信息一并和节点进行可视化展示。...这段代码首先需要被抽取出来，这对于 d3 来说非常简单，只需注意引入的JavaScript库以及使用的json文本数据。...，这里利用了类节点和标签节点出现的次数，来分辨两种节点的种类，因为绘制时类节点和标签节点都是一视同仁的被绘制。...，得到的类节点的次数一定是100的倍数，而标签节点的次数一定小于100，这个值可以设的很大，从而让两者不可能出现交集。...例如上述代码需要给定节点的大小，类节点的次数统计可能是100-4800（1-48次），而标签节点的次数却是1-10（1-10次），如是，两者应绘制的一样大。

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    edgebundleR一行代码优雅的绘制网络图

    levels(clr) <- c("#DE9ED6FF", "#709AE1FF", "darkorange") V(g)$color <- as.character(clr) # 绘制图形，使用圆形布局...，顶点大小为度的5倍，不显示顶点标签 plot(g, layout = layout.circle, vertex.size = degree(g) * 5, vertex.label = NA) 图片...(factors = as.factor(d$ID), xlim = c(0, 10)) # 创建轨道绘图区域，使用数据中的ID作为因子，设置y轴范围为0到0.5，背景颜色根据图中节点的颜色设定，不显示边界线...较低的值会产生较直的边，而较高的值会产生更弯曲的边。这里设置为 0.1。 cutoff: 边捆绑的阈值参数，控制捆绑边的密度。较低的值会产生更多的捆绑边，而较高的值会产生较少的捆绑边。...fontsize: 边标签的字体大小。这里设置为 18。 padding: 边捆绑图的内边距，控制图形的边缘空白区域的大小。这里设置为 40。 图片

    47500

    原创 | 决策树在金融领域的应用（附链接）

    如图1所示决策树算法算出了下面的这棵决策树： 图1 决策树算法示例 可以看出，在这个决策过程中，我们一直在对记录的特征进行提问。...最初的问题所在的地方叫做根节点，在得到结论前的每一个问题都是中间节点，而得到的每一个结论都叫做叶子节点。 决策树算法的核心是要解决两个问题： （1）如何从数据表中找出最佳节点和最佳分枝？...其他技术通常专门用于分析仅具有一种变量类型的数据集。 （5）能够处理多输出问题，即含有多个标签的问题，注意与一个标签中含有多种标签分类的问题区别开。 （6）是一个白盒模型，结果很容易能够被解释。...本章节参照以往非法交易识别文献分析以及当前融资交易行为的分析，选取了交易强度特征、交易频度特征这两个基础交易特征，并进一步添加关联地址特征，获取关联地址的实体标签数据用于恐怖融资地址预测。...其中在这些交易数据中，节点表示比特币交易中的实体，边表示比特币交易实体间的交易关系和方式，该交易网络数据集一共分为三个数据表，如下表2所示各个表的数据说明。

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    《使用D3设计交互式图表》简读笔记|可视化系列31

    本书思维导图简要版 D3技术基础 D3操作的是Web上的文档，可以便捷快速地向全世界发布可视化作品，对操作系统和设备的依赖很低。...一个基础的svg示例如下，表示一个半径为20像素的圆形。...d3的select()方法传入一个 CSS 选择符，返回DOM 中匹配的第一个元素的引用。...我们在选择了需要操作的svg元素后，需要添加rect(矩形)等图形，用append()方法添加元素，insert()方法在所选元素前添加一个元素。用remove()方法在DOM中删除元素。...关于D3，可以继续深入学习内容参考如下： •交互：通过绑定事件监听器和定义行为实现图形和键鼠的交互；•过渡动画：同样通过事件监听和缓动实现过渡效果和数据更新；•各种布局：通过饼图布局实现柱状图变旭日图、

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