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使用markdown,knitr和pandocR语言中编写可重现报告

传统上,大多数生物学家会在R执行阶段2和3,然后启动Word或Powerpoint并复制粘贴阶段4所有内容。...以R markdown编写文件具有扩展名 .Rmd。 将R markdown视为可以编译 为上述markdown变体之一东西 。...knitr 报告 该 knitr 软件包编写是单个文档结合了RMarkdown和R代码元素 。从一个例子开始。...避免麻烦 我们建议您使用 setwd() 脚本。这在这里更重要。Rmd文件更改工作目录将导致麻烦。因此,建议您假设所有Rmd文件都在项目的根目录运行,以使其运行。...根据其创建说法 ,“如果您需要将文件从一种标记格式转换为另一种标记格式,那么pandoc是您瑞士军刀。

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71-R分享01-Rmd新手入门指南

★借助于Rknitr和rmarkdown扩展包帮助, 可以Markdown格式文件插入R代码, 使得R代码结果能够自动插入到最后生成研究报告。”...我们可以将Rmd 理解为,可以md 文档运行R 代码,并能将R 代码运行结果最终输入到输出报告文件。 输出格式可以是HTML、docx、pdf、beamer等。...Rmd 基本结构 一个Rmd 文件包含三个部分: 分别是: yaml 格式开头部分 一般md 格式正文部分 R 代码部分 我第一个Rmd 选择Rmd 创建: 选择默认值即可,这里选择输出为...Rmd 文件编译 RStudio 是一个集成R软件环境, 可以用来编辑和执行R程序, 这个软件也可以用来编辑和编译R Markdown格式文件, 使得R Markdown格式文件变得容易使用。...注意,如果不缩小打印, 数学公式编号以及较长数学公式可能会被裁剪掉。 从Word文件转换成PDF格式 使用Word软件文件-导出”或者“文件-另存为”功能即可。

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Rmarkdown使用及转换为R文件

R Markdown是一种用于创建动态文档工具,它结合了R代码、文本和结果展示。...使用R Markdown,你可以将代码、分析结果、图表和解释性文本组合在一起,创建可重复、可交互和可发布报告、演示文稿、网页和其他文档。...以下是R Markdown一些主要特点和用途: 可嵌入R代码:R Markdown文档,你可以直接嵌入R代码块,并使用R语言进行数据处理、分析和可视化。...代码块可以包含任何有效R代码,并且可以文档不同位置重复使用。 多种输出格式:R Markdown支持多种输出格式,包括HTML、PDF、WordMarkdown等。...你可以根据需要选择适合输出格式,并使用相应R包和设置来生成最终文档。 可嵌入文本和标记:除了R代码,你还可以R Markdown文档嵌入文本、标题、段落、列表、链接、图片等。

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R Bookdown 做本书,上线

Bookdown 支持采用 Rmarkdown (R 代码可以运行) 或普通 markdown 编写文档,然后编译成 HTML, WORD, PDF, Epub 等格式。...而 RMarkdown 是建立 Markdown 基础之上一种语言,旨在方便将文本和代码混合在同一个文件。 用途:Markdown 主要用于编写格式化文本,如网页、文章、文档等。...而 RMarkdown 则专门设计用于数据分析与报告,允许同一个文件交织代码 (通常是 R 代码) 和文字说明。 代码执行:Markdown 无法直接执行代码,只能将代码块展示为格式化文本。...而 RMarkdown 可以执行嵌入代码块,将结果动态渲染到文档。这对于分析报告和可重复研究非常有用。 输出格式:Markdown 通常会被渲染为 HTML、PDF 等格式。...而 RMarkdown 不仅支持这些格式,还可以输出报告、幻灯片、网页、Word 文档等多种格式。 工具支持:Markdown 有许多编辑器支持。

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Flutter 文本解读 9 | 打造 Icon 图标字体创建工具

现在为止,功能还是比较单薄,比如字体还需要自己 pubspec.yaml 配置,其实作为一个脚本而言,最好就是一键 OK,所以 pubspec.yaml 配置也可以通过代码自动完成。...如果没有 fonts: 节点,则创建 fonts: 节点 2. [ pubspec.yaml ] 自动对 fonts: 节点进行字体图标配置 3. 如果已存在 该字体图标配置 ,则不处理 ?...---- 为了避免注释对匹配干扰,处理时,通过 RegExp(r'#.*') 将行注释临时去掉。...但如果真的有多个图标文件需求,也可以将 icon_builder.dart 再优化一些。 ? ---- 就目前小工具而言,再引入一个 Ruby 字体文件,构建一下。...随便写写,代码结构上有待优化,其中包含了很多文件处理,字符串分析知识,这些都挺好玩。有什么更好想法,也可以和我群里交流。其实按照这个逻辑做成 AS 插件或Gradle 插件也未尝不可。

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R沟通|Rmarkdown教程(2)

R配套软件包tinytex可以帮助你将LaTeX或R Markdown文档编译为PDF时自动安装缺少LaTeX软件包,并确保将LaTeX文档编译正确次数以解决所有交叉引用。...新建流程 弹出选项框里,可以申明rmarkdownTitle、Author以及默认输出文件格式,一般可以选择HTML、PDF、Word格式,具体见下图。 ?...选项框 新建markdown文件里,主要包含三块内容:1.YAML、2.markdown文本、3.代码块。 ?...这对撰写数据分析报告带来了极大便利。Rmd文件除了R代码段以外, 还可以插入Rcpp、Python、Julia、SQL等许多编程语言代码段, 常用编程语言还可以与R代码段进行信息交换。...,同样支持pdf、word、html等多种文件格式。

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如何使用WriteHat生成渗透测试报告

关于WriteHat WriteHat是一款功能强大渗透测试报告工具,该工具帮助下,广大研究人员可以轻松生成渗透测试报告,从此不必再将大量时间放在Microsoft Word等文字编辑工具身上了...; 能够克隆和模板化报告; 搜索结果数据库; 支持多种评分类型(CVSS 3.1,DARED); 可以从同一组分析结果轻松生成多个报告; 可扩展设计使高级用户能够创建高度定制报告部分; LDAP集成...$ cd writehat 接下来,writehat/config/writehat.conf文件创建安全保护密码,密码将用于: MongoDB MySQL Django 管理员用户 添加我们目标主机名...,writehat/config/writehat.conf文件allowed_hosts字段设置。...Python文件; 2、writehat/templates/componentTemplates/HTML模板; 3、writehat/static/css/component/CSS文件

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如何做视频教程笔记(以吴恩达课程为例)

3.视频截图 3.视频截图推荐使用potplayer播放视频,截图有个快捷键:ctrl+c,即可将当前视频画面(不含字幕)复制到剪贴板,可以复制到word等编辑器,还可以word对图片进行裁剪。...1) word文件markdown文件推荐使用Writage插件(本文提供下载),安装以后,word软件里使用另存为,可以直接存为md格式,同时,可以把word文件图片,保存在md文件目录里media...5.多个markdown文件合并为一个word文件 1)使用Typora,点击菜单,文件--导出--word(.docx) 2)打开word(以word2016为例),点击:插入--对象--由文件创建...注:这一步很重要,word文件大的话,如果直接把文件复制粘贴,很容易卡死。 3)建议样式设置好:正文、标题1、标题2、标题3、图片、公式等样式,选中需要格式化文本,选择样式即可调好文件格式。...Writage-1.12.zip wordmarkdown文件插件,安装以后,word软件里使用另存为,可以直接存为md格式。

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【进阶之路】和南橘一起探索连接池(一)

.markdown-body{word-break:break-word;line-height:1.75;font-weight:400;font-size:15px;overflow-x:hidden...顾名思义,连接池就是将应用所需连接对象放在池中,每次访问时从池中获取,使用完毕再放回池中,以达到连接复用目的。连接池和线程池很像,都是为了减少连接对象创建、销毁连接过程不必要消耗资源。...实际微服务,连接池是非常重要组件,因为服务间需要建立连接通信,通过连接池可以极大地提高服务间通信性能。 ?...java,有各种锁机制能够解决连接池并发问题。...我们这个连接池是使用LinkedList来实现,主要目的是考虑到过期时间。链表,前面连接持续时间一定高于后面的连接,也可以减少连接时间。

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Linux logrotate 详细

文件包含了关于系统中发生事件有用信息,排障过程或者系统性能分析时经常被用到。对于忙碌服务器,日志文件大小会增长极快,服务器会很快消耗磁盘空间,这成了个问题。...日志文件设置独立配置文件,它(们)放在/etc/logrotate.d/目录下。 样例一 第一个样例,我们将创建一个10MB日志文件/var/log/log-file。...missingok: 日志轮期间,任何错误将被忽略,例如“文件无法找到”之类错误。 notifempty: 如果日志文件为空,轮不会进行。...上面的模板是通用,而配置参数则根据你需求进行调整,不是所有的参数都是必要。 样例二 本例,我们只想要轮一个日志文件,然而日志文件大小可以增长到50MB。...演练 排障过程最佳选择是使用‘-d’选项以预演方式运行logrotate。要进行验证,不用实际轮任何日志文件,可以模拟演练日志轮并显示其输出。

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群分享:关于Markdown,你可能想知道

本文用Markdown完成,想看 Markdown文件小伙伴请在后台回复「Markdown文件」获取网盘下载链接。...Markdown 输出格式比较自由,可以是 HTML ,可以是 PDF 文件,有些编辑工具甚至提供了Word文件格式。...我们为什么要用 Markdown 1. 避免编辑疯掉 如果你有过给他人文档排版经验,尤其是那种把多个文档进行整合排版经验,你一定明白这个标题意思。...即使每个人都将自己文章按照模板整合进 Word 文档,最后汇总者仍然面临着大量排版调整工作。...阳志平Markdown写作浅谈》时说到: 难以专心:写Word文档时候,我们经常浪费大量时间Word本身上,特别是那80%我们用不到功能。比如,找借口,Word又出问题了;或者,又要升级了。

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1.5w字Rmarkdown入门教程汇总

对于专注于用 R 语言写报告数据分析师来说,rmarkdown 既提高了数据分析工作便捷性,也提高了数据分析报告复用性。...新建流程 弹出选项框里,可以申明rmarkdownTitle、Author以及默认输出文件格式,一般可以选择HTML、PDF、Word格式,具体见下图。 ?...新建markdown文件里,主要包含三块内容:1).YAML、2).markdown文本、3).代码块。 ?...3)代码块:rmarkdown一个主要功能是可以执行文件代码块(上图2位置),并将代码执行结果展示markdown里。这对撰写数据分析报告带来了极大便利。...默认情况下代码和结果会在输出文件呈现。如果通过参数来控制代码块运行结果输出情况可以{r }设置。一般包括代码及运行结果输出、图片表格格式定义等。

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为什么我要用markdownword

代码可读性好: Markdown 支持代码块语法,可以将代码片段以可读性好形式展示 Word 文档。...易于维护和修改: Markdown 语法相对简单,文本文件也容易备份和管理,可以不同编辑器和平台上进行修改。...Word 不便 排版不稳定: Microsoft Word ,即使同一台电脑上使用同一个版本软件,不同文档不同电脑上打开也会出现格式错乱情况,导致排版不稳定。...这是一个嵌套引用文本。 表格 Markdown,可以使用竖线( | )和短横线( - )来表示表格结构。第一行,使用竖线来分隔每个单元格,使用短横线来表示表头。...Pandoc支持将Markdown转换为多种格式,包括Word格式。Pandoc支持Windows、Mac OS X和Linux等多个操作系统。

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Excel催化剂输出内容汇总PDF及Word版本分享

电子书做了PDF版和WORD版本,PDF版本,阅读体验更佳,WORD版本编辑和查找体验更佳,大家按各自所需下载即可。...,整理好所需转换文件集后,例如Excel催化剂功能介绍写了100+篇,把所有文件都输出到一个PDF或WORD文件时,最后结果是只能转换100多页数据,20多篇文章,剩下就不显示了。...这样结果,显然不是想要,一个合集还要分在多个PDF或WORD里,对搜索体验太差了。...同时它也是免费软件,不必心里老过意不去用盗版软件。 一开始看到有人提到过它可以将markdown格式导出PDF格式,没当回事,毕竟我场景是多个markdown格式文件来转。...后来想想,markdown格式就是文本格式文件,文本文件合并也是很容易事,自己作文本清洗过程,顺带合并一下很轻松,合并后一试,出人意外惊喜,完成没卡死,完全显示正常,格式和图片都正常。

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R语言自动化报告格式——knitr

---- 一、背景 R世界里,凡是提到自动化报告,很多人就会想到Sweave,它已经诞生十几年了。...简单地说,报告中有文字也有代码,Knitr就是通过markdown语法报告该显示代码地方显示代码,该显示运行结果(比如图表)地方显示运行结果,这样整个报告文档就可以直接运行再次生成报告,而不需要把代码单独复制到控制台中执行...[] 2、Markdown 是什么,如何写Markdown[] Markdown 是一种轻量级标记语言。类似HTML,但是比html简单多,我文件夹中放了一个markdown语法说明。...通过以下5步,你就可以创建自己第一个knitr文档: l 打开 RStudio, 点击File > New File > R Markdown创建一个新R Markdown 文件 l 为这个文件起一个有意义名字...你已经成功创建了第一个knitr文件!

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1.5w字Rmarkdown入门教程汇总

对于专注于用 R 语言写报告数据分析师来说,rmarkdown 既提高了数据分析工作便捷性,也提高了数据分析报告复用性。...新建流程 弹出选项框里,可以申明rmarkdownTitle、Author以及默认输出文件格式,一般可以选择HTML、PDF、Word格式,具体见下图。 ?...新建markdown文件里,主要包含三块内容:1).YAML、2).markdown文本、3).代码块。 ?...3)代码块:rmarkdown一个主要功能是可以执行文件代码块(上图2位置),并将代码执行结果展示markdown里。这对撰写数据分析报告带来了极大便利。...默认情况下代码和结果会在输出文件呈现。如果通过参数来控制代码块运行结果输出情况可以{r }设置。一般包括代码及运行结果输出、图片表格格式定义等。

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八款不可错过热门 Markdown 开发包 | 码云周刊第 34 期

主要特性: 与常见 Markdown 编辑器不同:LME 走是 IDE 路子,适合用来制作 CHM。 工作区管理 “ LME ,首先要设置当前工作区, 然后才能创建 Markdown 文件。...图像数据块直接粘贴成链接 “LME 创建每个 Markdown 文件都有自己资源文件夹,其中包含一个图像资源文件夹。...而 LME 工作区目录下会自动创建一些资源文件(包括一些图标、CSS文件、JS代码文件), 这样就可以让编译后 Html 支持较丰富功能。”...导出 word 文档,微软 office word 中格式是最好,毕竟 poi 开发时候,也是以支持 ms word 为主。 wps 也还不错。... pages 内容排版基本正常,部分样式不支持。导出 pdf 文档,相对于 word 文档,会美观很多。

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【python】利用docxtpl和Jinja2生成基于模板Word文档

本文通过将 json 配置信息以表格形式展示Word案例,介绍如何利用docxtpl、python-docx 和 Jinja2这些Python库来实现基于现有的Word模板生成个性化文档。...原理人工使用 MicrosoftWord 编辑文档模板时,可以直接在文档插入Jinja2标记,并将文档保存为.docx文件(XML格式)。...循环中要合并单元格内容前面补充:{% hm %}垂直合并单元格for循环中要合并单元格内容前面补充:{% vm %}准备数据在生成文档之前,我们需要准备要插入到文档数据。...这些数据可以来自各种来源,如数据库、API或本地文件。根据实际情况,我们可以使用适当方法获取和准备数据,并将其存储合适数据结构,如字典、列表等。...word 文件失败: {}".format(e))生成 Word 效果如下:若最终生成 Word 是由多个.docx模板拼接而成,可以使用下述代码:import json import os from

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GPT学术优化 (GPT Academic):支持一键润色、一键中英互译、一键代码解释、chat分析报告生成、PDF论文全文翻译功能、互联网信息聚合+GPT等等

因此,如果您能理解我们配置读取逻辑,我们强烈建议您在config.py旁边创建一个名为config_private.py新配置文件,并把config.py配置转移(复制)到config_private.py...Markdown格式文件 crazy_functions\总结word文档.py 对输入word文档进行摘要生成 crazy_functions\总结音视频.py 对输入音视频文件进行摘要生成...文件,没有定义任何类或函数,它唯一作用就是标识"crazy_functions"模块是一个包。...程序执行结束后,还会生成一个任务执行报告,记录程序运行详细信息。...格式文件 总结word文档.py 对输入word文档进行摘要生成 总结音视频.py 对输入音视频文件进行摘要生成 批量Markdown翻译.py 将指定目录下Markdown文件进行中英文翻译

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