在R中绘制多重密度图 - 腾讯云开发者社区 - 腾讯云

开发者社区

文档建议反馈控制台

文章/答案/技术大牛

发布

R语言可视化——ggplot绘制中心密度辐射图

因为在ggplot2中一直没有看到好的关于密度辐射图（或者称它为热力辐射图，就是那种PowerMap中可以通过颜色色度探查区域指标分布密度的图表类型）的合适解决方案，最近在看github官网上ggmap...的介绍帖，看到作者在ggmap函数中嵌套了geom_polygon图层并并使用fill=..level..参数和stat="density_2d"来来制作类似的热度辐射图。...早期关注过数据小魔方的用户大概都知道，我曾经共享过一个名为rstudy的文件包（我在刘万祥老师的公众号里发现的，现在应该也还可以获取），如果手上没有数据可以添加魔方学院的QQ群，在群共享里查找R语言资料...（共享文件比较多，可能需要找一阵子）另一个是之前在讲解REmap热度辐射图时用过的城市价值指标数据集，推送后会共享在魔方学院的QQ群里。...针对本图表类型，核心参数是第二个geom_polygon()中的fill = ..level..和stat="density_2d"统计变换，使得多边形图转换成为二维水平密度图，但是至今我还没有搞懂里面的算法是什么样的

2.3K5 0

R-Python 基础图表绘制-核密度估计图

前面介绍了基础直方图的绘制教程，接下来，同样分享一篇关于数据分布的基础图表绘制-核密度估计图。具体含义我们这里就不作多解释，大家可以自行百度啊，这里我们主要讲解R-python绘制该图的方法。...本期知识点主要如下： R-ggplot2.geom_density()绘制方法 Python-seaborn.kdeplot()绘制方法各自方法的图片元素添加 R-ggplot2.geom_density...()绘制方法我们还是使用前几期绘制的数据，关注公众号DataCharm,后台回复柱形图，即可获取练习数据啦。...#0F8B8B")) + guides(fill = guide_legend(nrow = 1)) + labs(y="", title = "Base Charts in R...总结本期将R-ggplot2绘图和Python-seaborn 进行了汇总整理，一方面因为内容较为基础，另一方面，大家也可以对比下R-ggplot2系列和Python-matplotlib系列绘图。

9081 0

您找到你想要的搜索结果了吗？

是的

没有找到

绘图系列(3):绘制密度图

在进行数据可视化的时候，通常可以通过散点图比较直观的查看数据的分布情况。但是当数据量大且分布比较集中的时候就没那么容易确定数据的分布了，这时候可以通过绘制密度或是热力图直观获取数据分布情况。...python中的 matplotlib 库中提供了 hexbin 函数绘制密度图，但是我还是更喜欢 R 语言中绘制密度图的方式，比如自带的 smoothScatter 函数以及 ggplot2 中的 geom_bin2d...上述函数利用核密度估计生成用颜色密度来表示点分布的散点图。...利用美国历年的龙卷数据，绘制美国龙卷风的分布图，直接上代码： library(maps) library(ggplot2) library(ggmap) data <- read.csv('1950-...meridians,labels=[0,0,0,1],fontsize=10) # 这里要转换坐标，否则可能无法显示图形 # 由于 data 为 DataFrame，所以要直接提取值，因为 basemap 在转换

1.5K3 0

R中轻松绘制南丁格尔图

加载R包 library(tidyverse) library(ggtext) 导入数据 df <- readr::read_csv('data.csv') 构建标签数据 labs <- data.frame...12, 22, 32, 42, 52), label = c('10', '20', '30', '40', '50'), color = "black") + # 在y...为间隔添加水平线 geom_hline(yintercept = seq(0, 50, by = 10), colour = "grey70", linewidth = 0.3) + # 添加柱状图，...geom_col(aes(y = F_count_total, fill = as.factor(Season)), alpha = 0.8, show.legend = FALSE) + # 添加柱状图，

8742 0

分布（二）利用python绘制密度图

分布（二）利用python绘制密度图密度图（Density chart）简介 1 密度图用于显示数据在连续数值（或时间段）的分布状况，是直方图的变种。...seaborn主要利用kdeplot绘制密度图，可以通过seaborn.kdeplot[1]了解更多用法修改参数 import seaborn as sns import matplotlib.pyplot...1 sns.kdeplot(data=df, x="var1", fill=True, alpha=1) # 绘制密度图2 kde = gaussian_kde(df.var2) x_range =...（共用坐标轴） g = sns.FacetGrid(diamonds, col='cut', hue='cut', col_wrap=3) # 绘制密度图 g = g.map(sns.kdeplot,"...，也可通过gaussian_kde构建密度函数后再通过matplotlib进行简单绘制，并通过修改参数或者辅以其他绘图知识自定义各种各样的密度图来适应相关使用场景。

7711 0

【R绘图】散点图+直方图（密度图）

前面我也给大家简单介绍过 ☞R计算mRNA和lncRNA之间的相关性+散点图 ☞R语言绘图：复杂散点图绘制相信大家在读paper的时候也见到过下面这种类型的图这张图在传统的相关性散点图的基础上还多了一个直方图...今天我们就来带大家来重现这样的图。...#行坐标名 ylab="SATQ", #纵坐标名 title="SATQ vs SATV" #修改主标题 ) 接下来我们整点高级的，数据中还包含有性别这一列...，我们用不同的颜色来区分两种性别，并展示密度图。...mRNA和lncRNA之间的相关性+散点图 ☞R语言绘图：复杂散点图绘制

1.2K4 0

技术解析｜如何绘制密度分布图

前言在前几天对数据分析师与算法工程师进行岗位对比分析的文章中，我们使用了密度分布图和箱线图对薪资水平与学历对薪资的影响进行了分析，那么早起就对这两种图形的绘制方法进行解析，也借着这个机会讲一下我最喜欢的绘图包...：ggplot2 密度分布图在频率分布直方图中，当样本容量充分放大时，图中的组距就会充分缩短，这时图中的阶梯折线就会演变成一条光滑的曲线，这条曲线就称为总体的密度分布曲线。...这条曲线排除了由于取样不同和测量不准所带来的误差，能够精确地反映总体的分布规律，密度分布图其实就是密度分布曲线的填充。原文的的密度分布图的绘制软件为R，为啥不用Python？...+ xlim(0,80000) options(scipen=200)就是用来处理坐标轴的科学计数法，并且我们的x轴不需要那么大的范围，因此使用xlim(0,80000)来调整，这样我们就做出了漂亮的密度分布图...结束语以上就是使用R绘制漂亮的密度分布图过程，我已将原始数据放在公众号后台回复招聘获取，感兴趣的读者可以利用原始数据自己使用python进行处理得到我们需要的数据格式再绘制，最后留一个问题，怎样绘制学历关于薪资的箱线图

3.1K1 0

使用R语言ggplot2包绘制SCI论文配图密度散点图

R适用于统计分析，绘图的一款编程软件，R属于开源，自由，免费的软件。随着生物信息学的发展，R语言在数据分析和绘制图形上都有着十分重要的优势。尤其是现在大部分科研绘图，都使用R语言来完成的。...那么下面我就用所学R知识不多的情况下教大家绘制这幅SCI配图。本次绘图工具：RStudio。 RStudio是R的集成开发环境，界面更加丰富实用，使用起来更加方便。...本次绘图所使用的R包：ggplot2和ggpointdensity ggplot2是R语言绘制图形一个十分重要也是非常基础的一个包，使用ggplot2再加上R自带的base画图基本可以完成所有图形的绘制...ggpointdensity是这次绘制密度散点图的包。...知乎的这篇文章：https://zhuanlan.zhihu.com/p/109468400，详细介绍了R和Rstudio的安装，大家可以参考一下。接下来打开RStudio来完成这幅图的绘制。

3.9K5 0

R语言作图——density plot(密度图)

原创黄小仙上次分享了小提琴曲线(violin plot)的作图方法,今天小仙同学给大家介绍一下如何用R画出漂亮的密度图(density plot)。 Step1....绘图数据的读取 data<-read.csv(“your file path”, header = T) #注释：header=T表示数据中的第一行是列名，如果没有列名就用 header=F Step3...导出高清图的方法在这里： R语言作图技巧——导出高清图 R语言作图系列还有： R语言作图——Beeswarm(蜜蜂图) R语言作图——Circular bar plot(环形柱状图) R语言作图...R语言作图——Dumbbell plot(哑铃图) R语言作图——Slope chart(坡度图) R语言作图——Split violin plot R语言作图——Violin plot with...dot R语言作图——Line plot with error R语言作图——Ridgeline plot(山脊图) R语言作图——Dot plot(点图) R语言作图——Histogram

3.4K1 0

Python绘制卫星降雨散点密度图

font.size": 16,"mathtext.fontset":'stix'} rcParams.update(config) # 读取数据 import pandas as pd filename=r'F...(12,9),dpi=100) scatter=ax.scatter(x,y,marker='o',c=z,edgecolors='',s=15,label='LST',cmap='Spectral_r'...======= BIAS = mean(x - y) MSE = mean_squared_error(x, y) RMSE = np.power(MSE, 0.5) R2...plt.text(1,23, '$R^2=%.3f$' % R2, family = 'Times New Roman') plt.text(1,22, '$BIAS=%.4f$' % BIAS...pd.read_excel(filename)#读取文件 x=df2['data1'].values.ravel() y=df2['data2'].values.ravel() N = len(df2['data1']) #绘制拟合线

2.2K2 0

R中优雅的绘制物种冲积图

最近有朋友问R中绘制冲积图的代码，其本质仍然是条形图只是添加了样本间的连线；案例要求按列计算每个样本的相对丰度跟往常有所不同。...加载R包 library(tidyverse) library(ggsci) library(magrittr) library(reshape) library(RColorBrewer) library...,read_tsv("group.xls"),by=c("name"="sample")) 绘制冲积图 ggplot(plot, aes(name, value, alluvium = Genus, stratum...size = 11, color = "black"), # 设置x轴标题的边距、大小，颜色为黑色 axis.title.y = element_text(margin = margin(r...= unit(0.1, "cm"), # 设置图例水平间距为0.1厘米 legend.box.background = element_blank() # 设置图例框背景为空白 ) 图片绘制组间冲积图

1.9K2 0

R中绘制环状聚类热图

欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近有朋友需要绘制环状热图叠加多层注释，本节来通过一个例子来简单介绍一下如何实现，主要通过「ggtreeExtra」来实现，聚类分析使用「ape」包来进行更加适用于生物信息相关的数据...❞ 加载R包 library(tidyverse) library(ggtree) library(treeio) library(ape) library(magrittr) library(ggnewscale

1.2K2 0

如何在R中绘制树图(TreeMap)

树图(TreeMap) 通过矩形面积的大小，以及填充颜色的深浅，来显示节点的统计数据，通过嵌套层次来显示分组的层级的可视化图形。...那么如何绘制树图呢？...首先绘制树图需要的包： install.packages(“treemap”) 树图函数： treemap(x,index,vSize,vColor,palette,range,border.col...设置边框的颜色值 type 设置统计数据的大小的类型，一般选择value，也就是值类型代码实现： install.packages("treemap", repos='http://cran.r-project.org...border.col='#63B8FF', palette=c("#FFFFFF00", "#1C86EE00"), range=c(minSales, maxSales) ) 一副完美的tree图就搞定啦

6.8K10 0

R中轻松绘制聚类热图

❞ 加载R包 library(tidyverse) library(ggtree) library(treeio) library(ape) library(magrittr) library(ggtreeExtra

1.1K2 1

R中优雅的绘制物种冲积图

欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近有朋友问R中绘制冲积图的代码，其本质仍然是条形图只是添加了样本间的连线；案例要求按列计算每个样本的相对丰度跟往常有所不同。...下面小编就来简单介绍一下代码 ❞ 加载R包 library(tidyverse) library(ggsci) library(magrittr) library(reshape) library(RColorBrewer...,read_tsv("group.xls"),by=c("name"="sample")) 绘制冲积图 ggplot(plot, aes(name, value, alluvium = Genus,...size = 11, color = "black"), # 设置x轴标题的边距、大小，颜色为黑色 axis.title.y = element_text(margin = margin(r...= unit(0.1, "cm"), # 设置图例水平间距为0.1厘米 legend.box.background = element_blank() # 设置图例框背景为空白 ) 绘制组间冲积图

1.3K3 0

R中优雅的绘制环状sina图

❝在R中创建sina图使用geom_sina函数，sina图是一种用于显示单个分类变量的每个观测值的图形。它与箱线图和小提琴图类似，但是它显示了每个单独的数据点，这可以提供关于数据分布的更多信息。...❞ 「sina图的主要优点是它可以清楚地显示每个数据点，而不是简单地显示数据的总体分布。这使得sina图特别适用于小样本大小的数据集，其中每个数据点的值都很重要。」...加载R包 library(tidyverse) library(lubridate) library(scico) library(ggforce) 导入数据 df 绘制sina图 ggforce::geom_sina(aes(color=gas_in_storage_t_wh), alpha=.5, shape=21)+ # 添加文本标签...), lab=c("2","4","6","8TWh")), aes(x=x, y=y, label=y),inherit.aes = FALSE)+ # 使用scico包中的

1.8K3 0

R云朵图：等高线图+密度图

之前看到师妹画的一张图很好看，是等高线图和密度图的组合。今天自己模仿了一下，幸得师妹提名：云朵图。不同分组的点用类似于等高线图的形式呈现，点越密颜色越深。上侧和右侧为点的密度分布图。

1.2K3 0

超简单的高密度和条件密度图绘制方法推荐~~

详细内容如下： R-hdrcde包介绍 R-hdrcde包样例样式 R-hdrcde包介绍 R-hdrcde包为最高密度区域和条件密度估计(Highest Density Regions and Conditional...Density Estimation)的缩写，主要用于计算和绘制高密度估计函数，更多详细内容可参考：R-hdrcde介绍[1] R-hdrcde包样例样式这一小节小编主要介绍R-hdrcde包优秀的计算和绘图函数...，这些函数主要用于估计和绘制最高密度区域和条件密度估计。...rnorm(200,4,1)) y <- c(rnorm(200,0,1),rnorm(200,4,1)) hdr.boxplot.2d(x,y) hdr.boxplot.2d hdr.den():具有最高密度区域的密度图...总结今天推送了一篇简单的用于计算和绘制最高密度区域和条件密度估计的优秀工具-R-hdrcde，希望可以帮助到大家，更多案例可参考官方网址~~ 参考资料 [1] R-hdrcde介绍: https://

9492 0

R 热图绘制heatmap①

R.package heatmap():用于绘制简单热图的函数 heatmap.2():绘制增强热图的函数 d3heatmap:用于绘制交互式热图的R包 ComplexHeatmap:用于绘制、注释和排列复杂热图的...R&bioconductor包（非常适用于基因组数据分析）首先使用ggplot2画简单热图 data <- as.data.frame(matrix(rnorm(9*10),9,10)) rownames...scale_fill_gradient2('legend name', low = 'blue', high = 'red', mid = 'white') #修改图例名字以及图中颜色大神Y叔也有画热图的

1.5K2 0

R EnhancedVolcano 绘制火山图

火山图是用于差异表达分析结果可视化的一种有效方法。...今天，我们来介绍一个用于增强火山图绘制的强大 R 包：EnhancedVolcano ，该包拥有强大的绘图功能，用户可以简单的通过设置颜色、形状、大小和阴影等参数定义不同的绘图属性，此外通过可以通过添加连线的方式有效避免数据点之间的重叠现象...使用 EnhancedVocalno 包绘制的火山图基本可以直接用于文献发表，可以说非常简单又实用的一款神器了。 1. 下载与安装 R 版本：3.6.1。...EnhancedVolcano 包可以使用多种差异算法（例如 DESeq2 等）的结果作为输入，数据中需包含 log2FC 、Pvalue 或（和） qvalue 结果，示例数据如下： ?...EnhancedVolcano 包绘制火山图就先介绍到这里。

6.9K5 5

点击加载更多

相关资讯

热门标签

活动推荐

运营活动

活动名称

广告关闭