首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

在箱线图r中添加回归线

在箱线图中添加回归线是为了观察变量之间的线性关系。回归线可以帮助我们判断变量之间是否存在趋势或相关性,并预测一个变量如何随着另一个变量的变化而变化。

在R语言中,可以使用ggplot2包来绘制箱线图并添加回归线。以下是一个示例代码:

代码语言:txt
复制
# 导入所需的包
library(ggplot2)

# 创建示例数据
x <- c(1, 2, 3, 4, 5)
y <- c(2, 4, 6, 8, 10)
data <- data.frame(x, y)

# 绘制箱线图并添加回归线
ggplot(data, aes(x, y)) +
  geom_boxplot() +
  geom_smooth(method = "lm", se = FALSE)

在这个例子中,我们创建了两个变量x和y,并将它们存储在一个数据框中。然后,使用ggplot函数创建一个基本的箱线图,其中x轴表示自变量x,y轴表示因变量y。使用geom_smooth函数并设置method参数为"lm",表示使用线性回归模型来拟合回归线。se参数设置为FALSE,表示不显示回归线的置信区间。

这是一个简单的例子,你可以根据实际需求进行修改和定制。关于ggplot2包的更多信息和用法,请参考腾讯云的产品介绍链接地址:ggplot2包介绍

页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

跟着Nature Genetics学作图:R语言ggplot2普通线图分组线图分面线图

YroV0nZBzic https://github.com/Jingning-Zhang/PlasmaProtein/tree/v1.2 今天的推文重复一下论文中的Figure3,涉及到4个图,普通线图...,分组线图线图分面,最后一个知识点是如何将这5个图组合到一起 首先是定义了ggplot2的主题 library(ggplot2) My_Theme <- theme( panel.background...= element_blank(), title = element_text(size = 7), text = element_text(size = 6)) 第一个普通的线图 部分示例数据集...scale_fill_manual(values=c("#4a1486","#cb181d"))+ theme(axis.line = element_line()) p1 image.png 分组线图...两个图中间没有空白,上面灰色区域的地方如果想区分开,可以将边框颜色设置为白色strip.background = element_rect(color="white") image.png 最后一个线图

62120

R语言线图添加显著性--不同水平实现方法

本节,介绍一下线图实现显著性添加的方法,类似这种: 「单因素二水平T检验线图可视化」 「单因素三水平T检验线图可视化」 「单因素三水平柱形图」 「单因素三水平折线图」 「二因素柱形图」...B 15.497850 18 B 13.033383 19 B 15.701356 20 B 14.527209 这里,使用的是ggpubr包进行绘图: 1.1 绘制线图...library(ggplot2) library(ggpubr) ggboxplot(dd,x = "Group",y = "y") 在这里插入图片描述 1.2 线图添加不同颜色 ggboxplot...(dd,x = "Group",y = "y",color = "Group") 1.3 线图添加散点图 ggboxplot(dd,x = "Group",y = "y",color = "Group...主要分享R语言,Python,育种数据分析,生物统计,数量遗传学,混合线性模型,GWAS和GS相关的知识。

2.2K30

R语言 | 差异线图的绘制

本次讲的是差异线图的绘制,基因表达量、生态学实验数据统计(如发芽率、产卵量、性比等等)等方面应用比较多。 先看看示例图(以孵化率为例): 那么这样的图该如何绘制呢?...第一步、准备数据 数据格式如下(未截全,展示部分): 第二步、运行代码 将数据导入Rstudio,复制粘贴以下代码即可出图: #安装并加载ggplot2和ggpubr install.packages...("ggplot2") install.packages("ggpubr") library(ggplot2) library(ggpubr) #设置工作目录(这里注意R'/'和Windows'..."D:/桌面内容/test/data.xlsx") #提取data数据集中第2列,第3列的列名 x=colnames(data)[2] y=colnames(data)[3] #显示Treatment因子水平名称...axis.text.x=element_text(size=15)) #绘图 #stat_compare_means(comparisons = my_comparisons):指定需要进行比较以及添加

4.2K21

R-ggplot2 学术线图制作

本期推文就推出线图(boxplot)的R-ggplot2 绘制方法,大家可以和 Python-matplotlib 线图绘制 这篇文章对比下。 02....(2)数据可视化 R-ggplot2 绘制线图很简单,主要为 geom_boxplot() ,先采用默认的参数绘制 ,代码如下: plot_pir <- ggplot(data = box_data,...虽然默认的格式还不错,但想要符合学术图表要求,还是需要们进行定制化修改,如线图的宽、颜色、字体以及一些主题 颜色等,下面我们进行修改。...总结 R-ggplot2 绘制线图还是十分简单的,不仅拥有丰富 的图表元素设置函数、主题以及额外的第三方绘图包。当然,对绘图数据的要求也比较严格。大家觉得和Python 绘制 有什么不同呢?...欢迎文末 读者讨论 或 进群进行交流讨论

1.2K10

R语言入门之线图(重要内容)

线图 科研工作线图是一种常用且重要的统计图。R语言里我们可以针对单一变量绘制线图,也可以针对分组后的变量绘制。...除此之外,如果添加参数varwidth=TRUE,那么线图的宽度便会与样本量的平方根成正比。另外参数horizontal=TRUE则可以使横纵坐标颠倒过来。 1....绘制带V形切迹的线图(Notched boxplot) # 利用ToothGrowth绘制带有V型切迹的线图(notched boxplot) # 给线图添加颜色 boxplot(len~supp...V型切迹线图中,如果切迹之间不重叠,这说明两组数据之间有较大的差异。...关于线图的其它选项 “sfsmisc”包,boxplot.matrix()函数可以针对矩阵的行元素绘制线图(传统线图是用列元素绘制的),而“gplots”包里的boxplot.n()函数则可以注释上样本量信息

3.1K30

如何在线图添加显著性--代码分享

R语言除了统计强,就是作图强。学好统计,再作图水平高,就是墙上加强了。...多个水平的线图,可以展示不同水平的分布、平均值、方差等信息,也可以把显著性甚至多重比较加上去,R语言包这方面越来越友好了,代码都封装好了,十分流畅!...本节要实现下面截个图: 「单因素二水平T检验线图可视化」 「单因素三水平T检验线图可视化」 「单因素三水平柱形图」 「单因素三水平折线图」 「二因素柱形图」 「二因素折线图」 1....library(ggplot2) library(ggpubr) ggboxplot(dd,x = "Group",y = "y") 在这里插入图片描述 1.2 线图添加不同颜色 ggboxplot...(dd,x = "Group",y = "y",color = "Group") 1.3 线图添加散点图 ggboxplot(dd,x = "Group",y = "y",color = "Group

1.6K20

R语言专题6-表达矩阵画线图

专题6-表达矩阵画线图GEO的芯片数据处理可能要用到这些这边放到第六个专题详细写一下先生成一个随机的矩阵set.seed(10086) # 为了我的结果能在你的电脑重复,设置了种子exp = matrix...1.82 -1.62## gene2 -1.74 0.37 2.08 2.11 -0.22 1.42## gene3 1.57 1.25 1.32 2.49 0.58 -0.81运行几个R包...library(tidyr)library(tibble)library(dplyr)现在开始处理数据,将其转化为一个R语言看得懂的数据框顺便复习下之前讲过的管道符号dat = t(exp) %>% #...treat gene1 -1.62## 17 test6 treat gene2 1.42## 18 test6 treat gene3 -0.81处理完数据就可以开始画图了R语言作图...ggplot2的应用详细介绍过这个R包,这边就不过多描述了library(ggplot2)p = ggplot(data = pdat,mapping = aes(x = gene,y = count

21330

R语言ggplot2分组线图添加误差线的简单小例子

ggplot2 更改图例的顺序 线图添加误差线这个自己老是记不住,每次作图都得现查,今天的推文记录一下实现代码,方便自己以后查看。...收下是读取数据 df<-read.csv("iris.csv") head(df) 宽格式转换为长格式 reshape2::melt(df,id.vars="Species") -> dfa 基本线图...0.5)+ scale_fill_material_d()+ theme_bw()+ guides(fill=guide_legend(reverse = T)) image.png 分组线图...))+ scale_fill_material_d()+ theme_bw()+ guides(fill=guide_legend(reverse = T)) image.png 分组线图需要我们...geom_boxplot()函数里分别加上position = position_dodge(0.5)参数,目的是使误差线和箱子的位置对应上 如果不加这两个参数,效果如下 image.png 这里还有一个疑问是 线图中间的线好像是中位数

4.7K10

R语言ggplot2做线图的时候如何添加表示平均值的线

线图展示的就是分位数,中间的线表示的是中位数,也就是50%分位数,如果非要在线图上画上表示平均值的线段也是可以实现的,今天介绍一下实现代码 示例数据集我们用R语言的内置数据集PlantGrowth...image.png 首先是画一个最普通的线图 df<-read.csv("PlantGrowth.csv") library(ggplot2) library(tidyverse) p1<-ggplot...aes(x=group,y=weight))+ geom_boxplot(aes(fill=group)) p1 image.png 通过ggplot_build()函数可以获取画线图用到的数据...ggplot_build(p1)$data[[1]] image.png 我们利用原始数据计算一下平均值,然后将数据集的平均值添加到这组数据 df %>% group_by(group...image.png 这个方法还是比较繁琐的,不知道有没有比较好的办法 (猜测geom_boxplot函数里应该是有一个步骤计算中位数的,试着看看源代码,看能不能把中位数的代码改为平均值) 还有一个问题是如果是分组的线图那么应该如何来实现呢

6K50

R语言学习 - 线图一步法

线图 - 一步绘制 绘图时通常会碰到两个头疼的问题: 有时需要绘制很多的图,唯一的不同就是输入文件,其它都不需要修改。如果用R脚本,需要反复替换文件名,繁琐又容易出错。...数据矩阵存储boxplot.normal.data、sampleGroup和boxplot.melt.data文件 (TAB键分割,内容文档最后。如果你手上有自己的数据,也可以拿来用)。...线图出来了,但有点小乱。...'": 指定每个线图的颜色 sp_boxplot.sh -f boxplot.normal.data -q A -Q sampleGroup -F Group -V TRUE -J TRUE -L "...使用melted矩阵默认参数绘线图 # -f: 指定输入文件 # -m TRUE: 指定输入的矩阵为melted format # -d Expr:指定表达值所在的列 # -F Rep: 指定子类所在列

1.4K50

R语言学习 - 线图(小提琴图、抖动图、区域散点图)

线图 线图是能同时反映数据统计量和整体分布,又很漂亮的展示图。2014年的Nature Method上有2篇Correspondence论述了使用线图的好处和一个在线绘制线图的工具。...绘制单个基因 (A)的线图 为了更好的展示效果,下面的矩阵增加了样品数量和样品的分组信息。...zygote_2 zygote_3 3.0 zygote_3 获得样品分组信息 (这个例子比较特殊,样品的分组信息就是样品名字下划线前面的部分) # 可以利用strsplit分割,取出其前面的字符串 # R复杂的输出结果多数以列表的形式体现...,之前的矩阵操作教程 # 提到过用str函数来查看复杂结果的结构,并从中获取信息 group = unlist(lapply(strsplit(data_m$sample,"_"), function...长矩阵绘制线图 常规矩阵绘制线图要求必须是个方正的矩阵输入,而有时想比较的几个组里面检测的值数目不同。

4.4K100
领券