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Sample3 chr105 Sample3 chr10由于这是正态图的大量数据，我打算做一个每个样本的chr10分布的热图。Chromosome),color = "white")+大约有50个独特的样本，它们在染色体因子的
浏览 6提问于2017-03-02得票数 0
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我有一个数据集，它显示了人类染色体的长度(在这里称为“值”)和它们各自的基因。进一步将基因分为RNA、prot编码、假基因和rest 4组(gtype)。我想在y轴和x轴上绘制单个染色体，我想用一个geom_point、bar或col来绘制染色体的密度(即“每条染色体的基因数目”除以染色体的长度)，然后根据基因的gtype生成一个facet_wrap。这个图只是将所有基因的总数除以单个值(不过，chrM是最大的，这是正常的)。
然而，我总是在x轴上失败，我不知道如何得到一个有意义的<em
浏览 1提问于2021-06-03得票数 0
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我有染色体的位置和分数了。我可以做5个单独的图，每个染色体上的位置作为x轴，p分数在y轴上。我想把它们并排画在同一张图上，这样只有一个y轴，然后染色体按顺序(1-5)显示。有谁有什么想法吗？
浏览 1提问于2015-04-09得票数 0
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，例如
种群中的每一个染色体最终都会有"HellV，Wor`dL“基因。即使在1万代之后，基因也是一样的。其他时候，这些基因达到目标基因“你好，世界！”约33代后。当使用Java时，种群总是达到目标基因。而且，我今天才刚开始学习C++，所以我的代码中很可能有一个我没有看到的缺陷。
浏览 4提问于2015-06-30得票数 2
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3 5443 93 23 77我想创建一个由染色体组织的热图我认为在facet_wrap图像(由染色体组织)中，这看起来很好，但这意味着我必须在Ggg图中使用热图，而且我知道这不是一件事，所以我必须使用geom_tiles()。所以我试着搜索了所有的地方，但是我一直在研究如何首先绘制每条染色体的热图，然后每一个样本做一张瓷砖。所有的例子
浏览 0提问于2015-11-29得票数 0
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我目前正在使用qqman R包来创建曼哈顿图：manhattan(gWasResults,cex.axis = 0.5)但我想将每个染色体中的所有颜色都改为黑色，如下所示：
如果我想在每条染色体之间添加间距，这样您就可以区分哪列数据/或数据点属于哪条染色体，我是否可以在曼哈顿模块中指定一个特定的绘
浏览 0提问于2018-06-22得票数 3
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我有一个带有基因组数据的文件，我试图为它创建一个数据的热图，并为染色体信息创建一个侧栏。为了绘制热图，我从我的文件中转换了数值，创建了一个数据矩阵，然后我就可以绘制出来：然而，我想添加一个额外的颜色侧栏来表示上述数据的染色体位置。
浏览 12提问于2013-06-24得票数 0
我想用SNP标记画一个核型图。
这里唯一的问题是，它看上去更像是条形图，而不是染色体。所以我试着运行
浏览 1提问于2017-03-28得票数 3
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我正在尝试使用Biopython的BasicChromosome库绘制核型/表意文字图。我能够像在教程中那样绘制我的染色体并在染色体内部进行注释；但是，我的老板更喜欢染色体外部的注释以及各种符号。
浏览 2提问于2017-07-11得票数 0
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每个结果都按染色体(df$chr)列出。
我想绘制df[i]和df[15]之间的相关性，但由chr组织。目前，我正在将所有的相关性绘制在一张图上，并且正在生成每个染色体的图。然而，所有的图看起来都是一样的，所以我怀疑它给了我整个样本的相关性，而不是按染色体分组。你能帮上忙吗？
浏览 2提问于2014-08-16得票数 0
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我正在使用JGAP为一个原理图生成测试向量。通过将染色体的基因设置为位，我获得了单个测试载体的最大覆盖率。现在我需要用最少的测试向量获得100%的覆盖率。如果我将每个基因设计为测试向量，id需要根据基因的数量和总覆盖率来计算适应度函数，id还需要同时进化染色体长度和每个测试向量(基因)位。
有没有可能有一个可变长度的染色体？
浏览 0提问于2012-05-23得票数 2
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嗨，我做了一个x轴上的染色体和y轴上的P值的图。在x轴上，我得到了分析中的所有20条染色体，但我希望x轴的大小增加到23条。
浏览 26提问于2021-05-12得票数 0
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2)
我想创建多个圆形条形图，编辑:我的图与下面的circos图有些相似。
为了回应以下对David的回答，这是我所想象的- chr不是分离circe，而是分类为不同的切片(如circos图)
浏览 0提问于2012-02-24得票数 7
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每一行都是基因组中的一个单核苷酸多态性，以及它的染色体、位置和P.value。从这个数据帧中，我想生成一个曼哈顿图，其中x轴从Chr1上的第一个SNP到chr5上的最后一个SNP，y轴是-log10(P.value)。为此，我生成了一个Index列，以便沿着x轴以正确的顺序绘制SNP，但是，我希望x轴由染色体列而不是Index来标记。不幸的是，我不能使用染色体来绘制我的x轴，因为任何给定染色体上的所有SNP都将被绘制在一列点中。看到x轴是如何根据染色体标记的了吗？这就是我想要的输出。
浏览 11提问于2019-08-23得票数 1
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我想可视化一个叶绿体染色体，以及它的基因注释和表达直方图。理想情况下，我的最终结果应该类似于：
我正在尝试用R的RCircos包来做这件事，但是我遇到了一些困难。我已经成功地运行了教程命令，并获得了人类染色体的一张漂亮图片。然而，我在画一个只有一个染色体的圆圈时遇到了问题。按照教程的例子，我的整个染色体看起来像一条小线，而不是一个完整的环形分子-就像它是从其他披萨中切出来的一小片披萨。
浏览 6提问于2015-02-01得票数 1
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如何绘制染色体图形的位置
、、、
我想要生成一个图，描绘14条线性染色体，供我工作的有机体使用，在每条染色体的指定位置上有彩色条。理想情况下，我希望使用R，因为这是我唯一有经验的编程语言。我探索了各种方法，例如用GenomeGraphs，但我发现这比我想要的/显示的数据要复杂得多(例如显示细胞分裂带)，而且常常是人类染色体特有的。12 2271494 14 3291936
然后有颜色的标记，描绘大约150个位置，散落在染色体长度上我一
浏览 3提问于2015-11-16得票数 16
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我正在尝试使用ggplot中的facet grid将样本和染色体绘制为行和列。我的问题是，考虑到我有25条染色体和许多样本，每个面都很小。有没有一种方法可以画出每个面的实际大小，并在样本和染色体之间水平和垂直滚动？theme(panel.background=element_rect(fill="white")) + ylim(c(-2,2))
正如您所看到的，小平面缩小了其中所有细节消失的图。我想知道如何制作一个高分辨率的图，在这个图中，人们可以水平和垂直滚动
浏览 6提问于2016-07-25得票数 1
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当染色体是图的时候，你知道应用交叉和变异的方法吗？非常感谢!任何帮助，即使它与我的问题没有直接关系，我也很感激！
曼纽尔
浏览 3提问于2010-07-02得票数 15
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