我在做一个网络图形项目。我的任务之一是找出两个节点之间的最短路径,并总结权重。如你所见,我可以找到最短的路径。但是,我不知道如何在最短的路径上总结每条边的权重。我想包里会有一个简单的函数,但我没有发现。
import matplotlib.pyplot as plt
import networkx as nx
def graph(path):
G = nx.Graph()
for line in open(path):
strlist = line.split(',')
n1 = strlist[0].replace(
我有一个熊猫的数据格式如下,df,
A B C D
A 0 0.5 0.5 0
B 1 0 0 0
C 0.8 0 0 0.2
D 0 0 1 0
我正在尝试从这里创建一个networkx图形。我尝试了以下代码变体:
a)
G=networkx.from_pandas_adjacency(df)
G=networkx.DiGraph(G)
b)
G=networkx.from_pandas_adjacency(df, create_using=networkx.DiGraph())
然而,最
我对osmnx、openstreatmap和nominatim都是新手。我正在尝试使用in_degree_centrality networkx function.However检索具有最高/最大in度的节点,在extended_stats字典中只有degree_centrality和betweenness_centrality。如何定位此节点?在使用Networkx或osmnx中的in_degree_centrality函数之前,我必须将place网络转换为有向图吗?
import osmnx as ox, networkx as nx, matplotlib.cm as cm, panda
需要找到输入文件中每个蛋白质的度数,如下所示
A B
a b
c d
a c
c b
我已经使用networkx来获取节点。如何在创建的节点上使用我的输入文件创建边?
代码:
import pandas as pd
df = pd.read_csv('protein.txt',sep='\t', index_col =0)
df = df.reset_index()
df.columns = ['a', 'b']
distinct = pd.concat([df['a'], df['b
import networkx as nx
def core_number(G):
nodes=list(G.nodes())
if G.is_multigraph():
raise nx.NetworkXError('MultiGraph and MultiDiGraph types not supported.')
if G.number_of_selfloops()>0:
raise nx.NetworkXError('Input graph has self loops; the core num
在设置networkx.MultiDiGraph实例G的属性值时,我遇到了此错误。我正在使用set_edges_attributions方法。代码如下。
# a lib I wrote myself
import dijkstra
for edge in G.edges():
w = dijkstra.cost_cal(G, edge[0])
print(w, edge)
# G: networkx.MultiDiGraph
# edge: a tuple with two node IDs
# w: float
nx.set_ed
我试图用给定的txt文件在NetworkX中为编程任务加载多向图,但它不起作用。没有错误,但当我绘制图形时,当我快速检查有多少节点/边时,两者都返回0-这使我相信它根本没有加载到图形的文件中。下面是我的代码: import networkx as nx
def answer_one():
# Your Code Here
G = nx.read_edgelist('email_network.txt', delimiter='\\t', data=[('time', int)], create_using=nx.MultiDiG