……如果作为R的使用者你说自己与Hadley无关，那几乎只有一种原因——你用着他写的包却不自知。...我第一次上这门课的时候简直是噩梦——你需要记忆R中各种毫无规律的字符串函数名称，例如grep, grepl, regexpr, gregexpr……后来我有一次在洛杉矶旅行的时候突然有了个主意：为什么我不写个包把所有...base R中的字符串函数打包呢？...写了这个包，把base R中的正则表达式函数全都用统一的名称给命名了一遍，它也就成了stringr的基础。很自然的，在第二次上这门课的时候，我就使用stringr教学生了。...你在使用其它tidyverse包的过程中也许已经接触了这些规范。我推崇这些规范，是因为他们真的在你的工作中起作用。就stringr而言，我认为以下两种这样的“规范”是最值得一提的。
---- R语言中有两套支持正则表达式的函数，基础函数和stringr包中的字符串处理函数系统。...str_extract() #返回匹配值 以上便是R语言中支持正则表达式的高频应用函数，其中R语言基础函数中缺少一个精确返回匹配模式结果的函数，但是stringr中弥补了这一缺陷...关于stringr我今天只讲了一个函数，主要是很多类型需求在基础函数中基本都可以找到对照函数。 如果你想详细的了解stringr包的话，请一定要仔细阅读它的官方文档。...下图是R语言中基础字符串处理函数（支持正则表达式）与stringr内 函数的对照图。...好了，R语言和派森中的有关字符串处理与正则支持函数基本就这些了（并未包含完，主要我使用的也很有限，这几个是很高频的需求，可以解决数据清洗中的大部分问题）。
1.函数与参数 图片 写函数的函数 fun <- function(a,b,m = 2){ (a+b)^m #a+b的m次幂 } #{}内部的为具体的函数运算 fun(a = 1,b = 2...100,59,73,95,45);scores sort(scores) order(scores) scores[order(scores)] #sort（x）=x[order(x)] #order函数返回排序结果的值在原有向量中的位置...或 当前位置的值来源于原始向量中的哪个位置上的元素 图片 #order的语法规则 order(..., na.last = TRUE, decreasing = FALSE, method...require(stringr))install.packages("stringr") 学习使用R包 browseVignettes('stringr') ##部分R包可以打开网页版的学习文档 ls...("package:stringr") #列出R包中的函数，使用前需要先安装及加载这个R包 R语言中的符号 图片
在R语言中，有两种风格的正则表达式可以实现，一种就是在基本的正则表达式基础上进行扩展，这和相应的R字符串处理函数相关，另一种就是Perl正则表达式，这种风格的正则我们在R中一般不常用，本文主要还是针对R...stringr包是Hadley Wickham开发了一款专门进行文本处理的R包，它对基础的文本处理函数进行了扩展和整合，在一致性和易于理解性上都要优于基础函数。...本文在介绍基本的正则表达式语法的基础上，通过R中这两种文本处理函数进行实例说明，也好让大家对R语言中正则表达式的基本用法有个大致了解，在后续的爬虫演练中更容易理解一些信息提取的细节知识。...image.jpeg R中基础文本处理函数和stringr包文本处理函数对于正则表达式的支持情况如下表所示： ?...3333或5555的特征并返回所在位置 grep("[35]{4}", example_text1) [1] 1 2 查询字符串中是否存在3333或5555的特征并返回逻辑值 grepl("[35]{
这节课同样干活满满，只挑了自己感兴趣的记了，不是特别全1.函数与参数（1）形式参数与实际参数函数（括号里是形式参数，由函数作者设计，不可修改，熟练后可不写）形式参数的内容就是实际参数，使用者可以进行改动...(3,6,-2)函数只区分“是什么”（数据类型/数据结构），与“怎么得到的”无关当一个代码需要复制粘贴三次，就应该写成函数或使用循环#plot画iris的前四列jimmy <- function(i){...，没写的会使用默认值2.R包（R package）介绍R包可以理解为是多个函数的打包存放，也可以只有数据包含函数、示例数据、帮助文件、描述文件等2.1 为什么要安装R包？...seqbrowseVignettes("stringr")ls("package:stringr")2.10 R包的使用场景1.某些流程代码中用到某些包2.学绘图3.别人的代码套自己的数据，报错不会改大多数包里的函数规律一致...，不需要单独学习，用到哪个函数学哪个函数少部分包里的函数自有语法，例如ggplot2,dplyr其他要点：符号的提示作用$：数据框取列，列表取子集=：赋值，或连接形式参数与实际参数{}：多行代码重要TIPS1
使用国内镜像-推荐清华或中科大镜像-设置镜像即可-网址在day4的R脚本tools - global option -packages -primary CRAN repository中设置镜像，选择中科大或清华代码设置...-day4的R脚本中清华镜像CRAN清华镜像bioconductor清华镜像中科大镜像CRAN中科大镜像bioconductor中科大镜像R包安装和使用逻辑安装-加载-使用包里的函数已经安装的包可以用:...require(stringr))install.packages("stringr")#使用该代码，如果没有该包则安装。...，用到ggplot2别人代买自己数据套，报错不会改大多数包规律一致，不需要单独学习，用哪个函数学习哪个函数少部分包有自学语法，比如ggplot2，dplyr等R包如何使用查看帮助文档搜索引擎搜R包介绍页面...ls("package:包名")该命令可以列出R包里的函数或数据R语言里的符号()前是函数 []前是向量数据框或矩阵取子集[[]]列表取子集 $数据框取子集，列表取子集 <-赋值 = 赋值，或连接形式参数和实际参数
本次主要介绍了一些基本的正则表达式用法以及公式的创建和使用，然后介绍使用 tidyverse 组合拳进行批量建模和可视化。...查看本期代码[2] 资料： 小抄-因子[3] 小抄-purrr[4] 小抄-正则[5] 小抄-stringr[6] 内容： 字符处理基础 因子 手动 常见需求 基础字符串处理函数 映射 stringr...常用函数 建模基础：参考 https://www.jianshu.com/p/f8ce25fb2697 https://openbiox.github.io/Cookbook-for-R-Chinese.../section-4.html 基础教程：https://www.datacamp.com/community/tutorials/r-formula-tutorial 因变量与自变量 y ~ x 公式表示...字符串转公式 实战：结合 tidyverse 对 mtcars 进行批量建模和生成 ggplot2 图形 编程将变量名组合转为公式 目标数据结构与生成 分组处理 purrr 批量建模与可视化 图形拼接
R基础字符串处理函数 nchar paste strsplit tolower toupper casefold chartr gsub sub substr substring grep grepl...regexpr R包stringr 字符串处理学习思路 拼接 对应拼接，如 (‘a’,’b’)+(‘c’,’d’) → (‘ac’,’bd’) 多拼为一，如 (‘a’,’cd’,’m’)...针对向量 strsplit #针对字符串向量（拆分） str_split #针对字符串向量（拆分）stringr包内函数 paste #针对向量合并 针对数据框 unite...#合并数据框中的某几列 separate #将数据框中某一列按照某种模式拆分成几列 a <- c("2016-2-7","2016-3-8","2016-4-9","2017-5-...# 使用|或来按照两种形式拆分 q <- c("a-b.c-d") strsplit(q,"\\.|-") # "a" "b" "c" "d" # 改变字符串 # 大小写转换 (c <- toupper
require(stringr))install.packages('stringr')library(stringr)rm(list = ls()) #清空环境变量if(!...arrange(test, desc(Sepal.Length)) #从大到小#2.distinct，数据框按照某一列去重复distinct(test,Species,.keep_all = T)类似与unique...在R语言的世界里，没有赋值就是没有发生过。#补充select()、filter() 筛选列、行类似于之前的$,[]#管道符号（%>%），表示把前一步的运算结果传递给后一步的函数，不需要多次赋值。...x为逻辑值或逻辑值向量；yes为逻辑值为TRUE时的返回值；no为逻辑值为FALSE时的返回值例如：x = rnorm(3)xifelse(x>0,"+","-")#3ifelse()+str_detect...s=s+i print(c(i,s))}或者x <- c(5,6,0,3)s = 0for (i in 1:length(x)){ s=s+x[[i]] print(c(x[[i]],s))}如何将结果存下来
，就应该写成函数或使用循环,减少人为错误2.R packages2.1 认识R packages2.1.1 定义: 多个函数的打包存放，包含函数、数据、帮助文件、描述文件等2.2.2 用途: 特定的分析功能...，需要用相应的packages实现需要学会的是R包的使用规律,并非某个R包的具体用法2.2 R packages的安装2.2.1 镜像的设置镜像的作用是加快访问速度1.CRAN的镜像设置:options...require(stringr))install.packages("stringr")if()里面逻辑是F则跳过后面的代码，T则运行后面的代码图片已经安装的包可以用::快速调用里面的函数,e.ppheatmap...::pheatmap(volcano)2.4 R packages的常见问题2.4.1 package not available图片原因1:包名写错原因2:安装命令使用错误原因3:本机的R语音版本与包所要求的版本不符...stringr3.3 浏览Package作者的在线教程browseVignettes("stringr")不一定每个作者都会写3.4 罗列指定packages中的所有函数ls("package:stringr
只是函数名多了个下划线那么简单吗？ 正则表达式 R与stringr分别使用grepl()和str_detect()来进行，我比较喜欢基础R的，不知你喜欢安装包还是用基本的。...使用dplyr高效处理数据 这个包名的意思是数据框钳，相比基础R的优点是运行更快、与整洁数据和数据库配合好。函数名的部分灵感来自SQL。 ?...与基本R中类似函数不同，变量无需使用 $ 操作符就可直接使用，设计与magrittr包的%>%管道操作符一起使用，以允许每个数据阶段写成新的一行。其是一个大型包，本身可以看成一门语言。...非标准计算 代码中没有引号包裹的原始名字，这种方式叫做非标准计算（NSE），高效交互使用函数，减少键盘输入，允许Rstudio中自动完成。还是函数名多个_。...数据库与dplyr 必须使用src_*()函数创建一个数据源。# 使用data.table()处理数据 是dplyr的替代，两个哪个好存在争议，最好学一个一直坚持下去。
其用法相比于R自带的函数，更加简单明了。stringr包在我工作中，是属于频繁使用的R包之一。简单的用法也是深入我心，强烈推荐使用该包进行字符串的预处理。...#根路径wd 去空格 场景：在Excel中，使用查找筛选时，字符串后面的空格往往对结果无影响，但是在R中，却会出问题，所以在匹配之前，先将空格删除。...#截取guige 提取 场景：与截取的功能类似，但是可以使用正则表达式匹配，更为强大。在我的工作中，常用来提取csv文件名。...#提取filepath 字母大小写转换 场景：在Excel中，查找匹配不区分大小写，但是在R中区分大小写，常出现在Excel中能查到到但是R中匹配不到的情况，故先预处理统一大小写再做匹配。...该包不仅仅只有以上几个函数，还有其他函数，只是工作中较少用到，所以未列举出来。可见stringr包确实强大，提供了一整套字符串的处理方案。
1 目录 三种数据结构简介 R与Python字符串函数 字符串函数-基于R 字符串函数--基于Python 2 三种数据结构 数据根据结构分为三种：结构化数据、非结构化数据、半结构化数据。...结构化数据可以使用关系数据库（RDBMS）存储，可以使用二维表来逻辑表达实现的数据（R和Python中的数据框类型数据）。...3 R与Python字符串函数 R语言中推荐使用stringr包里面的函数进行字符串处理，Python中有正则表达式库re和内置的字符串string包。...4 字符串函数--基于R R语言中自带的字符串函数操作起来非常难用，而且函数名字经常记不住，因此这里介绍stringr包，提供了大部分字符串处理函数（如果发现很难使用stringr包中函数实现，可以考虑使用...stringr包中函数按照是否使用正则表达式分为使用正则表达式函数和其他函数，函数参数中有pattern参数的则为使用正则表达式函数。
函数和参数图片写函数的函数functionjimmy <- function(a,b,m = 2){ (a+b)^m}##a,b,m为形式参数；jimmy为函数名称；m的默认值为2;##大括号内为编写函数使用的代码...iris[,2],col = iris[,5])plot(iris[,3],col = iris[,5])plot(iris[,4],col = iris[,5])#当一个代码需要复制粘贴三次，就应该写成函数或使用循环...jimmy <- function(i){ plot(iris[,i],col=iris[,5])}jimmy(1)jimmy(2)jimmy(3)jimmy(4)安装R包多个函数打包存放包含函数，数据...找到R包的使用规律R包的位置：CRANinstall.packages("tidyr")R包的位置：bioconducterBiocManager::install("ggplot2")R包的位置：githubdevtools...require(stringr))install.packages("stringr")图片看看包里面有哪些函数ls("package:stringr")图片图片
title: "day4note" output: html_document date: "2024-03-09" 1.R包安装 R包理解为多个函数打包存放，包含函数、数据、帮助文件、描述文件 找所有...R包使用的规律 生物信息学R包的三个来源 install.packages("tidyr") #CRAN网站 install.packages('BiocManager') #Bioconductor...上哪里偷 .libPaths() ## [1] "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.3-x86_64/Resources/library" 找到与包同名的文件夹...#当一个代码要复制三次，写成循环 4.安装包时存在提示信息 R语言版本只追求第二位最新 4.1问是否更新的、“不存在”的是依赖包 使用包里的函数，要先安装或加载包 更新一个包：取消加载，卸载，重启session...#在线帮助文档 ls("package:limma") #列出一个包里都有哪些函数或数据 ## [1] "[.EList" "[.EListRaw"
承接R&Python Data Science系列:数据处理(5)--字符串函数基于R(一)，继续介绍R语言中的字符串函数。...元字符与反义符 重复量词 分组与条件或 为了显示字符串中字符函数是怎么匹配的，这里使用str_view()函数进行讲解。...4.2.5 分组和条件或 上面重复量词都是重复前面的一个元素，那么如果我们想重复前面两个元素，即需要将前面两个元素作为一个整体。正则表达式中使用()来做分组，把括弧中的元素当做一个整体。...正则表达式中使用"|"来表示或(或使用中括号[])，也叫做分支条件，满足分支条件中的任意一种条件时，都会成功匹配。...4.2.6 R语言正则表达式总结 正则表达式部分比较晦涩，看书的时候在这个部分花了很长时间，理解这一块，最好是理论结合练习，多写一下案例，下面会接着介绍stringr包中的使用正则表达式的字符串处理函数
近期写R代码，经常用dplyr::case_when结合stringr::str_detect进行条件判断。...痛点：判断条件可能会改或增删，全写在case_when里，代码冗余且不利于复制和维护，stackoverflow找了一圈，没发现好的解决方案，干脆自己写了一个通用代码以自动生成批量case_when判断...) 使用示例： 初始表tibble(fruit=stringr::fruit) 想实现字母a开头为’starts with a’，字母e结尾为’ends with e’ 等若干条件。...'(an)|(ch)','contains an or ch' ) 或者写在Excel里， 然后复制单元格，用conditions <- clipr::read_clip_tbl()读进R...函数的核心依然是case_when，条件为真即停止，所以效率上没有损失。 如果想改条件，在conditions里放肆增删改，改完再跑一遍allCaseWhen即可。
R包本文内容均来自花花老师生信星球学习小组R包是多个函数的集合，具有详细的说明和示例。...("stringr")#安装来自cran的stringr包BiocManager::install("limma")#安装来自Biocductor的limma包加载加载R包的两个函数library和require...二者均可library(dplyr)安装加载三部曲R包使用流程：先安装后加载，然后才能使用包里的函数options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn...表匹配的x表所有记录semi_joinanti_join(x = test2, y = test1, by = 'x') #反连接：返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join#简单合并:在相当于...R包怎么学快速查看函数帮助文档 现查现用?
这种入门的学习路径属于base R first，学习的流程基本是先了解变量的类型、数据的结构，再深入点就会学到循环与自定义函数。...(处理因子问题) tidyverse的安装也很简单，在R中输入以下命令： #安装包 install.packages("tidyverse") #使用前，记得载入包 library(tidyverse...管道函数 %>% 在tidyverse中，管道符号是数据整理的主力，它的功能和Linux上的管道符“|”类似，可以把许多功能连在一起，而且简洁好看，比起R的基本代码更加容易阅读！...同样，也可以与tidyverse中的管道和group_by结合，批量的做回归分析，并且得到整理好的结果。 ? ?...当然，入门之后如果使用者在未来需要使用R完成更细腻的分析时，再分配较充足的时间学习base R。
R语言中，select函数用于选择数据框中的列，可以使用列名或者向量来指定要选择的列。...例如，若要选择数据框df中的列x和y，可以使用以下代码：library(dplyr)，df 10且y 10 & y % names() #注释在R语言中，head()和tail()函数用于查看数据框或向量的前几行或后几行。
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