首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

在Fortran中使用mpif90编译器进行HDF5链接的问题

Fortran是一种高级编程语言,主要用于科学计算和数值分析。HDF5(Hierarchical Data Format 5)是一种用于存储和管理大规模科学数据集的文件格式和库。

在Fortran中使用mpif90编译器进行HDF5链接,可以通过以下步骤完成:

  1. 安装HDF5库:首先,需要在系统中安装HDF5库。可以从HDF Group的官方网站(https://www.hdfgroup.org/downloads/hdf5/)下载适合您系统的HDF5库,并按照官方文档进行安装。
  2. 编写Fortran代码:编写使用HDF5库的Fortran代码。在代码中,您可以使用HDF5库提供的函数来创建、读取和写入HDF5文件,以及操作其中的数据集、组和属性等。
  3. 导入HDF5模块:在Fortran代码中,需要导入HDF5模块,以便可以使用HDF5库提供的函数和类型。通常,可以使用以下语句导入HDF5模块:
  4. 导入HDF5模块:在Fortran代码中,需要导入HDF5模块,以便可以使用HDF5库提供的函数和类型。通常,可以使用以下语句导入HDF5模块:
  5. 链接HDF5库:在使用mpif90编译器编译Fortran代码时,需要将HDF5库链接到生成的可执行文件中。可以使用以下命令行选项来链接HDF5库:
  6. 链接HDF5库:在使用mpif90编译器编译Fortran代码时,需要将HDF5库链接到生成的可执行文件中。可以使用以下命令行选项来链接HDF5库:
  7. 其中,-L/path/to/hdf5/lib指定HDF5库的路径,-lhdf5指定链接HDF5库。
  8. 注意:具体的路径和命令行选项可能因系统和HDF5库的安装方式而有所不同,请根据实际情况进行调整。
  9. 运行可执行文件:完成编译后,可以运行生成的可执行文件,执行Fortran代码并使用HDF5库进行数据的读写和处理。

总结起来,使用mpif90编译器进行HDF5链接的步骤包括安装HDF5库、编写Fortran代码、导入HDF5模块和链接HDF5库。通过这些步骤,您可以在Fortran中使用mpif90编译器进行HDF5链接,并进行科学数据的存储和处理。

腾讯云相关产品和产品介绍链接地址:

  • 腾讯云对象存储(COS):https://cloud.tencent.com/product/cos
  • 腾讯云云服务器(CVM):https://cloud.tencent.com/product/cvm
  • 腾讯云容器服务(TKE):https://cloud.tencent.com/product/tke
  • 腾讯云人工智能(AI):https://cloud.tencent.com/product/ai
  • 腾讯云物联网(IoT):https://cloud.tencent.com/product/iot
  • 腾讯云移动开发(移动推送、移动分析):https://cloud.tencent.com/product/mps
页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

无缝衔接Fortran大气模式和Keras深度学习模型!

近期加利福尼亚大学研究者构建了基于Keras-Fortran桥梁接口(KFB),并利用FKB解决有关全球气候模拟实验方法鲁棒性问题该方法,利用深度学习神经网络模拟次网格物理过程。...不过当前大部分海洋学、计算物理、气候模式和航天仍在使用Fotran进行数值计算。由于这些历史“宝藏”代码复杂性以及体量等问题,导致很难利用现代编程语言重写这些Fortran代码。...然后,这些信息转换为与FKB/F匹配Fortran神经网络配置,从而允许用户可以Fortran构建相同网络,很容易Fortran环境中加载和使用。...如果在Fortran环境中进行了任何修改,FKB/P将这些更改解析到HDF5文件,利用Keras重新训练。...也就是说,初始网络模型可以Fortran构建,初始训练和测试之后,可以迁移到Keras进行评估。这使得可以利用GPU训练Keras模型,然后嵌入到Fortran代码

2.6K30

CESM 2.1.1 移植指南(CentOS 7.6)

CESM是CCSM升级版,2010年,国家科学基金会(NSF)和美国能源部(DoE)重要资金(NSF)和重要资金全球动力学部门(CGD)2010年发布了CESM1。...www.centos.org/download/ Kernel 4.14.0-115.el7a.0.1 https://www.centos.org/download/ 3 移植规划数据 本章节给出CESM软件移植过程涉及到相关软件安装规划路径用途及详细说明...2 /path/to/OPENBLAS OpenBLAS安装规划路径。 这里安装规划路径只是一个举例说明,建议部署共享路径。...现网需要根据实际情况调整,后续章节凡是遇到安装路径命令,都以现网实际规划安装路径为准进行替换,不再单独说明。 3 /path/to/HDF5 HDF5安装规划路径。...需要查看输出到屏幕日志,如图7-1所示红线处,需要手动计算出时间差,数值越少性能越优。 图7-1 测试样例 ?

2.8K50

CESM 2.1.1 移植指南(CentOS 7.6)

CESM是CCSM升级版,2010年,国家科学基金会(NSF)和美国能源部(DoE)重要资金(NSF)和重要资金全球动力学部门(CGD)2010年发布了CESM1。...www.centos.org/download/ Kernel 4.14.0-115.el7a.0.1 https://www.centos.org/download/ 3 移植规划数据 本章节给出CESM软件移植过程涉及到相关软件安装规划路径用途及详细说明...2 /path/to/OPENBLAS OpenBLAS安装规划路径。 这里安装规划路径只是一个举例说明,建议部署共享路径。...现网需要根据实际情况调整,后续章节凡是遇到安装路径命令,都以现网实际规划安装路径为准进行替换,不再单独说明。 3 /path/to/HDF5 HDF5安装规划路径。...需要查看输出到屏幕日志,如图7-1所示红线处,需要手动计算出时间差,数值越少性能越优。 图7-1 测试样例 ?

3.8K20

离线编译OpenMolcas+QCMaquis

使用高级一些LaTeX编译器,如TeX Live等。...编译器/系统环境基本要求: (1)GNU编译器>=5.x版本,笔者机子上装是5.4.0(读者可运行gcc -v查看版本号)。若读者机子上编译器版本太低,可参考教程《Linux下安装高版本GCC》。...注意若将GCC安装到非默认位置(如/opt/gcc-5.4.0),请勿自己账户~/.bashrc里导出关于/usr/lib64库路径,因为显然/usr/lib64里是旧版库,故意导出旧版库容易造成后续编译问题...linux下再)解压,改名,进入文件夹 tar -jxvf hdf5-1.12.0.tar.bz2 mv hdf5-1.12.0 hdf5 cd hdf5 依次执行以下三条命令进行编译 ....完成后~/.bashrc写上环境变量 export HDF5_ROOT=/home/$USER/software/hdf5-1.12.0 export PATH=$HDF5_ROOT/bin:$PATH

1.4K31

MNIST数据集上使用PytorchAutoencoder进行维度操作

这将有助于更好地理解并帮助将来为任何ML问题建立直觉。 ? 首先构建一个简单自动编码器来压缩MNIST数据集。使用自动编码器,通过编码器传递输入数据,该编码器对输入进行压缩表示。...通常,编码器和解码器将使用神经网络构建,然后示例数据上进行训练。 但这些编码器和解码器到底是什么? ? 自动编码器一般结构,通过内部表示或代码“h”将输入x映射到输出(称为重建)“r”。...现在对于那些对编码维度(encoding_dim)有点混淆的人,将其视为输入和输出之间中间维度,可根据需要进行操作,但其大小必须保持输入和输出维度之间。...由于要比较输入和输出图像像素值,因此使用适用于回归任务损失将是最有益。回归就是比较数量而不是概率值。...检查结果: 获得一批测试图像 获取样本输出 准备要显示图像 输出大小调整为一批图像 当它是requires_grad输出时使用detach 绘制前十个输入图像,然后重建图像 顶行输入图像,底部输入重建

3.4K20

JavaScript原型继承使用存在安全问题

JavaScript原型很多人都知道也很好用,但是很多人在使用原型继承中导致安全问题却很少人知道,接下来我们就来好好了解一下。...真实开发,我们经常会在代码中使用Property accessors 属性访问器,并且使用用户输入参数去访问某个对象属性。...这看起来可能是一个很稀疏平常操作,但是往往在这个过程我们代码就已经产生了一个很大安全漏洞!!!为什么这样写代码会产生安全问题?...如果在客户端上,这可能问题不大,如果这是服务器上,那就可能会为黑客攻击提供漏洞。...代码减少属性访问器使用尽可能使用.方式去访问对象属性或者使用 Map或Set,来代替我们对象检查对象原型链,查看新创建对象原型是否被恶意添加了原本不该有的属性,或者属性被修改检查用户输入

16711

GitXcode配置与使用常见问题总结

书接上回提出GitXcode配置与使用常见问题4个问题 问题1,如何在Xcode创建代码库,并添加和提交代码到代码库? 问题2,如何在Xcode中提交推送给远程服务器代码库?...问题3,如何在Xcode克隆远程服务器代码库到本地? 问题4,如何使用Xcode获取远程代码库数据,并解决冲突问题?...2、问题2 本地有代码库提交推送给远程服务器代码库,Xcode可以通过菜单File→Source Control→Push…进行推送,但是如果是第一次访问,会出现对话框,没有可以推送远程服务器代码库名...Xcode可以通过菜单Window → Organizer,选中Repositories→myrepo→Remotes,点击左下角“Add Remote”按钮,弹出对话框,Remote Name...如果这个过程中有冲突发生,会弹出对话框在两个代码窗口中可以看到它们冲突点, ? 下面的4个按钮,可以把冲突点进行合并,并进行编辑。如果没有冲突,Pull是可以点击,点击Pull按钮就可以了。

3.4K110

Ubuntu16.04Caffe安装

4.修改配置文件 $ sudo vim Makefile.config 根据个人需要进行修改 a.若使用 cudnn,则将#USE_CUDNN := 1 修改成:USE_CUDNN := 1...注意:GPU运算能力(GPU Compute Capability )3.0以上才支持CUDNN b.若使用 opencv 版本是 3 ,则将#OPENCV_VERSION := 3 修改为...7.执行编译和测试命令 ~/ caffe/目录下 $ make all -j4 $ make test -j4 $ make runtest -j4 问题: Makefile:532: recipe...配置 pycaffe 接口 caffe 根目录 python 文件夹下,有一个 requirements.txt 清单文件,上面列出了需要依赖库,按照这个清单安装就可以了。...安装 scipy 库时候,需要先安装 fortran 编译器 (gfortran),如果没有这个编译器就会报错,因此,我们可以先安装一下。

63320

PHP中使用SPL库对象方法进行XML与数组转换

PHP中使用SPL库对象方法进行XML与数组转换 虽说现在很多服务提供商都会提供 JSON 接口供我们使用,但是,还是有不少服务依然必须使用 XML 作为接口格式,这就需要我们来对 XML...而 PHP 并没有像 json_encode() 、 json_decode() 这样函数能够让我们方便地进行转换,所以操作 XML 数据时,大家往往都需要自己写代码来实现。... phpToXml() 代码,我们还使用了 get_object_vars() 函数。就是当传递进来数组项内容是对象时,通过这个函数可以获取对象所有属性。...测试 $data 内容非常长,大家可以直接通过测试代码链接去 Github 上查阅。 总结 这篇文章内容是简单学习了一个 SPL 扩展库对于 XML 操作两个对象使用。...测试代码: https://github.com/zhangyue0503/dev-blog/blob/master/php/202009/source/PHP中使用SPL库对象方法进行XML与数组转换

5.9K10

c和fortran混编

这正是因为链接器(链接器其实 是ld,gcc调用了它)foo.o中找到了main.o需要foo定义,并且main.o中找到了main定义。...这里还牵扯到一个问题,那就是c是很纯朴语言,c函数文本文件是什么名字,那么编译出来目标文件(一般是.o文件)相应那个函数还是那个名字(不会像c++一样为了重载函数名前后加一大堆区分符)。...就像c++要用c库,也需要在声明这个库函数时使用extern “C”,使c++编译器在编译这个函数时生成符号名是C风格而不是C++风格。...这也就是为什么时常有人问gcc main.cc会出错问题了,如果main.cc用到了c++库函数,那么当然要使用gcc -lstdc++ main.cc才行了) 如果我们保持main.c不变,...这是编译器(f77)一个命名规则,没有为什么,它就是把你fortran函数名字全转换成小写,然后最后加一个下划线。我昨天搜了很多版本,头昏脑胀,怎么调都说找不到,也没有想到要自己看看。

1.5K41

GPU版GAMESS快速安装

LibCChem不仅有GPU加速代码,也用Global array(GA)共享内存机制进行并行代码编写。同时,也采用了HDF5文件存储方式,可以并行I/O以及在内存写临时文件。...例如,用户需要安装HDF5,Boost(C++一个大库),eigen(C++线性代数库)。当然GAMESS也需要Fortran编译器、数学库、并行环境等。...以afandiadib/gamess为例进行讲解,如何用镜像进行计算。我们可以进入容器(container),容器运行GAMESS。...如果上述功能依赖老版本GAMESSddikick并行机制,那么可能没法使用LibCChem进行加速。我测试能量分解遇到这样问题。...另外如果打包镜像的人仔细搭配了编译器或软件库,那么容器效率也许会比自己编译效率高。IBM一个研究文档讨论过Docker效率问题

91020

matlab基础1

它将数值分析、矩阵计算、科学数据可视化以及非线性动态系统建模和仿真等诸多强大功能集成一个易于使用视窗环境,为科学研究、工程设计以及必须进行有效数值计算众多科学领域提供了一种全面的解决方案,并在很大程度上摆脱了传统非交互式程序设计语言...版本也加入了对C,FORTRAN,C++,JAVA支持。 编程环境 MATLAB由一系列工具组成。这些工具方便用户使用MATLAB函数和文件,其中许多工具采用是图形用户界面。...允许用户编写可以和MATLAB进行交互C或C++语言程序。另外,MATLAB网页服务程序还容许Web应用中使用自己MATLAB数学和图形程序。...软件开发 开发环境使用户更方便地控制多个文件和图形窗口;在编程方面支持了函数嵌套,有条件中断等;图形化方面,有了更强大图形标注和处理功能,包括对性对起连接注释等;输入输出方面,可以直接向Excel...和HDF5进行连接。

1.3K100

大数据存储_hdf5 简介

概述 HDF5 (Hierarchical Data Format) 是由美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校,是一种跨平台传输文件格式,存储图像和数据 hdf5优势 通用数据模型,可以通过无限多种数据类型表示非常复杂...各种计算平台(从笔记本电脑到大规模并行系统)和编程语言(包括C、c++、Fortran 90和Java)上运行软件库 hdf5结构 hdf5结构分为两个部分,一个是group,一个是dataset...不同group存放不同数据,dataset分为原始数据和元数据 groups 每一个hdf5文件有一个根目录,根目录子级单位有多个group ?...hdf5文件格式,极其类似unix操作系统 datasets HDF5数据集包含数据和描述文件也就是metadata ?...hdf5是一个非常专业数据存储格式,同时支持数据类型广泛,有更高级使用,但是考虑到时间和需求,我应该不会在这方面深入过多,后续应该会更新r语言hdf5文件处理,python备用。

5.8K10
领券