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R||R语言基础(三)_R

今天继续学习R语言基础的R包使用,以R包:dplyr为例 数据准备 01 R包的安装 install.packages(“dplyr”) 或BiocManager::install(“dplyr”)...#务必要打引号 02 R包的调用/加载 library(dplyr) 或require(dplyr) #这里不用引号 部分人可能会因为镜像的问题失败,解决方法https://mp.weixin.qq.com.../s/XvKb5FjAGM6gYsxTw3tcWw 03 R包及数据准备 install.packages("dplyr") library(dplyr) test <- iris[c(1:2,51:52,101...经过这几期的R语言基础,你应该能够入门R了,渐渐的也要自己去学会看帮助文档,去搜报错,还记得怎么搜命令和R包的帮助文档吗? ?...+命令 #搜命令帮助文档 help(package='R包') #搜R包帮助文档 如果你能独立处理这些问题,那么恭喜你,你的R应该没问题啦! 应该没问题了!!!!吧?

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R||R语言基础(一)

学习生信时,最常用的可视化软件就是R,可大家在使用的时候又好像用的是Rstudio,究竟什么是R和Rstudio? R是一种编程语言,也是统计计算和绘图的环境,它汇集了许多函数,能够提供强大的功能。...RStudio提供了一个具有很多功能的环境,使R更容易使用,是在终端中使用R的绝佳选择。...01 安装R 进入R的官网https://www.r-project.org/ 第一步 点击红框中的download R 第二步 在镜像这里中选择第一个 第三步 接下来按照红框点点点就能完成R的安装...第四步 第五步 R语言软件界面简陋,通常不直接使用,而是用图形界面的Rstudio。...1.显示文件列表 dir() #查看工作路径下文件,类似于Linux系统下的ls list.files() #同上 示例 2.加减乘除 和其他编程语言相同,直接输入即可 示例 3.赋值 赋值符号

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r语言 固定效应模型_r语言coef函数

___________________________________________________________________________________ 二、R语言中的线性混合模型 来自博客...R中的线性混合模型介绍(翻译博客)(来自科学网邓飞博客)原来来自:http://www.r-bloggers.com/linear-mixed-models-in-r/ 1、nlme lme4 Asreml...几个包的介绍: 包 优点 缺点 nlme 这是一个比较成熟的R包,是R语言安装时默认的包,它除了可以分析分层的线性混合模型,也可以处理非线性模型。...2、R语言案例 数据来源:一个传统的裂区数据来说明不同软件包的用法,这个数据oats是在MASS包中,是研究大麦品种和N肥处理的裂区试验,其中品种为主区,肥料为裂区。...在R语言中我们使用mgcv包中的lmer函数来完成这项工作。首先载入faraway包以便读取psid数据集,然后加载mgcv包,再将年份数据中心化以方便解释模型,最后用lmer函数进行建模。

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R语言升级

因为一个R包让我不得不对电脑的R进行升级,正好整理下整个升级的过程。我们是在Rstudio中进行的升级操作。用到了包installr。...install.MikTeX, install.git,install.git, install.GraphicsMagick,install.ImageMagick, check.for.updates.R,...我们不在此一一介绍,今天主要介绍updateR这个函数: updateR()主要要来升级R软件,升级过程中会遇到下面的一些选项: 会提示当前版本已经后面最新的升级版本: ?...我们设置好后关闭Rstudio,再次打开Rstudio新版本的R就可以用了。 ? 当然,我们如果需要安装github的包的时候,Rtools软件老版本也不再适用,需要下载新版本的Rtools。...下载链接:https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/。 ? 当然这个包有一个缺陷,暂时还不能完成Linux系统下的R升级。

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R语言入门

R语言简介 四十多年前, R 语言的始祖诞生了 , John Chambers 在贝尔实验室中开发出S语言 ,用于快速地进行数据探索, 统计分析和可视化 。...R语言及其生态作为连接现实世界中的数据和数学模型的桥梁,正在社群的努力下一步一步地把这些想法具体化。 让我们进入 R 语言的世界!...R语言基本数据结构 下面用 R 的解释器来熟悉一下 R 语言的基本数据结构。 首先让我们先进入 R 环境下 我是在mac操作环境下的,ubuntu的是一样的。...统计之都 : 国内质量最高的统计网站,有一些关于统计和R语言的优秀博客以及与R有关的会议通知。 肖凯博客(需访问外国网站): 很有质感的博客,有大量 R 语言应用的案例。...R 语言实战 : 一本从统计角度介绍 R 语言的书籍 ,较为简单 , 适合快速翻阅。

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