豆花寄语:学生信,R语言必学的原因是丰富的图表和Biocductor上面的各种生信分析R包。
因为自己之前学习过一部分B站生信技能树的R语言入门视频,但实际使用时经常会遇到一些问题,这次参加了生信技能树的系统培训班想查漏补缺。这里是整理的第一周学习笔记,主要是针对以前存在的一些问题有了更清晰的认识。
在大概了解了R语言和在自己电脑上安装了Rstudio之后,相信大家对学习使用R语言迫不及待了。接下来,我们会推出一系列的推文来帮助大家由浅入深的学习R语言,保证每一个同学在这系列推文结束的时候都能成为R语言编程的大牛。
什么是“对象引用”呢?比如,现在我们有一个表单form1,表单上有一个页框pageframe1,页框的第一页上有一个表格grid1,现在,我要把第一列的标题设置为“第一列”,把背景色设置为灰色,正常情况下,我们不得不输入长长的对象层次如:
分析师面临的普遍问题是,无论从哪里获得数据,大部分情况都是一种不能立即使用的状态。因此,不仅需要时间把数据加载到文件中,还得花更多的时间来清洗它,改变它的结构,以便后续做分析的时候能更好的使用这个数据。
数据探索和预处理是任何数据科学或机器学习工作流中的重要步骤。在使用教程或训练数据集时,可能会出现这样的情况:这些数据集的设计方式使其易于使用,并使所涉及的算法能够成功运行。然而,在现实世界中,数据是混乱的!它可能有错误的值、不正确的标签,并且可能会丢失部分内容。
假设数据以 tibble 格式保存。数据集如果用于统计与绘图,需要满足一定的格式要求,(Wickham, 2014) 称之为 整洁数据 (tidy data),基本要求是每行一个观测,每列一个变量,每个单元格恰好有一个数据值。这些变量应该是真正的属性,而不是同一属性在不同年、月等时间的值分别放到单独的列。
semi_join anti_join实际上没有发生过两个数据框的连接,其实是对左边的数据框取子集
数据结构是指在计算机中存储和组织数据的方式,不同的数据结构有不同的特点和适用场景。R语言中的常用数据结构,包括向量、矩阵、数组、列表和数据框。关于数据结构的使用,我们将分四篇文章分别介绍每种数据结构的操作方法和代码示例。
编译 | AI科技大本营(rgznai100) 参与 | 周翔 注:Pandas(Python Data Analysis Library) 是基于 NumPy 的一种工具,该工具是为了解决数据分析任务而创建的。此外,Pandas 纳入了大量库和一些标准的数据模型,提供了高效地操作大型数据集所需的工具。 相比较于 Numpy,Pandas 使用一个二维的数据结构 DataFrame 来表示表格式的数据, 可以存储混合的数据结构,同时使用 NaN 来表示缺失的数据,而不用像 Numpy 一样要手工处理
Qt 是一个跨平台C++图形界面开发库,利用Qt可以快速开发跨平台窗体应用程序,在Qt中我们可以通过拖拽的方式将不同组件放到指定的位置,实现图形化开发极大的方便了开发效率,本章将重点介绍TableWidget表格组件的常用方法及灵活运用。
通过 gather ,并设定key(原先的列),与value(原先的数据),并通过 - (原先的行),对数据框进行转换。
想必大家都见过下面这款南丁格尔玫瑰图,有没有觉得很高大上?是不是很想知道怎么绘制它?
1、R中的数据结构-Array #一维数组 x1 <- 1:5; x2 <- c(1,3,5,7,9) x3 <- array(c(2, 4, 6, 8, 10)) #多维数组 xs <- array(1:24, dim=c(3,4,2)) #访问 x1[3] x2[c(1,3,5)] x3[3:5] xs[2, 2, 2] xs[2, 2, 1] #增加 x1[6] <- 6 x2[c(7, 9, 11)] <- c(11, 13, 15) #动态增加 x1[length(x1) + 1] <
作为一名数据分析师,也是Pandas重度依赖者,虽然其提供了大量便利的接口,但其中的这3个却使用频率更高!
在 VFP 9 中,数据分组有三个增强。 第一个增强,是当报表中有多个自左向右而不是自顶向下打印的字段时,VFP 把组标头放在哪里。图12展示了在以前版本中,报表引擎把组标头放在细节带区的行里;它(指组标头)占据了第一列,而细节带区的内容只好从第二列开始。第一列被保留给组标头带区,即使你把这个带区的高度设置为0也一样,而且这么做的话,第一列就会是空白的。另外,它的高度还是固定的——等于细节带区的高度——所以如果组标头带区的高度高于细节带区的高度,那么组标头对象还可能会掩盖住细节带区的第二行中的对象们。
Python按照某些列去重,可用drop_duplicates函数轻松处理。本文致力用简洁的语言介绍该函数。
pd.concat([数据1,数据2,数据3·····], axis=0 或 1)
主成分分析算法(Principal Component Analysis,PCA)的目的是找到能用较少信息描述数据集的特征组合。它意在发现彼此之间没有相关性、能够描述数据集的特征,确切说这些特征的方差跟整体方差没有多大差距,这样的特征也被称为主成分。这也就意味着,借助这种方法,就能通过更少的特征捕获到数据集的大部分信息。
生信技能树-数据挖掘课程笔记 数据框 #数据框的新建 df = data.frame(gene = paste0("gene",1:6),change = rep(c("up","down"),each = 3)) #数据框的读取 df df = read.csv("gene.csv") #数据框的属性 dim(df) #查看行数和列数 nrow(df) #查看行数 ncol(df) #查看列数 rownames(df) #查看行名 colnames(df) #查看列名 输出结果: 图片 图片 数据框的操
很明显,有些信息是冗余的,有些是有效信息可以用来分组,但是表型记录太多,看起来会混淆,所以需要去除那些冗余信息,就是在所有样本里面表型记录都一致的列。
机器学习的模型训练越来越自动化,但特征工程还是一个漫长的手动过程,依赖于专业的领域知识,直觉和数据处理。而特征选取恰恰是机器学习重要的先期步骤,虽然不如模型训练那样能产生直接可用的结果。本文作者将使用Python的featuretools库进行自动化特征工程的示例。
对金融产品进行台账管理,基础数据表如黄色框所示(上图左边表格)。为了快速查找出不同产品的费用,需要达到上图右边表格里的效果:机构,利率档和期限可以从下拉列表中选择,选好以上三个条件后,相应的费用就会自动显示出来。
个人理解,向量是有方向的,由大于等于2个元素构成的数据类型。也就是说,向量的所有元素必须属于同种模式(mode),或数据类型(见1.2),比如数值型,字符型等。其类型可以用typeof()查看。 标量只含有一个元素,在R中没有0维度或标量类型。单独的数字或字符串本质是一元向量。
R中缺失值以NA表示,判断数据是否存在缺失值的函数有两个,最基本的函数是is.na()它可以应用于向量、数据框等多种对象,返回逻辑值。
今天跟大家分享的是另一种升级版的条形蝴蝶图! ▽▼▽ 之前曾出过一期关于蝴蝶图的教程,是一个关于Facebook、Twitter用户年龄分布的图表,今天之所以还要写蝴蝶图(升级版)的教程,是因为之前那
方式:RStudio中,菜单栏File→NewProject→NewDirectory→NewProject→DirectoryName
输入后会在Rstudio右上角框框Environment中显示,在控制台中输入x,回车后就会显示1+4的值,即5。
约等于“表格”原因:数据框不是独立的文件,是二元内部的一个数据,电脑上可能并没有这样一个文件,不是在电脑上真实存在的文件;excel表格没有要求一列只有一种数据类型,而数据框要求一列只能有一种数据类型。
tip:运行项目时需要将文件放置于工作目录下;R中严格区分大小写;改错变量可以重新赋值覆盖;可以使用并保存脚本文件,文件格式为R
专题一:玩转字符串1.检测字符串长度x <- "The birch canoe slid on the smooth planks."xstr_length(x)#检测字符串内的字符数,空格也算length(x)#向量里面元素的个数2.字符串拆分str_split(x," ")#以空格为分隔符号将字符串拆分开x2 = str_split(x," ")[[1]];x2y = c("jimmy 150","nicker 140","tony 152")str_split(y," ")str_split(y,"
在偶尔刷别人VBA公众号文章时,刷到两列交换数据的文章,然后想想自己日常工作中,好像也有那么一些时候会用到,就顺手也做到Excel催化剂上来,当做完后,要开始写文章时,发现还真没想到有什么场景特别对此功能刚需,既然已开发了,那也写个文章留个记号,让有需要的人可以找到吧。
约等于表格 但是:列有要求(同一列只允许同一种数据类型);不是文件(可以导出来成为一个文件);
作为一名数据专家,日常工作很可能都是在使用数据之前对其进行导入、操作和转换。可悲的是,许多人都没有机会接触到拥有精心策划过的数据的大数据库。相反,被不断地喂食 “TXT” 或 “CSV” 文件,并且在开始分析之前,必须经历将它们导入到 Excel 或 Power BI 解决方案的过程。对用户来说,重要的商业信息往往是以以下格式存储或发送给用户的。
我们在做数据分析工作的前提,当然是得有数据,巧妇难为无米之炊,所以数据的获取和产生是非常重要和基础的,然而,在当前互联网时代,信息非常的膨胀,我们获取数据的方式很多,这里简单的将其归为三类, 1,自己
根据数据内容不同,我们会设置不同的excel表,但是如果它们之间还存在着同样的内容,为了方便查看,可以把它们放在同一个表格里进行编辑,今天我们带来的课程是:怎么把两个excel表合成一个表并合并相同数据。
其实在本次做作业的过程中,我还犯了一个错,我把filter记错了,本来是取行的我记成取列的了,导致我的一些尝试一直报错,但是(重点来了!),老师真的一眼就看出来我哪里错了,打错大小写,还有用错函数,还有一些我的疑问都可以给到很正确很令人信服的解答!
每个切片的颜色显示在图表左侧的工作表单元格区域内。根据单元格包含的字母“R”、“Y”或“G”将它们填充为红色、黄色和绿色。这在工作表中很容易做到,但在图表中没有像这样更改颜色的机制。
df1 <- data.frame(gene=paste0("gene",1:4),
校对:欧阳锦 本文约3200字,建议阅读5分钟本文介绍了Python数据分析的一个利器——Bamboolib,它无需编码技能,能够自动生成pandas代码。
read.table() #从文件中读取数据,sep表示文件中的分隔符,header表示第一行是否为标题行
pandas库apply函数是用于数据处理和创建新变量最常用的函数之一。把数据框的每一行或者每一列传送到一些处理函数,可以返回一些结果。函数可以是默认函数或者自定义函数。
1、CSS的三种定位机制 CSS 规定的定位机制有三种,分别是: 标准文档流(Normal flow): 特点:从上到下,从左到右,输出文档内容。由块级元素(块级元素特点:从左到右撑满页面,独占一行,触碰到页面边缘时,会自动换行)和行级元素(块级元素特点: 在同一行内显示,不会改变HTML文档结构 )组成。 浮动(Floats) 绝对定位(Absolute positioning) 言下之意就是网页布局和元素的定位都离不开这三种机制。 2、什么是W3C标准 W3C标准,是由万维网联盟制定的一系列标准,
CSS布局中有一些概念,一旦你理解了它们,就能真正提高你的 CSS 布局能力。本文是关于块格式化上下文(BFC)的。你可能从未听说过这个术语,但是如果你曾经用CSS做过布局,你可能知道它是什么,理解什么是 BFC,怎么工作以及如何创建 BFC 非常有用,这些可以帮助你理解CSS中的布局是如何工作的。
当有多张表时,如何将一个excel表格的数据匹配到另一个表中?这时候就需要使用vlookup函数。它可以按条件查找出数据。
由于不同的列可以包含不同模式(数值型、字符型等)的数据,数据框的概念较矩阵来说更为一般。它与你通常在SAS、SPSS和Stata中看到的数据集类似。数据框将是你在R中最常处理的数据结构。
在使用python进行数据分析时,如果数据集中出现缺失值、空值、异常值,那么数据清洗就是尤为重要的一步,本文将重点讲解如何利用python处理缺失值
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