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「R」ggplot2在R包开发中的使用

尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式,以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...将ggplot2列入Depends会让你的包在被加载/测试的同时加载ggplot2。这会让其他想要使用你包的人通过::使用你的函数而无需加载它。...常规任务最佳实践 使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包中通常用于可视化对象(例如,在一个plot()-风格的函数中)。.../ 234, "r" = 25 / 234 ), class = "discrete_distr" ) R中需要的类都有plot()方法,但想要依赖一个单一的plot()为你的每个用户都提供他们所需要的可视化需求是不现实的...如果没有,则会将主题对象存储在编译后的包的字节码中,而该字节码可能与安装的ggplot2不一致!

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    分组后合并分组列中的字符串如何操作?

    一、前言 前几天在Python最强王者交流群【IF】问了一个Pandas的问题,如图所示。...下面是他的原始数据: 序号 需求 处理人 1 优化 A 2 优化 B 3 运维 A 4 运维 C 5 需求 B 6 优化 C 7 运维 B 8 运维 C 9 需求 C 10 运维 C 11 需求 B...如果不去重,就不用unique,完美地解决粉丝的问题! 后来他自己参考月神的文章,拯救pandas计划(17)——对各分类的含重复记录的字符串列的去重拼接,也写出来了,如图所示。...这篇文章主要盘点了一个pandas的基础问题,文中针对该问题给出了具体的解析和代码实现,帮助粉丝顺利解决了问题。...最后感谢粉丝【IF】提问,感谢【月神】、【瑜亮老师】给出的思路和代码解析,感谢【dcpeng】等人参与学习交流。

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    文献阅读|Nomograms列线图在肿瘤中的应用

    列线图,也叫诺莫图,在肿瘤研究的文章中随处可见,只要是涉及预后建模的文章,展示模型效果除了ROC曲线,也就是列线图了。...列线图的定义 列线图是肿瘤预后评估的常用工具,在医学和肿瘤相关的期刊杂志上随处可见。典型的做法是首先筛选患者的生物学特征和临床指标构建一个预后模型,然后用列线图对该模型进行可视化。...所以列线图是预后模型的可视化形式,是回归公式的可视化,一个典型的列线图如下所示 在列线图中,对于模型中的每一个自变量,不论是离散型还是连续型变量,都会给出一个表征该变量取值范围的坐标轴,在最上方有一个用于表征变量作用大小的轴...2)Calibration 校准度,描述一个模型预测个体发生临床结局的概率的准确性。在实际应用中,通常用校准曲线来表征。...4)列线图的高的理论性能并不代表好的临床效应 最后,列线图作为预后模型的可视化方式,可以辅助临床决策,但是前提是必须有清晰明了的临床问题和模型构建,而且在应用于临床决策前,需要了解其性能和局限。

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    在Python里面如何达到R的gplots包的balloonplot函数对table后的列联表的可视化效果

    在 R 编程语言中,使用 table() 函数可以创建列联表(contingency table),也称为频数表或交叉表。列联表用于显示两个或多个分类变量之间的关系,它显示了每个组合的计数(频数)。...在列联表中,行代表一个变量的水平(类别),列代表另一个变量的水平(类别),交叉点的值表示两个变量对应水平的组合出现的次数。...我们做单细胞转录组数据分析的时候尤其是喜欢使用这个函数,比如我们的多个样品整合后细分到亚群,然后在R的gplots包的balloonplot函数对table后的列联表的可视化效果如下所示: R的gplots...包的balloonplot函数对table后的列联表的可视化效果 从上面的列联表可以看到06的这个样品其实是有点惨淡,它整体就细胞数量偏少。...)],file = 'phe.csv') gplots::balloonplot(table(phe$celltype,phe$orig.ident)) 然后在Python里面,使用代码读取上面的

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    在 Nest.js 中编写 SQL 的另一种方式(MyBatisMapper)

    在 Nest.js 开发中我们通常会选择 TypeORM 框架操作数据库,这对前端 SQL 弱的来说确实是有很大的帮助。但对于一些复杂的查询显得有点麻烦,甚至比直接写 SQL 更复杂。...但是你必须使用内置的各种方法,以至于当你去调试这个 SQL 的时候,你不得不按照各个方法的作用转化一遍,调试修改完后再转化回来。...MyBatisMapper 在 Java 中都会使用 MyBatis 插件提供的语法在 XML 文件里写 SQL 语句。...使用很简单对现有代码无影响,使用它生成 SQL 语句后交给数据库工具去执行。...我们可以创建一个 Nest.js 模块去自动读取,并且监听到变化时自动更新。简单实现如下:使用 fast-glob 查询文件,使用 chokidar 监听文件的变化后重新读取。

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    在vscode中配置R的开发环境

    写在前面 有时候各位使用R的用户不知道会不会有这样的感觉,visual studio和Rstudio由于负载过重,在打开或者加载R script时会出现加载过慢的情况,但对于很多数据工作者来说,variable...并且在1.21中完善了windows系统下的extension的bug。...▶ pip install radian 四 在R中安装languageserver和jsonlite R LSP client需要借助languageserver实现函数的智能识别,R session...的配置 Path中添加R的执行文件的路径,当然也可以选择radian.exe的路径(该路径存在于python的scripts文件夹中)。...中运行的话,则会出现R session watcher不启用的状况,data和plot的review窗口则会自动调用自身gui所带的review窗口,以在windows中选择radian.exe路径为例

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    混合列压缩(HCC)在OLAP及OLTP场景中的测试

    EHCC(或者说后来因使用平台更多,在除了exadata之外,在Oracle corp的zfssa、Pillar Axiom、SuperCluster、ODA上都支持了之后改成了叫做HCC)本质上解决的问题是...那么在接下来的分配中,超出当前CU的数据是特么的不会被压缩的。...那么,我前面铺垫了那么多row level locking的HCC特性这个时候就发挥作用了。这个特性是在12c的HCC中引入了。...在执行update操作时,db会将列压缩的数据,转换为行来操作,并且在操作完成之后,并不会再次压缩。 如果需要重新让这些复苏的数据重新压缩,需要显式的move这些表。...rowid,block id均保持不变 第三部分,上面OLAP及OLTP的这么多测试均是单个场景的测试,那么HCC在实际场景下使用起来跟不带HCC的环境对比起来怎么样?

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    问与答112:如何查找一列中的内容是否在另一列中并将找到的字符添加颜色?

    Q:我在列D的单元格中存放着一些数据,每个单元格中的多个数据使用换行分开,列E是对列D中数据的相应描述,我需要在列E的单元格中查找是否存在列D中的数据,并将找到的数据标上颜色,如下图1所示。 ?...图1 如何使用VBA代码实现?...A:实现上图1中所示效果的VBA代码如下: Sub ColorText() Dim ws As Worksheet Dim rDiseases As Range Dim rCell...(iDisease)) End If Loop Next iDisease Next rCell End Sub 代码中使用...Split函数以回车符来拆分单元格中的数据并存放到数组中,然后遍历该数组,在列E对应的单元格中使用InStr函数来查找是否出现了该数组中的值,如果出现则对该值添加颜色。

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    【R语言】因子在临床分组中的应用

    前面给大家简单介绍了 ☞【R语言】R中的因子(factor) 今天我们来结合具体的例子给大家讲解一下因子在临床分组中的应用。 我们还是以TCGA数据中的CHOL(胆管癌)这套数据为例。...stage I,stage II,stage III和stage IV四个分期 接下来我们试着把组织病理分期从四个组合并成两个组,并转换成因子 方法一、使用gsub函数 前面也给大家介绍过☞R替换函数...*","stage I/II",stage) #转换成因子 stage=factor(stage) stage 可以得到下面这个两分组的因子 方法二、直接使用factor函数 #删除组织病理学分期末尾的...gsub一样的结果 接下来我们试着把组织病理分期从四个组合并成三个组,并转换成因子 方法一、使用gsub函数 #删除组织病理学分期末尾的A,B或者C等字母,例如Stage IIIA,Stage IIIB...参考资料: ☞【R语言】R中的因子(factor) ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验,复现临床paper ☞R生成临床信息统计表

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    Notepad++的列编辑功能,多列粘贴:在列模式中选中才能在粘贴到列模式中;notpad 中文乱码

    notpad 中文乱码 多列粘贴:在列模式中选中才能在粘贴到列模式中 3.6. Notepad++的列编辑功能 下面来解释Notepad++中的强大且好用的列编辑功能。 3.6.1....Notepad++的列编辑模式的基本操作 在Notepad++中,按住Alt键之后,就处于列(编辑)模式了。 比如,按住Alt键,此处从上到下,选择多列: 例 3.20....列编辑:删除多行内容 然后也可以同时删除多行内容: 先按住Alt键,选后同时选取多列: 然后松掉Alt键,点击右键选择删除,或者直接按键盘上面的Delete键,都可以实现删除所选的多行中对应部分的内容:...列编辑:多行中插入相同或不同的内容 进入列编辑模式后,除了可以手动输入内容外,也可以通过插入,实现输入多行内容: 按住Alt键进入列编辑模式后: 然后松掉Alt键,点击 编辑(E) ⇒ 列编辑 Alt+...列编辑:同时复制和粘贴多列 然后在Notepad++中,新建一个页面,将拷贝的内容,粘贴到新建页面中: 然后再用列模式去选取此部分内容: 然后Ctrl+C复制所选内容,再回到要粘贴的地方,同样先是进入列模式

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    使用VBA删除工作表多列中的重复行

    标签:VBA 自Excel 2010发布以来,已经具备删除工作表中重复行的功能,如下图1所示,即功能区“数据”选项卡“数据工具——删除重复值”。...图1 使用VBA,可以自动执行这样的操作,删除工作表所有数据列中的重复行,或者指定列的重复行。 下面的Excel VBA代码,用于删除特定工作表所有列中的所有重复行。...Cols(i) = i + 1 Next i rng.RemoveDuplicates Columns:=(Cols), Header:=xlYes End Sub 这里使用了当前区域...如果只想删除指定列(例如第1、2、3列)中的重复项,那么可以使用下面的代码: Sub DeDupeColSpecific() Cells.RemoveDuplicates Columns:=Array...(1, 2, 3), Header:=xlYes End Sub 可以修改代码中代表列的数字,以删除你想要的列中的重复行。

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