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R语言多个样本均数多重比较

对于多个样本均数多重比较,比较常用是LSD-t,SNK,Dunnett,Tukey等,这些方法之前推文中介绍过。...R语言和医学统计学系列(9):多重检验 但是之前介绍是用不同R包完成,整洁一致性不够,其实这些都是可以通过多重比较全能R包:PMCMRplus完成。...下面我们展示下~ 还是使用课本例4-2数据(孙振球,徐勇勇《医学统计学》第四版)。课本电子版及配套数据已上传到QQ群,加群即可免费获取。...完全随机设计样本均数比较是用one-way anova: fit <- aov(weight ~ trt, data = data1) summary(fit) ## Df...下次继续介绍非参数检验多重比较,主要是kruskal-Wallis H检验后多重比较,Friedman M检验后多重比较。

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使用 AutoMapper 自动多个数据模型间进行转换

访问数据库、IPC 通信、业务模型、视图模型……对于同一个业务同一种数据,经常会使用多种数据模型工作不同代码模块。这时它们之间互相转换便是大量重复代码了。...使用 AutoMapper 便可以很方便地不同模型之间进行转换而减少编写太多转换代码(如果这一处代码对性能不太敏感的话)。...关于 AutoMapper 系列文章: 使用 AutoMapper 自动多个数据模型间进行转换 使用 AutoMapper 自动映射模型时,处理不同模型属性缺失问题 安装 AutoMapper 库...初始化 MapperConfiguration,定义类型映射关系 DEBUG 下验证 MapperConfiguration 映射是否正确 创建一个 IMapper 映射器,用于后续映射使用...如果希望两个类型之间能够双向映射,那么初始化 IMapper 时候也应该再额外调用一下 ReverseMap 方法,否则就会抛出异常 AutoMapper.AutoMapperMappingException

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如何去掉数据离群样本

引言 当我们拿到一组数据想要开始分析时,做第一件事情就是质控,看一下数据怎么样,是否适用于我们分析流程,以及某些低表达或极端表达基因和样本是否应该删除更利于分析结果。...自己表达量矩阵数据绘制主成分分析图 #加载R包 library("FactoMineR") library("factoextra") #载入数据 load(file = 'symbol_matrix.Rdata...TCGA-44-2666-01B" "TCGA-44-6147-01B" "TCGA-21-5782-01A" name_index <- which(rownames(exp) %in% name) #基因矩阵及分组删除离群样本...只是删除了PCA12个样本,所以看起来影响不大,那么我们再考虑他统计学意义,结合P值看一下对差异基因是否有影响。...gplots::balloonplot( table( deg_DESeq2[ids,'g'], deg1_DESeq2[ids,'g']) ) dev.off() 从比较表格可以看出删除样本之后上调差异基因减少了将近一半

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R语言数据结构与转换

任何数据分析第一步都是按照所需要格式创建数据集。 R ,这个任务包括两个步骤:首先选择一种数据结构来存储数据,然后将数据输入或者导入这个数据结构。...下面介绍 R 中用于存储数据多种数据结构。 R 数据结构 大多数情况下,结构化数据是一个由很多行和很多列组成数据集。 R ,这种数据集被称为数据框。...因子 R 中非常重要,它决定了数据展示和分析方式。数据存储时因子经常以整数向量形式存储。所以进行数据分析之前,经常需要将它们用函数 factor( ) 转换为因子。...常见矩阵运算都可以R 实现,如矩阵加法、矩阵乘法、求逆矩阵、矩阵转置、求方阵行列式、求方阵特征值和特征向量等。...进行数据分析时,分析者需要对数据类型熟稔于心,因为数据分析方法选择与数据类型是有密切联系R 提供了一系列用于判断某个对象数据类型函数,还提供了将某种数据类型转换为另一种数据类型函数。

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MixCSE:困难样本句子表示使用

因此,才会有一系列论文旨在解决各向异性,比如bert-flow、bert-whitening。 对比学习句子表示使用? ​...问题是对于大量数据而言,我们怎么去构建正样本和负样本? ConsBERT使用大量数据增强策略,比如token shuffling和cutoff。...目前一些模型主要关注是在生成正样本对时使用数据增强策略,而在生成负样本对时使用随机采样策略。计算机视觉,困难样本对于对比学习是至关重要,而在无监督对比学习还没有被探索。...该方法训练过程不断地注入人工困难负特征,从而在整个训练过程中保持强梯度信号。 ​ 对于锚特征 ,通过混合正特征 和随机负特征 构建负特征: 是一个超参数,用于控制混合程度。...包含这些混合负特征后,对比损失变为: 定义为梯度停止,确保反向传播时不会经过混合负样本。 ​ 接着,我们注意到锚和混合负样本内积: 某些阶段, 。另外,实现对齐时, 。

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TRICONEX 3636R 服务器聚合来自多个来源数据

TRICONEX 3636R 服务器聚合来自多个来源数据图片在异构计算平台上节省资源和可普遍部署应用程序工业数据方面为工业4.0提供了新世界。...容器应用程序是提供严格定义功能小软件模块,是自动化世界聪明数据管理一个例子。Softing推出了一个新产品系列,将容器技术用于西门子和Modbus控制器。...背后想法如前所述,容器应用程序是具有精确定义功能软件模块,允许新部署选项,为自动化技术带来许多好处。好处是运行在不同计算机平台上低资源、通用应用程序或软件实际隔离、封装和可移植性。...这确保了容器应用程序总是行为一致,而不管它在什么环境执行。下载后,容器应用程序可以几秒钟内使用单个命令行进行部署,并且在生产级别提供了实现简单集中管理优势。...这可以在内部使用设备管理系统(DMS)或在云环境完成(例如微软Azure物联网边缘, AWS物联网绿草),而且随着机器工作负载变化,工作TRICONEX 3351TRICONEX AI3351 TRICONEX

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多个单细胞转录组样本数据整合之CCA-Seurat包

单细胞水平研究是仅次于NGS一次生物信息学领域革命,同样随随便便发CNS黄金时期也过去了,现在想发高分文章,拿多个病人多个样本进行单细胞转录组测序是非常正常,比如下面的: 发表 Nat...还有我们单细胞天地分享scRNA-seq揭示胰腺导管腺癌瘤内异质性和恶性进展 ,有24个原发性PDAC肿瘤病人样本及11个对照胰腺样本(3例非胰腺肿瘤患者和8例非恶性胰腺肿瘤患者样本) 大多数百万经费起项目...多个样本单细胞转录组数据整合算法 Seurat主要是处理10x单细胞转录组数据,而10x仪器商业上成功可以说是成就了Seurat包,另外一个比较火多个样本单细胞转录组数据整合算法是mutual nearest...有趣是 sctransform 还在预印本:Hafemeister, C. & Satija, R....示例2个样本整合效果 canonical correlation analysis (CCA) Seurat官网最简单例子是两个样本,本来是有很明显样本差异,使用CCA整合后右图可以看到样本间差异就被抹去了

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样本学习及其美团场景应用

样本分布局部空间(图1):某个领域往往只有少量标注数据,而有大量未标注数据。...根据对未标注数据使用方式不同,我们将其划分为两种,第一种是半监督学习,是模型Finetune过程同时学习标注样本和未标注样本,利用了模型对未标注数据预测一致性;第二种是集成学习+自训练,强调是融合多个模型对未标注数据预测结果作为伪标注数据加入训练...样本增强早先在计算机视觉对图像进行数据增强,图像一些简单操作,如将图像旋转或将其转换为灰度,并不会改变其语义,语义不变变换存在使增强成为计算机视觉研究一个重要工具。...单纯使用多个模型预测时做集成会增加线上负担,因此我们利用多个模型对大量无标注数据进行预测,选取组合置信度较高数据合并到训练集进行训练,最后将多个模型优势集成到一个统一模型上。...,该分类器可以类别识别出该类样本

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VBA多个文件Find某字符数据并复制出来

VBA多个文件Find某字符数据并复制出来 今天在工作碰到问题 【问题】有几个文件,每个文件中有很多条记录,我现在要提取出含有“名师”两个字符记录。...文件如下: 【常规做法】打开文件--查找---复制---粘贴---关闭文件,再来一次,再来一次 晕,如果文件不多,数据不多那还好,如果文件多,每个文件记录也很多,那就是“加班加班啦” 【解决】先Application.GetOpenFilename...要打开文件对话框,选中要打开文件,存入数组,再GetObject(路径)每一个文件打开,用Find指定字符,找到第一个时用firstAddress记录起来,再FindNext查找下一个,当循环到最初位置时停止...,把找到数据整行复制出来就可也。...B.弹出输入字符对话框,输入你要查找字符 C.完成,打开文件数:3个,查找到了记录:36

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R」ggplot2R包开发使用

尤其是R编程改变了从ggplot2引用函数方式,以及aes()和vars()中使用ggplot2非标准求值方式。...有时候开发R包时为了保证正常运行,不得不将依赖包列入Depdens。...常规任务最佳实践 使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2通常用于可视化对象(例如,一个plot()-风格函数)。.../ 234, "r" = 25 / 234 ), class = "discrete_distr" ) R需要类都有plot()方法,但想要依赖一个单一plot()为你每个用户都提供他们所需要可视化需求是不现实...然而,提供一个 plot()用于一个对象可视化总结帮助用户理解该对象是有帮助。为了满足你所有用户,我们建议写一个函数将这个对象转换为一个数据框(如果更加复杂,可以是包含数据列表)。

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Excel小技巧54: 同时多个工作表输入数据

excelperfect 很多情形下,我们都需要在多个工作表中有同样数据。此时,可以使用Excel“组”功能,当在一个工作表输入数据时,这些数据也被同时输入到其它成组工作表。...如下图1所示,将工作表成组后,一个工作表输入数据将同时输入到其它工作表。 ?...图1 要成组工作表,先按住Ctrl键,然后工作簿左下角单击要加入组工作表名称,此时工作簿标题中会出现“名称+组”,如下图2所示。 ?...图2 注意,如果一直保持工作表“组合”状态,可能会不小心工作表输入其它工作表不想要内容。因此,要及时解除组合状态。...单击除用于输入内容工作表外任意工作表名称,则可解除工作表组合;或者工作表名称标签单击右键,快捷菜单中选取“取消组合工作表”命令。

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Python数据类型转换

Python 类型转换 Python 数据类型转换可以分为: 隐式类型转换 - 自动完成 显式类型转换 - 需要使用类型函数来转换 隐式类型转换 隐式类型转换,Python 会自动将一种数据类型转换为另一种数据类型...以下实例,我们对两种不同类型数据进行运算,较低数据类型(整数)就会转换为较高数据类型(浮点数)以避免数据丢失。...实例我们对两个不同数据类型变量 num_int 和 num_flo 进行相加运算,并存储变量 num_new 。...然后查看三个变量数据类型。 输出结果,我们看到 num_int 是 整型(integer) , num_flo 是 浮点型(float)。...Python 在这种情况下无法使用隐式转换。但是,Python 为这些类型情况提供了一种解决方案,称为显式转换。 显示类型转换 显式类型转换,用户将对象数据类型转换为所需数据类型。

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Python数据类型转换

基本类型转换 python3与python2通用函数: int('123456',10) # 转换为指定进制整数 hex(123456) # 整数转换为16进制串,转换后类型为字符串 bin(123)...'.decode('hex') # ascii码转换为对应字符串 特别注意:python3比python2多了个字节数据类型,python3字节专用函数: # 字符串转字节 bytes('str',...pythonstruct库 程序,输入多个字符可以被当作一个 WORD 或者 DWORD 甚至 QWORD 类型进行运算,运算结果放到内存再逐字节取出来!...简言之,就是能把所使用数据转换成在内存存储形式 常用到一些格式字符 b char 1 B uchar 1 h short 2 H ushort 2 i int 4 I uint 4 l long...binascii库 python2 中有encode('hex')函数可以快速将字符串转换为对应 ascii 码16进制数, python3 只有借助binascii才能实现类似功能!

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python数据清洗时间转换

Python python数据清洗时间转换 最近在爬取微博和B站数据作分析,爬取过程首先遇到是时间转换问题 B站 b站时间数据是是以时间戳 我们可以直接转换成我们想要格式 time.localtime...()把时间戳转换成标准struct_time 然后再time.strftime()格式化想要格式 time.strftime("%Y-%m-%d",time.localtime(i.get('created...'))) 看下效果 微博 微博抓取数据时间戳 还自带时区 我们可以用time.strftime函数转换字符串成struct_time,再用time.strftime()格式化想要格式 import...%j 年内一天(001-366) %p 本地A.M.或P.M.等价符 %U 一年星期数(00-53)星期天为星期开始 %w 星期(0-6),星期天为 0,星期一为 1,以此类推。...%W 一年星期数(00-53)星期一为星期开始 %x 本地相应日期表示 %X 本地相应时间表示 %Z 当前时区名称 %% %号本身 本站文章除注明转载/出处外,均为本站原创

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