我正在尝试在RMarkdown中使用doParallel。R代码调用一个名为report.RMD的脚本，目标是从虹膜数据集生成3个html报告，每个报告都以物种命名，并在中使用一个筛选到该物种的表。例如，virginica.html文档中列出了杂色物种。这似乎是一个并行化问题，因为当%dopa%更改为%do%时，html报告将按预期生成。更广泛的目标是在比这个例子更大的规模上使用RMarkdown的并行处理，但我使用
浏览 23提问于2021-09-28得票数 1
1回答
示例前的快速总结：
我有几百个数据集，我想从这些数据中创建每天的报告。为了有效地做到这一点，我用doParallel并行化了这个进程。在RStudio内部，流程工作正常，但是当我试图通过windows上的任务调度程序使流程自动化时，我似乎无法让它工作。因此，我不得不使doParallel脚本成为一个非函数的住房脚本，因此不能与get_files脚本一起使用，这将在每次引入所有内容时启动报表生成。rmarkdown::pandoc_available)."但是rmarkd
浏览 5提问于2021-08-08得票数 1
回答已采纳
2回答
我在RMarkdown中使用reticulate，并试图通过并行处理来运行本地定义的Python函数。我环顾四周，我发现是最接近于解决我的问题的，除了我使用的函数不是在单独的Python脚本中定义的，而是在Rmarkdown中定义的。下面是一个使用llply的简化示例，它给出了错误Error in unserialize(socklist[[n]]) : error reading from connection。我
浏览 2提问于2019-10-22得票数 2
1回答
如果我使用%do% -也可以。如果我使用%dopar% -3选项：library(tidyverse)library(doParallel)
render_all_obj &
浏览 5提问于2022-08-22得票数 3
回答已采纳
在之后，下面显示了三种不同的尝试。这些选项正确地更改了最后一个块中的ggplot对象。我使用的是RMarkdown和knitr。include=FALSE, echo=FALSE}库(RODBC)库(矩阵)
库(DoParallel
浏览 1提问于2019-08-21得票数 0
1回答
我应该做什么改变才能在这里有一个可复制的结果？我多次运行它，结果向量是不同的。谢谢你的帮助。 runif(1)} ,.parallel = T,
浏览 2提问于2016-01-22得票数 3
回答已采纳
我试图在4个节点上并行化一个代码(type= "SOCK")。这是我的密码。library(itertools)library(doParallel)
workers <- ip address of 4如果我使用doMC，即使用同一台机器的内核，则此代码运行良好。但是，当我试图使用其他计算机进行并行计算时，就会出现上述错误。当我将其更改为registerDoSNOW时，错误仍然存在。雪和DoSNOW<em
浏览 3提问于2014-08-01得票数 10
1回答
关于foreach函数，doParallel和R中的doMC有什么不同？doParallel支持windows，类unix，而doMC只支持类unix。换句话说，为什么doParallel不能直接取代doMC呢？谢谢。
更新：doParallel构建在parallel之上，它本质上是multicore和snow的合并，并自动为您的系统使用适当的工具。因此，我们可以使用doParallel来支持多系统。换句话说，我们可以使用do
浏览 5提问于2015-03-11得票数 51
回答已采纳
在Linux计算机上，继之后，我使用doParallel::registerDoParallel()，然后使用options(cores = N)，其中N是我想要与foreach一起使用的核数。然而，在Windows10(最新版本的R和软件包)上，该选项似乎没有任何效果，因为更改其值不会改变foreach::getDoParWorkers()的值(在调用doParallel::registerDoParallel()时在3上初始化)。
浏览 0提问于2017-08-22得票数 4
回答已采纳
假设我在一个rmarkdown文件中有以下代码块，它只会重置我的全局环境，在几个库中加载，并包含一个print语句。Jsonlite)；图书馆(Plyr)；图书馆(Dplyr)；图书馆(data.table)；图书馆(RSelenium)；图书馆(Rvest)；库(Foreach)；库(DoParallelRpart)；阵容优化数据可视化
图书馆(Ggplot2)；图书馆(Resh
浏览 2提问于2016-12-21得票数 2
1回答
我正在测试doRedis包，方法是在另一台机器上运行一台工作人员，在另一台机器上运行主/服务器。我主人的代码如下所示： }UPDATE2:我问了另一个与doRedis相关的问题：“允许每台工作机器使用其所有内核吗？”
浏览 2提问于2014-03-28得票数 1
回答已采纳
我是在Linux下开发的，mclapply函数将从parallel包中使用。Windows不支持此包(它使用doParallel)。不过，我真的很喜欢parallel包，因为它的简单性和速度，我不知道这是否应该成为为CRAN提供两个不同版本的包的原因，对于单独的操作系统(似乎是需要维护的额外工作)，更不用说它是否允许使用了。而且，现在我还在考虑parallel's相当于doParallel</em
浏览 3提问于2013-09-03得票数 7
回答已采纳
我想使用llply来使用多核doParallel后端(即doParallel::registerDoParallel(cores=8))执行一些并行计算，但是每次计算将花费不同的时间，因此我希望将多核预存选择设置为但是，我不确定如何将此选项传递给llply，后者将它传递给foreach，后者将把它传递给doParallel，后者将最终将其传递给mclapply。有人能举出这样做的例子吗？换句话说，我将如何在下面的代码中禁用预编码？library(plyr)
library(doP
浏览 3提问于2014-03-24得票数 3
回答已采纳
}这比它看起来需要的时间要长，并且冒着风险，我可能不记得在底部的顶部出现任何变化。
浏览 4提问于2016-04-06得票数 4
回答已采纳
在R中，我可以成功地运行它，但是对于大的m，它需要一些时间。subset(pgz, pgz$user_id==i) u[i] <- i}u=c() if(
浏览 0提问于2015-08-02得票数 0
1回答
我使用options()和getOption()来设置代码执行方式的选项。在顺序操作中，它工作得很好。 但是，当我使用doparallel包并行运行我的代码时，这些选项不会传递给工作进程。显示问题的示例代码： library(doParallel)registerDoParallel()
getOption('a')
##我尝试在foreach中导出.Options，但得到相同的结果：
浏览 23提问于2019-02-22得票数 0
我已经和一些不同的人讨论过如何解决这个问题，有些人建议使用矢量化，但这对我来说是新的。我也尝试过切换到数据表，但我没有看到太多的变化。tryCatch用于防止代码在加载URL时遇到错误而停止。urls被加载到一个列表中，每个股票对应一个urls所以它们相当长。第二个for循环从URLS中抓取数据，并将格式正确的数据发布到数据帧中。
浏览 36提问于2019-02-11得票数 1
回答已采纳
2回答
如果我在没有注册集群的情况下运行foreach...message:但是，如果我在启动、注册和停止集群后运行相同的代码，它将失败或者，在我重新启动R会话之前，我会一直使用旧集群的幽灵吗？/edit:一些谷歌搜索显示了 Biocondoctor包中的bumphunter:::foreachCleanup()函数：{
if (exist
浏览 0提问于2014-08-03得票数 36
回答已采纳
最近，我开始使用foreach和doParallel包将代码切换到并行执行。由于不同的线程相互干扰，使用futile.logger日志记录的工作效率很低。因此，我开始使用ParallelLogger，即使在并行设置中，它也应该处理日志记录。不幸的是，我对这个记录器有两个问题，我自己解决不了，也许我做错了什么，或者系统中有一个错误。1] INFO doParallel fun Start Data Loading2018-09-17
浏览 2提问于2018-09-17得票数 1
1回答
我在R中使用foreach和doParallel库。output_location='/home/Desktop/pp/' library(doParallel)
library(data.table4个核，因此使用这个code.But编写所需的时间非常少，我想要使用GPU的前置-多列驱动程序。在GPU上有处理 doParallel循环
浏览 1提问于2018-06-21得票数 5
回答已采纳
云服务器
ICP备案
云直播
腾讯会议
对象存储
腾讯云开发者
