腾讯云
开发者社区
文档
建议反馈
控制台
登录/注册
首页
学习
活动
专区
圈层
工具
文章/答案/技术大牛
搜索
搜索
关闭
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,
尽在小程序
立即前往
文章
问答
(9999+)
视频
沙龙
1
回答
使用ggplot2绘制热图中的级别
、
、
Sample3 chr105 Sample3 chr10由于这是正态
图
的大量数据,我打算做一个每个样本的chr10分布的热
图
。Chromosome),color = "white")+大约有50个独特的样本,它们在
染色
体因子的
浏览 6
提问于2017-03-02
得票数 0
回答已采纳
1
回答
绘制由另一列的观测数组成的轴的问题
、
我有一个数据集,它显示了人类
染色
体的长度(在这里称为“值”)和它们各自的基因。进一步将基因分为RNA、prot编码、假基因和rest 4组(gtype)。我想在y轴和x轴上绘制单个
染色
体,我想用一个geom_point、bar或col来绘制
染色
体的密度(即“每条
染色
体的基因数目”除以
染色
体的长度),然后根据基因的gtype生成一个facet_wrap。这个
图
只是将所有基因的总数除以单个值(不过,chrM是最大的,这是正常的)。 然而,我总是在x轴上失败,我不知道如何得到一个有意义的<em
浏览 1
提问于2021-06-03
得票数 0
回答已采纳
1
回答
合并散点图,使它们与R中的相同x轴并排
、
我有
染色
体的位置和分数了。我可以做5个单独的
图
,每个
染色
体上的位置作为x轴,p分数在y轴上。我想把它们并排画在同一张图上,这样只有一个y轴,然后
染色
体按顺序(1-5)显示。有谁有什么想法吗?
浏览 1
提问于2015-04-09
得票数 0
1
回答
种群变陈腐遗传算法
、
、
,例如 种群中的每一个
染色
体最终都会有"HellV,Wor`dL“基因。即使在1万代之后,基因也是一样的。其他时候,这些基因达到目标基因“你好,世界!”约33代后。当使用
Java
时,种群总是达到目标基因。而且,我今天才刚开始学习C++,所以我的代码中很可能有一个我没有看到的缺陷。
浏览 4
提问于2015-06-30
得票数 2
回答已采纳
1
回答
如何创建面热
图
ggplot2
、
3 5443 93 23 77我想创建一个由
染色
体组织的热
图
我认为在facet_wrap图像(由
染色
体组织)中,这看起来很好,但这意味着我必须在Ggg图中使用热
图
,而且我知道这不是一件事,所以我必须使用geom_tiles()。所以我试着搜索了所有的地方,但是我一直在研究如何首先绘制每条
染色
体的热
图
,然后每一个样本做一张瓷砖。所有的例子
浏览 0
提问于2015-11-29
得票数 0
回答已采纳
1
回答
R:在曼哈顿图中添加X轴刻度线之间的间距?
、
、
、
我目前正在使用qqman R包来创建曼哈顿
图
:manhattan(gWasResults,cex.axis = 0.5)但我想将每个
染色
体中的所有颜色都改为黑色,如下所示: 如果我想在每条
染色
体之间添加间距,这样您就可以区分哪列数据/或数据点属于哪条
染色
体,我是否可以在曼哈顿模块中指定一个特定的绘
浏览 0
提问于2018-06-22
得票数 3
1
回答
使用heatmap.2创建侧边栏。
、
、
、
我有一个带有基因组数据的文件,我试图为它创建一个数据的热
图
,并为
染色
体信息创建一个侧栏。为了绘制热
图
,我从我的文件中转换了数值,创建了一个数据矩阵,然后我就可以绘制出来:然而,我想添加一个额外的颜色侧栏来表示上述数据的
染色
体位置。
浏览 12
提问于2013-06-24
得票数 0
1
回答
ggplot2 (geom_path,geom_bar,ggbio)的Karyogram和SNP
、
、
我想用SNP标记画一个核型
图
。 这里唯一的问题是,它看上去更像是条形
图
,而不是
染色
体。所以我试着运行
浏览 1
提问于2017-03-28
得票数 3
回答已采纳
1
回答
D3.js: X轴
、
我试图在x轴代表不同
染色
体的图表中绘制出
染色
体数据。这对于条形
图
等来说是很容易做到的。我的问题是,我应该使用哪个比例?
浏览 4
提问于2016-03-08
得票数 2
回答已采纳
1
回答
如何在Biopython的
染色
体图中添加更多内容?
、
、
我正在尝试使用Biopython的BasicChromosome库绘制核型/表意文字
图
。我能够像在教程中那样绘制我的
染色
体并在
染色
体内部进行注释;但是,我的老板更喜欢
染色
体外部的注释以及各种符号。
浏览 2
提问于2017-07-11
得票数 0
回答已采纳
1
回答
如何从循环向图中添加点
每个结果都按
染色
体(df$chr)列出。 我想绘制df[i]和df[15]之间的相关性,但由chr组织。目前,我正在将所有的相关性绘制在一张图上,并且正在生成每个
染色
体的
图
。然而,所有的
图
看起来都是一样的,所以我怀疑它给了我整个样本的相关性,而不是按
染色
体分组。你能帮上忙吗?
浏览 2
提问于2014-08-16
得票数 0
1
回答
我可以在JGAP中有一个可变长度的
染色
体吗?
、
、
、
我正在使用JGAP为一个原理
图
生成测试向量。通过将
染色
体的基因设置为位,我获得了单个测试载体的最大覆盖率。现在我需要用最少的测试向量获得100%的覆盖率。如果我将每个基因设计为测试向量,id需要根据基因的数量和总覆盖率来计算适应度函数,id还需要同时进化
染色
体长度和每个测试向量(基因)位。 有没有可能有一个可变长度的
染色
体?
浏览 0
提问于2012-05-23
得票数 2
回答已采纳
1
回答
使用遗传算法的背包
、
、
初始化时我使用这种
染色
体1=权重,因为他的公式KP对
染色
体权值x的评价有利可
图
。输入后使用轮子选择后不会。
浏览 1
提问于2011-04-19
得票数 0
1
回答
在GGplot中增加x的长度
、
嗨,我做了一个x轴上的
染色
体和y轴上的P值的
图
。在x轴上,我得到了分析中的所有20条
染色
体,但我希望x轴的大小增加到23条。
浏览 26
提问于2021-05-12
得票数 0
2
回答
R中叠加的多个圆形条形
图
、
、
2) 我想创建多个圆形条形
图
,编辑:我的
图
与下面的circos
图
有些相似。 为了回应以下对David的回答,这是我所想象的- chr不是分离circe,而是分类为不同的切片(如circos
图
)
浏览 0
提问于2012-02-24
得票数 7
回答已采纳
1
回答
使用dataframe中的另一列标记x轴
、
每一行都是基因组中的一个单核苷酸多态性,以及它的
染色
体、位置和P.value。从这个数据帧中,我想生成一个曼哈顿
图
,其中x轴从Chr1上的第一个SNP到chr5上的最后一个SNP,y轴是-log10(P.value)。为此,我生成了一个Index列,以便沿着x轴以正确的顺序绘制SNP,但是,我希望x轴由
染色
体列而不是Index来标记。不幸的是,我不能使用
染色
体来绘制我的x轴,因为任何给定
染色
体上的所有SNP都将被绘制在一列点中。看到x轴是如何根据
染色
体标记的了吗?这就是我想要的输出。
浏览 11
提问于2019-08-23
得票数 1
回答已采纳
1
回答
RCircos -如何绘制单个圆形
染色
体
、
我想可视化一个叶绿体
染色
体,以及它的基因注释和表达直方图。理想情况下,我的最终结果应该类似于: 我正在尝试用R的RCircos包来做这件事,但是我遇到了一些困难。我已经成功地运行了教程命令,并获得了人类
染色
体的一张漂亮图片。然而,我在画一个只有一个
染色
体的圆圈时遇到了问题。按照教程的例子,我的整个
染色
体看起来像一条小线,而不是一个完整的环形分子-就像它是从其他披萨中切出来的一小片披萨。
浏览 6
提问于2015-02-01
得票数 1
3
回答
如何绘制
染色
体图形的位置
、
、
、
我想要生成一个
图
,描绘14条线性
染色
体,供我工作的有机体使用,在每条
染色
体的指定位置上有彩色条。理想情况下,我希望使用R,因为这是我唯一有经验的编程语言。我探索了各种方法,例如用GenomeGraphs,但我发现这比我想要的/显示的数据要复杂得多(例如显示细胞分裂带),而且常常是人类
染色
体特有的。12 2271494 14 3291936 然后有颜色的标记,描绘大约150个位置,散落在
染色
体长度上我一
浏览 3
提问于2015-11-16
得票数 16
回答已采纳
1
回答
ggplot刻面网格/高分辨率包装
、
、
、
我正在尝试使用ggplot中的facet grid将样本和
染色
体绘制为行和列。我的问题是,考虑到我有25条
染色
体和许多样本,每个面都很小。有没有一种方法可以画出每个面的实际大小,并在样本和
染色
体之间水平和垂直滚动?theme(panel.background=element_rect(fill="white")) + ylim(c(-2,2)) 正如您所看到的,小平面缩小了其中所有细节消失的
图
。我想知道如何制作一个高分辨率的
图
,在这个图中,人们可以水平和垂直滚动
浏览 6
提问于2016-07-25
得票数 1
3
回答
将交叉和变异应用于
图
(遗传算法)
、
、
、
当
染色
体是
图
的时候,你知道应用交叉和变异的方法吗?非常感谢!任何帮助,即使它与我的问题没有直接关系,我也很感激! 曼纽尔
浏览 3
提问于2010-07-02
得票数 15
回答已采纳
点击加载更多
扫码
添加站长 进交流群
领取专属
10元无门槛券
手把手带您无忧上云
热门
标签
更多标签
云服务器
ICP备案
对象存储
云直播
腾讯会议
活动推荐
运营活动
广告
关闭
领券