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Nature | 突破优化合成反应瓶颈,机器学习提供新思路!

今天给大家介绍来自不列颠哥伦比亚大学Jason E. Hein教授发表Nature官网News and Views上文章。...+ 背景 无论开发应急救生药物合成途径还是探索新材料潜能方面,合成目标化合物反应优化问题对于化学研究和发现都至关重要。...Shields等人在Nature中报告了一种机器学习软件,该软件优化各种反应类别时所需迭代次数平均地比人类更少。...从稀疏数据开始,该算法会创建一个替代模型,以尝试数学定义输入变量(反应参数)如何影响输出目标(反应收率或其他性能指标)。随后,该算法获取新实验数据更新模型。...反复循环,直到反应性能达到指定目标或试剂耗尽为止。 随后将贝叶斯优化性能与人类专家性能进行实验比较,结果如图1所示,专家们做出了更好初始选择,但是第三批实验之后,该算法平均表现优于人类。

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Nature | 突破优化合成反应瓶颈,机器学习提供新思路!

今天给大家介绍来自不列颠哥伦比亚大学Jason E. Hein教授发表Nature官网News and Views上文章。...无论开发应急救生药物合成途径还是探索新材料潜能方面,合成目标化合物反应优化问题对于化学研究和发现都至关重要。...Shields等人在Nature中报告了一种机器学习软件,该软件优化各种反应类别时所需迭代次数平均地比人类更少。...从稀疏数据开始,该算法会创建一个替代模型,以尝试数学定义输入变量(反应参数)如何影响输出目标(反应收率或其他性能指标)。随后,该算法获取新实验数据更新模型。...反复循环,直到反应性能达到指定目标或试剂耗尽为止。 随后将贝叶斯优化性能与人类专家性能进行实验比较,结果如图1所示,专家们做出了更好初始选择,但是第三批实验之后,该算法平均表现优于人类。

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TensorFlow 分布式之论文篇 Implementation of Control Flow in TensorFlow

只要执行帧之间没有数据依赖关系,则来自不同执行帧操作可以并行运行。 Switch:Switch 运算符会根据输入控制张量 p 布尔值,将输入张量 d 转发到两个输入一个。...我们接下来看看 while 循环运行一个或多个迭代设备 A 上,由于 P 第一次迭代时为真,一个实数张量被发送到设备 B。同时 Recv 被执行,等待来自设备B 返回值。...一个参与设备可以有多个迭代并行运行,而且两个参与设备可以同时一个循环不同迭代工作。...def pred(i, _): return i < N while_loop(pred, g_body, [0] + g_vars) 其中 N 前向传播 while 循环运行迭代次数,g_body...注意,积累 eagerly 地进行,以并行迭代次数为界。这与 static unrolling 不同, static unrolling ,AddN 需要所有的部分梯度同一时间生效。

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入门 | 贝叶斯线性回归方法解释和优点

其中,y 反应变量(也被称为因变量),β 为权重(也被称为模型参数),x 为预测变量,ε 为代表随机采样噪声误差项或者没有被包含在模型变量影响。...线性回归一个易于解释简单模型: β_0 截距项,其它权重(β's)表示预测变量增加对反应变量影响。例如:如果 β_1 为 1.2,那么 x_1 每增加一个单位,反应变量就会增加 1.2。...不仅响应变量从概率分布中生成,而且假设模型参数也来自于概率分布。模型参数后验分布是以训练输入和输出作为条件。 ? 其中,P(β|y, X) 给定输入和输出时模型参数后验概率分布。...从分布抽取随机样本来近似估计分布技术蒙特卡洛方法应用之一。我们有许多蒙特卡洛抽样算法,其中最常用马尔可夫链蒙特卡洛变体。...贝叶斯线性模型应用 我将跳过本文代码部分(请参阅 PyMC3 代码实现),但是实现贝叶斯回归基本流程:指定模型参数先验(在这个例子我使用正态分布),创建将训练数据输入映射到输出模型

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R语言偏最小二乘回归PLS回归分析制药产品化学制造过程数据、缺失值填充、变量重要性

p=34046 PLS回归主要客户来自于化学、药品、食品和塑料行业。本文中,我们将使用此类背景下示例(点击文末“阅读原文”获取完整代码数据)。 相关视频 什么偏最小二乘回归(PLS回归)?...与多元回归不同,PLS不假设预测变量固定。这意味着预测变量可能带有误差,使得PLS对测量不确定性更加稳健。 使用PLS 文中讨论了一种制药产品化学制造过程。...将产品产量提高1%将使每批收入增加大约十万元: 启动R并使用以下命令加载数据: 数据包含了176次制造过程57个预测变量(其中12个描述输入生物材料,45个描述制造过程预测变量)。...., ytest) ) 得分较低指标比重新采样指标更好。 您训练模型,哪些预测因子最重要?生物因子和工艺因子哪个列表占主导地位?...如果结果良好,那么产品产量可能会增加。从顶级生物材料来看,我们可以看到它与反应变量有着积极但适中相关性。 另一方面,制造过程可能创建最终产品步骤,这些步骤由一个评级来评估。

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左手用R右手Python系列之——迭代器与迭代对象

R语言中,其实也有迭代概念,但是需要借助第三方包辅助。 今天要介绍iterators和itertools,这两个包在最新开发软件包工具中使用非常频繁。...而我们普通场景下构造循环,一般都利用R语言内部现有的数据结构(列表、向量、数据框等),这些数据结构可见迭代对象,而且迭代完一次之后,可以重复使用,这一点迭代器与普通对象最大区别。...library("iterators") library("itertools") iter函数可以创建一个迭代器对象,迭代器可以从所有R语言数据结构对象创建,包括向量、矩阵、列表、数据框。...一个迭代器可以被for循环直接访问(R好像不允许)。...Python迭代器经常一起被提起就是生成器了(关于生成器目前R语言中还没有看到很好实例)。 使用各种推导式函数可以很方便改造成生成器。

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HLS最全知识库

延迟一个数据项被推入后弹出时间,而时间间隔决定了数据可以被推入速率。 循环间隔可以开始循环迭代最大速率,以时钟周期为单位。...流水线后函数或循环可以每 N 个时钟周期处理一次新输入其中 N 启动间隔(Initiation Interval)。'...ARRAY_MAP 对同一个实例使用多个 来告诉 HLS 创建一个名为“instance”新数组,其中包含所有较小数组。保留“偏移”未设置。...而不是给出最小和最大延迟值。这是因为设计至少有一个循环数据相关,即它循环次数取决于 HLS 无法知道数据值。...例如,下面的代码: 当综合在综合报告给出以下内容: 如果我们检查代码,它将来自ram元素相加,但要相加元素的确切数量来自用户,作为arg1参数输入

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shell for while until 语法和案例

1.for循环for循环允许你对一组元素(如数组元素、文件行、命令输出等)进行迭代。...for循环来自动删除上边创建用户常用做法人力部门给你发来一个名单现如今需要 创建对应用户如果名单有300个名字该如何创建呢 该不会是人力部门报名完毕 之后跑到运维部来一个创建用户吧哈哈哈那样不得累坏如下所示使用...循环每次循环迭代时执行一组命令。#!...循环次数循环开始之前就确定了,通常用于已知循环次数情况。语法形式为for variable in list,其中variable循环变量,list迭代元素列表。...语法形式为until [ condition ],循环条件结果同样必须退出状态码为0或非0表达式。总结:for循环适用于已知循环次数情况,可以用于迭代已知元素列表。

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Python标准库笔记(10) — itertools模块

1.合并和分割 chain() 函数将多个迭代器作为参数,并返回一个迭代器,这样它生成所有输入内容,就像来自于单个迭代器一样。...# OutPut i1: [0, 1, 2, 3, 4] i2: [0, 1, 2, 3, 4] 需要注意,由 tee() 创建迭代器将共享它们输入,因此创建迭代器后不要再使用输入迭代器。...(5) r2 = range(2) for i in map(multiply, r1, r2): print(i) 一个例子,函数将所有输入值乘以2。...第二个例子,函数将从两个单独迭代获取两个参数相乘,并返回一个包含原始参数和计算值元组。第三个例子,在生成了两个元组之后便停止了,因为第二个输入已经耗尽。...它不再调用函数,而是使用另一个迭代值来指示何时接受值何时忽略值。

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《数据库系统实现》学习笔记

定义R和S笛卡尔积一个(r+s)元元组集合,每个元组r个分量来自R一个元组,后s个分量来自S一个元组 投影(Projection):对关系进行垂直分割,消去某些列,并重新安排列顺序,再删去重复元组...表扫描迭代器实现,open方法获取第一个一个元组,next方法判断加载下一个块和元组。 排序扫描迭代器实现,open方法读取整个关系R,然后排序,next方法顺序读取。...并操作迭代器实现,open方法先调用第一个关系迭代器,next方法判断第一个关系是否结束,如果结束就打开第二个关系迭代器。...阶段2归并流程1,为关系R和S每个子表都使用缓冲区。流程2把元组t输入输出缓冲区后,删除输入缓冲区中和元组t相同元组。...对于集合差:关系R集合减S,当且仅当t出现在R,但不在S,就输出t。 对于包差:关系R包减S,输出t次数tR中出现次数减去S中出现次数

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【技术分享】交换最小二乘

1 什么ALS ALS交替最小二乘(alternating least squares)简称。机器学习,ALS特指使用交替最小二乘求解一个协同推荐算法。...但是这个值有用,它描述了一个特定观察信任度。 一个发生一次事件可能对用户偏爱没有用,但是一个周期性事件更可能反映一个用户选择。 (4) 评价隐式反馈推荐系统需要合适手段。...如下图3.1所示,求解v1需要获得u1,u2,求解v2需要获得u1,u2,u3等,在这种假设下,每步迭代所需交换数据量O(m*rank),其中m表示所有观察到打分集大小,rank表示特征数量。...以这样格式修改([v1, v2, v1, v2, v2], [ui1, ui1, ui2, ui2, ui3], [r11, r12, r21, r22, r32]),得到结果([v1, v2],...格式(用户分区id,用户特征矩阵factors),其中factors一个二维数组,第一维长度用户数,第二维长度rank数。

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什么叫做类比,为什么有些 Python 入门教程结构不合理?

element in c: # 对元组进行迭代 print(element) 循环迭代这个操作,字符串、列表和元组完全相同。...if 3 in c: print('元素 3 元组!') 判断一个字符是否字符串,或者判断一个元素是否列表、元组,操作完全相同。...统计出现次数 a = 'helloworld' num = a.count('l') print('字符 l 字符串中出现次数为:', num) b = ['kingname', 'pm', 'ui...', 'pm', 'spider'] num = b.count('pm') print('元素 pm 列表中出现次数为:', num) c = ('kingname', 'pm', 'ui',...总结 “读”这个操作上面,字符串、列表、元组完全相同,只要掌握了其中一个,另外两个自动就知道怎么操作了。这就叫做类比。

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shell编程 for while until循环使用方法及案例

1.for循环 for循环允许你对一组元素(如数组元素、文件行、命令输出等)进行迭代。...就是利用for循环来自动删除上边创建用户 常用做法 人力部门给你发来一个名单现如今需要 创建对应用户 如果名单有300个名字该如何创建呢 该不会是人力部门报名完毕 之后跑到运维部来一个创建用户吧...循环每次循环迭代时执行一组命令。 实例如下: #!...循环次数循环开始之前就确定了,通常用于已知循环次数情况。 语法形式为for variable in list,其中variable循环变量,list迭代元素列表。...语法形式为until [ condition ],循环条件结果同样必须退出状态码为0或非0表达式。 总结: for循环适用于已知循环次数情况,可以用于迭代已知元素列表。

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精读《高性能 javascript》

将集合 length 属性缓 存到一个变量迭代中使用这个变量。如果经常操作这个集合,可以将集合拷贝到数组。...for,while,do-while 循环性能特性相似,谁也不比谁更快或更慢。除非你要迭代遍历一个属性未知对象,否则不要使用 for-in 循环。...改善循环性能最好办法减少每次迭代运算量,并减少循环迭代次数。 一般来说,switch 总是比 if-else 更快,但并不总是最好解决方法。...浏览器调用栈尺寸限制了递归算法 JavaScript 应用;栈溢出错误导致其他代码也不能正常执行。如果你遇到一个栈溢出错误,将方法修改为一个迭代算法或者使用制表法可以避免重复工作。...JavaScript 和用户界面更新一个进程内运行,同一时刻只有其中一个可以运行。这意味着当 JavaScript 代码正在运行时,用户界面不能响应输入,反之亦然。

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CS224n 笔记1-自然语言处理与深度学习简介1 自然语言处理简介2 词向量(Word Vectors)3 基于奇异值分解(SVD)方法4 基于迭代算法-Word2vec

3 基于奇异值分解(SVD)方法 对于这一类寻找词嵌入(也称作词向量)方法,首先在一个大型数据集进行循环,并且从某种形式矩阵X积累单词共现次数,然后对矩阵X执行奇异值分解来获得一个USVT.我们然后将...使用一个不规则窗口-根据文档单词之间距离来计算共现次数 使用Pearson相关系数和将原始计数设置为负数。 正如我们下一节中提到,基于迭代方法以更加优雅方式解决了许多问题。...4 基于迭代算法-Word2vec 让我们后退一步尝试新方法,我们可以尝试创建一个模型,它可以一段时间内学习一个迭代,并最终能够根据上下文对一个单词概率进行编码,而不是计算和存储一些巨大数据集...模型符号: • wi: 词汇第i个单词 • V ∈Rnn×|V| : 输入词矩阵 • vi: 矩阵V第i列,代表单词wi输入向量 • U∈ R|V|×n : 输出词矩阵 • ui...我们创建两个矩阵,V∈IRn×|V|和U|V|×n.其中n可以使任意大小,它定义了嵌入空间大小。V输入矩阵,当单词wi作为模型输入时,V第i列wi输入向量,记为vi。

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3800 字 Python 流程控制专题总结

除了具备控制循环次数外,还能直接迭代容器元素。...5 range 序列 rangePython中经常用于生成一串数字序列,对刚入门Python朋友想尝试打印其中值: In [3]: print(range(10)) range(0, 10) 要想看到每个值可与...测试: 请输入一个整数: t input value is not a valid number 请输入一个整数: 5 输入 5 奇数 try 保护代码正常通过后,else才执行。...今天跟大家分享一个pass特别有用用法,尤其对Java语言interface,implements等较熟悉朋友,Python也能实现类似写法。...首先安装一个包: pip install python-interface 下面这个包基本用法,首先创建一个接口类: from interface import implements, Interface

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Resize Observer 介绍及原理浅析

ResizeObserver 回调对 dom 进行操作,比如改变另外一个元素大小,或是隐藏/展示某个元素,这些操作可能会导致新回调调用,引发无限循环,最终导致界面 UI 卡死。...还有另外一种场景监听函数创建 ResizeObserver 实例,导致循环每一次迭代都有新元素需要通知,那么最终循环就会因为内存溢出而终止,这里不作过多讨论。...有三种限制策略可以考虑: 执行次数限制 允许执行最多次数 N 次循环,当超过次数 N 时,循环终止 优点实现简单,并且具有一致性,当这个算法不同机器上运行时都能有相同表现 缺点 N 定义太过随意...,缺乏比较可靠结论定义 执行时间限制 循环最多执行 N ms 时长,当超过这个时间时循环终止 虽然听起来实现很简单,但我们无法保证具体会执行多少次调度,不同性能机器上,每次执行时间不同,意味着不同机器执行次数会不同...Depth 为 ∞ 当 N 不为空时,开始循环 一次迭代,对集合 N 所有元素进行通知(并在通知可能触发重新布局流程),并将 Depth 更新为本次迭代中元素最小深度 d 将所有小于等于深度

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《Linux命令行与shell脚本编程大全》第十三章 更多结构化命令

本章讨论bash shell循环命令for、while和until 13.1 for命令 重复执行一系列命令在编程很常见。 bash shell提供了for命令,允许你创建一个遍历一系列值循环。...每次迭代都使用其中一个值来执行已定义好一组命令。下面基本格式 for var in list do command done list参数需要提供迭代要用到一系列值。会依次迭代下去。...每次迭代,var会包含列表要用到一系列值。 do 和 done直接输入命令可以是一条或多条标准bash shell命令。...13.5嵌套循环 循环语句可以循环内使用任意类型命令,包括其他循环命令。 注意在循环嵌套时执行次数两次循环次数相乘。 例子:   1 #!...用脚本创建用户 1.先建立一个文本,里面放用户id和name。用逗号分隔 ? 2. 再去读取上述文件信息 while IFS=',' read -r userid name 这个还是蛮有技巧

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【JavaSE专栏14】Java while 循环语句

---- 一、什么 while 循环语句 Java ,while 循环一种用于重复执行特定代码块循环语句。...每次循环迭代之前,都会先计算条件表达式值。 需要注意,如果条件表达式一开始就是假,那么循环体内代码将不会执行,直接跳过循环。...它允许每次循环迭代之前动态计算条件表达式值。这使得while循环更加灵活,能够应对不同情况和需求。 不确定循环次数:与for循环相比,while循环更适合处理不确定循环次数情况。...当需要在满足某个条件时重复执行代码,但循环次数未知或取决于用户输入或其他外部因素时,使用while循环更为合适。...遍历集合或数组:遍历集合或数组时,如果不需要索引或特定循环次数,则使用while循环进行遍历一种简洁方式。通过循环体内更新迭代条件,可以轻松地遍历整个集合或数组。

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R︱foreach+doParallel并行+联用迭代器优化内存+并行机器学习算法

包简介与主要函数解读 foreach包revolutionanalytics公司贡献给R开源社区一个包,它能使R并行计算更为方便。...这里需要注意一点:a, b叫循环变量,循环次数取两者长度中最小。譬如a=1,2,3 b=1,2,也就只能循环两次。...,每次定义一个iterator,它都内定了“循环次数”和“每次循环返回值”,因此非常适合结合foreach使用。...) 1、独立循环运行随机森林算法 如果我们要创建一个包含1200棵树随机森林模型,6核CPU电脑上,我们可以将其分割为六块执行randomForest函数六次,同时将ntree参赛设为200,最后再将结果合并...注意: .export需要输入方程没有的值,而且必须一个文本型,可以用list方式。

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