看到一个成熟的R包,所以推荐一下 https://knausb.github.io/vcfR_documentation/ https://cran.r-project.org/web/packages.../vcfR/vignettes/intro_to_vcfR.html 最重要的使用方法,当然是读入vcf文件啦,如下: library(vcfR) vcf_file='/Users/jmzeng/germline.../merge.dbsnp.vcf' vcf <- read.vcfR( vcf_file, verbose = FALSE ) 十几秒钟就轻轻松松读入一个300多M的vcf文件啦,成为一个S4对象: >...212,875 variants Object size: 356.6 Mb 0 percent missing data ***** ***** ***** > 懂R的朋友就应该是知道如何去查看帮助文档来学习它啦...,而fix存储在vcf的固定列,gt存储在样本基因型信息。
在Linux系统中,有时候我们需要批量重命名文件夹中的所有文件,以便更好地组织和管理文件。本文将详细介绍几种在Linux中重命名文件夹中所有文件的方法,包括使用命令行工具和脚本等方式。...在执行mv命令之前,可以先执行一个测试命令来确认重命名操作是否符合预期。ls -l这将列出文件夹中的文件,并显示它们的详细信息。确保重命名操作没有出现错误,并且文件名已按预期修改。执行重命名操作。...请注意,在使用mv命令重命名文件时,一定要小心谨慎。确保你明确了解要重命名的文件和重命名操作的后果,以免不小心删除或覆盖了重要文件。...请注意,在使用rename命令进行文件重命名时,同样要小心谨慎。确保你明确了解正则表达式的使用和重命名操作的后果,以避免错误的重命名操作。...在使用任何重命名方法之前,请务必小心谨慎,并确保你明确了解要重命名的文件和重命名操作的后果。在进行任何重命名操作之前,建议先进行备份以防止意外情况发生。
简介 R文档沟通前两期内容: R沟通|舍弃Latex,拥抱Rbeamer吧! R沟通|制作个性化ppt!...这期主要介绍下如何在Rstudio中运行和使用.tex文件,并给大家安利一个非常nice的模板和根据该模板制作的案例。...使用教程 在ElegantPaper[1]网站中下载整个仓库,可以直接下载到本地github或者下载压缩包。 ?...解压压缩包,找到主要的.tex文件(比如这里的中文文件cn),通过Rstudio打开。 ? 点击Compile PDF即可得到模板对应的paper了。 ? ?...如需直接获得这些文件,在后台输入latex模板即可获取以上文件(免费,没有啥硬性条件,有条件的帮我分享群,朋友圈,那就太感谢了! ?),实在办不到帮忙点点文末广告也行!
作者干货非常多,其中一个部分写了文件命名的问题。...一些要点: 在文件名开头标记一些数字; 如果文件名需要记录时间,使用ISO 8601 标准:YYYY-MM-DD; 使用数字时统一位数,需要补位时,使用零填充。...这样的好处就是我们甚至还可以把文件整理成一个表格,借助一款酷酷的R 包HenrikBengtsson/dirdf: R package: dirdf - Extracts Metadata from Directory...其实我也在一直努力改善啦~ 拓展阅读:How to name files - Speaker Deck[3] 【元数据文件命名法】规范性文件命名系统,不再为文件命名发愁 - 少数派 (sspai.com...slide=17 [4]【元数据文件命名法】规范性文件命名系统,不再为文件命名发愁 - 少数派 (sspai.com): https://sspai.com/post/69524
在RMAN中,COPY命令是拷贝数据文件,相当于OS的cp命令,而SWITCH则相当于ALTER DATABASE RENAME用来更新控制文件。...数据库12c R1版本中对数据文件的迁移或重命名不再需要太多繁琐的步骤。...在12c R1中,可以使用ALTER DATABASE MOVE DATAFILE这样的SQL语句对数据文件进行在线重命名和移动。...而当此数据文件正在传输时,终端用户可以执行查询,DML以及DDL方面的任务。另外,数据文件可以在存储设备间迁移,如从非ASM迁移至ASM,反之亦然。 ...ASM数据文件和OS文件系统互相转移方法总结 总结 1、若是12c,则可以在线直接操作 2、若是11g,请严格按照步骤来操作,在offline后记得执行recover操作 3、最最重要的一点:在移动数据文件之前
[toc] 在R中根据shapefile进行点的抠取 当我们有一个图层文件时候,然后再放些采样点在该图层上,发现,某些采样点落在地图的外面,如下图所示。...如果用Arcgis操作,很容易把外围的点抹去,保留图层内的点,那么如果在R里面,实现该操作呢。 image.png 本篇文章,主要介绍在R中实现根据shp文件进行地图点的抠取。...数据准备 首先我们利用广西,云南为案例,随机生成一些散在的点。...#### 根据shp文件进行抠图 library(rgdal) spg = df_point # 1)point change to SpatialPixelsDataFrame coordinates...= raster(shape, res=0.05) shape_r = rasterize(shape, r, "val") plot(shape_r) plot(shape,add=T) 参考
因为你要进行重命名的文件有可能当前被引用着,你修改之后,原本可以跑通的程序有可能跑不通了。...所以重命名输入重构(Refactor)的内容,所以在project选项卡中,选中文件或者文件名称,右键选择Refactor,再选择Rename即可。...如图所示: 随后会弹出 第一个是查找是不是有代码应用了它,第二个复选框含义是是否在注释和字符串中查找这个名称。有时候你需要修改重命名文件的相关引用,有时候不需要。随心所欲。
日志文件的轮循设置在独立的配置文件中,它(们)放在/etc/logrotate.d/目录下。...compress 在轮循任务完成后,已轮循的归档将使用gzip进行压缩。...missingok 在日志轮循期间,任何错误将被忽略,例如“文件无法找到”之类的错误。 notifempty 如果日志文件为空,轮循不会进行。...create 644 root root 以指定的权限创建全新的日志文件,同时logrotate也会重命名原始日志文件。...在没有执行kill -USR1 `cat ${pid_path}`之前,即便已经对文件执行了mv命令而改变了文件名称,tomcat还是会向新命名的文件" xxx.out_ 20180619"照常写入日志数据的
可以针对特定应用程序或服务日志文件的轮循设置在独立的配置文件中,放在/etc/logrotate.d/目录下 cat /etc/logrotate.conf cd /etc/logrotate.d/ ls...(图片可放大查看) 参数说明: create 0644 nginx root: 以指定的权限创建全新的日志文件,同时logrotate也会重命名原始日志文件 daily:日志文件将按日轮循 rotate...对于第11个归档,时间最久的归档将被删除 missingok: 在日志轮循期间,任何错误将被忽略,例如“文件无法找到”之类的错误。 notifempty: 如果日志文件为空,轮循不会进行。...compress: 在轮循任务完成后,已轮循的归档将使用gzip进行压缩 postrotate/endscript: 在所有其它指令完成后,postrotate和endscript里面指定的命令将被执行.../var/spool/cron/ 目录下存放的是每个用户包括root的crontab任务,每个任务以创建者的名字命名 /etc/crontab 这个文件负责调度各种管理和维护任务。
先看下在VB中遍历文件并用正则表达式完成复制功能将"E:\my\汇报\成绩"路径下源文件中的“1项目”,“一项目”等文件复制到目标文件下。以下为实现方式。...Private Sub Option1_Click()Dim myStr As String'通过在单元格中输入项目序号,目前采用的InputBox方式指定的,也可通过此方式。二者取其一。'...4 + 1, 1))End If'组成汉字表达式strCh = strCh & Trim(strTempCh)NextCChinese = strChEnd Function补充:下面看下用VB实现重命名...、拷贝文件夹及文件Private Sub commandButton1_Click()'声明文件夹名和路径Dim FileName, Path As String, EmptySheet As String'Path...否则不能重命名当期文件夹”Else:Name FileName As Path & “” & myTimeEnd IfEnd If'判断文件夹是否存在If Dir(FileName, vbDirectory
除此之外,处理一个单个的庞大日志文件也常常是件十分棘手的事。 logrotate是个十分有用的工具,它可以自动对日志进行截断(或轮循)、压缩以及删除旧的日志文件。...日志文件的轮循设置在独立的配置文件中,它(们)放在/etc/logrotate.d/目录下。...,0 指没有备份,5 指保留5 个备份 dateext 使用当期日期作为命名格式 dateformat ..../log/log-file -rw-r--r-- 1 root root 10485760 Jan 14 14:40 /var/log/log-file.1 即使轮循条件没有满足,我们也可以通过使用‘-...f’选项来强制logrotate轮循日志文件,‘-v’参数提供了详细的输出。
在Linux系统中,日志的使用非常频繁,那么对日志就需要一定策略的管理,包括存放目录的设计,log文件命名规则,历史log文件的存放,log目录的容量限制,另外还有日志轮循。...日志轮循就是,将过期的log文件以新的文件名存放,创建一个新的log文件供应用使用,同时合理管理存储的历史log文件的个数。 用shell脚本实现的日志轮循功能: 01....里面包含的各个变量是日志轮循的各种属性,有轮循频率,保存历史log文件个数,需要进行轮循的日志目录,是否进入当前日志目录的子目录进行轮循,日志目录存储容量大小限制,日志文件权限。 02....进入日志目录后轮循的方法是,循环对文件遍历,非历史log文件进行重命名,并根据配置文件中的设置,删除多余历史log文件。对当前文件夹进行容量计算,超过配置文件的设置则记录日志。...得到,是函数的退出状态,只可以是0~256的整数,并且函数在return后退出。 02. grep -w 的内容中有"/"则视作两个单词。
日志文件的轮循设置在独立的配置文件中,它(们)放在/etc/logrotate.d/目录下。...compress 在轮循任务完成后,已轮循的归档将使用gzip进行压缩。...missingok 在日志轮循期间,任何错误将被忽略,例如“文件无法找到”之类的错误。 notifempty 如果日志文件为空,轮循不会进行。...create 644 root root 以指定的权限创建全新的日志文件,同时logrotate也会重命名原始日志文件。...在日志轮循期间,任何错误将被忽略,例如“文件无法找到”之类的错误。
贾言 代码评审歪诗 窗外风雪再大 也有我陪伴着你 全文字数:2000字 阅读时间:5分钟 贾言 代码评审歪诗 验幻空越重 命循频异长 依轮线日简 接偶正分壮 架构师说, 用20个字描述代码评审的内容...命-明 包/类/方法/字段/变量/常量的命名要遵循规范,要名副其实,这不但可以增加可读性,还可以在起名的过程中引导我们思考方法/变量/类的职责是否合适 有意义很重要, 典型无意义命名: ?...循-勋 不要在循环中调用服务,不要在循环中做数据库等跨网络操作; 频-品 写每一个方法时都要知道这个方法的调用频率,一天多少,一分多少,一秒多少,峰值可能达到多少,调用频率高的一定要考虑性能指标,考虑是否会打垮数据库...,是否会击穿缓存; 异-宜 异常处理是程序员最基本的素质,不要处处捕获异常,对于捕获了只写日志,没有任何处理的catch要问一问自己,这样吃掉异常,是否合理; 下面是一个反例, 在导出文件的controller...但是mq解耦的方式不能滥用,在同一系统内不宜过多使用mq消息来做异步,要尽可能保证接口的性能,而不是通过mq防止出问题后重新消费。
详细步骤如下: 重命名正在输出日志文件,因为重命名只修改目录以及文件的名称,而进程操作文件使用的是 inode,所以并不影响原程序继续输出日志。...compress: 在轮循任务完成后,已轮循的归档将使用 gzip 进行压缩。...missingok: 在日志轮循期间,任何错误将被忽略,例如 “文件无法找到” 之类的错误。 notifempty: 如果日志文件为空,轮循不会进行。...指保留 5 个备份 tabooext [+] list:让 logrotate 不转储指定扩展名的文件,缺省的扩展名是:.rpm-orig, .rpmsave, v, 和~ missingok:在日志轮循期间...要进行验证,不用实际轮循任何日志文件, 可以模拟演练日志轮循并显示其输出。
在此之前在和讯网负责股票基金行情系统的研发工作,具备高并发、高可用互联网应用研发经验。 贾言验幻空越重, 命循频异长。 依轮线日简, 接偶正分壮。言欢空月虫, 明勋品宜昌。...- 明勋品宜昌 命: 包 / 类 / 方法 / 字段 / 变量 / 常量的命名要遵循规范,要名副其实, 这不但可以增加可读性,还可以在起名的过程中引导我们思考方法 / 变量 / 类的职责是否合适...有意义很重要, 典型无意义命名: public static final Integer CODE_39120 = 39120; public static final String MESSAGE...循: 不要在循环中调用服务,不要在循环中做数据库等跨网络操作 频: 写每一个方法时都要知道这个方法的调用频率,一天多少,一分多少,一秒多少,峰值可能达到多少,调用频率高的一定要考虑性能指标,...考虑是否会打垮数据库,是否会击穿缓存 异: 异常处理是程序员最基本的素质,不要处处捕获异常,对于捕获了只写日志,没有任何处理的 catch 要问一问自己,这样吃掉异常,是否合理 下面是一个反例, 在导出文件的
不仅是这个,如果你是一个日志文件的话,你阅读、打开都要花费很大力气,那么怎么才能处理好这种情况? logrotate是个十分有用的工具,它可以自动对日志进行截断(或轮循)、压缩以及删除旧的日志文件。.../etc/logrotate.conf include /etc/logrotate.d 常见参数 dateext: 切割的日志带上日期 monthly: 日志文件将按月轮循。...compress: 在轮循任务完成后,已轮循的归档将使用gzip进行压缩。...missingok: 在日志轮循期间,任何错误将被忽略,例如“文件无法找到”之类的错误。 notifempty: 如果日志文件为空,轮循不会进行。...create 644 root root: 以指定的权限创建全新的日志文件,同时logrotate也会重命名原始日志文件。
基于这个前提,轮循调度是一个简单而有效的分配请求的方式。然而对于服务器不同的情况,选择这种方式就意味着能力比较弱的服务器也会在下一轮循环中接受轮循,即使这个服务器已经不能再处理当前这个请求了。...这意味着在服务器B接收到第一个请求之前前,服务器A会连续的接受到2个请求,以此类推。...这个值在L7配置界面设置。...对于非常强大的“基于代理的自适应负载均衡”方法来说,负载主机以这种方式来定时检测所有服务器负载情况:每台服务器都必须提供一个包含文件,这个文件包含一个0~99的数字用来标明改服务器的实际负载情况(0=空前...,99=超载,101=失败,102=管理员禁用),而服务器同构http get方法来获取这个文件;同时对集群中服务器来说,以二进制文件形式提供自身负载情况也是该服务器工作之一,然而,并没有限制服务器如何计算自身的负载情况
基于这个前提,轮循调度是一个简单而有效的分配请求的方式。然而对于服务器不同的情况,选择这种方式就意味着能力比较弱的服务器也会在下一轮循环中接受轮循,即使这个服务器已经不能再处理当前这个请求了。...这个值在 L7 配置界面设置。...对于非常强大的 “基于代理的自适应负载均衡” 方法来说,负载主机以这种方式来定时检测所有服务器负载情况:每台服务器都必须提供一个包含文件,这个文件包含一个 0~99 的数字用来标明改服务器的实际负载情况...(0 = 空前,99 = 超载,101 = 失败,102 = 管理员禁用),而服务器同构 http get 方法来获取这个文件;同时对集群中服务器来说,以二进制文件形式提供自身负载情况也是该服务器工作之一...加权响应 Weighted Response: 流量的调度是通过加权轮循方式。加权轮循中 所使用的权重 是根据服务器有效性检测的响应时间来计算。
所以,在linux中,日志一般会按一定的规则进行循环,保证日志量控制在一定的范围内。 日志循环的方法 日志循环的原理一般是:在特定的时间点,或日志达到一定大小,就触发循环脚本。...1.1 有损循坏 直接清理日志 cp /usr/local/nginx/logs/access.log /usr/local/nginx/logs/access_$(date -d '-1day' '+.../bin/bash #设置日志文件存放目录 logs_path="/usr/local/nginx/logs/" #设置pid文件(也有可能在/var/run中) pid_path="/usr/...local/nginx/logs/nginx.pid" #日志文件 filepath=${logs_path}"access.log" #重命名日志文件 mv ${logs_path}access.log...首先日志mv重命名,期间nginx依然打印日志到重命名的文件中,通过kill向nginx master进程发送信号,nginx重新读取配置文件,触发新的access日志重新打印。