我一直在学习如何使用parallel包，特别是具有14个内核的mclapply()函数来并行化R中的代码。我注意到，仅仅从几次代码运行中，重复调用mclapply() (使用相同的参数和相同数量的内核)所需的时间长度明显不同。例如，第一次跑了18秒，下一次跑了23秒，下一次跑了34秒，当我背靠背地(在相同的输入上)做这两个动作的
浏览 18提问于2021-05-23得票数 1
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您是否知道是否有计划在R中为所有包引入并行编程？我知道一些开发，比如R-revolution和并行编程包，但它们似乎有专门的功能，取代了最流行的功能(线性编程等)。其中许多都使用非常流行的函数，如广义线性模型，但也使用结果进行额外的计算和比较，最后整理输出。据我所知，你需要定义函数的哪些部分可以在并行<
浏览 1提问于2012-04-18得票数 2
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插入符号文档中给出了允许并行处理的以下代码registerDoMC(cores = 5) 但在最新的R版本(3.4)中，包doMC不可用。有没有人可以告诉我做并行处理的其他方法？
更新:罗曼的建议奏效了。DoMC不适用于windows
浏览 14提问于2017-06-27得票数 13
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我目前正在使用R中的future包来执行一些繁重的并行处理任务。 当我在脚本运行时检查CPU使用率时，我注意到每个并行部分仅使用机器上2.3%的CPU能力(见下文)。有没有办法将使用率提高到一个更高的数字(比如5%或10%)？ ? 如果我在包文档中遗
浏览 116提问于2021-01-30得票数 1
我暂时使用带有R的Mac (M1)，但它只运行在一个核心上。我正在编辑我的问题，以包括一个可重复的例子。我想使用多核运行大数据函数。这是一个可重复的例子：library(microbiome)
#devtools::install_github('microsud/microbiomeutilitiesmycols <- c(nonCRC="#d6e2e9", CRC="#cbf3
浏览 8提问于2022-10-23得票数 3
我在Rstudio的Win7操作系统上使用R3.3.1。目的是将glmnet与并行处理结合使用。来自?glmnet帮助：
# ParallelregisterDoMC(cores=4)
install.packages
浏览 4提问于2016-11-04得票数 9
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我试图在一个包含27个预测变量的数据帧上对一个随机森林执行递归特性消除，每个变量都有3653个值。所以在预测器数据中总共有98631个值。我正在使用包插入符号中的rfe函数。y, rfeControl = ctrl)
我正在rfeControl中使用rfeControl，希望它能在我的</e
浏览 1提问于2015-08-29得票数 3
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我一直在linux (8核)上使用库(多核)进行并行处理，但速度不够快(叹息..)所以我正在尝试使用我的window工作站(也是8核)。(因此，如果我可以同时使用两个内核，它将使用16个内核)。似乎在Window上使用的是foreach、snow、doSMP，并且在Linux上经常使用多核。
有没有人可以分享一下使用这两个系统<
浏览 1提问于2012-06-28得票数 2
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我现在有一个R查询，它可以使用foreach在循环中进行并行处理。但是它是使用32核的单一服务器来完成的。由于我的数据大小，我试图找到可以将计算分发到不同窗口服务器的r包，并且可以使用foreach进行并行处理。
非常感谢你的帮助！
浏览 4提问于2017-02-07得票数 1
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我使用的是R包snowfall。在运行并行计算时，有没有办法在我的主实例上使用flush.console()？当我进行并行计算时，我的R主控制台死机了，我想避免这种情况。 { { flush.console()
浏览 2提问于2014-04-12得票数 0
在R中并行化的一种方法是通过包。要向工作者发送自定义函数，可以使用sfExport() (参见Joris的post )。
我有一个自定义函数，它依赖于来自非基础包的函数，这些函数不是自动加载的。因此，当我并行运行我的函数时，R会因为某些函数不可用而崩溃(想想包spatstat、splancs、sp...)。到目前为止，我已经通过
浏览 0提问于2010-11-02得票数 3
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在R中并行预测
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我正在使用R中的预测模型，并且我正在使用mgcv包。当前的预测模型与GAM一起运行。然而，使用R需要很多天的时间，我想优化命令。
我正在研究Hadoop和Spark R的并行性。我在Spark R上找到了预测命令，但我认为它没有GAM。你能告诉我是否有任何方法来运行我们<em
浏览 0提问于2017-06-20得票数 0
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我在R中使用gbm库，我想使用我所有的CPU来适应一个模型。 offset = NULL,
misc = NULL,...
浏览 4提问于2015-11-20得票数 3
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R中使用“并行”包的并行处理
、、、、
我遇到的问题是由于数据帧的尺寸和进行匹配并返回我想要的值，在我的计算机上需要5个小时。我使用了以下方法，但无法使用计算机上的所有内核，甚至无法使其正常工作： matchreturn_first_match_position, 'int')(k$V1,g$start, g$end), retu
浏览 0提问于2014-03-21得票数 3
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集群上R的内存虚拟化
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我对并行计算几乎一无所知，所以这个问题可能很愚蠢，而且可能不可能做我想做的事情。
我使用的是有40个节点的linux集群，但是由于我不知道如何在R中编写并行代码，所以我只能使用一个。在这个节点上，我试图分析内存被淹没的数据(大约64 am )。所以我的问题不是缺乏计算能力，而是内存限制。我的问题是，是否甚至可以使用一些R
浏览 1提问于2014-07-26得票数 1
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是否有可能在单个多核机器上并行迭代单个文本文件？对于上下文，文本文件的JSON输出在250-400MB之间。以下是我一直在使用的一些代码示例。令我惊讶的是，并行处理并没有获胜--只是基本的lapply --但这可能是由于我的用户错误。此外，当尝试读取大量大文件时，我的机器卡住了。
浏览 0提问于2012-11-27得票数 6
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我在R-GUI中运行了一个大的循环脚本，我很好奇是否可以在同一个R-GUI会话中同时运行其他脚本，或者我可以打开R的另一个会话吗？如果有任何建议，我将不胜感激。
浏览 0提问于2011-09-10得票数 7
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目前，我在一台多核Windows机器(24核)上很好地利用了R，通过使用foreach包，传递给它其他包forecast、glmnet等来进行并行处理。有了一个Xeon，我知道我希望编译R ，并且我知道这可以通过并行Studio的跟踪版本来完成。
然后，我需要编辑R的Makeconf文件，添加C/C++标志和Phi吗？在并行</
浏览 5提问于2016-02-25得票数 5
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我正在学习如何使用并行编程(特别是在R中，但我试图使这个问题尽可能通用)。有许多不同的图书馆使用它，如果不知道它们描述中使用的计算机科学术语，就很难理解它们之间的差异。和期货(来自R的“未来”包)。第二个问题：--我不理解其中的一些，我不确定是否有必要将它们加入到我称之为(并行处理)“方法”的
浏览 5提问于2022-11-28得票数 1
我再次尝试使用parLapply (现在在中成功地使用了它)，但这一次要并行化的函数包含了mc2d包中的一些函数(即。deprt，ppert)。在代码的并行部分之前，我安装并加载了包。我使用集群导出成功地将我的变量导出到集群，...但是，我尝试使用
浏览 1提问于2014-06-19得票数 5
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