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BrainStat:一个用于全脑统计和多模态特征关联的工具箱

神经影像数据分析和解释需要结合多学科的共同努力,不仅依赖于统计方法,而且越来越多地依赖于与其他脑源性特征相关的关联,如基因表达、组织学数据、功能和认知结构。在这里,我们介绍了BrainStat,它是一个工具箱,包括(i)在体素空间和皮层空间的神经影像数据集中的单变量和多变量线性模型,以及(ii)死后基因表达和组织学的空间图谱,基于任务的功能磁共振成像元分析,以及几个常见静息态功能磁共振成像大脑皮层模板在内的多模态特征关联。统计和特征关联结合成一个关键的工具箱简化了分析过程并加速了跨模态研究。工具箱用Python和MATLAB实现,这两种编程语言在神经影像和神经信息学领域中广泛使用的。BrainStat是公开提供的,并包括一个可扩展的文件。

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文献翻译:Statistical Approaches for Gene Selection, Hub Gene Identification and Module Interaction in...

信息基因的选择是基因表达研究中的重要问题。基因表达数据的小样本量和大量基因特性使选择过程复杂化。此外,所选择的信息基因可以作为基因共表达网络分析的重要输入。此外,尚未充分探索基因共表达网络中枢纽基因和模块相互作用的鉴定。本文提出了一种基于支持向量机算法的统计学上基因选择技术,用于从高维基因表达数据中选择信息基因。此外,已经尝试开发用于鉴定基因共表达网络中的中枢基因的统计学方法。此外,还开发了差异中枢基因分析方法,以在案例与对照研究中基于它们的基因连接性将鉴定的中枢基因分组成各种组。基于这种提出的方​​法,已经开发了R包,即dhga(https://cran.rproject.org/web/packages/dhga)。在三种不同的农作物微阵列数据集上评估了所提出的基因选择技术以及中枢基因识别方法的性能。基因选择技术优于大多数信息基因的现有技术。所提出的中枢基因识别方法,与现有方法相比,确定了少数中枢基因,这符合真实网络的无标度属性原则。在这项研究中,报道了一些关键基因及其拟南芥直系同源物,可用于大豆中的铝毒性应激反应工程。对各种选定关键基因的功能分析揭示了大豆中铝毒性胁迫响应的潜在分子机制。

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推荐系统衡量:ABtest 框架

无法衡量就无法优化,对于互联网产品而言,不仅是推荐系统,整个 app 系统的更新迭代必然需要建立一套度量衡,来把控整个流程优化的方向。而 abtest 系统就是一个很好的进行变量控制和优化方向选取的工具,循环:衡量-发现-迭代-验证。所谓精细化迭代是一种建立在数据基础上的思维方式——用较少的成本获得较好的效果。无数据,不优化, 线上分流实验是进行推荐算法优化的必由之路。并且 abtest 不仅是推荐迭代的利器,他还可服务于所有需要逐步完善的产品迭代。有人说为什么需要 abtest ,为什么不能够前后进行实验比较;因为同时期测试的 abtest 非常有必要的原因是不同时间的测试无法说明 b 比 a 好,通常时间也是一个变量,比如电商的双十一等。

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线性回归(一)-多元线性回归原理介绍

高中的数学必修三有一个概念——线性拟合,其主要原理是通过对两组变量的统计值模型化。高中的的模型主要是简单的一维线性模型,在某种程度上也可以叫做一次函数,即 y = kx + b 的形式。这是一个简单的线性拟合,可以处理两组变量的变化趋势呈现相当的线性规律的问题,且关于因变量只有一个自变量。实际情况下,对于一个目标函数进行估计,其影响因素可能会有多个,且各个因素对于结果的影响程度各不相同。若多个变量的的取值与目标函数取值仍呈现线性关系,则可以使用多元线性回归进行建模预测。本文将从一元线性回归推广到多元线性回归。并通过统计学的显著性检验和误差分析从原理上探究多元线性回归方法,以及该方法的性质和适用条件。

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