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我正在尝试对比例数据(介于0和1之间的数字)运行GAM。基本上，我是在根据海面温度对温暖适应物种的出现次数和冷适应物种的总出现次数进行建模，并使用来自另一个天气系统(NAO)的数据作为随机效应，以及其他三个分类、参数变量。, data=DAT_WC, method = "REML") prop =发生的比例，WarmCold =物种是热适应的还
浏览 158提问于2020-04-17得票数 0
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我使用来自gam包的mgcv来拟合负二项式族中的广义加法模型。我有一个包含因变量y、自变量x、因子fac和随机变量ran的数据框架。我符合以下模型我在负二项式回归书中读到，模型仍有可能过度分
浏览 0提问于2019-12-15得票数 3
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我正在尝试探索mgcv包中的" gam“函数与gam包中的”gam“函数的不同之处。但是，我不能在一个R会话中同时运行两个gam函数。我认为如果我以mgcv::gam或gam::gam作为前缀，它将能够运行正确的函数，但看起来我必须分离mgcv才能
浏览 31提问于2019-06-03得票数 2
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我正在使用r中的mgcv包构建一个模型。这些数据有一系列的度量(数据是在15分钟的时间间隔扫描期间收集的，但不连续，例如，一天可能有5次连续扫描，然后直到第二天才进行任何扫描，等等)。该模型具有二项响应、日随机效应、固定效应和三种平滑效应。我的理解是，REML是二项式模型的最佳拟合方法，但是这种方法不能使用二项式模型的gamm函
浏览 17提问于2022-10-28得票数 2
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在GAM (和GLM )中，我们正在拟合一个条件似然模型。因此，在对模型进行拟合后，对于一个新的输入x和响应y，我应该能够计算给定x的y特定值的预测概率或密度。例如，为了比较各种模型在验证数据上的适合性，我可能会这样做。是否有一种方便的方法在mgcv中安装了GAM？否则，我如何计算出所使用的密度的确切形式，以便适当地插入参数？作
浏览 2提问于2017-06-21得票数 1
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我试图在R中绘制一个gam对象，这是我用gam包制作的。我收到中报告的相同错误。然而，在那里找到的解决方案，更新到最新版本(我认为)，并不适用于我。我正在运行R3.3.1、gam 1.12和mgcv 1.8.12 (mgcv是plot.gam函数的发源地)。
不幸的是，我无法分享我正在工作的数据。但是，下面的代
浏览 2提问于2016-08-19得票数 5
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我刚刚完成了安装使用mgcv包的GAM (我将称之为模型gam1.5)。我一直在玩vis.gam函数，我有一个问题是我无法解决的。我想标准化我的模型的拟合值，所以当我使用vis.gam时，z轴有限值0，1。我的想法是将规范化公式应用于GAM模型的$fitted.values中，如下所示：
gam1.5$fitt
浏览 1提问于2017-06-22得票数 2
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在尝试将二项式GAM与数据匹配时，我遇到了一个问题。这些模型有两种编码方式：(一)提供一个比例作为响应变量，试验次数作为权重；(二)提供两个列，列出成功和失败。我有理由去衡量我的数据点(独立于样本的数量)。然而，我注意到，如果我使用方法(ii)并添加权重(使用weights参数)，我确实得到了非常奇怪的结果。此外，如果我提供相同的相对权重(但不同的绝对幅度)，我得到了非常不同<em
浏览 1提问于2021-09-29得票数 2
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我使用来自gam包的mgcv来拟合负二项式族中的广义加法模型。我有一个包含因变量Y、自变量X、其他自变量Oth和因子Fac的数据框架。我想要符合以下模式每个因素级别都有不同的theta。换句话说，我用但这只为整个数据集提供了一个色散参数theta。相反，我相信不同因素的平
浏览 2提问于2015-12-07得票数 0
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我正在使用R中的mgcv软件包将GAM模型拟合到二项式数据。其中一个协变量是周期性的，因此我指定了bs = "cc"循环三次样条。我是在一个交叉验证框架中这样做的，但是当我使用predict函数拟合我的保持数据时，我得到了以下错误： can'
浏览 0提问于2012-08-01得票数 1
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我正在尝试为分组数据帧中的每个样本创建一条平滑样条线。为此，我使用了嵌套和映射方法和mgcv gam (遵循这个示例https://smu095.github.io/2019/02/16/2019-02-16-tidytuesday-fitting-multiple-time-series-models-using-purrr在运行gam之后，我想使用broom::augment来提取拟合数据
浏览 18提问于2020-09-07得票数 1
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在绘制GAM模型的预测拟合时，有没有办法设置x轴限制？更具体地说，我使用'by =‘为因子的每个级别拟合一个平滑器，但是，每个因子级别都有不同的值范围。在ggplot中绘制变量会导致x轴自动适应‘x’的不同范围；然而，在拟合GAM (mgcv::gam())之后，plot.gam()的默认行为似乎是预测共享x轴限制上的
浏览 38提问于2021-06-02得票数 1
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我试图使用以下代码将geom_smooth()添加到qplot()中：library(ggplot2movies)然而，情节中漏掉了更流畅的东西。我还收到以下警告消息：
> sessionInfo()
R versio
浏览 7提问于2017-08-11得票数 5
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我想更新R vegan中ordisurf函数后面的GAM模型(添加随机因子)。为此，我首先构建了应该与ordisurf后面的模型相同的模型，如下所述：
然而，我在mgcv中创建的ordisurf和GAM模型给出了完全不同的结果。下面是沙丘数据的示例代码。有谁能解释一下吗？GAM模型应该是什么样子才能执行类似于ordisurf的操作？(在开始改进它
浏览 0提问于2019-06-21得票数 2
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我已经使用mgcv包在R中运行了一个GAM，其形式如下： s(Mean.Front.density, bs = "cr"), data=r, family=gaussian)
在运行该模型并计算每个变量所解释的百分比偏差
浏览 5提问于2013-04-02得票数 4
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mgcv后部覆盖
、、、
我正在用R中的mgcv包拟合一个空间二项式模型，并想要模拟预测点的后验分布(代码如下)。我一直在使用模拟数据来测试后验的覆盖特性。我发现，当总流行率在0.5左右(50%)时，覆盖率很低(大约35%的真实值在95%的后间隔内)，但当你离开0.5时，这种情况会有所改善。例如，当平均患病率为1%时，~97%在95%<
浏览 1提问于2019-12-05得票数 0
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我有一个简单的GAM，有一个平滑的。当我在模型上运行summary()或anova.gam()时，它给出了光滑性的F检验。然而，目前尚不清楚dfs是用来计算f分布和p值的。我试图了解R中的mgcv包如何确定F测试中关于光滑项的意义的df。这是在一般加法模型中给出的方程式:带R
浏览 9提问于2022-11-09得票数 0
我想使用GAM函数在mgcv包中运行一个分级gam。我在brms中使用了相同的模型形式，没有问题，我最终会在brms中重新运行相同的模型，但是在周日是抽象提交的最后期限，所以我想尝试mgcv中的模型，以获得更快的结果。")) + s(INTERTIDAL_TRANSECT, bs =
浏览 9提问于2022-01-28得票数 0
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我在与betar家族进行gam()分析时遇到了问题，奇怪的是，它以前工作得很好。在我重启R之后，出现了各种各样的错误和警告消息。我正在用贝塔回归族分析一个比例对另一个比例(0,1)的影响和一个随机效应(因子)。数据如下所示。gam::s，?is.factor，?mgcv::gam上的信息，在互联网上搜索，但没有找到任何适合我<e
浏览 5提问于2020-01-21得票数 0
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