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R软件SIR模型网络结构扩散过程模拟

基本的算法非常简单: 生成一个网络:g(V, E)。 随机选择一个或几个节点作为种子(seeds)。 每个感染者以概率p(可视作该节点的传染能力,通常表示为ββ)影响与其相连的节点。 其实这是一个最简单的SI模型在网络中的实现。S表示可感染(susceptible), I表示被感染(infected)。易感态-感染态-恢复态(SIR)模型用以描述水痘和麻疹这类患者能完全康复并获得终身免疫力的流行病。对于SIR流行病传播模型,任意时刻节点只能处于易感态(S)或感染态(I)或恢复态(R)。易感态节点表示未被流行病感染的个体,且可能被感染;感染态节点表示已经被流行病感染且具有传播能力;恢复态节点则表示曾感染流行病且完全康复。与SIS模型类似,每一时间步内,每个感染态节点以概率λλ尝试感染它的邻居易感态节点,并以概率γγ变为恢复态。SIR模型可以表达为:

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R语言从入门到精通:Day13

在前面两次的教程中,我们学习了方差分析和回归分析,它们都属于线性模型,即它们可以通过一系列连续型 和/或类别型预测变量来预测正态分布的响应变量。但在许多情况下,假设因变量为正态分布(甚至连续型变量)并不合理,比如:结果变量可能是类别型的,如二值变量(比如:是/否、通过/未通过、活着/死亡)和多分类变量(比如差/良好/优秀)都显然不是正态分布;结果变量可能是计数型的(比如,一周交通事故的数目,每日酒水消耗的数量),这类变量都是非负的有限值,而且它们的均值和方差通常都是相关的(正态分布变量间不是如此,而是相互独立)。广义线性模型就包含了非正态因变量的分析,本次教程的主要内容就是关于广义线性模型中流行的模型:Logistic回归(因变量为类别型)和泊松回归(因变量为计数型)。

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【统计学家的故事】泊松定理、泊松公式、泊松方程、泊松分布、泊松过程的西莫恩·德尼·泊松

西莫恩·德尼·泊松(Simeon-Denis Poisson 1781~1840)法国数学家、几何学家和物理学家。1781年6月21日生于法国卢瓦雷省的皮蒂维耶,1840年4月25日卒于法国索镇。1798年入巴黎综合工科学校深造。受到拉普拉斯、拉格朗日的赏识。1800年毕业后留校任教,1802年任副教授,1806年任教授。1808年任法国经度局天文学家。1809年巴黎理学院成立,任该校数学教授。1812年当选为巴黎科学院院士。泊松的科学生涯开始于研究微分方程及其在摆的运动和声学理论中的应用。他工作的特色是应用数学方法研究各类物理问题,并由此得到数学上的发现。他对积分理论、行星运动理论、热物理、弹性理论、电磁理论、位势理论和概率论都有重要贡献。他还是19世纪概率统计领域里的卓越人物。他改进了概率论的运用方法,特别是用于统计方面的方法,建立了描述随机现象的一种概率分布──泊松分布。他推广了“大数定律”,并导出了在概率论与数理方程中有重要应用的泊松积分。

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