在Cytoscape上将GOslim输入到ClueGO中
，可以通过以下步骤完成：
- 首先，确保已经安装并打开了Cytoscape软件。
- 在Cytoscape的菜单栏中，选择"File"（文件）> "Import"（导入）> "Table"（表格）。
- 在弹出的对话框中，选择GOslim文件所在的位置，并选择正确的文件格式（例如，文本文件或Excel文件）。
- 点击"Open"（打开）按钮，将GOslim文件导入到Cytoscape中。
- 接下来，安装并打开ClueGO插件。在Cytoscape的菜单栏中，选择"Apps"（应用程序）> "App Manager"（应用程序管理器）。在应用程序管理器中，搜索"ClueGO"并点击"Install"（安装）按钮。
- 安装完成后，在Cytoscape的菜单栏中，选择"Plugins"（插件）> "ClueGO"。
- 在ClueGO的界面中，选择"Enrichment"（富集分析）选项卡。
- 在"Ontologies"（本体）下拉菜单中，选择"Gene Ontology"（基因本体）。
- 在"GO Term Selection"（GO术语选择）部分，点击"Import"（导入）按钮。
- 在弹出的对话框中，选择之前导入的GOslim文件，并点击"Open"（打开）按钮。
- 在"GO Term Selection"（GO术语选择）部分，可以选择要进行分析的GO术语，并设置其他参数。
- 点击"Start Analysis"（开始分析）按钮，ClueGO将开始对GOslim进行分析，并生成结果。
ClueGO是一款用于生物信息学研究的Cytoscape插件，可以帮助用户进行富集分析和功能注释。它可以将基因本体（如GOslim）与实验数据结合起来，帮助用户发现基因功能的富集模式和生物学过程。ClueGO的优势包括易于使用、可视化效果好、支持多种生物本体和富集分析方法等。
ClueGO的应用场景包括基因功能注释、生物学过程分析、疾病相关基因的富集分析等。通过ClueGO，用户可以更好地理解基因功能和生物学过程之间的关系，从而为生物信息学研究提供有力支持。
腾讯云提供了一系列与生物信息学相关的产品和服务，例如腾讯云基因组分析平台（https://cloud.tencent.com/product/ga），可以帮助用户进行基因组数据分析和解读。此外，腾讯云还提供了云服务器、云数据库、人工智能等多种云计算产品和服务，可以满足用户在生物信息学研究中的各种需求。
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我是cytoscape.js的新手，我想知道是否有可能在网络中显示不符合我的网络过滤标准的节点，即可能在网络底部作为异常值。这将非常有用，使用户能够完全了解网络以及过滤标准如何受到影响。例如，如中的图A
另外，我想问一下，我在cytoscape.js中遇到了springy layout选项，但它并没有在主cytoscape.js中列出。我目前使用arbor布局，并使用与数据值成比例的边长参数。然而，我希望我的边长是永久的(即，如果节点或边移动，网络应该弹回原始边长。类似这样的东西-
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浏览 1提问于2014-04-04得票数 0
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考虑到这是由用户数据支持的，可能会出现他们放入无效数据的情况，特别是有缺失目标的边。我想捕获这些数据并将其呈现给用户，这样他们就可以修复错误。
目前，我在日志中收到此错误，但我无法确定如何捕获数据。
Can not create edge `TableOfBooks>att` with nonexistant target `att`
我尝试过将cytoscape构造器包装在try...catch中……块，但它似乎没有捕获到错误。
try {
var cy = cytoscape(...);
} cat
浏览 2提问于2017-09-17得票数 3
当我试图在一个Uncaught TypeError: qtip.$domEle.qtip is not a function指令中为AngularJS节点创建一个qtip工具提示时，我遇到了错误消息AngularJS。
我的代码如下所示：
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return {
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浏览 3提问于2016-07-26得票数 1
我想在我的Ember应用程序的一个组件中使用cytoscape-qtip，它已经将Cytoscape.js作为一个依赖项来绘制一个图形。
Cytoscape.js的成功安装
Cytoscape.js本身已经成功地通过bower bower install cytoscape安装并通过成员-cli-build.js导入了Ember：
在我的成员-应用程序/成员-cli-build.js：
// in my-ember-app/ember-cli-build.js
// ....
app.import('bower_components/cytoscape/dist/cytoscape.j
浏览 0提问于2016-11-17得票数 0
1回答
我对Cytoscape Reactome FI插件的使用比较陌生。我已经用DESeq分析确定了我感兴趣的两种实验条件下小鼠(小鼠)差异表达的基因。我希望找出在这些差异表达的基因中丰富的途径。我偶然发现了Cytoscape的Reactome FI插件，它可以找到与癌症和其他类型的疾病相关的路径和网络模式。可以将小鼠的基因输入到反应组中以识别丰富的途径吗？
浏览 16提问于2020-04-09得票数 0
我正试着用和Cytoscape.js做这个。我在使用圆圈布局，但它不起作用。我将动态地添加更多的项目。对于其他节点，第一个节点总是比第二个节点更近，依此类推。
以下是代码：
$(function(){
var cy = cytoscape({
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.selector('node')
.css({
'content': 'd
浏览 0提问于2015-08-11得票数 1
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我有相对大量的图形数据(超过1000个节点，超过2000条边)。Cytoscape.js无法呈现这么多的数据，所以我决定做一些交互式的图表探索。我想从图根开始(它是DAG)，用户将能够在点击节点之后探索它们。
我知道我可以在cytoscape.js之外这样做，但是我想知道我是否可以创建一个节点/边缘集合来操作(删除除了根和它们的邻居之外的所有节点)，然后作为数据源(获取节点的子节点)。Cytoscape使图形处理变得非常容易，不需要重新发明轮子是很棒的。
我尝试基于输入到图形的JSON数据创建cy.collection，但它似乎不接受与cy.load相同的数据格式。
浏览 1提问于2015-02-04得票数 0
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我使用了一个复杂的过程来可视化RDF图: SPARQL查询、JSON导出、->导入到Cytoscape Desktop ->导出以及-> ->导入到Cytoscape.js。有没有什么方法可以在Cytoscape.js中直接可视化RDF图，例如使用一个类似于Cytoscape Desktop的RDFScape的插件？
附言:对于任何有这个问题的人，你可以像这样使用我们的解决方案：。使用"& instances“参数也可以加载实例(不适用于DBpedia，因为它太大了)。源代码在.
浏览 22提问于2016-08-08得票数 1
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我对使用Cytoscape分析基因之间的分子关系很感兴趣，我一直在阅读Cytoscape网站上的教程，但我不确定如何使用Cytoscape进行“一对多”比较。
例如，每个基因通常被指定为“节点”，其“边”对应于与其他基因的交互作用。Cytoscape使用“属性”将节点或边名称映射到特定的数据值。在一个简单的“一对一”比较中，您可能有一个包含10个基因及其表达值的列表，这样每个基因的属性将是1)基因的名称和2)表达值。看起来很清楚Cytoscape将如何使用这些类型的数据来构建交互网络。
但是，对于每个基因(节点)，我有多个数据值，例如对于基因X，我将拥有指示基因X与分析中所有其他基因之间的预测
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我正在尝试将Cytoscape Json (*cyjs)读取到NetworkX图中。到目前为止还没有成功，我也尝试了其他格式。以下是一个输入示例：
{
"format_version" : "1.0",
"generated_by" : "cytoscape-3.8.2",
"target_cytoscapejs_version" : "~2.1",
"data" : {
"shared_name" : "Network",
浏览 44提问于2021-05-25得票数 0
2回答
我试图在角8中实现胞角扩展
npm安装细胞角-边缘编辑细胞角工作良好。
1.app.ts
import * as cytoscape from 'cytoscape';
import * as edgeBendEditing from 'cytoscape-edge-editing';
import * as jquery from 'jquery';
let cytoscape = require('cytoscape');
let jquery = require('jquery');
let edge
浏览 0提问于2019-12-06得票数 0
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我正在尝试在角度应用中集成细胞角。
首先我下载了：
npm i --save ngx-cytoscape cytoscape @types/cytoscape
然后，我将Cytoscape库导入到模块中。
import { NgModule } from '@angular/core';
import { CommonModule } from '@angular/common';
import { ItemComponent } from './item/item.component';
import { CytoscapeModule }
浏览 0提问于2018-08-18得票数 2
1回答
我正在尝试使用cytoscape-popper和/或cytoscape-qtip (无论哪种工作) cytoscape在angular 6中的扩展。
我使用了以下方法来导入和使用：
import popper from 'cytoscape-popper';
import qt from 'cytoscape-qtip';
_.use(require('cytoscape-popper'));
_.use(require('cytoscape-qtip'));
但是，当我使用this.cy.popper()时，它并没有编译说po
浏览 0提问于2018-08-29得票数 0
我有一个使用Kruskal API创建MST的图表。我很想把MST形象化，但我没有看到任何显而易见的方式。 let originalGraph = cytoscape({
...
elements: jsonData
});
let mst = originalGraph.elements().kruskal(e => e.data().weight);
let newGraph = cytoscape({
...
elements: ???
}); 我如何从MST (或者任何其他像originalGraph这样的图)中提取元素，以便将其传递到一个新的cytosca
浏览 8提问于2019-09-25得票数 0
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1回答
此代码按预期使用破折号生成网络：
import dash
from dash import dcc
from dash import html
import dash_cytoscape as cyto
from dash.dependencies import Input, Output
import plotly.express as px
dash_elements = [{'data': {'id': '6840', 'label': '6840'}, 'classes': 'bl
浏览 5提问于2021-10-24得票数 1
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我在使用cityscape和它的类型记录定义。这些类型的定义如下：
export = cytoscape;
export as namespace cytoscape;
declare function cytoscape(options?: cytoscape.CytoscapeOptions): cytoscape.Core;
declare function cytoscape(extensionName: string, foo: string, bar: any): cytoscape.Core;
declare namespace cytoscape { ... }
我是这样用
浏览 0提问于2019-06-07得票数 1
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1回答
我的项目在浏览器中使用ES6模块，但我需要使用一个使用Node模块生成的库，然后再进行but打包:cytoscape或cytoscape。这些都是对Cytoscape的扩展，它本身有一个运行良好的ESM端口。我发现很多资源可以从ES6转到其他任何东西，但不是相反的。有人知道我该去哪吗？
浏览 4提问于2021-08-16得票数 1
我知道cytoscape不支持webgl-3d轴。但是它支持webgl在2D中渲染吗？
在cytoscape中渲染的默认上下文是什么?如果是canvas，在这种情况下如何使用webgl？
例如，我必须使用2d渲染2k个从中心元素到所有其他元素的边缘元素。
let layout = {
container: document.getElementById('app'),
elements: []
};
for(let i = 0, j = 2000, k = 0; i < 2000; i++) {
layout.elements[i] = {
dat
浏览 0提问于2017-03-27得票数 1
1回答
我正试图在我的公司内建立一个代理的maven项目。
Pom中列出的依赖项在Maven Central repo中不存在。它们位于这里：
<repositories>
<repository>
<id>cytoscape_snapshots</id>
<snapshots>
</snapshots>
<releases>
<enabled>false</enabled>
<
浏览 0提问于2018-05-08得票数 0
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我按照这里的说明(https://github.com/cytoscape/cytoscape/wiki/Cytoscape-App-Ladder)来学习如何构建第一个简单的Cytoscape应用程序，但我陷入了“设置Cytoscape应用程序开发”的步骤，因为在IntelliJ中从github导入项目后，我遇到了以下问题： ? 。 我该如何解决？ PS。我也是Cytoscape和Maven项目的新手。谢谢!
浏览 16提问于2019-12-15得票数 1
2回答
如何用类型记录进行细胞角初始化？
、、、、
我用类型记录构建了一个使用 (及其)作为无头模型的React组件。我的目标是创建一个NPM包，以便我可以直接导入其他项目。
我的图书馆：
当我将cytoscape.js作为静态资产导入index.html时工作。
当我在一个新的es6应用程序：Uncaught ReferenceError: cytoscape is not defined at new WbsLayout中使用我的组件时，就不会这么做了。这一点，尽管在安装我的组件时，node_modules中会自动安装胞景。
打字稿来源
WbsLayout.tsx：
export class WbsLayout
浏览 0提问于2017-06-14得票数 6
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我正在尝试理解Cytoscape自动化，以便将浏览器应用程序与Cytoscape桌面软件进行通信。据我所知，cyBrowser可能会很有用。我的目的是将json字符串从浏览器应用程序传递到cytoscape。正如在https://github.com/cytoscape/cytoscape-automation/wiki/App-Developers:-Adding-Automation-to-Web-Pages中指出的，下面可能是有用的，然而，我手头有一个字符串(不是服务器端的url)。 <input type="button" class="btn btn-
浏览 15提问于2020-06-17得票数 1
我想使用py2cytoscape包在cytoscape中自动保存一个视图。 from py2cytoscape import cyrest
cytoscape = cyrest.cyclient()
cytoscape.network.load_file("FILENAME.cyjs")
cytoscape.vizmap.apply(styles="default")
cytoscape.network.set_current(network="FILENAME")
cytoscape.layout.apply_preferred()
cyt
浏览 11提问于2019-01-29得票数 3
我最近尝试将Cytoscape v3.8.2下载到我的计算机上(MacOS11.5.2)。我在最新的mac更新中看到了有关该问题的警告，并按照建议下载了disable-opencl.dummy文件并将其放置在CytoscapeConfiguration目录中。我仍然无法打开Cytoscape，所以我继续查看建议的故障排除协议。我检查了我的Java版本并运行了系统检查器脚本： java version "12.0.1" 2019-04-16
Java(TM) SE Runtime Environment (build 12.0.1+12)
Java HotSpot(TM) 64
浏览 73提问于2021-09-06得票数 0
我尝试在一个类型记录项目中使用CytoscapeJS和扩展。在引用了@types/cytoscape后，我在 中更改了一行，但是，由于对它不熟悉，所以在黑暗中迷失了设置index.d.ts，所以想得到任何建议，如何实现？或者其他地方有什么问题吗？真心的。
@type/cytoscape/index.d.ts
function use(module: Ext, module2?: Ext, module3?: Ext): void;
canvas.ts
import cytoscape from "cytoscape";
import $ from 'jquery'
浏览 1提问于2021-03-04得票数 1
是否可以在Typescript中使用Cytoscape UI扩展？可以使用布局扩展，但是当我需要例如时，我不能调用cy.cxtmenu函数(默认值)，因为它不在cytoscape接口中。有没有办法使用它？
我在index.ts中的代码：
import cytoscape = require('cytoscape');
import contextMenus = require('cytoscape-cxtmenu');
cytoscape.use(contextMenus);
const cy = cytoscape({
container: docu
浏览 12提问于2018-09-22得票数 2
我有一个React Container，可以渲染一个cytoscape实例。在容器中，我还有一个模态组件，它包含一个滑块组件，其中包含一个input标记。
问题是这个输入标记有一个永远不会被调用的onChange函数。
有没有办法阻止cytoscape阻止输入标记上的侦听器？
我尝试修改模态组件的z索引，使其位于cytoscape之上，但仍然不起作用。我还尝试将eventlisteners转换为cytoscape:例如：
props.cy.removeAllListeners();
props.cy.userZoomingEnabled(false);
props.cy.userPanning
浏览 13提问于2019-08-08得票数 1
我在一个角10应用程序中使用。cytoscape.js的文档显示
在具有npm的无害环境管理环境中使用Cytoscape.js (例如Webpack或Node.js与ESM包)：import cytoscape from 'cytoscape';
我把它像import cytoscape from 'cytoscape';一样导入到我的类型记录文件中。
但我看到了警告
CommonJS或AMD依赖项可以导致优化纾困。
所以我转到node_modules\cytoscape\dist文件夹。我看到有很多重要的文件。
我把console.l
浏览 3提问于2020-10-01得票数 2
1回答
我在react中使用了plotly的cytoscape for react，here。 我已经执行了以下步骤： // import and register the layouts
import Cytoscape from 'cytoscape';
import COSEBilkent from 'cytoscape-cose-bilkent';
Cytoscape.use(COSEBilkent); 并且我在组件中呈现我的图形(元素的格式正确)： render() {
...
let elements = ...
const layout =
浏览 56提问于2019-02-14得票数 0
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我想为我的图形添加工具提示，但我在cytoscape.js中使用弹出扩展时遇到了问题。我不能导入这个扩展，因为当我尝试调用"use“函数时，我仍然收到一个错误："Cannot read property 'use‘of undefined”。我使用: npm install cytoscape and npm install cytoscape-popper安装了cytoscape和cytoscape-popper。
下面是我的代码的一部分-它看起来像在中
import cytoscape from 'cytoscape';
import popper
浏览 1提问于2018-05-21得票数 0
在使用Cytoscape.js之前，我使用了Cytoscape进行生物网络可视化。
Cytoscape能够使用其内部布局算法从我们的网络文件中创建一个自动布局。布局布局是非常合理的--相互连接的节点被放置在附近，节点与每组节点中心的中心节点很好地分布在一起，这对生物网络来说是很好的，因为节点太多，节点之间的连接也很多。
现在我正在使用Cytoscape.js。我希望Cytoscape.js能够自动创建一个布局，就像Cytoscape所创建的那样。我试着使用所有不同的布局选项(“随机”、“网格”、“cose”、“圆形”、“广度优先”)，但它们都没有创建类似于Cytoscape创建的布局。
我不需
浏览 2提问于2017-03-04得票数 3
这是一个例子，标题是cytoscape js ()中的“图像-宽度优先-布局”。
cy.on('tap', 'node', function(){
var nodes = this;
var tapped = nodes;
var food = [];
nodes.addClass('eater');
for(;;){
var connectedEdges = nodes.connectedEdges(function(el){ <-- here
return !el.target().anySame( nodes );
浏览 0提问于2018-11-03得票数 0
在之后，我试图将cytoscape.js包含到一个超级基本的网页中。我通过npm install cytoscape下载了cytoscape，并将cytoscape/dist/cytoscape.js复制到我的项目目录中。该目录如下所示：
Kyles-MBP:Desktop kyleweise$ tree testing-cytoscape/
testing-cytoscape/
├── cytoscape.js
└── index.html
我基本上复制了本教程中的内容，index.html如下所示：
<!doctype html>
<html>
<head
浏览 2提问于2018-07-07得票数 0
回答已采纳
我想在我的Ember项目中使用Cytoscape.js。因此，我安装了依赖项：npm install --save cytoscape。接下来，我创建了我的Ember组件。当我编写组件js文件时，我无法找到如何导入Cytoscape。我试过import cytoscape from "cytoscape"，var cytoscape = require("cytoscape")，但是这些都不起作用。
那么，如何在我的组件中适当地“包括”细胞扫描呢？
浏览 3提问于2015-08-11得票数 1
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2回答
基于本指南：
我在Ubuntu上运行了一个脚本，该脚本克隆了一组github存储库：
它会失败，错误为：
$ ./cy.sh init
Target directory =
Cytoscape project will be cloned to: /home/user/projects/cytoscape
Cloning: parent (URI = git@github.com:cytoscape/cytoscape-parent.git)
Cloning into 'parent'...
Permission denied (publickey).
fatal: Coul
浏览 0提问于2016-02-07得票数 3
回答已采纳
我正在开发一个功能来编辑Cytoscape.js中的边缘数据。我也可以编辑节点的数据，而且它运行得很好！但是当我试着做同样的事情时，它就没有了。
Chrome：70.0.3538.110
Cytoscape.js：3.2.16
Node.js：8.10.0
角：6.1.2
以下是我的简化代码：
节点编辑：
<form #form="ngForm" autocomplete="off">
<div *ngFor="let field of buildDisplaySet(selectedElement) | keyvalue"
浏览 2提问于2018-11-30得票数 1
我正在构建一个交互式图形应用程序，其中用户将上传数据文件。然后，应用程序将从输入文件构建图形。 我在使输入与cytoscape一起工作时遇到了问题。更具体地说，当我包含div时，文件对话框窗口不会弹出。也就是说，除非我注释掉cytoscape，否则输入按钮不会响应。 请看下面的代码。我猜，这不是特定于细胞的。然而，我不能弄清楚这个问题的真相，所以我发布了这个问题的完整实例。 <!doctype html>
<html>
<head>
<meta charset="UTF-8">
<title>Test
浏览 31提问于2021-11-19得票数 0
回答已采纳
我有大约100个*.xgmml文件，每个文件指定一个不同的网络。如何通过Cytoscape为每个输入文件自动生成PNG图像文件？
( Cytoscape命令行选项包括一些用于加载文件的选项，但我没有看到用于将网络导出为图像文件的选项。)
浏览 1提问于2013-01-13得票数 3
我正在通过JSNI使用测试数据利用一个名为cytoscape.js的外部javascript库。当我在java类中运行我想如何通过JSNI的脚本时，它无法生成图形。然而，当我通过Chrome控制台运行它时，它工作正常。
所有的值似乎都正确地传递给了cytoscape.js库。当前，JSNI代码失败了由Javascript库执行的测试，控制台代码能够通过这个测试。
下面是我使用的JSNI代码：
public static native void cytoscape() /*-{
var cy = $wnd.cy = $wnd.cytoscape({container: $wnd.
浏览 0提问于2019-08-02得票数 0
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我正在使用Rstudio，为了创建网络可视化，我正在使用Cytoscape。我找不到任何帮助文档来理解如何添加注释到节点，鼠标的onHover。已经在http://js.cytoscape.org/demos/colajs-graph/上完成了节点的onmouseclick事件。但我的要求是onHover。 任何帮助或指导都是非常有帮助的。
浏览 75提问于2019-10-08得票数 1
我使用的是AngularJS和TypeScript。我使用的是cytoscape库，扩展名为cytoscape-edgehandles，包装器是AngularJS的ngCytoscape。我正在尝试将图像添加到节点的悬停句柄中，但是cytoscape-edgehandles 2.7.1中的drawImage方法的实现在绘制之前并不等待图像加载，因此发生了范围错误。
我曾尝试在加载图像后为cytoscape图提供选项，但是cytoscape图希望这些选项立即可用。因此，在将图像传递到图形之前，我需要以某种方式加载图像。
在控制器的构造函数中：
this.$scope.ehOptions = th
浏览 0提问于2019-11-07得票数 2
我尝试在macOS (10.15.7版)上用Cytoscape java (3.8.1版)设置我的网络图的样式，但无法将边一直绘制到节点的中心，例如它们最终看起来是满的。现在，它们似乎被截断了。
特别难搜索，因为所有的结果通常都与姊妹项目Cytoscape.js有关。
这是我的可视化的当前状态：
这是在绘图软件中手动完成的所需状态：
非常感谢你的建议。
浏览 4提问于2020-10-19得票数 1
我是Cytoscape的新手，我有一个工作图，但我的节点相距很远。虽然我意识到Cytoscape动态生成所有内容，但似乎应该可以说“在节点之间使用一半的空间”。
此演示：
似乎表明你可以动态地改变边缘的长度。但是，当我查看源代码()时，我不知道它是如何工作的。
看起来演示程序向makeLayout传递了一个edgeLength选项，但是Cytoscape文档甚至没有提到edgeLength是一个有效的选项。
有没有更有经验的人告诉我如何缩短节点之间的边？
浏览 0提问于2016-09-01得票数 0
我怎样才能将一个Cytoscape网络保存为一个扁平的JSON文件？
cytoscape.js示例通常将底层网络数据存储为一个平面data.json文件(例如，，也请参阅)。
这与将图形保存为Cytoscape文件时获得的分组或键控格式形成了鲜明对比(在Cytoscape：file > Export > Network to File > Cytoscape JSON (*.cyjs))中)。
备注： 表示我可以使用cy.json()导出图形的JSON表示，但我不知道如何调用这个命令(相对于javascript而言，我是个新手)。
浏览 3提问于2021-07-02得票数 0
我正在生成网络，并使用将它们导入到Cytoscape中。
我有很多关于每个节点的额外信息，这些信息超出了节点标签的范围。我希望用户能够点击一个节点，并带出一个详细的面板与这个额外的信息。Cytoscape有没有什么特性，或者现有的插件可以做到这一点？
浏览 12提问于2020-05-30得票数 1
回答已采纳
我已经尝试过安装和重新安装Cytoscape和Java。当涉及到这些事情时，我有点无知，所以我希望得到详细的帮助。
macOS Catalina版本10.15.4。Cytoscape 3.8.0和Java 8更新251
浏览 10提问于2020-05-28得票数 0
我正在尝试使用Cytoscape命令行运行一个导入和导出网络的脚本，如下所示：
cytoscape.bat -S "script_for_cytoscape.txt"
该脚本工作并执行所需的任务，但是，将显示Cytoscape，并且我们可以看到网络和GUI。
我想将其作为后台作业运行，而不显示Cytoscape。我尝试了"-noView“选项，但它不起作用。
所以我想知道是否有一种方法可以在非图形(无视图)模式下运行Cytoscape？
非常感谢您的提前！
浏览 0提问于2017-03-06得票数 0
1回答
我在cytoscape中生成了一个网络模型，并希望使用R对其进行一些分析。然而，我不确定如何才能将我的图形从cytoscape导入到R中的可分析形式。我尝试将其作为SIF文件和XGGML文件读取到R中，但到目前为止都没有成功。我找到的所有函数要么导致错误，要么过期。
有人知道我是怎么把细胞图读入R的吗？
非常感谢！
浏览 0提问于2021-01-11得票数 0
我使用Cytoscape.js来表示网络图。我可以一次高亮显示多个节点，方法是选择第一个节点，然后选择第二个节点，同时保持shift键。
如何在Javascript中获得我选择的所有节点in？例如，如果所有同时选择的节点ids都被组织到Javascript列表中，那么这将是理想的。
我查看了cytoscape.js文档，但找不到所描述的位置。
浏览 1提问于2018-02-19得票数 1
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1回答
我添加到流星细胞角:无穷大:细胞角
我有非常基本的流星应用程序：
hello.js hello.html
但我不能让它起作用
下面是我在web浏览器控制台中看到的错误：
关于呈现的zavolana hello.js:9 ss对象对象debug.js:41异常跟踪器afterFlush函数: debug.js:41 TypeError:无法读取未定义at CanvasRenderer.registerBinding (infinitedg_cytoscape.js:17127) at CanvasRenderer.load (infinitedg_cytoscape.js:
浏览 1提问于2016-01-16得票数 2
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