这一期分享 R 语言绘制热图的案例,希望大家通过案例感受 R 语言的强大,同时消除对热图等看似高大上的图形的恐惧感,在文献阅读时更加从容,今后也尝试去绘制这样炫酷的图,如果能够放到文章里面就完美了。...我之所以学 R 语言,一方面是希望能够利用 R 语言将原始数据转化为可放入论文中的精美图形,另一方面,大数据时代已经到来,每个人都应该懂一些大数据的处理手段,R 语言可以胜任。...什么是热图?热图是矩阵中的数值以颜色来显示的图形化表示。热图因其丰富的色彩变化和生动饱满的信息表达被广泛应用于各种大数据分析场景。...将行系统树图 Rowv 设置为 NA,即不显示;2. 将列系统树图设置为NA,即不显示;3. cm.colors 修改为 heat.colors,即调整了颜色的模式。 图 2....利用上面的 NBA 数据,我们只是在绘制热图的那一步利用 pheatmap 函数,输入以下代码: 图 3.
最近,受到互动图的趋势和不断学习新工具的渴望的启发,我一直在使用 Bokeh,一个 Python 库。我为我的研究项目构建的仪表板中显示了 Bokeh 交互功能的一个示例,如下: ?...我们首先创建一个图形(figure),然后在图形中添加称为图形符号(glyphs)的元素。...Bokeh 样式中,通过将元素添加到原始图形中来包含元素。...图的主要观点是显示数据,添加不必要的元素只会减少图形的用处! 最终的图形如下: ? 当将鼠标悬停在不同的栏上时,会得到该栏的精确统计数据,显示该区间内的间隔和航班数。...创建交互的小部件 一旦我们在 Bokeh 中创建基本图形,通过窗口小部件添加交互相对简单。 我们想要的第一个小部件是一个选择框,允许读者选择要显示的航空公司。
最近,受到互动图的趋势和不断学习新工具的渴望的启发,我一直在使用 Bokeh,一个 Python 库。 我为我的研究项目构建的仪表板中显示了 Bokeh 交互功能的一个示例,如下: ?...我们首先创建一个图形(figure),然后在图形中添加称为图形符号(glyphs)的元素。...Bokeh 样式中,通过将元素添加到原始图形中来包含元素。...图的主要观点是显示数据,添加不必要的元素只会减少图形的用处! 最终的图形如下: ? 当将鼠标悬停在不同的栏上时,会得到该栏的精确统计数据,显示该区间内的间隔和航班数。...创建交互的小部件 一旦我们在 Bokeh 中创建基本图形,通过窗口小部件添加交互相对简单。 我们想要的第一个小部件是一个选择框,允许读者选择要显示的航空公司。
from Bokeh.io import show, output_notebook 我们需要以下命令来在 jupyter notebook 中显示图表的输出。...界面创建图表的步骤是: 准备数据 创建一个新的情节 为您的数据添加渲染,以及您对绘图的可视化自定义 指定生成输出的位置(在 HTML 文件中或在 Jupyter Notebook 中) 显示结果 Python...到目前为止,我们已经看到了Bokeh中的所有基本图表,现在看看如何在Bokeh中使用布局。这将帮助我们创建仪表板或应用程序。因此,我们可以将特定用例的所有信息集中在一个地方。...Bokeh库的布局功能 Layout 函数将让我们构建一个由绘图和小部件组成的网格。我们可以在一个布局中拥有尽可能多的行和列或网格。...# 将结果排成一行并显示 show(row(s1, s2, s3)) 在 Bokeh 中制作仪表板布局。在这里我拍了三张图表,一张是棒棒糖图,另外两张是Bokeh的饼图。
https://blog.csdn.net/u010099080/article/details/84197684 写在前面 如果图形和文字显示有异常,请前去我的个人小站:Plotly...散点图 go.Scatter 此图用于说明 Python 2 和 3 在开发者们中的使用比例。...而且如果要分享或者在网站上嵌入自己绘制的图形,那么就需要使用这种方式来将图形托管在 plotly 上,然后复制嵌入代码到自己的网站,就像我现在做的这样。...ff.create_distplot 此图用于说明 Python 2 和 3 在开发者们中的使用比例,类似于 sns.distplot,是直方图和 KDE 的混合,用于展示一个单变量的分布。...plotly 重绘,其实还有其他图形没有涉及,例如 3D 散点图(这也是我放弃 bokeh 的原因)。
在这篇文章中,我将介绍一些流行的Python可视化包,它们的优缺点,以及它们各自的优点。...第9-14行中的Bokeh代码创建了一个优雅的、专业的响应计数直方图,具有合理的字体大小、y标记和格式。我编写的大部分代码用于标记坐标轴和标题,以及给条形图添加颜色和边框。...当制作漂亮的,像样的图形时,我非常倾向于Bokeh -很多美学工作已经为我们做了! 上面的蓝色图是上面要点的第17行上的一行代码。这两个直方图具有相同的值,但用途不同。...在一个探索性的设置中,与pandas一起写一行来查看数据要方便得多,但是Bokeh的美学是相当出色的。...使用Pygal非常简单: 实例化你的图片 使用图形对象的属性格式化 使用figure. Add()符号将数据添加到图形中 我在Pygal中遇到的主要问题是如何渲染图形。
01 概述 折线图(Line)是将排列在工作表的列或行中的数据进行绘制后形成的线状图形。折线图可以显示随时间(根据常用比例设置)而变化的连续数据,非常适用于显示在相等时间间隔下数据的趋势。...▲图2 代码示例②运行结果 代码示例②第3行使用multi_line()方法,实现一次性绘制两条折线,同时,在参数中定义不同折线的颜色。...▲图4 代码示例④运行结果 代码示例④在代码示例③的基础上增加了图例的位置、显示或隐藏图形属性;通过点击图例,可实现图形的显示或隐藏,当折线数目较多或者颜色干扰阅读时,可以通过该方法实现对某一条折线数据的重点关注...这种通过图例、工具条、控件实现数据人机交互的可视化方式,正是Bokeh得以在GitHub火热的原因,建议在工作实践中予以借鉴。...第17行定义了x轴刻度的间隔以及中间刻度数,读者可以尝试将num_minor_ticks=10的显示效果与图8进行对比;第18行定义了y轴的数据显示格式。
python中的bokeh包也是作图神器,现在了解到了如何作散点图和柱形图,先记录一波。 Bokeh 专门针对Web浏览器的呈现功能的交互式可视化python库。...Bokeh接口 Charts:高层接口,以简单的方式绘制复杂的统计图- Plotting:中层接口,用于组装图形元素- Models:底层接口,为开发者提供最大灵活性首先bokeh图举例如下: 个人认为绘图的基本框架可以为...上面是在jupyet notebook里作图,好处是通过output_notebook( )命令,图形可以直接显示在浏览器中,当然还可以保存为html文件。...如下命令: from bokeh.plotting import figure,show,outplot_file #output_file是用于非notebook中创建绘图空间 #即没法立即在编辑器中显示...这里是以循环,遍历三个类别,分别做出三个图,其实可以单独做一个。将循环拆开即可。
它可以用于使用各种GUI工具箱(例如Tkinter,GTK +,wxPython,Qt等)将绘图嵌入到应用程序中。...Seaborn数据图形可以包括条形图,饼图,直方图,散点图,误差图等。Seaborn还具有各种工具来选择可以显示数据中图案的调色板。...打开Jupyter Notebook或JupyterLab并执行任何代码以在Altair中获得该数据可视化。...Bokeh Bokeh是一个数据可视化库,它为详细的图形提供了跨各种数据集(无论大小)的高交互性。...Pygal Pygal与Plotly或Bokeh相似,它创建的数据可视化图表可以嵌入到网页中,并可以使用Web浏览器访问,但主要区别在于它以SVG的形式输出图表或可缩放矢量图形。
Bokeh的优势: Bokeh允许你通过简单的指令就可以快速创建复杂的统计图, Bokeh提供到各种媒体,如HTML,Notebook文档和服务器的输出 ·我们也可以将Bokeh可视化嵌入flask...和django程序 Bokeh可以转换写在其它库(如matplotlib, seaborn和ggplot)中的可视化 ·Bokeh能灵活地将交互式应用、布局和不同样式选择用于可视化 综合Bokeh的优点及其面临的挑战...这些方式包括箱形图、柱状图、面积图、热图、甜甜圈图和许多其它图形。你只需输入数据框(data frames)、numpy数组或字典就可以生成这些图。 让我们来看看创建一个图表的通用方法: 1....可视化图表 为了更好地理解这些步骤,让我用下面的例子来演示一下: 图表范例-1:使用Bokeh创建一个柱状图并在Web浏览器上显示 我们将遵循上述列出的步骤来创建一个图表: #导入库函数 from bokeh.charts...5.图表可视化 为了更好地理解这些步骤,让我举例演示: 绘图范例-1:在Notebook文档中创建二维散点图(正方形标记) from bokeh.plotting import figure, output_notebook
自定义插件示例 Mpld3 将Phython的核心绘图库matplotlib和备受欢迎的JavaScript图表库D3结合在一起,创建了与浏览器兼容的可视化图形。...如果你熟悉D3和JavaScript,就可以创造无穷尽的各种图形。 当你准备发布图形的时候,在最后添加一行额外的代码,把你的图形转换成HTML和JavaScript字符,就可以嵌入到任何网页中。...Bokeh在允许用户在浏览器中操作数据方面做得尤为突出,用户可以通过滑动和下拉菜单进行筛选。与mpld3一样,你可以在其中缩放和平移操作图表,但是也可以关注通过框或套索选中的一组数据点上。...在matplotlib或Bokeh后端中绘图是分开进行的,因此,你能够专注于数据,而非编写绘图代码。 HoloViews提供的主要交互功能是滑动条,因此,人们能够通过一个变量来观察它的影响。...另一种在Plotly中操作和分享图形的方式是在Mode中进行操作。你可以用SQL拖入数据,在Phthon Notebook中,利用Plotly离线库绘制查询的结果,之后把交互式图表添加到报告中。
▲图1 散点数据的相关性 在Python体系中,可使用Scipy、Statsmodels或Sklearn等对离散点进行回归分析,归纳现有数据并进行预测分析。...▲图2 散点数据拟合(线性) 但是在分析过程中需要注意,变量之间的相关性并不等同于确定的因果关系,仍需要考虑其他影响因素。 02 实例 散点图代码示例如下所示。...第7行工具条中的不同工具定义,第9行数据点的不同颜色定义,第20行和第21行采用网格显示图形,可以提前了解这些技巧,具体使用方法在下文中会专门进行介绍。...中的画布可通过多种布局方式进行显示; 通过配置参数BoxSelectTool,在图中用鼠标选择数据,采用不同方式进行交互。...中的画布可通过多种布局方式进行显示:通过配置视图参数,在视图中进行交互可视化。
程序 Bokeh可以转换写在其它库(如matplotlib, seaborn和ggplot)中的可视化 Bokeh能灵活地将交互式应用、布局和不同样式选择用于可视化 Bokeh面临的挑战: 与任何即将到来的开源库一样...这些方式包括箱形图、柱状图、面积图、热图、甜甜圈图和许多其它图形。你只需输入数据框(data frames)、numpy数组或字典就可以生成这些图。 让我们来看看创建一个图表的通用方法: 1....可视化图表 为了更好地理解这些步骤,让我用下面的例子来演示一下: 图表范例-1:使用Bokeh创建一个柱状图并在Web浏览器上显示 我们将遵循上述列出的步骤来创建一个图表: ? ?...激活图(类似matplotlib) 4. 执行后续的绘图操作,这将影响已经生成的图形。 5....图表可视化 为了更好地理解这些步骤,让我举例演示: 绘图范例-1:在Notebook文档中创建二维散点图(正方形标记) ? ?
程序 Bokeh可以转换写在其它库(如matplotlib, seaborn和ggplot)中的可视化 Bokeh能灵活地将交互式应用、布局和不同样式选择用于可视化 Bokeh面临的挑战: 与任何即将到来的开源库一样...这些方式包括箱形图、柱状图、面积图、热图、甜甜圈图和许多其它图形。你只需输入数据框(data frames)、numpy数组或字典就可以生成这些图。...可视化图表 为了更好地理解这些步骤,让我用下面的例子来演示一下: 图表范例-1:使用Bokeh创建一个柱状图并在Web浏览器上显示 我们将遵循上述列出的步骤来创建一个图表: 在上面的图表中,你可以看到顶部的工具选项...激活图(类似matplotlib) 4. 执行后续的绘图操作,这将影响已经生成的图形。 5....图表可视化 为了更好地理解这些步骤,让我举例演示: 绘图范例-1:在Notebook文档中创建二维散点图(正方形标记) 同样,你可以创建各种其它类型的图:如线、角和圆弧、椭圆、图像、补丁以及许多其它的图
看完本篇你将学会: 使用Bokeh可视化数据 自定义和组织可视化 为可视化添加交互性 ▍Bokeh的使用步骤 Bokeh在使用上有一个固定的操作顺序,因此,只要你熟悉了这个流程(模板),就可以快速了解并入门...Bokeh提供了两个常见选项:(1) 生成静态的HTML文件,(2) 在Jupyter Notebook中内联呈现可视化。 步骤 3:配置图形界面 你将配置图形,为可视化准备画布。...'):将可视化文件写入静态HTML文件 output_notebook():将直接在Jupyter Notebook中呈现你的可视化 注意,这两个函数在调用show()之后才会有效果。...步骤 5:组织布局 图形绘制完毕,我们想将两个绘图进行布局。Bokeh中,可以是使用网格式布局,或者选项卡切换式的布局。...套索 在套索模式下,我们在左图中随意地选择一个范围,可以看到在右图自动地出现了对应的数据点。 ?
一、matplotlib绘制热力图 Matplotlib是Python著名的2D绘图库,该库仿造Matlab提供了一整套相似的绘图函数,用于绘图和绘表,是强大的数据可视化工具和做图库,且绘制出的图形美观...二、seaborn绘制热力图 Seaborn是基于matplotlib的Python可视化库。它提供了一个高级界面来绘制有吸引力的统计图形。...Seaborn其实是在matplotlib的基础上进行了更高级的API封装,从而使得作图更加容易,不需要经过大量的调整就能使你的图变得精致。...如果是列表,则标签名改为列表中给的内容。如果是整数K,则在图上每隔K个标签进行一次标注。...如果是auto,则自动选择标签的标注间距,将标签名不重叠的部分(或全部)输出 mask:控制某个矩阵块是否显示出来。默认值是None。
乾明 发自 凹非寺 GitHub上,一份用Python做交互式图形的资源火了。 这一工具名为Bokeh,官方介绍称,它能读取大型数据集或者流数据,以简单快速的方式为网页提供优美、高交互性能的图形。...比如,有人用它做出了这样的图: ? 有人做出了这样的图: ? 还有其他各种图: ? 也有人用它做了图去TED上演讲: ?...: 低级接口能为应用开发者提供高度灵活的图形表示(支持自定义一些顶层的组件) 中级接口主要用于绘制曲线(会默认加载一些低级的组件) 高级接口用于快速简单地构建复杂图形 官方支持Python 2.7和3.5...,下载地址: https://www.anaconda.com/distribution/ 在工具使用方面,官方也提供了详尽的用户指南,包括快速安装运行、了解基础概念、如何处理数据、绘图、添加注释交互等等...有人正在将Bokeh的用户指南汉化: https://github.com/DonaldDai/Bokeh-CN 在具体实现方面,官方提供了教程与示例: ?
转自量子位,作者乾明 GitHub 上,一份用 Python 做交互式图形的资源火了。...这一工具名为 Bokeh,官方介绍称,它能读取大型数据集或者流数据,以简单快速的方式为网页提供优美、高交互性能的图形。 比如,有人用它做出了这样的图: ? 有人做出了这样的图: ?...还有其他各种图: ? 也有人用它做了图去 TED 上演讲: ? “美观、实用” 是不少用户给出的评价,甚至有人想让这份工具用起来更方便,尝试去汉化它的官方文档。...: 低级接口能为应用开发者提供高度灵活的图形表示(支持自定义一些顶层的组件) 中级接口主要用于绘制曲线(会默认加载一些低级的组件) 高级接口用于快速简单地构建复杂图形 官方支持 Python 2.7 和...有人正在将 Bokeh 的用户指南汉化: https://github.com/DonaldDai/Bokeh-CN 在具体实现方面,官方提供了教程与示例: ?
欢迎关注R语言数据分析指南 论文 原图 加载R包 library(tidyverse) library(cowplot) 导入数据 df <- read_tsv("group.xls") 绘制热图...heatmap % pivot_longer(-cluster) %>% # 将数据从宽格式转换为长格式,除了"cluster"列 separate(`name`, into...= "name", sep = "-") %>% # 将"name"列根据"-"分隔成新的列 ggplot(aes(name, cluster, fill = value)) + # 使用ggplot...绘图,设置映射 geom_tile() + # 添加瓷砖图层,用于绘制热图 scale_y_discrete(position = "right") + # 设置y轴刻度位置 scale_x_discrete...% ggdraw() + draw_plot(line, scale = 0.93, x = 0.12, y = 0.023) # 添加线图到热图上 图形导出 ggsave(plot, file
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