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    用R在地图上绘制网络图的三种方法

    作者:严涛 浙江大学作物遗传育种在读研究生(生物信息学方向)伪码农,R语言爱好者,爱开源 地理网络图与传统的网络图不同,当引用地理位置进行节点网络可视化时,需要将这些节点放置在地图上,然后绘制他们之间的连结...首先准备需要的R包,当需要一次性加载多个R包时,我们可以利用pacman,它整合了library包中的一些相关函数,利用pacman包中的p_load函数可以自动加载需要的R包,如果没有找到则会自动安装缺失的...这样我们就不用写很多行library命令了,从而使代码变得简单些。...注意:geoms的顺序很重要,因为它定义了先绘制哪个对象,先绘制的将被后面的图层覆盖。因此我们先绘制了连线(edges),然后绘制节点(nodes),最后绘制节点的标签(labels)。...下面创建第一个需要覆盖在地图上的图层——各节点之间的连线(edges)。

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    在kubernetes中部署Jenkins并简单使用

    ,下图是基于 Kubernetes 搭建 Jenkins 集群的简单示意图: ?...从图上可以看到 Jenkins Master 和 Jenkins Slave 以 Pod 形式运行在 Kubernetes 集群的 Node 上,Master 运行在其中一个节点,并且将其配置数据存储到一个...Volume 上去,Slave 运行在各个节点上,并且它不是一直处于运行状态,它会按照需求动态的创建并自动删除。...Jenkins 中直接从源代码控制(SCMD)中直接载入 Jenkinsfile Pipeline 这种方法 2.2、创建 2.2.1、简单的Pipeline 直接 在Jenkins的WEB UI上输入脚本...2.2.2、在slave中运行Pipeline 上面对Jenkins的Pipeline做了简单的测试,但是其并未在我们的Slave中运行,如果要在Slave中运行,其就要使用我们前面添加的Label,如下

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    R语言在地图上绘制月亮图、饼状图数据可视化果蝇基因种群

    在研究受试者对不同图表类型中百分比的感知时,"圆形切片 "的表现与饼图类似。月亮图与 "圆形切片 "的不同之处在于,后者是在一个基础圆上滑动第二个同样大小的圆盘,更像是月食而不是月相。...两个新的美学在geom_moon中也很重要:比例和填充。 比例美学 比率控制要绘制的月亮的比例。它必须在0("新月",实际上什么都没画)和1("满月",即一个圆)之间。...工作实例 地图上的月亮图 多饼图的一个常见用途是表示地图上不同坐标处的比例。x和y维度已经致力于地图坐标,所以像柱状图这样的比例可视化就比较困难。这是一个尝试月形图的绝佳机会!...饼图地图在人口遗传学中很流行,所以让我们看一下该领域的一个例子。数据包含果蝇种群中Adh基因的两个变体的频率。这些种群中有许多都很接近,所以我们必须处理过度绘制的问题,我们在下面手动处理。...我们可以用月球图(在这种情况下与饼图相同)绘制这些主要阶段。

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    【教程】估算一个最佳学习速率,以更好地训练深度神经网络

    在这篇文章中,我将描述一个简单而有力的方法来找到一个合理的学习速率。这种方法是我从Fast AI网站的深度学习课程中了解到的。 学习速率如何影响训练 深度学习模型通常由随机梯度下降优化器训练。...权重的变化会非常大,以至于优化器会超过最小值,并使损失变得更严重。 梯度下降与小(上)和大(下)学习速率。...我们需要在图上选择一个点,以最快的速度减少损失。在本例中,当学习速率在0.001到0.01之间时,损失函数就会迅速下降。...另一种观察这些数字的方法是计算损失的变化率(损失函数关于迭代次数的导数),然后绘制y轴上的变化率和x轴上的学习速率。 损失变化率 它看起来波动有些大,让我们用简单的移动平均数的方法来平滑它。...损失的变化率,简单的移动平均数 这样看起来更好。在这张图上,我们需要找到最小值。它接近于学习速率=0.01。 实现 美国USF数据研究所的杰里米霍华德和他的团队开发了fast.ai。

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    在爱 context 一次,并结合 useReducer 使用,这次有一点简单

    context const context = createContext(defaultValue) context 本身不保存任何信息,他包含了两个引用 context.Provider 用于包裹子组件并传递数据...一个非常简单的 demo 如下。...在子组件 Page 以及他更低层的子组件中,我们都可以使用 useContext 来获取数据 数据如何获取 假如在上面案例的子组件 Page 内部,还有一个更底层次的子组件 Button , 在 Button...首先我们简单调整一下实现思路,封装一个顶层父组件,并在该父组件中约定好数据和操作数据的方法。...惊喜的是,在逻辑清晰的情况下,我们发现 useReducer + useContext 使用起来也不是很困难。 我们在来一个更复杂一点的案例,巩固一下我们学习到的知识。

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    Canvas 绘图技术:实现原生柱状图以及定制化开发特殊功能

    获取绘图上下文Canvas提供了两种绘图上下文:2D和3D。在本文中,我们只需要使用2D上下文。获取2D上下文的代码如下:var ctx = canvas.getContext("2d");3....绘制图形通过绘图上下文,我们可以绘制各种图形。...三、定制化开发以上的代码只是实现了简单的柱状图功能,但是在实际应用中,我们可能需要根据具体需求进行定制化开发。下面介绍几个常见的定制化需求。1....绘制Y轴坐标我们通过 Math.max.apply(null, data) 方法获取数据中的最大值,然后将最小值设为0。接着,我们计算出Y轴刻度比例尺,即每个刻度所对应的像素值。...通过了解Canvas的基础知识和绘制柱状图的步骤,我们可以快速地实现一个简单的柱状图。同时,本文还介绍了如何根据需求进行定制化开发,例如改变柱子颜色和样式,添加鼠标交互效果以及绘制X,Y坐标。

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    阿丘科技之AIDI高级应用讲解一(5)

    创建混合图像工程: 在创建工程时选择图片格式混合图,设置图片数 混合图合成导入 通过对一组拍摄同一物体的图片进行合成得到一张多通道图像并导入模块。...标准视图 显示类型 原图,灰度,伪彩色(JET),伪彩色(HOT) 色谱图 最小值,最大值 自适应 自动调整色谱图最小值最大值。...兼容旧版本工程 打开旧版本工程后会自动使用默认显示属性 5.6 图片搜索 在图片列表顶部图片搜索栏中输入图片名称然后回车即可快速在图片列表中定位并显示目标图片。...注意如果图片在模块中但是不在当前图片列表中时,搜索无法找到目标图片。...图片列表中图片左上角序号底色为绿色时,代表此图标注为OK图 5.8 导出数据 导出原图:在图片列表中选中图上右键导出原图。 导出标注数据:在图片列表中选中图上右键导出训练集测试集。

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    吴恩达机器学习 Coursera 笔记(二) - 单变量线性回归

    采用任何颜色并沿着’圆’,可得到相同的成本函数值 当θ0= 800且θ1= -0.15时,带圆圈的x显示左侧图形的成本函数的值 取另一个h(x)并绘制其等高线图,可得到以下图表 例如...在我们的图表右侧绘制这些值似乎将我们的观点置于最内圈“圆圈”的中心。...x轴上,θ1放在y轴上,成本函数放在z轴 我们的图上的点将是使用我们的假设和那些特定的θ参数的成本函数的结果 我们知道,当我们的成本函数位于图中凹坑的最底部时,即当它的值是最小值时,我们已经成功了...6 梯度下降知识点总结 在本文,我们探讨了使用一个参数θ1并绘制其成本函数以实现梯度下降的场景 对单个参数的公式是:重复直到收敛 θ1:=θ1−αddθ1J(θ1) 无论ddθ1J(θ1)的斜率符号如何...,θ1最终会收敛到其最小值 下图显示当斜率为负时,θ1的值增加,为正时,θ1的值减小 Choose Learning Rate α 另外,我们应该调整参数α以确保梯度下降算法在合理的时间内收敛

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    吴恩达机器学习 Coursera 笔记(二) - 单变量线性回归

    采用任何颜色并沿着'圆',可得到相同的成本函数值 当θ0= 800且θ1= -0.15时,带圆圈的x显示左侧图形的成本函数的值 取另一个h(x)并绘制其等高线图,可得到以下图表 [1240] 例如,在上面的绿线上找到的三个红点具有相同的...在我们的图表右侧绘制这些值似乎将我们的观点置于最内圈“圆圈”的中心。...想象一下,我们根据其字段θ0和θ1绘制我们的假设函数(实际上我们将成本函数绘制为参数估计函数) 我们不是绘制x和y本身,而是我们的假设函数的参数范围以及选择一组特定参数所产生的成本值 我们将θ0放在x轴上...,θ1放在y轴上,成本函数放在z轴 我们的图上的点将是使用我们的假设和那些特定的θ参数的成本函数的结果 [1240] 我们知道,当我们的成本函数位于图中凹坑的最底部时,即当它的值是最小值时,我们已经成功了...[1240] 6 梯度下降知识点总结 [1240] 在本文,我们探讨了使用一个参数θ1并绘制其成本函数以实现梯度下降的场景 对单个参数的公式是:重复直到收敛 θ1:=θ1−αddθ1J(θ1) [1240

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    绘图技巧 | 双变量映射地图可视化绘制方法

    本期推文我们绘制不常见的双变量主题地图,该类地图可以很好的在地图上用颜色展示两个变量的信息,相较于单一变量映射地图,此类地图表达的信息更加丰富和全面。...Map 在绘制地图时,我们常常使用单一变量进行映射处理,当然,这样展示的结果可以很好的表现我们研究的特征(如收入、房价等)的变化情况或者具体的情况,如下图: ?...单一变量映射地图 首先,我们先通过通过下图来简单解释下双变量映射的含义: 首先我们创建单一变量的3级顺序配色色系。色系从较浅的中性色开始,代表第一个变量的最小值。...(注:以上双变量简介参考资料:Bivariate Choropleth Maps: A How-to Guide[1]) R-ggplot2+biscale 轻松绘制双变量映射地图 在简单介绍完之后,接下来...「双变量图例绘制」: biscale包也提供了用于绘制双变量映射地图图例的简单绘制方法,对于本例子,图例绘制如下: legend_us <- bi_legend(pal = "DkBlue",

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    绘图技巧 | 双变量映射地图可视化绘制方法

    本期推文我们绘制不常见的双变量主题地图,该类地图可以很好的在地图上用颜色展示两个变量的信息,相较于单一变量映射地图,此类地图表达的信息更加丰富和全面。...Map 在绘制地图时,我们常常使用单一变量进行映射处理,当然,这样展示的结果可以很好的表现我们研究的特征(如收入、房价等)的变化情况或者具体的情况,如下图: ?...单一变量映射地图 首先,我们先通过通过下图来简单解释下双变量映射的含义: 首先我们创建单一变量的3级顺序配色色系。色系从较浅的中性色开始,代表第一个变量的最小值。...(注:以上双变量简介参考资料:Bivariate Choropleth Maps: A How-to Guide[1]) R-ggplot2+biscale 轻松绘制双变量映射地图 在简单介绍完之后,接下来...「双变量图例绘制」: biscale包也提供了用于绘制双变量映射地图图例的简单绘制方法,对于本例子,图例绘制如下: legend_us <- bi_legend(pal = "DkBlue",

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    8000 字 Python 数据可视化实操指南

    我想提到这个库,因为也许在他们的示例画廊中,我们可以找到一些可以帮助我们的特定图形。 7. folium Folium是一项研究,可以让我们绘制地图,标记,也可以在上面绘制数据。...在本文中,为简单起见,我们仅将OpenStreetMap视为地图提供者。 使用地图非常复杂,值得一读。在这里,我们只是看一下基础知识,并用我们拥有的数据绘制几张地图。...让我们从基础开始,我们将绘制一个简单的地图,上面没有任何内容。...然后,我们将使用Geopandas将国家/地区名称转换为可在地图上绘制的坐标。...如果需要可视化更多信息,可以使用在matplotlib中可以找到的简单图形作为散点图或直方图。

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    配电网WebGIS研究与开发

    要求:工作人员将停电计划录入到SQL数据库中,并指示当天的台区停电计划,有的台区有可能有一系列的下属表箱,每个表箱都对应着一个地理坐标,这些表箱散点构成一个区域,“停电区域显示”就是要将这些停电影响区域在地图上高亮显示出来...NET环境提供了一些方法对地图进行图形绘制,但是实现的方法却比较繁琐。然而,.NET框架提供给Web ADF一系列的对象去通过简单的API扩展其功能达到在地图上创建图层的目的。...,得到某一停电台区下属表箱相关数据,每个表箱都有一个坐标属性,要绘制停电区域就需要对这些坐标在地图上对应的散点群进行“覆盖区域”计算。...然后对每个带状区域内部的表箱坐标集合选出经度值的最大值和最小值,这样就找到了此处带状区域内部表箱的一个“覆盖区域”了,然后依此类推,最终找到全部表箱的整体“覆盖区域”,也就是停电区域。   ...,而且使用起来很简单。

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    一次不算愉悦的爬虫与可视化之旅

    在开始之前请安装该版本,并安装相应的中国地图包。...目标1:绘制播放地域分布图 数据获取 输出province的结果如下图 可以看出结构还是非常简单的。我们需要的数据正是data里的name和value。...数据处理的代码如下: 图形绘制 我们的目标是一个中国地图的样式,所以需要用到pyecharts的Map图形,下面是Map的文档说明: 这样我们就绘制出了基本的图形,如果用鼠标在地图上移动...图形绘制 接下来绘图,我直接给出最终的代码,并附上各个参数的含义,读者可以像上面那样一步一步的进行添加,看看这个过程中的变化。...这几点我没有找到好的解决方案,读者朋友可以思考尝试一下。 全部明星看点 我们只需要把上面代码的break去掉,并加上颜色的配置(同样是一个一个测量出来的),就可以显示全部的曲线。

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