在R树状图中，如何减少树叶长度来拟合标签？

我正在尝试以与使用软件包'ape‘绘制树时相同的’风格‘来绘制聚集聚类(UPGMA with Agnes)的结果。下面的图中包含了一个简单的示例关键问题是，我希望能够根据树叶标签中的图案对树状图的树叶进行着色。我尝试了两种方法:要么使用hc2Newick，要么使用Joris Meys在回答时提出的代码。这可能是因为我也不完全理解树状图的构建方式。可以在上找到abundance.agnes.ave对象的ASCII保存(从运行agnes中

浏览 5提问于2013-04-17得票数 4

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树状图高度太长

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我使用下面的R代码来获得一些数据的热图；热图在列的顶部显示一个树状图，但我宁愿树状图的长度更短，以便在热图的底部留出足够的空间来放置一些长的列标签。有没有办法调整树状图的长度？

浏览 1提问于2012-08-13得票数 1

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在python中使用tight_layout()创建不必要的空白

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我使用tight_layout()来拟合一个图，因为x标签被切断了，但是从图中可以看到，在图的左边和下方，我得到了不必要的空白。如何尽量减少图形周围空白的数量，但仍然保持所有文本可见？我试着用但是这只会减少图片顶部和右边的空白。

浏览 1提问于2016-04-19得票数 1

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在dendextend中将节点标签添加到树状图中

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我有一个带有叶和节点标签的树状图(class=phylo，使用read.tree读取)。在将其转换为树状图类之后，节点标签不再存在。然而，我想通过在一些节点的顶部显示标签来绘制树状图(即在所选集群的顶部以NODE_1等形式显示)。有人知道如何将节点标签添加到树状图类并添加到图中吗？类似这样的东西，但不是数字，而是id-s或标签，只有一些选择的节

浏览 2提问于2017-10-20得票数 2

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用树状图和样品标签绘制热图

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") 本例中的标签是与热图第一次和顶部行相邻的正方形，用于表示每个样本的标签，以便人们可以看到标签是否与热图/树状图所显示的聚类相对应。在这个特定的图中，他们选择使这些标签与树状图簇的颜色完全对应，但不必是这样，我正在寻找的方法只是在样本中添加一个通用的列和一行标签，这可能与应用树状图的特定阈值导致的聚

浏览 1提问于2013-07-25得票数 4

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用R's用树状图绘制聚类热图

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我遵循关于如何使用R的plotly创建带树状图的集群热图。list( showgrid = FALSE,) 然后：这意味着：我的问题是：如何使热

浏览 1提问于2017-05-05得票数 12

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为什么Matplotlib locator_params隐藏负面标签？

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我使用"matplotlib locator_params“来降低以下图中θ轴标签的频率： ax.locator_params(axis='x', nbins=30)另外，如何减少r(经度)方向上标签的数量？用y代替x代替参数轴对我不起作用。

浏览 6提问于2017-06-02得票数 0

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重绘xAxis坐标

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在截图中，我试着根据特定的日期来拟合所有的点，但是，有时点会经过X轴。我的问题是，我如何才能知道x轴长度来测量我的点呢?

浏览 5提问于2020-03-17得票数 0

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如何更改r中的树状标签

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我在R中有一个树状图，它基于层次聚类，使用hclust。我对不同颜色的标签进行了着色，但是当我尝试使用dendrogram = dendrogram %>% set("labels", dataframe$column)更改我的dedrogram的标签(集群所基于的数据帧的行)时，标签会被替换，但位置不对。例如： ___|___| | | 2 现在，当我尝试像

浏览 4提问于2015-11-09得票数 6

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如何用dendextend标记层次聚类树中的一个观察值？

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不幸的是，由于在终端节点包含了如此多的标签，树看起来非常杂乱，并且包含了许多不必要的信息。因此，为了减少混乱，我只想标记一个感兴趣的观察结果。我已经删除了所有标签，但我不知道如何检索和添加我感兴趣的标签。对于这个MWE，让我们假设，我想将字母k添加到我的树状图中。

浏览 9提问于2020-12-16得票数 0

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带有ggplots和treemapify的图表树状图

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我有一个简单的数据框架，我想用一个树状地图来可视化。我已经使用了ggplot和treemapify。这看起来没问题，但我想知道如何在树状图中既显示名称变量又显示实验室变量，而不显示一个作为标签和一个在图例中。colour = "white", size = 15, scale_fill_brewer(palette = "Greens"

浏览 10提问于2019-11-10得票数 2

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在R中生成高分辨率的树状图

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我正在尝试用R生成一个高分辨率的树状图。困难之处在于有200多个叶节点，每个节点都由一个字符串标识。我希望确保这些字符串标签中的每一个在生成(打印)的图中都是可读的。为了更清楚地演示，我想在图的顶部再添加一个x轴(对应于切换图中的距离信息)。在R中如何做到这一点呢？

浏览 1提问于2011-12-07得票数 3

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当顶级标签使用fontsize.labels设置为0时，R标签不合理吗？

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我正在尝试删除R树地图上的顶级标签，该标签使用R3.1版的2.4版本在Macbook Air R上创建。vSize="x", type="categorical")

浏览 3提问于2015-11-02得票数 5

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如何解决Python sklearn的随机森林中的过拟合问题？

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我正在使用python sklearn包中实现的RandomForestClassifier来构建一个二进制分类模型。在每次交叉验证中，有163个训练样本和41个测试样本。提前感谢！

浏览 0提问于2013-12-09得票数 49

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在R中突出显示树状地图中使用树状地图包的特定部分

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我正在使用R中的树状图包来突出显示不同环境下的COVID暴发次数。我正在使用reports做一些不同的报告。每种设置都描述了不同类型的设置，我想在每一份报告的树状图中强调这一设置，显示在所涉环境中发生的总暴发所占的比例。例如，我目前正在研究K-12学校的报告，并希望在图中突出显示该类别的方框。我正在设想一种改变标签或边框在一个特定的盒子上的方法。在盒子周围放一个黄色边框，或者把标签涂成黄色。我找到了一种方法，为所有的

浏览 3提问于2020-12-15得票数 1

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(Keras)将pad_sequences应用于更深层次//可变标签长度

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我得到了一个标签数据形状的(2000,2,x)，其中x是100到250之间的每一个2000集，其中2是x和y坐标。据我所知，在下面的代码中拟合我的模型只会匹配坐标的长度。keras.preprocessing.sequence.pad_sequences(train_labels, maxlen=250), batch_size=BATCH_SIZE) 那么，我如何才能把所有这些标签都保持在相同的长度，因为这似乎是必要的，以

浏览 3提问于2018-03-29得票数 0

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