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R语言非线性拟合之多项式回归

2 今天用R语言实操。...当然也有一些统计方法可以检验,加了2次项、3次项之后是不是有统计学意义,可以用似然比检验,比如anova: # 线性回归和2次项比较 anova(f, f1) ## Analysis of Variance...但是在拟合线的开头和末尾可以发现有点上翘的趋势,这也是多项式拟合的缺点,如果此时在两头多点数据,可能拟合效果就不是很好了。解决方法也很简单,就是我们下次要介绍的样条回归。...多项式回归的公式写法像上面这样略显复杂,如果是更高次的项,岂不是更复杂?当然是有简便写法的。可以使用poly()函数。...看到这里,不知道你有没有想起重复测量数据的多重比较中用过的正交多项式呢?没有印象的赶紧去复习下:重复测量数据的多重比较 这样的拟合线,当然也是可以用ggplot2画的。

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R语言统计相关函数总结

R 语言在统计分析方面起了很大的作用,并且其开开放性更是促进了大量分析R包的出现。今天我们就不一一去列举相关的R包,而是总结一下R语言自带的统计学函数。...多项式求根 max 最大元素 min 最小元素 range 最小值和最大值组成的向量 sum 和 prod 元素连乘 pmax 向量间相同下标进行比较最大者,并组成新的向量 pmin 向量间相同下标进行比较最小者...T检验,对总体均值进行区间估计 aov 方差分析 anova 一个或多个模型对象的方差分析 cor.test 相关分析 wilcox.test wilcoxon秩和检验 fisher.test 费舍尔精确检验...ks.test K检验(经验分布的Kolmogorov-Smirnov检验) binom.test 二项分布总体假设检验 mcnemar.test McNemar频数检验 五、批处理计算函数 t 矩阵转置...rowsum 行求和 colsum 列求和 rowmeans 行平均 colmeans 列平均 solve 对线性方程求解或求矩阵的逆 欢迎大家学习交流

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    R语言系列第五期(番外篇):R语言与线性模型相关问题

    你可能已经注意到,lm()函数既可以应用到分组数据的情况,也可以应用到线性回归问题,详情点击:R语言系列第四期:④R语言简单相关与回归、R语言系列第四期:②R语言多组样本方差分析与KW检验、R语言系列五...多项式回归 在多元回归里有的时候不像它看起来那么简单,有时可以在多元回归分析中纳入变量的二次和高次幂,尽管这个看似是非线性关系的模型依旧属于线性模型的范畴,重点在于参数和预期的观测值是线性关系。...这是为拟合数据选取了二次多项式形式的模型导致的。而身高和pemax变量之间的关系也可以很好地使用二次项来解释。 B....如果想做一个正规的检验来比较简单线性模型和各组具有独立均值的模型的话,可以直接运行下面代码: > anova(lm(trypsin~grp+grpf)) Analysis of Variance Table...我们可以通过添加特殊交互项来指定一个变量受另一个变量水平变动的影响程度。在R中的模型公式里,交互项可以使用“:”来生成,比如a:b。

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    「R」回归分析

    lm()拟合回归模型 在R中,拟合线性模型最基本的函数就是lm(),格式为: myfit <- lm(formula, data) 其中,formula指要拟合的模型形式,data是一个数据框,包含了用于拟合模型的数据...表示包含除因变量外的所有变量 - 减号,表示从等式中移除某个变量 -1 删除截距项 I() 从算术的角度来解释括号中的元素 function 可在表达式中用的数学函数。...多项式回归 在p的方差解释率已经增加到了99.9%。二次项的显著性表明包含二次项提高了模型的拟合度。...在左上图可以清楚看到一个曲线关系,暗示着你可能需要对回归模型加上一个二次项。 同方差性 若满足不变方差假设,那么在Scale-Location Graph中,水平线周围的点应该随机分析。...在states的多元回归模型中,我们发现Income和Frost的回归系数不显著,此时可以通过检验不含这两个变量与包含这两项的预测效果是否一样好。

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    R语言ISLR工资数据进行多项式回归和样条回归分析

    p=8531 执行多项式回归使用age预测wage。使用交叉验证为多项式选择最佳次数。选择了什么程度,这与使用进行假设检验的结果相比如何ANOVA?对所得多项式拟合数据进行绘图。 加载工资数据集。...age, black, chas, crim, dis, indus, lstat, medv, nox, ptratio,## rad, rm, tax, zn 使用poly()函数拟合三次多项式回归来预测...该图显示了一条平滑的曲线,很好地拟合了数据。 绘制多项式适合不同多项式度的范围(例如,从1到10),并报告相关的残差平方和。 我们绘制1到10度的多项式并保存RSS。...绘制结果,并解释您的发现。 library(gam)...plot(gam.fit, se=TRUE, col="blue") 评估在测试集上获得的模型,并解释获得的结果。...检验显示了响应与支出之间存在非线性关系的有力证据,以及响应与Grad.Rate或PhD之间具有中等强度的非线性关系(使用p值为0.05)。

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    R语言系列第五期(番外篇):R语言与线性模型相关问题

    多项式回归 在多元回归里有的时候不像它看起来那么简单,有时可以在多元回归分析中纳入变量的二次和高次幂,尽管这个看似是非线性关系的模型依旧属于线性模型的范畴,重点在于参数和预期的观测值是线性关系。...#Tips:我们可以从图里看出来,身高较小时,拟合曲线随着身高的增加而减少,而后随着身高的增加而快速增加。这是为拟合数据选取了二次多项式形式的模型导致的。...如果想做一个正规的检验来比较简单线性模型和各组具有独立均值的模型的话,可以直接运行下面代码: > anova(lm(trypsin~grp+grpf)) Analysis of Variance Table...我们可以通过添加特殊交互项来指定一个变量受另一个变量水平变动的影响程度。在R中的模型公式里,交互项可以使用“:”来生成,比如a:b。...通常,我们还会在模型中包含a和b这两项,同时,R的模型里允许a*b或者a+b+a:b这种公式,这两个公式是等效的。 当然在模型建立的过程中还有很多需要注意很多事项,我们这里就不一一列举了。

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    数据分享|用加性多元线性回归、随机森林、弹性网络模型预测鲍鱼年龄和可视化|附代码数据

    abalone_add_small 的 RMSE 分数 kable(rmse(abalone_add_small 方差分析 F 检验 anova(small,ablone_add) 根据Anova检验...方差分析 F 检验 anova(abaloe_addpoy2,aalon_add_oy3) 均方根分数 kable(log_rmse(abaloe_dd_pol4 方差分析 F 检验 anova...均方根分数 kable(log_rmseaban_dd_poly6 方差分析 F 检验 anova 现在在用多项式次数为 6 进行拟合后,我们看到即使 F 检验表明它很重要,但检验的 RMSE 上升了...anova 在拟合交互模型并使用最佳可加模型执行 F 检验后,我们看到该检验表明交互模型是一个显着模型,具有改进的调整 r 平方值。...我们从测试数据中抽取了 10 个样本观察值,并使用我们选择的模型 (abalone_int_infant) 预测了年龄,平均而言,它正确预测了 10 次中的第 3 次。

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    R语言多项式样条回归、非线性回归数据分析

    p=9508 本文将使用三种方法使模型适合曲线数据:1)多项式回归;2)用多项式样条进行B样条回归;3) 进行非线性回归。在此示例中,这三个中的每一个都将找到基本相同的最佳拟合曲线。...多项式回归 多项式回归实际上只是多元回归的一种特殊情况。 对于线性模型(lm),调整后的R平方包含在summary(model)语句的输出中。AIC是通过其自己的函数调用AIC(model)生成的。...使用将方差分析函数应用于两个模型进行额外的平方和检验。  对于AIC,越小越好。对于调整后的R平方,越大越好。...将模型a与模型b进行比较的额外平方和检验的非显着p值表明,带有额外项的模型与缩小模型相比,并未显着减少平方误差和。也就是说,p值不显着表明带有附加项的模型并不比简化模型好。...这些残差的分布应近似正态。 残差与预测值的关系图。残差应无偏且均等。  ###通过以下方式检查其他模型: 具有多项式样条的B样条回归 B样条回归使用线性或多项式回归的较小部分。

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    【视频】什么是非线性模型与R语言多项式回归、局部平滑样条、 广义相加GAM分析工资数据|数据分享|附代码数据

    虽然这里 X 和 Y 之间的关系是非线性的,多项式回归无法拟合它们,但多项式回归模型仍然可以表示为线性回归。 给定三次多项式方程,将模型转换为具有新变量的简单线性回归。...matlines(age.grid,se.bands,lwd=2,col="blue",lty=3) 在这个简单的示例中,我们可以使用ANOVA检验 。...在这里,我们实际上看到的最小交叉验证误差是针对4次多项式的,但是选择3次或2次模型并不会造成太大损失。接下来,我们考虑预测个人是否每年收入超过25万。...为了拟合更复杂的样条曲线 ,我们需要使用平滑样条曲线。 绘制这两个模型 year 是线性的。我们可以创建一个新模型,然后使用ANOVA检验 。...在调用GAM之前,我们还可以使用局部回归来创建交互项。 我们可以 绘制结果曲面图  。 本文选自《R语言里的非线性模型:多项式回归、局部样条、平滑样条、 广义相加模型GAM分析》。

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    R语言重复测量数据的多重比较

    前面介绍了多个样本均数的多重比较,多样本非参数检验后的多重比较: R语言多个样本均数的多重比较 R语言非参数检验后的多重比较 今天学习下重复测量数据的多重比较,本篇内容和课本结果差异较大,如有错误欢迎指出...时间趋势比较 重复测量方差分析可以采取正交多项式来探索时间变化趋势,具体的内涵解读可以参考冯国双老师的这篇文章:https://mp.weixin.qq.com/s/ndinwbDJsHjAelvNfwqgwA...在R里面进行正交多项式的探索略显复杂,首先定义要对时间变量(这里是times)进行正交多项式转变,我们这里有5个时间点,所以是1次方到4次方: contrasts(df.l$times) <- contr.poly...时间点比较 课本说因为事后检验重复次数太多难以承受,但是我们用计算机很快,所以用事后检验也没什么问题。 事后检验可以参考组间比较,根据组别进行分组,分组比较不同时间点的差别。...事前检验课本采用配对t检验,全都和t0的数据进行比较。

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    【视频】什么是非线性模型与R语言多项式回归、局部平滑样条、 广义相加GAM分析工资数据|数据分享

    要解决这个问题,您必须使用多项式回归、使用非线性回归模型或转换您的数据。 R语言里的非线性模型:多项式回归、局部样条、平滑样条、 广义相加模型GAM分析 在这里,我们放宽了流行的线性方法的假设。...matlines(age.grid,se.bands,lwd=2,col="blue",lty=3) 在这个简单的示例中,我们可以使用ANOVA检验 。...在这里,我们实际上看到的最小交叉验证误差是针对4次多项式的,但是选择3次或2次模型并不会造成太大损失。接下来,我们考虑预测个人是否每年收入超过25万。...为了拟合更复杂的样条曲线 ,我们需要使用平滑样条曲线。 绘制这两个模型 year 是线性的。我们可以创建一个新模型,然后使用ANOVA检验 。...本文选自《R语言里的非线性模型:多项式回归、局部样条、平滑样条、 广义相加模型GAM分析》。

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    【视频】什么是非线性模型与R语言多项式回归、局部平滑样条、 广义相加GAM分析工资数据|数据分享|附代码数据

    要解决这个问题,您必须使用多项式回归、使用非线性回归模型或转换您的数据。 R语言里的非线性模型:多项式回归、局部样条、平滑样条、 广义相加模型GAM分析 在这里,我们放宽了流行的线性方法的假设。...matlines(age.grid,se.bands,lwd=2,col="blue",lty=3) 在这个简单的示例中,我们可以使用ANOVA检验 。...在这里,我们实际上看到的最小交叉验证误差是针对4次多项式的,但是选择3次或2次模型并不会造成太大损失。接下来,我们考虑预测个人是否每年收入超过25万。...为了拟合更复杂的样条曲线 ,我们需要使用平滑样条曲线。 绘制这两个模型 year 是线性的。我们可以创建一个新模型,然后使用ANOVA检验 。...在调用GAM之前,我们还可以使用局部回归来创建交互项。 我们可以 绘制结果曲面图  。 本文选自《R语言里的非线性模型:多项式回归、局部样条、平滑样条、 广义相加模型GAM分析》。

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    【视频】什么是非线性模型与R语言多项式回归、局部平滑样条、 广义相加GAM分析工资数据|数据分享|附代码数据

    虽然这里 X 和 Y 之间的关系是非线性的,多项式回归无法拟合它们,但多项式回归模型仍然可以表示为线性回归。 给定三次多项式方程,将模型转换为具有新变量的简单线性回归。...要解决这个问题,您必须使用多项式回归、使用非线性回归模型或转换您的数据。 R语言里的非线性模型:多项式回归、局部样条、平滑样条、 广义相加模型GAM分析 在这里,我们放宽了流行的线性方法的假设。...matlines(age.grid,se.bands,lwd=2,col="blue",lty=3) 在这个简单的示例中,我们可以使用ANOVA检验 。...在这里,我们实际上看到的最小交叉验证误差是针对4次多项式的,但是选择3次或2次模型并不会造成太大损失。接下来,我们考虑预测个人是否每年收入超过25万。...为了拟合更复杂的样条曲线 ,我们需要使用平滑样条曲线。 绘制这两个模型 year 是线性的。我们可以创建一个新模型,然后使用ANOVA检验 。

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    R in action读书笔记(13)第十章 功效分析

    如果概率低得难以接受,修改或者放弃这个实验将是一个明智的选择。 10.1假设检验速览 在研究过程时,研究者通常关注四个量:样本大小、显著性水平、功效和效应值。...我们可以把它看做是真实效应发生的概率。效应值指的是在备择或研究假设下效应的量。效应值的表达式依赖于假设检验中使用的统计方法。 ?...() 平衡的单因素ANOVA pwr.chisq.test() 卡方检验 pwr.f2.test() 广义线性模型 pwr.p.test() 比例(单样本) pwr.r.test(...10.3 绘制功效分析图形 假设对于相关系数统计显著性的检验,计算一系列效应值和功效水平下所需的样本量,此时可用pwr.r.test()函数和for循环来完成任务检验各种效应值下的相关性所需的样本量曲线...pedantics 一些有助于种群基因研究功效分析的函数 gap 一些病例队列研究设计中计算功效和样本量的函数 ssize.fdr 微阵列实验中样本量的计算 求关注 求扩散

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    数学建模学习笔记(六)多元回归分析算法(matlab)

    1、多元线性回归 形式: 回归系数的检验 (1)F检验 (2)r检验 matlab语言: [b,bint,r,rint,stats]=regress(Y,X,alpha)...b:回归系数点估计 bint:回归系数区间估计 r:残差 rint:置信区间 stats:用于检验的统计量,有三个数值,相关系数r^2,F值,与F对应的概率p alpha:显著性水平(缺省时为...预测: Y=polyval(p,x) 求polyfit所得的回归多项式在x处的预测值Y 预测误差估计: [Y,DELTA]=polyconf(p,x,S,alpha) 求polyfit所得回归多项式在x...alpha:缺省时0.05 model:(默认线性) linear(线性),purequadratic(纯二次),interaction(交叉),quadratic(完全二次) 使用示例:...在左下方下拉式菜单选”all“,则beta,rmse和residuals都传送到MATLAB工作区中 4、非线性回归 命令确定回归系数: [beta,r,J]=nlinfit(x,

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    绘制带回归线的散点图

    相反,代码y~x+I((z+w)^2)将展开为y~x+h,h是一个由z和w的平方和创建的新变量function可以在表达式中用的数学函数,例如log(y)~x+z+w表示通过x、z和w来预测log(y)...直线回归的变异来源 2、一元线性回归的假设检验 在一元线性回归中(多元也一样),假设检验主要分两块,分为对回归方程的检验和对回归系数的检验,这两个检验虽然构造的统计量不同,但在一元线性回归中,这两个检验结果是一样的...综合上述,对一个拟合的检验有三种统计量衡量,分别为t,F,和R方,在R中如下图所示: eg: fit<-lm(weight~height,data=women) summary(fit) > summary...(R^2=r^2) 残差的标准误(1.53lbs)则可认为模型用身高预测体重的平均误差 F统计量检验所有的预测变量预测响应变量是否都在某个几率水平之上 对拟合线性模型非常有用的其他函数函数用途Summary...Anova()生成一个拟合模型的方差分析,或者比较两个或更多拟合模型的方差分析表Vcov()列出模型参数的协方差矩阵AIC()输出赤池信息统计量Plot()生成评价拟合模型的诊断图Predict()用拟合模型对新的数据集预测响应变量值

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    数据分享|用加性多元线性回归、随机森林、弹性网络模型预测鲍鱼年龄和可视化|附代码数据

    abalone_add_small 的 RMSE 分数 kable(rmse(abalone_add_small 方差分析 F 检验 anova(small,ablone_add) 根据Anova检验...方差分析 F 检验 anova(abaloe_addpoy2,aalon_add_oy3) 均方根分数 kable(log_rmse(abaloe_dd_pol4 方差分析 F 检验 anova...均方根分数 kable(log_rmseaban_dd_poly6 方差分析 F 检验 anova 现在在用多项式次数为 6 进行拟合后,我们看到即使 F 检验表明它很重要,但检验的 RMSE 上升了...anova 在拟合交互模型并使用最佳可加模型执行 F 检验后,我们看到该检验表明交互模型是一个显着模型,具有改进的调整 r 平方值。...我们从测试数据中抽取了 10 个样本观察值,并使用我们选择的模型 (abalone_int_infant) 预测了年龄,平均而言,它正确预测了 10 次中的第 3 次。

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    用加性多元线性回归、随机森林、弹性网络模型预测鲍鱼年龄和可视化

    ,它也增加了先前加法模型的调整r平方值。...方差分析 F 检验 anova(abaloe\_addpoy2,aalon\_add_oy3) 均方根分数 kable(log\_rmse(abaloe\_dd_pol4 方差分析 F 检验 anova...均方根分数 kable(log\_rmseaban\_dd_poly6 方差分析 F 检验 anova 现在在用多项式次数为 6 进行拟合后,我们看到即使 F 检验表明它很重要,但检验的 RMSE...anova 在拟合交互模型并使用最佳可加模型执行 F 检验后,我们看到该检验表明交互模型是一个显着模型,具有改进的调整 r 平方值。...我们从测试数据中抽取了 10 个样本观察值,并使用我们选择的模型 (abalone\_int\_infant) 预测了年龄,平均而言,它正确预测了 10 次中的第 3 次。

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    数据分享|用加性多元线性回归、随机森林、弹性网络模型预测鲍鱼年龄和可视化|附代码数据

    abalone_add_small 的 RMSE 分数 kable(rmse(abalone_add_small 方差分析 F 检验 anova(small,ablone_add) 根据Anova检验...方差分析 F 检验 anova(abaloe_addpoy2,aalon_add_oy3) 均方根分数 kable(log_rmse(abaloe_dd_pol4 方差分析 F 检验 anova...均方根分数 kable(log_rmseaban_dd_poly6 方差分析 F 检验 anova 现在在用多项式次数为 6 进行拟合后,我们看到即使 F 检验表明它很重要,但检验的 RMSE 上升了...anova 在拟合交互模型并使用最佳可加模型执行 F 检验后,我们看到该检验表明交互模型是一个显着模型,具有改进的调整 r 平方值。...我们从测试数据中抽取了 10 个样本观察值,并使用我们选择的模型 (abalone_int_infant) 预测了年龄,平均而言,它正确预测了 10 次中的第 3 次。

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    单因素方差分析及其相关检验

    ANOVA 单因子方差分析 (1)问题与数据 设某因子有r个水平,记为,在每一水平下各做m次独立重复试 验,若记第i个水平下第j次重复的试验结果为,所有试验的结果可列表如下: ?...在这三个基本假定下,要检验的假设是 方差分析就是在方差相等的条件下,对若干个正态均值是否相等的假设检验. (3)平方和分解式 若记 上述诸平方和分别为 称为总平方和,其自由度 ; 称为组间平方和或因子...,因为p值在99%的置信水平下是显著的。...多重比较 在单因子方差分析中,当因子 显著时,就要继续研究如下问题 : 在多个水平均值中同时比较任意两个水平间有无明显差异的问题,这个问题的 检验法则称多重比较....95%置信区间图显示了只有一个组的置信区间和白色组置信区间有重叠。 方差齐次性检验 问题 方差齐性即诸方差相等,是方差分析的基本假定之一,方差齐性检验就是检验这个假定是否成立.

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