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20231221-R语言绘图-上-生物技能树学习

1 基础包-绘图函数高级绘图函数可以直接独立绘图低级绘图函数直接运行会报错，需要在高级绘图函数的基础上来进行元素的添加与修改2 ggplot2-R包学习（1）入门级绘图模板1基本代码ggplot (data...=画图的数据)+geom_point(作图函数(mapping=aes(x=X轴的列，y=Y轴的列))这个包的特殊语法：列名不加引号，行末加加号（除了最后一行）两个函数连接或者是行连接需要使用加号连接2...y=Petal.Length),color="blue",size=5, alpha=0.5, shape=8)颜色是字符串或者指定的列里的字符串大小单位是mm点的形状是数字编号表示，20个数字代表20...+geom_point(mapping=aes(x=sepal.Length, y=Petal.Length，color=species,shape=species))映射内指定具体颜色ggplot(data...color与fill两个属性的区分当一个图形不分边框和填充时，只需要使用color当一个图形的属性有边框和填充，边框颜色color fill是内心填充色4 分面：把一张图变成多张子图ggplot(data

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原创 | R的基础及进阶数据可视化功能包介绍

其次，我们需要根据数据确定X轴、Y轴，以及X轴Y轴的取值范围，因为一个平面直角坐标系在R绘图过程中是必不可少的。...最后，我们还可以在画布上添加额外信息，例如图表名称，图例等，当然我们也可以根据需求使每个数据点在图表中呈现不同的颜色和形状、并排绘制多个图表等。...在拥有坐标系的基础上，我们便可以描绘数据点，注意此处默认图表类型是点状图。 在plot()语句括号中，逗号前我们定义了数据点的X轴坐标值，逗号后定义了对应数据点的Y轴坐标值，两个都是用数组的方式表达。...Figure 5 plot()在特定位置添加文本信息 和text()同理， legend() 语句可对图表呈现方式进行标注方便理解， lines() 语句允许我们在散点图的基础上加入折线图并且调整折线的粗细...data=mpg表示使用的数据集为mpg，mapping中是定义了映射到图表X轴、Y轴的数据属性，以及每个数据点的颜色（映射在X轴上的数据属性是displ，Y轴是hwy，颜色则按照数据集中class的种类标注

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    ggplot2优雅的自定义绘制圈图

    欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍如何使用packcircles来计算圆圈大小通过ggplot2来绘制圈图，下面小编就通过一个案例来进行展示数据为随意构建无实际意义仅作图形展示用，添加了详细的注释希望各位观众老爷能够喜欢...，并为每个圆圈指定一个id df_plot % mutate(id = 1:5) # 利用circleLayoutVertices函数生成每个圆圈上的点的坐标信息...() + # 利用geom_textpath绘制围绕圆圈的文字标签 geom_textpath(data = df, aes(x, y, label = title), hjust = "ymax...",size = 4.5) + # 利用geom_text绘制圆圈内的文字标签，数字使用逗号分隔方便阅读 geom_text(data = df_plot, aes(x , y, label =...，即无背景和坐标轴 scale_pattern_filename_discrete(choices = image) + # 设置图案的选择 theme(legend.position = "none

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    从零开始的异世界生信学习 R语言部分 05 作图-1

    ：列名不带引号，行末写加号（加号表示不同函数之间的连接） library(ggplot2) #1.入门级绘图模板：作图数据，横纵坐标 ggplot(data = iris)+ geom_point(...，线型等） 3.2.1手动设置，需要设置为有意义的值 图片 color 颜色，可以用RGB编码值的字符串 size 大小，只能用数字 shape 形状，数字编号 alpha 透明度，0x的数字 fill...，才需要color和fill两个参数 ggplot(data = iris)+ geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length,...150个值 图片 3.2.4 几何对象 指一个以geom开头的函数画出来的所有东西称为一个几何对象，也称为了一个图层 几何对象可以叠加 #4.几何对象 #局部设置和全局设置 ggplot(data...= mpg, mapping = aes(x = class, y = hwy)) + geom_boxplot() + coord_flip() ##可以实现X轴，Y轴的转换 图片 #极坐标系

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    Day7：R语言课程 (R语言进行数据可视化)

    映射的例子包括： 位置（即在x和y轴上） 颜色（“外部”颜色） 填充（“内部”颜色） 形状（点数） 线型 尺寸 首先，必须添加x轴和y轴的位置，因为geom_point需要有关散点图的最基本信息，即要在...x和y轴上绘制的内容。...添加size参数，用数字指定点的大小： ggplot(new_metadata) + geom_point(aes(x = age_in_days, y= samplemeans, color =...ggscatter4 x轴和y轴上的标签也很小，难以阅读。要更改其大小，需要添加其他主题图层。...添加图层xlab()和ylab()，改变x轴和y轴的标签。将这些图层添加到当前图中，x轴标记为“年龄（天）”，y轴标记为“平均表达量”。 使用ggtitle图层为绘图添加标题。

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    Learn R 画图1-3

    plot(iris[,1],iris[,3],col = iris[,5]) #x轴-iris[,1],y轴-iris[,3] > text(6.5,4, labels = 'hello') #6.5,4...) #代表着模版不是具体的代码 #代表画图的函数 #写横纵坐标 列名不带“” #“+”代表ggplot()和geom_point()两个函数是同一张图...#ggplot2的特殊语法：列名不加引号，行末写加号 ggplot例子 > ggplot(data = iris)+ + geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length...，是具体的颜色···手动设置 Q2 区分color和fill两个属性 Q2-1 空心形状和实心形状都用color设置颜色 > ggplot(data = iris)+ + geom_point(mapping...+ facet_grid(Group ~ Species) #group取值是横着的，species是竖着的 图片 图片 4.几何对象 #一个函数生成的所有的点所组成的图像,可用加号进行叠加

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    【数据分析 R语言实战】学习笔记 第四章 数据的图形描述 （下）

    4.6.2分图层绘图 (1)数据和映射 ggplot(data，mapping=aes(x，y, )) 其中，data指定数据集:参数mapping用于构建映射，通常使用函数...=clarity))#定义的第一图层存储于p中 (2)几何对象 基本图层确定了数据源和映射后，通过加号(+)就可以不断地添加新图层.第二图层添加几何对象类的函数，在图中绘制图形元素其他类型的图形，如直方图...使用标度类的函数，相当于添加一个新的图层，因此仍然用“+”连接函数，除了基本图层ggplot()其他图层的设置都可以应用于函数qplot() 设置坐标轴样式的标度函数一般以“scale x"开头 ?...()+stat_smooth() 第二图层添加散点;第三图层对Y轴作log10变换;第四图层添加平滑的统计变换 (5)分面 当我们想要观察某一分类变量对数据的影响情况时，仅通过shape, color区分是不够的...这时就要用到facet数，它控制数据分组的方法和排列形式，进行条件绘图。 常用的函数是facet_wrap(~x, ncol)，其中x表示分组变量，ncol表示图形的排列方式，即分成几列。

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    这些条形图的用法您都知道吗？

    ，有两点需要说明，一方面，在ggplot2绘图过程中均采用图层思想，将多个图形进行叠加和设置；另一方面，图层思想是通过代码中的加号（+）表现出来的。...；如果设置为FALSE，则不显示任何图例；如果设置为TRUE，则显示图例； inherit.aes：bool类型的参数，绘图时是否延用ggplot函数中的数据和轴属性，默认为TRUE；根据作者的经验，如果...(data = df, # 指定绘图数据 # 指定x轴和y轴的变量 mapping = aes(x = Province, y = GDP)) + # 绘制条形图...' # 填充色为铁蓝色 ) + # 删除x轴的标题 labs(x = '')# 绘制有序的条形图 p2 ggplot(data = df, # 要求x轴的省份按...如上图所示，使用grid.arrange函数将两张图组合在一个图框内，其中左图是使用geom_bar函数直接生成的原始图形，右图则是在左图的基础上添加了三项功能，分别是条形图的排序（代码中reorder

    5.6K10

    R语言可视化及作图7--ggplot2之标签、图例和标题绘制

    美学函数 R语言可视化及作图5--ggplot2基本要素和几何对象汇总 R语言可视化及作图6--ggplot2之点图、条形图、盒形图、直方图、线图 * 1....() #使用geom_text绘制标签散点图 使用geom_label绘制标签散点图 p+geom_label() 绘制点，并通过nudge参数对标签进行x轴和y轴上的平移 p+geom_point(...(x=4,y=40),label='y==1.2+x^2',parse = TRUE,size=7) #如果parse=FAKSE,图形上显示的就直接是y == 1.2 + x^2，而不是图上的公式。...图例绘制 2.1 guide_legend函数（主要参数：color, shape, size） 图例调整函数也属于标度函数的一类，但不可以直接使用加号来连接，必须放在函数中，作为一个参数。...标题绘制 标题主要有五种：主标题，副标题，角注，x轴标签和y轴标签 p ggplot(mtcars,aes(mpg,wt,color=factor(cyl)))+geom_point() p+ggtitle

    5.7K10

    ggplot2|详解八大基本绘图要素

    数据与映射部分介绍了ggplot函数执行各种属性映射，只需要添加不同的几何对象图层，即可绘制出相应的图形。...等可更改的参数 第三个是具体的类型 此处仅介绍颜色设置和坐标轴设置函数的一些用法，其他类似。...2 坐标轴标尺修改（x , y） 本部分主要是对坐标轴做如下改变， 更改坐标轴名称 更改x轴上标数的位置和内容 显示对一个轴做统计变换 只展示一个区域内的点 更改刻度标签的位置 实现上面的这些可以使用scale_x...可以进行变换，例如XY轴翻转，笛卡尔坐标和极坐标转换，以满足我们的各种需求。...七 图层（Layer） ggplot的强大之处在于直接使用+号即可实现叠加图层，前面散点图添加拟合曲线即为图层叠加。

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    2021-05-08：给定两个非负数组x和hp，长度都是N，再给定一个正数range。x有序，x表示i号怪兽在x轴上的位置

    2021-05-08：给定两个非负数组x和hp，长度都是N，再给定一个正数range。x有序，x[i]表示i号怪兽在x轴上的位置；hp[i]表示i号怪兽的血量 。...range表示法师如果站在x位置，用AOE技能打到的范围是：[x-range,x+range]，被打到的每只怪兽损失1点血量 。返回要把所有怪兽血量清空，至少需要释放多少次AOE技能？...0开始，但在arr里是从1开始的 // sum[]模拟线段树维护区间和 // lazy[]为累加懒惰标记 // change[]为更新的值 // update[]为更新慵懒标记...{ ret.arr[i] = origin[i-1] } ret.sum = make([]int, MAXN的累加和信息...信息 this.pushUp(rt) } // 1~6 累加和是多少？

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    散点图及数据分布情况

    添加回归模型拟合线 5.7 根据已有模型向散点图添加拟合线 5.8 添加来自多个已有模型的拟合线 5.9 向散点图添加模型系数 5.10 向散点图添加边际地毯 5.11 向散点图添加标签 5.12 绘制气泡图...当设定为包含两个数值的向量时 #两个数值分别对应于x轴范围的上下限. # samples: x轴上包含的样本量 # ...: 更多参数 predictvals 的x轴范围是一样的了 5.9 向散点图添加模型系数 Q：如何向图形添加模型信息？...A：边际地毯图实际上是一个一维的散点图，可以用于展示每个坐标轴上数据的分布情况，调用geom_rug（）函数即可。...当x轴y轴都是分类变量的时候，气泡图可以表示网格点上的变量值 ##使用数据集HairEyeColor包含了592个学生头发眼睛颜色的分布 # 创建一个数据框，对男性组和女性组计数求和 hec <- HairEyeColor

    8.2K10

    如何通过R语言制作BBC风格的精美图片

    image.png 这就是bbc_style（）函数实际上是在做什么。 它本质上修改了ggplot2的主题功能中的某些参数。例如，第一个参数是设置绘图标题元素的字体，大小，字体和颜色。...添加注释 向绘图添加文本注释的最简单方法是使用geom_label： multiple_line + geom_label(aes(x = 1980, y = 45, label = "I'm an annotation...根据数据添加标签 上面的向图表添加注释的方法使您可以精确地指定x和y坐标。 如果我们想在特定位置添加文本注释，这将非常有用，但是重复起来将非常繁琐。...将左对齐标签添加到条形图 如果您想为条形图添加左对齐标签，只需根据数据设置x参数，而是直接使用数字值指定y参数。y的确切值将取决于数据范围。...这些数字分别指定顶部，右侧，底部和左侧的边距-但您也可以直接指定要更改的边距。

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    2024-02-28：用go语言，有一个由x轴和y轴组成的坐标系， “y下“和“y上“表示一条无限延伸的道路，“y下“表示这个道

    2024-02-28：用go语言，有一个由x轴和y轴组成的坐标系， "y下"和"y上"表示一条无限延伸的道路，"y下"表示这个道路的下限，"y上"表示这个道路的上限， 给定一批长方形，每一个长方形有(x1...像素点是水平或竖直方向连接的。 给你两个整数 x 和 y 表示某一个黑色像素的位置。 请你找出包含全部黑色像素的最小矩形（与坐标轴对齐），并返回该矩形的面积。...7.在minArea函数中，调用辅助函数获取左边界、右边界、上边界和下边界，并计算矩形的面积（(right - left + 1) * (down - up + 1)）。...8.在main函数中，定义一个示例图片image和给定的点(x, y)，调用minArea函数并将结果打印出来。...总的额外空间复杂度：除了存储输入数据和输出结果的额外空间外，代码没有使用其他额外的空间，因此总的额外空间复杂度为O(1)。

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    图形添加文本-ggfittext

    今天是大年初三，想必小伙伴们都放假在家陪着爸爸妈妈，吃着家乡的饭，和家人一起过节，小编在这里给大家拜个年~祝大家新年新气象，新年好运气有福气，工作顺利，身体健康~ 接下来小编向大家介绍一个相对简单的绘图添加文本的...install.packages("ggfittext") #安装包 library(ggfittext) head(animals) #查看数据，动物相关数据 1.在box上添加文本 (1)默认参数绘制...") + geom_fit_text() #默认参数 (2)改变文字的大小 ggplot(animals, aes(x = type, y = flies, label = animal))...的添加文本geom_bar_text() (1)默认参数 ggplot(altitudes, aes(x = craft, y = altitude, label = altitude)) + geom_col...place = "left") + #position = "dodge" 条形躲避 coord_flip() #横向转换坐标，把x轴和

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    python单细胞学习笔记-day5

    一句代码前后要加() 列名要带引号 形状不能用数字 用加号连接的代码不缩进 示例数据 还是使用的seaborn模块里面的iris数据： import pandas as pd iris = pd.read_csv...颜色：字符串，blue，red或者颜色编码（后面介绍） 大小：单位mm 形状：数字编号表示 shape o . , v ^ 1 2 3 4 s p * h H + x D d 形状 圆圈 点 像素点...倒三角 正三角 左三角 右三角 下箭头 上箭头 左箭头 右箭头 正方形 五角形 星号 六边形 另一种六边形 加号 叉号 菱形 瘦菱形 修改颜色：color='blue' (ggplot(data=iris...可以使用 scale_xx_manual 的函数 具体的颜色名： (ggplot(data=iris) + geom_point(aes(x='sepal_length', y='petal_length...(values=['#2874C5', '#e6b707', '#f87669'])) 2.2.2 最好的配色库pypalettes 上一节课也出现了这个配色网址：在这里看有哪些配色，2500+种！

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    R语言学习 - 线图绘制

    画图最喜欢的格式 # 好好体会下这个格式，虽然多占用了不少空间，但是确实很方便 # 这里可以用 `xvariable`，也可以是其它字符串，但需要保证后面与这里的一致 # 因为这一列是要在X轴显示，所以起名为...，但存储的实际是字符串 (因为是作为行名字读取的)，需要转换为数字。...# 注意断行时，加号在行尾，不能放在行首 p ggplot(data_m, aes(x=xvariable, y=value,color=variable,group=variable)) +...element_text(angle=45,hjust=1, vjust=1)) p dev.off() 比较下位置信息做为数字(前面的线图)和位置信息横轴的差别。...至此完成了线图的基本绘制，虽然还可以，但还有不少需要提高的地方，比如在线图上加一条或几条垂线、加个水平线、修改X轴的标记(比如0换为TSS)、设置每条线的颜色等。具体且听下回一步线图法。

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    ggplot2--R语言宏基因组学统计分析(第四章)笔记

    stat可以向数据集添加新变量。将几何映射到这些新变量是可能的 几何体：是指绘制来表示数据的几何对象；每个geom控制我们创建的打印类型。...4.3.3 使用ggplot()绘图 4.3.3.1 创建一个层叠的图 ggplot2语法的第一个明显特性是分层，这意味着一个图至少由一个层创建，并通过使用gglot()函数向现有图添加更多玩家来增强。...4.3.3.3 使用坐标系统来调节和限制X轴和Y轴 坐标系的用途是在计算机屏幕上调整从坐标到二维平面的映射。在ggplot2中可用的不同坐标系中，笛卡尔坐标系和极坐标系是最常用的坐标系。...4.3.3.4 添加标签图层以更改标题和轴标签 默认情况下，由ggplot2创建的绘图没有任何标题，并且带有与绘图中使用的变量名相对应的轴标签。...但是，在某些情况下，例如出版物，我们可能希望将标题添加到绘图中，也可能希望更改X轴和Y轴标签。

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