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比对软件BWA及其算法(上)

BWA-MEM 和 BWA-SW具有相同的特性,如支持长读长和切割比对,但是BWA-MEM这一最新的算法,通常推荐当reads质量较高时使用,因为它更快更准确。...二、BWT算法 我们以文献中的字符串googol 为例, 代表结束的字符,在字符串中有且仅有一个,且在字母表顺序中排第一位,例如在26字母表中 首先我们要生成左边形式的矩阵,他是将上一行的字符串的第一个字符放到最后一位形成的...随后我们将每一行新的字符串从前到后按字母表顺序排列,生成右边的矩阵,称为Suffix array矩阵,矩阵最后一列 looogg 称为Burrows-Wheeler Transform string (...BWT算法还有一些特性,我们将SA矩阵的第一列称为F列,最后一列(BWT string)称为L列,明显F列和L列中各字母数量相同,且在原字符串中的顺序相同,如下图所示。...在我们进行比对过程中,我们利用SA矩阵将BWT矩阵的string按字母表字典中顺序放在一起的特性,可以像检索字典一样实现快速的比对。

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关于“Python”的核心知识点整理大全5

3.3.1 使用方法 sort()对列表进行永久性排序 Python方法sort()让你能够较为轻松地对列表进行排序。假设你有一个汽车列表,并要让其 中的汽车按字母顺序排列。...现在,汽车是按字母顺序排列的, 再也无法恢复到原来的排列顺序: ['audi', 'bmw', 'subaru', 'toyota'] 你还可以按与字母顺序相反的顺序排列列表元素,为此,只需向sort(...下面的示例将汽车列表按与字母顺序相反的顺序排列: cars = ['bmw', 'audi', 'toyota', 'subaru'] cars.sort(reverse=True) print(cars...如果你要按与字母顺 序相反的顺序显示列表,也可向函数sorted()传递参数reverse=True。 注意 在并非所有的值都是小写时,按字母顺序排列列表要复杂些。...() print(cars) 注意,reverse()不是指按与字母顺序相反的顺序排列列表元素,而只是反转列表元素的排 列顺序: ['bmw', 'audi', 'toyota', 'subaru']

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    【基础知识】Flex-弹性布局原来如此简单!!

    flex-end:相对终点线顺序排列 center:居中排列 space-between:项目均匀分布,第一项在启点线,最后一项在终点线 space-around:项目均匀分布,每一个项目两侧有相同的留白空间...flex-end:项目按交叉轴终点线对齐 center:交叉轴方向项目中间对齐 baseline:交叉轴方向按第一行文字基线对齐 演示程序: [align-items] 演示程序 2.7 align-content...flex-end:相对终点线顺序排列 center:居中排列 space-between:项目均匀分布,第一项在启点线,最后一项在终点线 space-around:项目均匀分布,每一个项目两侧有相同的留白空间...基本语法: .item { order: ; /* 缺省 0 */ } 按order值从小到大顺序排列,可以为负值,缺省为0。...属性值可以是长度(20%,10rem等)或者关键字auto。它的默认值为auto,即项目的本来大小。

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    Android Studio 和 Gradle 插件使用全新版本编号

    此外,每个主要版本都将具有标准代号,从 Arctic Fox 开始,之后会按字母顺序依次命名,以帮助用户轻松辨别新老版本。...我们建议您使用最新版本的 Android Studio,以体验最新功能和质量改进。...因此,即使在开发周期的后期,您也可以安全地更新 Android Studio 版本,因为您的项目 AGP 版本与 Android Studio 版本可以采用不同的节奏进行更新。...最后,在新的版本系统中,只要您的 AGP 版本保持在稳定版,您或您的团队就可以在应用项目中更加方便地 同时运行 稳定版和预览版 Android Studio。...Android Studio 和 Android Gradle 插件之间的兼容性不会更改。您可以使用更新版本的 Android Studio 打开使用稳定版 AGP 的项目。

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    Fl Studio v21.0.3.3517中文解锁版有哪些新增功能及安装激活教程

    您可以按顺序排列所有元素,并借助浏览器制作完整的播放列表。它能够包含样本播放、合成、压缩、延迟、过滤等80多个插件。它能够执行适当的循环机制。您可以在项目中多次重复声音。...FL Studio 破解版 2023带来了新的浏览器,当项目更改时,搜索字段中带有“刷新”按钮 (15434)现在,FLEX 包现在可以放在 Channel Rack 窗口上,以在新版本中打开新的 FLEX...kLegacyMIDICCOutEvent 事件类型 (8193)脚本:它具有检索链接控制的 MIDI 通道的功能 (9419)新版本还允许同名的 MIDI 设备使用不同的脚本 (15356)已修复:15307 在浏览器中搜索时无法使用箭头键在项目之间移动解决了在删除和取消删除模式时向组添加模式时发生崩溃的问题...您可以在一个项目中创建多个轨道,以打造专业的音乐外观。...您可以按顺序排列所有元素,并借助浏览器制作完整的播放列表。它能够包含样本播放、合成、压缩、延迟、过滤等80多个插件。它能够执行适当的循环机制。您可以在项目中多次重复声音。

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    【新手指南】Android Studio中应用App的相关配置

    app中的build.gradle中的相关配置: 简介: Google推荐使用的Android Studio是采用Gradle来构建项目的。Gradle是一个非常先进的项目构建工具。...项目中一般会出现2个或者多个build.gradle文件,一个在根目录下,一个在app目录下。 项目位置: ?...每个小段都必须以字母开头。 所有字符必须为字母数字或下划线[a-zA-Z0-9_]。...直接按F4,或者是点击File>Project Structure(项目结构),在新弹出的窗口中,依次点击左边的Modules找到app、上方的Default Config,然后在Application...Android Studio应用App 名称、图标,启动页修改: 应用名称修改: 在Android Studio中以“Android”模式浏览程序,在“app->res->values->strings.xml

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    最全面的 Android 编码规范指南

    例如:android, com, junit, org, sun java imports5.javax imports组内不空行,按字典序排列。...常量按照使用先后排列 UI控件成员变量按照layout文件中的先后顺序排列 普通成员变量按照使用的先后顺序排列 方法基本上都按照调用的先后顺序在各自区块中排列 相关功能作为小区块放在一起(或者封装掉)...例如:android, com, junit, org, sun java imports5.javax imports组内不空行,按字典序排列。...常量按照使用先后排列 UI控件成员变量按照layout文件中的先后顺序排列 普通成员变量按照使用的先后顺序排列 方法基本上都按照调用的先后顺序在各自区块中排列 相关功能作为小区块放在一起(或者封装掉)...用统一的量词通过在结尾处放置一个量词,就可创建更加统一的变量,它们更容易理解,也更容易搜索。 注意:如果项目中使用ButterKnife,则不添加m前缀,以LowerCamelCase风格命名。

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    列表

    列表让你能够在一个地方存储成组的信息,其中可以只包含几个元素,也可以包含数百万个元素。 一,列表是什么? 列表由一系列按特定顺序排列的元素组成。...1.Python为访问最后一个列表元素,通过将索引指定为-1,可让Python返回最后一个列表元素。索引-2返回倒数第二个列a表元素,索引-3返回倒数第三个列表元素,以此类推。 ? 输出: ?...六,组织列表 1.使用方法sort()对列表进行永久性排序 方法sort()永久性地修改了列表元素的排列顺序,按字母顺序排列,再也无法恢复到原来的排列顺序。 ? 输出: ?...2.按与字母顺序相反的顺序排列列表元素。只需向sort()方法传递参数reverse=True。 ? 输出: ?...不是按与字母顺序相反的顺序排列列表元素,而只是反转列表元素的排列顺序。 ? 输出: ? 修改列表元素的排列顺序,但可随时恢复到原来的排列顺序。为此只需对列表再次调用reverse()即可。 ?

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    Android Studio 中 System Trace 的新增功能

    在 Android Studio 4.0 中,我们已经对 CPU Profiler 的 UI 做了大量调整来提供更加直观的工作流记录,而在 Android Studio 4.1 中,我们基于开发者们的反馈对此功能进行了持续改进...Android Studio 4.1 Beta 1 中的 System Trace 界面 您可以通过简单拖拽将某一区域或者区域内的某个元素进行向上或向下移动来重新组织列表。...框选、拖放与缩放 分析面板 说到分析,我们想着重聊一聊 Android Studio 4.0 中引入的新  Analysis Panel ,它位于  Profiler 窗口的右边一列。...作为补充,我们在 Android Studio 4.1 Canary 10 中添加了  Summary  选项卡,用于展示线程状态分布、跟踪事件统计等信息。...请记住,您可以增加 Android Studio 的 最大堆容量 来支持更长时间的追踪。 下载最新的 Android Studio 4.1 预览版 可以尝鲜本文介绍的新特性。也同样欢迎大家 反馈。

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    《Android Studio开发实战 从零基础到App上线》第一版的资源下载和内容勘误

    内容说明 一、关于Android Studio的版本 本书采用的Android Studio版本为当时最新的2.2.3,然后2017年3月份谷歌又推出了2.3版本,与2.2.3版本相比,2.3版在安装和使用上主要有两个差别...: 1、Android Studio 2.3适配的Gradle版本为3.3,可是安装包自带的Gradle版本却是3.2,造成项目编译失败。...在测试中发现,Android Studio 2.2采用defaultConfig方式编译jni工程,生成的App在Android 6.0上运行会闪退,日志报错“java.lang.UnsatisfiedLinkError...“Android Studio当前的最新版本是2016年12月6日发布的2.2.3”,这句话的本意是“本书使用的Android Studio为2016年12月6日发布的2.2.3版本”。...,即改为“mirrors.dormforce.net,端口:80” 3、第47页“2.4.2 状态列表图形”一节的第三段, “值为true表示按下时显示button_selected图像”,此处的

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    Android开发笔记(一百一十二)开发工具

    Eclipse/ADT ADT是Google在Eclipse基础上封装了Android开发工具的环境,最新版本是2014年7月2日发布的adt-bundle-windows-x86_64-20140702...2、在Studio上创建一个新项目报错“Failed to resolve: com.android.support:appcompat-v7:23” 原因是“Android Support Library...line client”右侧的浏览按钮选择本地安装的svn.exe 3、在Android Studio中使用svn检出项目 “VCS”——“Checkout from Version Control...开发者先写好一个类及内部变量的定义,然后在代码中按下Alt+Insert,弹出的菜单列表下方就有“Parcelable”项,截图如下: ?...Android Postfix Completion 该插件支持在代码中快速生成Toast、Log等代码行,开发者在代码中输入字符串,后面跟上“.toast”并回车,即可生成Toast.makeText

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    Android Studio 4.0 稳定版发布了

    3、在 Build 窗口中,以下列方式之一打开 Build Analyzer 窗口: Android Studio完成构建项目后,单击 Build Analyzer 选项卡。...Android Studio完成构建项目后,单击 Build Output 窗口右侧的链接。 Build Analyzer 窗口在左侧的树中组织可能的构建问题。...这意味着你现在可以在 java.util.streams 支持较旧版本的 Android 的应用程序中,包含仅在最新的Android版本中可用的标准语言API 。...image 在窗口右上角的选项图标图标或通过拖放组中的单个项目来上下移动组以重新组织列表 。...线程按它们中的跟踪事件数进行排序,以便 “busier” 的线程在列表中排名更高。 可以选择一个或多个线程以仅在那些选定的线程的右列中查看分析。

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    使用 Android Studio 进行 Flutter 开发

    使用 Android Studio(或者 IntelliJ)内置的调试功能, 比如设置断点等。...---- 在 Android Studio 中编辑 Android 代码,并获得完整 IDE 支持 打开 Flutter 项目的根目录,并不会在 IDE 中显示所有的 Android 文件。...如果你已经在 Android Studio 中将整个项目作为 Flutter 应用打开, 则有两种方法可以打开 Android 文件,在 IDE 中进行编辑。...在进行操作之前,请确保你使用的是最新版本的 Android Studio 和 Flutter 插件。 在“项目视图”中,你可以在 flutter 应用的根目录下看到一个 android 的子目录。...如果你还没在 Android Studio 中打开 Flutter 项目,你可以一开始就将 Android 文件作为项目打开: 点击欢迎窗口中的 Open an existing Android Studio

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    『AndroidStudio』从新认识IDE之-整体概述

    那么从这篇文章开始,在接下来会写关于Android Studio的一系列介绍,我们将非常详细的将Android Studio每一个细节讲述给您。...工具按钮 Mac快捷键 Win快捷键 功能 Project Cmd+1 Alt+1 浏览项目中的源文件和资源文件 Favorites Cmd+2 Alt+2 显示收藏夹、断点和书签等 Structure...Cmd+7 Alt+7 当前文件中的对象或元素以分层树的形式呈现 TODO - - 将项目中的所有事项显示在一个列表中 Project 我们发现Project工具窗口是非常有用的导航工具窗口,因为它将有限的宽度空间和相对容易的访问结合起来...在Android Studio运行期间发生剪贴或者粘贴的操作,无论是否在Android Studio中,Android Studio会将这些文本存起来。...Cmd+O(Windows使用Ctrl+N),会打开一个弹窗,你可以输入关键词来匹配对应的类,Android Studio会将匹配到的所有类以列表的方式列出来,你只需要选中按Enter就可以直接访问了。

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    Android Studio 3.6 发布啦,快来围观

    二、更新了Android Gradle插件 最新版本的 Android Gradle 插件包括许多更新,包括构建速度的优化,对Maven发布插件的支持以及对视图绑定的支持。 1....重新加载本机库的APK 在 IDE 外部更新项目中的 APK 时不再需要创建新项目。Android Studio会检测APK 中的更改,并提供重新导入 APK 的选项。...适用于Android Automotive OS的新虚拟设备和项目模板 使用 Android Studio 创建新项目时,现在可以从 Create New Project 向导的 Automotive...十二、优化 Gradle 同步时间的新选项 在以前的版本中,Android Studio 在 Gradle Sync 期间检索了所有 Gradle 任务的列表。...对于大型项目,检索任务列表可能会导致同步时间变慢。

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    Word VBA技术:统计文档中每个字母字符的数量

    标签:Word VBA 在某些情况下,可能想知道在文档中每个字母有多少个,即字母a-Z中每个有多少,或者可能想找出特定文本中最常用的字母。...本文包括两个VBA宏,计算Word文档中每个字母或其他字符的数量。 程序1:在对话框中显示结果,其中按指定的顺序显示每个字符的计数。...: " & lngTotal '如果列表strCharacters没有按字母顺序排列, '你应该编辑下面的MsgBox标题 MsgBox strMsg, vbOKOnly, "按字母顺序统计...1 Set oDocTemp = Documents.Add '插入用于为最终消息添加信息的表 With oDocTemp .Range.Text = "" '插入2列表..., 1).Range.Text = strChar Next lngCount '按列2排序表并转换成文本 oTable.Sort ExcludeHeader:=False, FieldNumber

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