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把函数包起来就是一个R包 - 完整开发指南

.Rd是Rmarkdown文件 写文档的时候可以直接在函数上面以标准格式的形式写注释，再使用roxygen2包来生成.Rd文件 打开fbind.R文件，然后点击Code>Insert roxygen skeleton...Depends attach包；而Imports只load包;一般情况下只需在Imports里面列出需要的包,写函数的时候使用::来获取需要的函数；另外Imports或者Depends里面的包在安装的时候如果没有安装会自动安装...: https://github.com/yihui/knitr/issues 对象文档化 man/ 标准方法是在man/文件夹下写.Rd文件，再渲染成HTML和PDF；但是可以使用roxygen2可以将特定格式的注释转化成....Rd文件，roxygen2除了生成.Rd文件外还可以更改NAMESPACE和DESVRIPTION中的Collate字段 基本的流程有4步： 将roxygen格式的注释添加到.R文件中 使用devtools...image-20200916144852749 Roxygen 注释 Roxygen注释以#'开头，并且在函数的前面；所有在函数前面的roxygen行叫做一个block，每一行不超过80个字符 block

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R语言里面如何高效开发R包

对我来说，比较新的知识点可能是一些小技巧，这里借花献佛给大家。 高效开发R包 什么情况下我们需要开发R包呢 开发R包（也称为R库）是一种有效的方法，可以用来组织、共享和重用你的R代码。...每个函数通常都会有自己的R文件。 man目录：这个目录包含了包的帮助文件，这些文件是用Rd格式写的，每个函数或数据集都应该有一个对应的帮助文件。...你需要为你的包选择一个名称，并选择一个位置来保存你的包。 添加函数：你可以在R目录中添加你的函数。每个函数通常都会有自己的R文件。 添加文档：你可以为你的函数添加文档。...在RStudio中，你可以使用Roxygen注释来添加文档。..." -> "Generate documentation with Roxygen"来生成文档。

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编写你的专属 MSBuild C# 代码生成器：在保存文件时自动实时生成你的代码

而本文是在此基础上更进一步，可以让生成代码变成实时的；更准确的说，是在保存文件时即生成代码，而无需完整编译一次项目。...一天，头像全白昵称空格的“wuweilai”童鞋问我为什么 GRPC 的 NuGet 包能自动在 .proto 文件保存时更新生成的代码，怎么才能做到像它那样。...我们即将实现的是：在保存 Test.txt 文件时，会立即执行我们的编译流程，这样，我们便能基于 Test.txt 来实时生成一些代码。...最简单的自动生成代码的逻辑 现在，我们打开项目 csproj 文件（双击项目名称即可打开编辑这个文件）： 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19...如果你想复制到你的项目里，记得去掉行首的所有 + 号。 等你复制到项目里之后，试着在 Test.txt 文件里面随便写点什么，然后保存。

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R包简单教程

data/： 包中附带的数据文件。 R包的工作流程 为了有效利用R包，一般遵循以下的工作流程： 指定名字，创建R包，并编写DESCRIPTION文件，对R包进行简单的描述。...如有必要，在data/中添加数据文件。 在R/中编写对应功能的R文件 编写好R文件后，生成R文档。 在tests/中编写R文件的测试文件。 在vignettes/中编写项目的说明文档。...R文档 对于每个R函数，需要编写R文档，包含R函数的功能、调用、使用方法等。...编写完成后，执行devtools::document()即可生成文档，生成的文档在\man目录下，此例中生成了hello_country.Rd文件。 重新建立包，执行?...hello_country即可预览生成的R文档。 测试R文件 每个R函数编写完成后，需要对其进行测试，测试的文件放在\test文件夹下。

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科学软件十条简单编程原则

在一天结束时，人们（包括您自己）需要能够阅读和理解您的源代码。好的变量和函数名称可以极大地提高可读性，尽管它们不能完全替代注释。虽然你的代码在没有评论的情况下可能会很明显，但其他读者可能不会那么幸运。...一个好的经验法则是假设README中包含的信息将是用户阅读的唯一文档。因此，您的自述文件应包括如何安装和配置软件，在何处查找完整文档，在何处发布许可证，如何测试以确保功能以及确认。...规则6：版本控制您的文档 首先，您应该将文档与其他文件一起保存在Git存储库中。这使您可以在项目历史中的任何位置查看文档。...R的Sphinx（sphinx-doc.org），perldoc，Javadoc和Roxygen（https://github.com/klutometis/roxygen）等软件可以生成文档，甚至可以阅读您的注释并使用它们生成详细的...此外，重要的是要说明生成错误时软件的状态，特别是如果运行需要很长时间或默认情况下不保存日志。

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TidyFriday 如何编写一个自动获取和展示疫情数据的 R 包？

查看创建的项目文件夹 我们可以从桌面上找到这个文件夹： ?...还是先创建一个包文档： usethis::use_package_doc() 使用下面的语句在 R 文件夹里面创建并打开 Hello.R 文件： usethis::edit_file("R/Hello.R...然后关于 Git 部分的操作就可以在这个表单里完成了，我不就不说这部分了，因为很多小伙伴可能还没用过 GitHub，所以我们还是回到 R 包的编写上。...编写 ncov 包的 DESCRIPTION 文件 使用下面的命令把该包依赖的 R 包写入 DESCRIPTION 文件中的 Imports 字段下： for(pkg in c("jsonlite",...License 字段是声明该包的许可证的，这里我使用的是 MIT 许可 + 文件许可证，这个文件在的内容是： YEAR: 2020 COPYRIGHT HOLDER: Zhenxing Cheng 这是符合

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编写你自己的R包

创建函数 可以手动创建函数： library("devtools") use_r("hd") 自动在R目录创建了名为hd.R的文件，这这里面就可以写函数的所有信息 前面写函数的注释信息，然后接着写函数的内容...is.null(names(obj))) names(res) = names(obj)[idx_x] } return(res) } 我编写了一个方便查看一二维数据的函数...，可以这里注释信息包括以下部分： Description 这部分具体描述函数的功能，没有特定的标签，在最开始书写，可换行 title 一般即为函数名 param param_name...将此函数导出至环境中，使用户可以使用，不写该标签的话用户不能使用，但是可以在该R脚本内调用（private？？)...检查、生成Rmd文档 check() devtools::document() 这一步骤先检查上一步书写语法是否有误以及是否有遗漏等其他错，之后将注释信息和函数转换为Rmd文档。

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AI 技术讲座精选：如何创建 R 包并将其发布在 CRAN GitHub 上？

将包提交至像 CRAN 之类的主要仓库时需通过严格的质量测试。 不断进行更新。如果包的维护人员在 CRAN 上的更新活动不活跃，他的包就会被遗弃。 4....你还须确保你已安装以下几个包：quantmod、xts、roxygen2 和 devtools。 5. 从零开始编写你的第一个包 现在让我们开始创建一个简单的包。...在 R studio 打开 DESCRIPTION 文件，编辑内容以最好地匹配对包的描述。然后保存。这就是我在编写这个包时的步骤。 ?...Suggests 包含运行例子或生成文档时可能需要的库。这个包最后的描述文件如下所示： ? 进入 R 文件夹，你会发现已生成 hello.R script。...必须在 export 字段下的 hello.R 文件中编写这个‘stock_predict’函数。

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Deep learning基于theano的keras学习笔记（0）-keras常用的代码

保存Keras模型 这里不推荐使用pickle或cPickle来保存Keras模型。 1....一般使用model.save(filepath)将Keras模型和权重保存在一个HDF5文件中，该文件将包含： 模型的结构，以便重构该模型 模型的权重 训练配置（损失函数，优化器等） 优化器的状态，以便于从上次训练中断的地方开始...= model.to_yaml() 当然，你也可以从保存好的json文件或yaml文件中载入模型： # model reconstruction from JSON: from keras.models...[3].output]) layer_output = get_3rd_layer_output([X])[0] 当然，我们也可以直接编写Theano和TensorFlow的函数来完成这件事 get_3rd_layer_output...训练数据在训练时会被随机洗乱吗？ 如果model.fit的shuffle参数为真，训练的数据就会被随机洗乱。不设置时默认为真。训练数据会在每个epoch的训练中都重新洗乱一次。

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麻省理工三位教授教你一步步创建自己的R程序包（附完整教程下载）

你的默认目录应该是空的，可以通过Is()命令来查看 - 你应该能够清楚的看见回复为（0） 2. 在R文件中可以为你的程序编写代码。你可以创建一个包含所有函数的文件，或者是为每个文件都创建单独的文件。...根据Rstudio的版本，当你在创建R安装包或者R文档时，帮助文件会自动生成的。 如果“man”文件夹中已经包含.Rd文件，打开每个文件，添加一个标题然后保存.(如果不是，请见步骤7）。...但是为了编译你的安装包，你需要在每个.Rd的文件下添加一个标题。 7. 如果你的”man”文件夹是空的，那么你需要为每个函数手动创建一个.Rd文件。...编辑你的新文件要包含标题域（再次强调，你可以选择现在编辑或者是稍后编辑，如果标题域是空的，那么你的安装包将无法编译）。保存”man”文件夹中的每一个.Rd文件。...9.返回并为每个函数编辑其记录文件（帮助文件）。打开每一个.Rd文件，为安装包添加一段简短的描述。如果可以的话,包含至少一个例子。接着，重载你的安装包，在R控制台上彻底检验你的文件。

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干货 | MIT手把手教你一步步创建自己的R程序包

1、首先打开一个新的R文件，确保你的默认目录是清楚的通过rm进行输入的（list=ls())。查看Is()，确保它是空的（你应该能够清楚的看见（0））。 2、在R文件中可以为你的程序编写代码。...“man”文件中将包含了文件中函数的所有帮助文件。根据Rstudio的版本，当你在创建R安装包或者R文档时，帮助文件会自动生成。...如果“man”文件夹中已经包含.Rd文件，打开每个文件，添加一个标题然后保存.(如果不是，请见步骤7）。你可以返回并在稍后编辑这些内容。...保存“man”文件夹中的每一个.Rd文件。 注意：如果你需要在你的安装包里添加更多的函数，那么你需要重复以上步骤。即使是在你一开始创建安装包和RStudio自动生成R记录文件的时候。...打开每一个.Rd文件，为安装包添加一段简短的描述。如果可以的话,至少包含一个实例。接着，重载你的安装包，在R控制台上彻底检验你的文件。

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学会这 11 条，你离 Git 大神就不远了！

使用命令行代替图形化界面 使用命令行来操作，简洁且效率高 提交应该尽可能的表述提交修改内容 区分 subject 和 body 内容，使用空行隔开 subject 一般不超过 50 个字符 body 每一行的长度控制在...使用 merge 操作 - Python 中的 Requests 库在使用 支持使用 merge 的开发者，他们认为仓库的提交历史就是记录实际发生过什么，它是针对于历史的一个文档，本身其实是有价值的，我们不应该随意修改...但是在最后，提交 PR 之前，一般情况下，我们是应该整理下这些提交记录的。有些 commit 需要合并起来，或者需要将其删除掉，等等。...而其钩子脚本的对应内容，都是使用 Shell 语法进行编写的。...此时，我们需要保存上个分支的工作状态，在我们修改完成线上 bug 之后，再继续工作。

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巧用R语言实现各种常用的数据输入与输出

R语言中数据的输入需要设置数据读取的路径，一般将数据文件放到工作目录下，这样直接就可以通过read.table等读取数据文档（不许要设置路径）。...常用参数的说明如下： （1）file：file是一个带分隔符的ASCII文本文件。 ①绝对路径或者相对路径。一定要注意，在R语言中\是转义符，所以路径分隔符需要写成"\\"或者“/”。...（2）header：一个表示文件是否在第一行包含了变量的逻辑型变量。 如果header设置为TRUE，则要求第一行要比数据列的数量少一列。 （3）sep分开数据的分隔符。...file: 一个字符串命名文件或编写而打开的一个连接。 " "表示输出到控制台。 append: 逻辑。只有当file是一个字符串才相关。...如果一个数值向量，其元素为引用的列的索引。在这两种情况下，行和列名报价，如果他们被写入。如果FALSE，并没有被引用。 sep: 字段分隔符字符串。每一行x中的值都被这个字符串分隔开。

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学会这 11 条，你离 Git 大神就不远了！

使用命令行代替图形化界面 使用命令行来操作，简洁且效率高 提交应该尽可能的表述提交修改内容 区分 subject 和 body 内容，使用空行隔开 subject 一般不超过 50 个字符 body 每一行的长度控制在...使用 merge 操作 - Python 中的 Requests 库在使用 支持使用 merge 的开发者，他们认为仓库的提交历史就是记录实际发生过什么，它是针对于历史的一个文档，本身其实是有价值的，我们不应该随意修改...但是在最后，提交 PR 之前，一般情况下，我们是应该整理下这些提交记录的。有些commit需要合并起来，或者需要将其删除掉，等等。...而其钩子脚本的对应内容，都是使用 Shell 语法进行编写的。...此时，我们需要保存上个分支的工作状态，在我们修改完成线上 bug 之后，再继续工作。

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为什么要用conda来安装一个R包

正常情况下，我们的R包都是依附于R语言环境，常见的情况是在个人电脑的Rstudio这样的界面软件安装的。...比如最近有小伙伴问到了popsicleR这个包，它还在GitHub上面，官网是：https://github.com/bicciatolab/popsicleR 它也有很多依赖包，而且官网文档写的很清楚...另外就是，大家在安装它的时候，它没办法很好的自动解决它自己的依赖问题，所以官网给了其系列依赖包的独立安装方式。...ggplotify","RANN","umap", "celldex","curl","httr","lattice","session","shinythemes","usethis","rcmdcheck", "roxygen2...官网文档给了一个 https://github.com/bicciatolab/popsicleR/blob/main/docs/popsicleR.yml， 可以看到内容如下所示： yaml格式的文件

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11个Git实用技巧记录!

使用命令行代替图形化界面 使用命令行来操作，简洁且效率高 提交应该尽可能的表述提交修改内容 区分 subject 和 body 内容，使用空行隔开 subject 一般不超过 50 个字符 body 每一行的长度控制在...使用 merge 操作 - Python 中的 Requests 库在使用 支持使用 merge 的开发者，他们认为仓库的提交历史就是记录实际发生过什么，它是针对于历史的一个文档，本身其实是有价值的，我们不应该随意修改...但是在最后，提交 PR 之前，一般情况下，我们是应该整理下这些提交记录的。有些 commit 需要合并起来，或者需要将其删除掉，等等。...而其钩子脚本的对应内容，都是使用 Shell 语法进行编写的。...此时，我们需要保存上个分支的工作状态，在我们修改完成线上 bug 之后，再继续工作。

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Git 实用技巧记录，看这篇你就明白了！

每一行的长度控制在 72 个字符 subject 结尾不需要使用句号或者点号结尾 body 用来详细解释此次提交具体做了什么 使用 .gitignore 文件来排除无用文件： 可使用模板文件，然后根据项目实际进行修改...使用 merge 操作 - Python 中的 Requests 库在使用 支持使用 merge 的开发者，他们认为仓库的提交历史就是记录实际发生过什么，它是针对于历史的一个文档，本身其实是有价值的，我们不应该随意修改...但是在最后，提交 PR 之前，一般情况下，我们是应该整理下这些提交记录的。有些 commit 需要合并起来，或者需要将其删除掉，等等。...而其钩子脚本的对应内容，都是使用 Shell 语法进行编写的。...此时，我们需要保存上个分支的工作状态，在我们修改完成线上 bug 之后，再继续工作。

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数据科学、机器学习IDE概览

RStudio 集成了 Git 和 SVN 支持，同时支持编写 HTML、PDF、Word 文档、幻灯片、交互式图形（基于 Shiny 和 ggvis）。...在 Visual Studio 下，数据科学家能够以便利的结构组织和管理相关文件，并使用 R 代码、R 文档、R Markdown、SQL 请求、保存的过程等的模板。...RTVS 可以绑定本地和远程的工作区，这让开发者可以在本地基于较小的数据集编写 R 代码，然后很方便地在更强大的云计算机中的更大的数据集上运行代码。...开发者可以通过 R Markdown 文档分享数据结果，markdown 的代码段可以使用集成的 R 代码。 RTVS 为 R 提供了完整的 REPL 体验，可以在交互窗口中直接运行源文件的代码。...绘图是 R 的一个重要部分。为了方便用 R 绘图，RTVS 支持多个独立的绘图窗口，每个具有独立的历史，并支持在窗口间移动图形。图形可以保存为图像或 PDF 文件，或者复制到剪贴板。

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