我正在尝试让一个非常基本的作业数组脚本在HPC上使用Slurm作业调度程序工作。我得到了一个错误: slurmstepd: error: execve(): Rscript: No such file or directory 这类似于this,但我没有使用任何export命令,所以这不是这里的原因一些消息人士说,这可能与在Windows中创建这些脚本有关,因此行尾将不适用于Unix。这会是问题所在吗?如果是这样的话,我该如何检查呢? 我的shell脚本: #!hell
我一直在使用一个由200个节点组成的集群,每个节点有32个核心,用于模拟随机过程。我必须对同一系统进行大约10000次模拟,所以我在一个节点的32个内核中运行相同的模拟(使用不同的RNG种子),直到它完成所有10000次模拟。在我的sbatch脚本中,我有以下内容: # Specify the number of nodes(nodes=) and the number of cores per nodes(tasks-pernode有没有办法将这些未使用的内核释放出来用于其他作业?有没有办法将这32个作业</em
在许多功能中,学习实现了用户友好的并行化。例如,在sklearn.cross_validation.cross_val_score中,您只需在n_jobs参数中传递所需的计算作业数。但是,如果我想在高性能集群中使用这样的选项(安装了OpenMPI包并使用SLURM进行资源管理)?如我所知,sklearn使用joblib进行并行化,而后者使用multiprocessing。而且,正如我所知道的(例如,从这里,) mul
我有一个shell脚本,它向SLURM提交多个作业。这些作业是在以下循环中提交的:slurmids=() # storage of slurm job ids
for k in $(seq 1 $nb_partitions除了提交作业外,此循环还创建数组slurmids,该数组包含所有SLURM作业的作业ids列表。现在,我有另一个SLURM<e